<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Smith (2018)
Title Efficacies of Cabotegravir and Bictegravir against drug-resistant HIV-1 integrase mutants.
Citation Retrovirology
SelectedGene IN
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Lab
NumIsolates 51
Lab Parent Strain NL43

 

Lab IN Isolates : Susceptibility Data


IsolateINIMajorDRMsINIMinorDRMsMethodDrugFold Res.
E138A_Q148R E138A, Q148R  NCI BIC 2.2 
     NCI CAB 11 
     NCI DTG 2.8 
     NCI EVG 46 
     NCI RAL 788 
E138A_S147G_Q148R E138A, S147G, Q148R  NCI BIC 1.2 
     NCI CAB 1.7 
     NCI DTG 3.4 
     NCI EVG 121 
     NCI RAL 352 
E138K E138K  NCI BIC 2.1 
     NCI CAB 5.4 
     NCI DTG 1.1 
     NCI EVG 0.4 
     NCI RAL 1.6 
E138K_G140A_Q148K E138K, G140A, Q148K  NCI BIC 117 
     NCI CAB 254 
     NCI DTG 133 
     NCI EVG 639 
     NCI RAL >1,250 
E138K_G140C_Q148R E138K, G140C, Q148R  NCI BIC 4.3 
     NCI CAB 56 
     NCI DTG 3.3 
     NCI EVG 148 
     NCI RAL >1,250 
E138K_Q148K E138K, Q148K  NCI BIC 31 
     NCI CAB 322 
     NCI DTG 16 
     NCI EVG 295 
     NCI RAL 721 
E138K_Q148R E138K, Q148R  NCI BIC 1.8 
     NCI CAB 10 
     NCI DTG 2.4 
     NCI EVG 125 
     NCI RAL 810 
E138K_R263K E138K, R263K  NCI BIC 1.8 
     NCI CAB 1.8 
     NCI DTG 2.0 
     NCI EVG 1.8 
     NCI RAL 2.0 
E92Q E92Q  NCI BIC 1.1 
     NCI CAB 1.8 
     NCI DTG 1.4 
     NCI EVG 24 
     NCI RAL 7.5 
E92Q_N155H E92Q, N155H  NCI BIC 1.7 
     NCI CAB 1.9 
     NCI DTG 1.1 
     NCI EVG 250 
     NCI RAL >1,250 
E92Q_N155H_G163R E92Q, N155H G163R NCI BIC 1.1 
      NCI CAB 1.8 
      NCI DTG 2.4 
      NCI EVG 106 
      NCI RAL >1,250 
G118R G118R  NCI BIC 2.8 
     NCI CAB 5.0 
     NCI DTG 8.1 
     NCI EVG 3.3 
     NCI RAL 8.9 
G140A_Q148H G140A, Q148H  NCI BIC 0.6 
     NCI CAB 1.6 
     NCI DTG 2.4 
     NCI EVG 39 
     NCI RAL 119 
G140A_Q148K G140A, Q148K  NCI BIC 72 
     NCI CAB 164 
     NCI DTG 282 
     NCI EVG 321 
     NCI RAL >1,250 
G140A_Q148R G140A, Q148R  NCI BIC 5.3 
     NCI CAB 5.7 
     NCI DTG 2.6 
     NCI EVG 90 
     NCI RAL >1,250 
G140C_Q148R G140C, Q148R  NCI BIC 3.4 
     NCI CAB 28 
     NCI DTG 1.8 
     NCI EVG >781 
     NCI RAL >1,250 
G140S G140S  NCI BIC 1.8 
     NCI CAB 2.1 
     NCI DTG 1.7 
     NCI EVG 2.0 
     NCI RAL 2.5 
G140S_N155H G140S, N155H  NCI BIC 1.2 
     NCI CAB 1.8 
     NCI DTG 1.3 
     NCI EVG 8.1 
     NCI RAL 120 
G140S_Q148H G140S, Q148H  NCI BIC 2.9 
     NCI CAB 15 
     NCI DTG 3.6 
     NCI EVG 891 
     NCI RAL 475 
G140S_Q148K G140S, Q148K  NCI BIC 2.4 
     NCI CAB 36 
     NCI DTG 1.4 
     NCI EVG 85 
     NCI RAL 28 
G140S_Q148R G140S, Q148R  NCI BIC 3.2 
     NCI CAB 173 
     NCI DTG 16 
     NCI EVG 207 
     NCI RAL >1,250 
G140S_Y143R_N155H G140S, Y143R, N155H  NCI BIC 1.1 
     NCI CAB 8.3 
     NCI DTG 1.6 
     NCI EVG 14 
     NCI RAL >1,250 
H51Y  H51Y NCI BIC 1.2 
     NCI CAB 4.1 
     NCI DTG 2.0 
     NCI EVG 0.7 
     NCI RAL 0.9 
H51Y_R263K R263K H51Y NCI BIC 1.8 
      NCI CAB 4.3 
      NCI DTG 10 
      NCI EVG 8.2 
      NCI RAL 1.5 
L74M  L74M NCI BIC 0.7 
     NCI CAB 0.4 
     NCI DTG 1.4 
     NCI EVG 0.9 
     NCI RAL 1.9 
L74M_G140A_Q148R G140A, Q148R L74M NCI BIC 6.2 
      NCI CAB 22 
      NCI DTG 7.5 
      NCI EVG 117 
      NCI RAL >1,250 
L74M_G140C_Q148R G140C, Q148R L74M NCI BIC 3.2 
      NCI CAB 92 
      NCI DTG 6.4 
      NCI EVG >781 
      NCI RAL >1,250 
M50I   NCI BIC 1.3 
    NCI CAB 0.3 
    NCI DTG 1.3 
    NCI EVG 0.4 
    NCI RAL 7.7 
N155H N155H  NCI BIC 1.4 
     NCI CAB 0.9 
     NCI DTG 2.3 
     NCI EVG 14 
     NCI RAL 38 
N155H_G163R N155H G163R NCI BIC 1.1 
      NCI CAB 0.9 
      NCI DTG 1.0 
      NCI EVG 11 
      NCI RAL 61 
Q146L  Q146L NCI BIC 2.7 
     NCI CAB 1.4 
     NCI DTG 1.3 
     NCI EVG 6.8 
     NCI RAL 6.0 
Q146P Q146P  NCI BIC 0.4 
     NCI CAB 4.3 
     NCI DTG 0.3 
     NCI EVG 0.7 
     NCI RAL 1.5 
Q148H Q148H  NCI BIC 0.5 
     NCI CAB 2.8 
     NCI DTG 0.4 
     NCI EVG 3.7 
     NCI RAL 36 
Q148H_N155H Q148H, N155H  NCI BIC 2.1 
     NCI CAB 5.5 
     NCI DTG 2.5 
     NCI EVG 97 
     NCI RAL 84 
Q148K Q148K  NCI BIC 0.6 
     NCI CAB 1.2 
     NCI DTG 0.6 
     NCI EVG 48 
     NCI RAL 362 
Q148R Q148R  NCI BIC 0.6 
     NCI CAB 1.9 
     NCI DTG 0.8 
     NCI EVG 46 
     NCI RAL 68 
Q148R_N155H Q148R, N155H  NCI BIC 1.1 
     NCI CAB 21 
     NCI DTG 4.4 
     NCI EVG 45 
     NCI RAL >1,250 
R263K R263K  NCI BIC 2.2 
     NCI CAB 5.6 
     NCI DTG 7.1 
     NCI EVG 0.8 
     NCI RAL 1.4 
S119R   NCI BIC 1.7 
    NCI CAB 1.0 
    NCI DTG 1.4 
    NCI EVG 1.2 
    NCI RAL 6.5 
S153Y  S153Y NCI BIC 1.5 
     NCI CAB 1.3 
     NCI DTG 1.3 
     NCI EVG 0.7 
     NCI RAL 4.5 
T66I T66I  NCI BIC 0.1 
     NCI CAB 0.4 
     NCI DTG 0.6 
     NCI EVG 10 
     NCI RAL 0.7 
T66I_E157Q T66I  NCI BIC 0.6 
     NCI CAB 0.1 
     NCI DTG 0.3 
     NCI EVG 10 
     NCI RAL 25 
T66I_T97A_E157Q T66I T97A NCI BIC 0.2 
      NCI CAB 0.3 
      NCI DTG 0.3 
      NCI EVG 11 
      NCI RAL 8.4 
T97A  T97A NCI BIC 0.8 
     NCI CAB 1.1 
     NCI DTG 0.7 
     NCI EVG 0.8 
     NCI RAL 0.7 
T97A_Q148H_N155H Q148H, N155H T97A NCI BIC 0.9 
      NCI CAB 0.8 
      NCI DTG 1.5 
      NCI EVG 35 
      NCI RAL 1,114 
T97A_Y143R_N155H Y143R, N155H T97A NCI BIC 4.3 
      NCI CAB 59 
      NCI DTG 5.3 
      NCI EVG 100 
      NCI RAL >1,250 
T97A_Y143R_Q148H Y143R, Q148H T97A NCI BIC 0.6 
      NCI CAB 2.2 
      NCI DTG 0.9 
      NCI EVG 6.5 
      NCI RAL >1,250 
Y143H_N155H Y143H, N155H  NCI BIC 1.4 
     NCI CAB 0.5 
     NCI DTG 1.1 
     NCI EVG 11 
     NCI RAL 301 
Y143R Y143R  NCI BIC 1.4 
     NCI CAB 1.1 
     NCI DTG 2.7 
     NCI EVG 1.2 
     NCI RAL 41 
Y143R_N155H Y143R, N155H  NCI BIC 2.1 
     NCI CAB 1.5 
     NCI DTG 1.6 
     NCI EVG 27 
     NCI RAL >1,250 
Y143R_Q148H Y143R, Q148H  NCI BIC 0.2 
     NCI CAB 2.5 
     NCI DTG 0.5 
     NCI EVG 3.6 
     NCI RAL 510