<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Manasa (2017)
Title Evolution of gag and gp41 in Patients Receiving Ritonavir-Boosted Protease Inhibitors.
Citation Sci Rep
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 148
NumPts 76
Subtype B, CRF02_AG, CRF01_AE, D

 

  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 148 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
CA14728 CA162299 ABC, AZT, 3TC, TDF, DDI None D67N, K70R, T215F, K219Q K101E P4S, K20R, A98S, K102Q, E138A, V179I, G196E, R211T, V292VI, I293V  
CA24950 CA134483 None None   A98S, K122E, D177E, I178M, G196E, I202V, A272P, L283I, I293V  
  CA191719 TDF, FTC None M184V  A98S, K122E, D177E, I178M, G196E, I202V, A272P, L283I, I293V  
CA25036 CA134487 AZT, 3TC, TDF, FTC EFV K65R, M184MV L100I, K103N V35M, I135T, E169D, I202V, A272P  
CA26307 CA61070 None None   V60I, R83K, D123E, I135IV, S162C, I178L, R211K, A272P, T286A, P294PS, E297R, F346H, G359S  
  CA212466 TDF, FTC None M184V  K11KR, V60I, R83K, D123E, I135X, S162C, D177DN, I178L, R211K, A272P, T286A, P294S, E297R  
CA35596 CA134521 TDF, FTC EFV T69D K103N, Y181C, G190GA V35T, E40D, K49R, V60I, K122KE, D123DE, I135X, D177E, T200I, Q207E, R211K, V245K, D250E, A272P, L282C, L283I, V292VI, I293V  
CA37879 CA84398 None None   K11R, D123E, I135T, D177E, T200I, I202V, R211K, A272P, L283I, I293V  
  CA152374 TDF, FTC EFV  L100LI, K103N K11R, D123E, I135T, D177E, T200I, I202V, R211K, L228LR, A272P, L283I, I293V  
CA38099 CA84848 None None A62V  K20R, V35VI, I135IT, T200I, I202V, R211K, V245E, K277R, Q278H, T286A W71M 
  CA152384 TDF, FTC None A62V  K20R, V35VI, T200I, I202V, R211K, V245E, K277R, Q278H, T286A W71M 
CA39143 CA88416 None None   K102Q, D123E, I142V, D177E, V245E, E248X, A272P, I293V, E297R Q269QH 
  CA191766 TDF, FTC None   K102Q, D123E, I142V, D177E, R211RK, V245E, E248X, A272P, I293V, E297R  
CA39270 CA88670 None None  K103N, P225H K20KR, A98S, K102R, K122KE, D123E, R172RK, K173N, Q174K, T200E, Q207X, R211K, E248D, D250DE, A272P, K277R, T286A, V292I  
  CA95311 TDF, FTC None  K103N, P225H K20R, A98S, K102R, K122E, D123E, R172RK, K173X, Q174K, T200E, Q207D, R211K, L228LH, E248D, D250DE, A272P, K277KR, T286A, V292I  
CA42036 CA95401 None None   E6D, K22KR, V35T, T39K, K43KE, V106I, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200TA, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
  CA123524 TDF, FTC EFV  K103KN E6D, K22R, V35T, T39K, V106I, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I180IV, T200A, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
CA42080 CA95489 RTI RTI  K103N K20KR, V60VI, V179I, T200TA, Q207E, R211RK, V245M, A272P, I293V, P294T  
  CA123528 RTI, ABC, 3TC RTI  K103N K20KR, V60I, V179I, Q207E, L210LS, R211RK, V245M, A272P, I293V, P294T  
  CA126277 RTI, ABC, 3TC RTI  K103KN K20KR, V35VI, V60VI, V179I, Q207E, L210S, R211K, V245X, A272P, I293V, P294T  
CA42183 CA95697 None None   K20R, K122E, I135T, S162Y, R211RK, F214FL, L283LI, A288S, I293IV  
  CA212607 TDF, FTC EFV  K103KN K20R, K122E, I135T, S162Y, T200TA, F214FL, L283LI, A288S  
CA42654 CA96749 None None   A98AS, D121Y, K122KE, D123DE, S162C, K173Q, D177E, G196A, Q207E, R211K, D250E, A272P, K277KR, T286TA, E291ED, I293IV, E297K  
  CA152398 TDF, FTC None K65KR, M184V  D121Y, K122E, S162C, K173Q, D177E, G196GA, T200TA, Q207E, R211K, D250E, A272P, T286A, E291D, E297K  
CA55928 CA123666 None None   K102KQ, D123DE, I142V, S162Y, K166KR, P176PS, D177E, I178IL, V179I, G196GE, T200A, I202V, R211X, I257IL, A272P, K277KR, I293V, E297Q  
  CA212611 TDF, FTC, Unknown EFV, Unknown  K103KN K102KQ, D123DE, I142V, S162Y, P176PS, D177E, I178IL, V179I, G196GE, T200A, I202V, R211X, I257IL, A272P, K277R, I293V, E297X  
CA55968 CA162353 TDF, 3TC, FTC EFV  K103KN T27S, V35M, E40EA, S48E, K49KR, V60I, R83K, D123E, E169D, D177E, I178M, G196E, T200A, R211X, A272P, K277R, T286A, E297K  
CA55970 CA123750 TDF, FTC None   K102E, K122E, A158S, S162Y, I178IM, R211G, A272P, V292I  
  CA126295 TDF, FTC None   V35VI, K102E, K122E, A158S, S162Y, I178M, R211G, A272P, V292I T131TA 
  CA175512 TDF, FTC None   V35VI, K102E, V106VI, K122E, A158S, S162Y, I178M, R211G, A272P, V292I  
CA56120 CA124064 None None   K122E, E138A, S162C, I202IV, Q207E, F214L, D250E, A272P, T286A, V292I, I293V  
  CA191787 TDF, FTC EFV  K103N, P225PH V35VI, K64KR, K122E, S162C, Q207E, D250E, A272P, T286A, V292I, I293IV  
CA56141 CA124106 ABC, FTC None M41L K103N V35I, K43Q, A98S, K101KR, D123E, I135T, D177E, G196E, T200TA, R211K, T215X, V245T, E248ED, I293V, E297R  
  CA212613 ABC, FTC None M41ML K103KN V35VI, K43KQ, V60VI, A98AS, K101X, D123E, I135T, D177E, G196GE, T200TA, R211K, T215X, D237DE, V245X, I293V, E297R  
CA57448 CA126573 None None   V118I, K122E, D123E, Q174QE, R211G, F214L, I293V, P294T  
  CA134561 TDF, FTC NVP M184I Y181C E6EK, V90VI, V118I, K122E, D123E, Q174E, R211G, F214L, V241VM, I293V, P294T  
CA57479 CA126635 None None T215L  K20R, V35X, K49R, V60I, R83K, A98S, E138A, S162D, T165I, K166R, I202V, L210F, R211K, A272P, K277R, I293V  
  CA234061 TDF, FTC None M184V, T215F  K20R, K49R, V60I, R83K, V90I, A98S, E138A, S162D, T165I, K166R, I202V, L210F, A272P, K277R, I293V  
CA61483 CA134607 None None   T27S, K32N, A98S, K122KE, D123X, I135R, D177E, F214L, V245E, K277R, R284K, T286A, I293V, E297A  
  CA152428 TDF, FTC EFV  K103KN, G190GA T27S, K32N, A98S, K122KE, D123X, I135R, D177E, F214L, V245E, K277R, R284K, T286A, I293V, E297A  
CA61631 CA134909 None None   V118I, K122E, I135T, T165I, T200X, E204EK, R211X, F214L, T286A  
  CA152444 TDF, FTC NVP K65KR, M184MV K103KN, Y181C, G190GA V118I, K122E, I135T, T165X, I178IV, T200X, E204EK, R211G, F214L, H221HY, T286A  
CA8006 CA55094 AZT, DDI, ABC, D4T, 3TC, TDF, FTC NVP M184V, N348NI  I135V, G196E, F214L, V245K, D250E, T286A, A288T, K311KR, P313PT, I329IL, A400T, E432D, Q480QR  
  CA191649 AZT, DDI, ABC, D4T, 3TC, TDF, FTC, Unknown NVP, Unknown M184MV K103KN, Y181YC I135V, G196E, F214L, H221HY, L228LR, V245X, D250E, T286A, A288T  
CA9918 CA64014 D4T, 3TC, Unknown EFV, Unknown   V35VI, A98AS, K122E, D123DE, I135R, R211K, T286A, V292I, E297K  
MK1 MK1w1 None None   K104R, K122E, I142T, Q197E, F214FL  
  MK1w70 ABC, 3TC None   K104R, K122KE, I142T, Q197E, E204EK, F214FL, V245VE, T286A, E297K Q269QH 
MK110 MK110w0 None None   I135T, I178M, G196E, T200X, A288S, I293V  
  MK110w37 TDF, FTC EFV  K103KN A98AS, I135T, I178IM, G196E, T200X, A288S, I293V  
MK119 MK119w0 None None   V35T, K122KE, D123E, I178L, Q197K, R211RK, K277R, I293V  
  MK119w112 TDF, FTC None   V35T, K122KE, D123E, I178L, Q197K, R211RK, K277R, I293V  
MK120 MK120w0 None None   K102KQ, V106I, D121Y, K122E, S162C, Q174K, I178L, T200A, R211S, V245X, D250E, A272P, K281R, L283I, I293V  
  MK120w49 TDF, FTC None   K102KQ, V106VI, D121Y, K122E, S162C, Q174K, I178L, T200A, R211S, A272P, K281R, L283I, I293V  
MK127 MK127w0 None None   K32N, K49R, A98S, K122E, I135R, Q207E, V245M  
  MK127w33 TDF, FTC None   K32N, K49R, A98S, K122E, I135X, Q207E, V245M, E248EK, I293V, E297A G262GE 
MK133 MK133w0 None None   E6D, D121DY, K122KE, S162C, D177E, S251T, T286A, I293V, P294A  
  MK133w70 ABC, 3TC None M184V  E6X, D121Y, K122E, S162C, D177E, S251X, T286A, I293V, P294A  
MK141 MK141w-1 None None T215L K103S, G190A K20R, K122E, V179I, D192DN, Q197K, I202V, R211K  
  MK141w57 ABC, 3TC None T215L G190A K20R, V35VL, K101KQ, K103X, K122E, V179I, D192N, Q197K, I202V, Q207QR, R211K, D218DG, V276VI, Q278E, I293V, E297R  
MK147 MK147w0 None None   K20R, D123E, S162C, T200A, Q207E, R211K  
  MK147w27 ABC, 3TC, AZT EFV M184V K103N K20R, I31L, D123E, S162C, T200A, Q207K, H221Y  
MK161 MK161w0 None None   V35I, R83K, I142V, T165I, K173Q, T200V  
  MK161w174 TDF, FTC None   V35I, R83K, I142IV, A158AS, T165TI, K173KQ, T200X, V245T, E248EK, D250E, A272T, K281KR, I293IV  
MK172 MK172w0 None None   V35R, T39A, Q174H, T200A, Q207H, R211K, F214L  
  MK172w31 TDF, FTC EFV  K103N, G190A V35R, T39A, Q174H, T200A, Q207H, R211K, F214L  
MK179 MK179w0 None None   F171Y, T200A, R211RK, F214L, D250E, A272P, K277R, I293V, P294A, E297K  
  MK179w48 ABC, 3TC None   F171Y, T200A, F214L, D250E, A272P, K277R, I293V, P294A, E297K  
MK18 MK18w0 None None   V35I, K122E, I135L, I202V, R211K  
  MK18w97 ABC, 3TC None   V35I, K122E, I135L, I202V, R211K  
MK182 MK182w0 None None M41L, T215D  K20R, T39A, E44D, S68G, S162C, Q174K, I178L, G196E, T200I, Q207D, R211K  
  MK182w27 ABC, 3TC EFV M41L, M184I, T215L K103N, G190A, K238T K20R, V35E, T39A, E44D, R83K, Q174E, V179I, Q207E, R211K, V245E  
MK187 MK187w0 None None   K20R, S162C, E248D, T286A, I293IV, E297A  
  MK187w115 TDF, FTC None   K20R, S162C, E248D, T286A, E297A  
MK188 MK188w0 None None   V35M, K122E, D123S, K173E, D177E, V179T, T200R, R211K, V245M  
  MK188w29 ABC, 3TC EFV   V35M, K122E, D123N, K173E, D177E, V179T, T200R, R211K, V245M  
MK193 MK193w0 None None   V35I, S68G, I135T, K166KR, D177G, I195T, R211K, A272P, K277R, I293V, E297T  
  MK193w88 TDF, FTC None   V35I, S68G, I135T, K166KR, D177G, I195IT, R211K, A272P, K277R, I293V, E297T  
MK194 MK194w0 None None   V35I, R83K, D123E, I135K, D177E, R211K  
  MK194w86 ABC, 3TC None   V35I, R83K, D123E, I135K, D177E, R211K, K275R, T286A, P294T, E297K  
MK202 MK202w0 None None   K11R, V35M, D123E, S162C, G196E, I202V, Q207K, R211A, V245Q, E248D, D250S  
  MK202w19 ABC, 3TC EFV D67N, M184I K103N, K238T K11R, L34LI, V35M, D123E, S162C, G196E, I202V, Q207K, R211A, V245Q, E248D, D250S  
MK205 MK205w0 None None   K20KR, S162A, G196GE, T200X, R211A, F214L, A272P, K277R, I293IV  
  MK205w36 ABC, 3TC None   K20KR, S162A, G196GE, T200X, Q207QK, R211A, F214L P225PT 
MK21 MK21w0 None None  V179D K20R, V118I, K122E, I135R, R211K, F214L  
  MK21w126 ABC, 3TC None  V179D K20R, V118I, K122E, I135R, R211K, F214L  
MK210 MK210w0 None None   V21VI, V35I, R83K, Q174R, T200A, R211K, V245E H96HP 
  MK210w53 TDF, FTC None   V35X, R83K, K173KE, Q174X, T200A, R211K, V245E, L260I, K281R, T286A, E297K  
MK213 MK213w0 None None   D123E, V189I, E248Q  
  MK213w111 ABC, 3TC None   V35VI, D123E, V189I, E248Q, A288S  
MK217 MK217w0 None None   K122E, I135L, Q174QR, I178IM, T200A, Q207E, A272P, I293V, E297A  
  MK217w39 TDF, FTC None   K122E, I135L, Q174QR, I178IM, T200A, Q207E, A272P, I293V, E297X  
MK219 MK219w0 None None  V179D D123E, I142T, T165I, I202V, R211T, V245Q, A272P, V276I, K277R, T286A, E297K G155GE 
  MK219w42 ABC, 3TC None   D123E, I142T, T165I, I202V, R211X, V245Q, A272P, V276I, K277R, T286A, E297K  
MK223 MK223w0 None None   R83K, K102Q, D123N, S162A, R211K  
  MK223w52 ABC, 3TC None   R83K, K102Q, S162A, K173KE, Q174QE, I178IM, R211K, V245M, D250E, A272P, K277R, K281R, T286TA, E297K  
MK228 MK228w0 None None   K20R, K49R, K122E, I135T, S162C, E169D, K277R K220KI 
  MK228w54 ABC, 3TC None   K20R, K49R, K122E, I135T, S162C, E169D, K277R  
MK230 MK230w0 None None   T27S, K64R, K104R, S162C, E169D, Q207K, R211K, D250E  
  MK230w34 TDF, FTC EFV   T27S, K64R, K104R, S162C, E169D, Q207K, R211K, D250E  
MK232 MK232w0 None None   A98S, N175H, D177E, V179I, T200E, I202V, E204K, R211K