<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Ndashimye (2018)
Title Absence of HIV-1 Drug Resistance Mutations Supports the Use of Dolutegravir in Uganda.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 316
NumPts 293
Subtype A, D, B, C, CRF10_CD, C + D

 

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Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 316 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
DR1 DR1-17 TDF, 3TC None   V35T, K49KR, V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K  
DR103 DR103-14 None None   E28EK, K32KE, V35X, E36D, T39K, K43E, E53D, V60I, T69S, D121H, K122E, I135T, F171Y, D177E, D192DN, T200X, Q207A, R211K  
DR11 DR11 ABC, 3TC EFV M184V  V60I, R83RK, K102Q, K122E, D123S, I135T, S162Y, K173L, Q174K, V179I, T200A, Q207E G45GV, H235HR 
  DR11-16 ABC, 3TC EFV   V35T, K49R, V60I, K122E, D123G, I135T, T165I, F171Y, K173L, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200I, I202V, Q207K, R211S P95PS 
DR110 DR110-13 None None D67N, K70R, M184V, T215F, K219E V106A, G190A, P225H K32I, V35T, T39K, I47L, K49R, V60I, L109I, K122E, E169EA, K173E, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207E, R211K, F214L  
DR111 DR111-14 None None   V35Q, T39D, V60I, T107S, K122E, D123X, I135T, I142IV, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
DR115 DR115-13 None None K70E, M184V K103N, Y188L K11T, K20R, V35T, T39R, K49R, V60I, S105T, K122E, D123N, I135M, D177E, I178M, V179T, T200A, I202V, Q207A, R211K  
DR138 DR138-13 None None D67DN, K70KR, K219Q  V35T, E44D, K49X, V60I, T69TN, V118I, D121H, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211N, F214L, T215X  
DR152 DR152-14 ABC, 3TC None M184V  V8I, K11T, K20R, V21I, V35T, T39X, K122KE, D123N, I135X, I142T, K173S, Q174K, V179I, G196GR, Q207A, R211K  
DR17 DR17-16-1 TDF, 3TC, ABC NVP, EFV L74V, Y115F, M184V K101E, G190S T69S, K122E, D123DN, E138G, K173S, D177E, V179T, T200K, Q207A, R211S  
  DR17-17 TDF, 3TC, ABC NVP, EFV M41L, D67N, K70R, V75M, M184V, L210W, T215Y, K219E G190A E6K, K20R, V35I, V60I, K101Q, K122E, D123X, I135T, K173S, Q174R, D177E, V179X, T200A, E203K, Q207D, H208Y, R211K, L228H  
DR171 DR171-14 None None  Y188L V35T, K49R, V60I, T69A, K122E, D177E, I178M, G196E, Q207E, R211K  
DR186 DR186-14 None None V75I, F77L, Y115F, F116Y, Q151M, M184V, K219E V108I, Y181C V35T, T39R, S68G, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A  
  DR186 AZT, 3TC None V75I, F77L, Y115F, F116Y, Q151M, M184V, K219E V108I, Y181C V35T, T39R, S68G, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A  
DR192 DR192-16-1 TDF, 3TC None   V35T, T39L, V60I, K122E, D123E, D177E, Q207E  
DR193 DR193 ABC, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y Y188L V21VI, V35T, T39A, K43E, E44A, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135T, S162C, E169D, G196GE, T200K, E203ED, Q207E, R211K, L228R  
  DR193-16-1 ABC, 3TC None M184V A98AG, K103N, P225H V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135M, S162D, D177E, T200I, Q207E, R211K, T215X  
DR202 DR202-14 None ETR   V35T, V60I, K66KR, K103KE, V106VI, D121Y, K122E, I135V, I159V, E169EK, D177E, V179I, Y188X, T200X, Q207E, R211K T128I 
DR210 DR210-14 TDF, 3TC None   K20KR, V35T, E40D, E44D, K49R, K122E, D123S, E138A, S162C, K173A, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K  
  DR210 TDF, 3TC None   K20KR, V35T, E40D, E44D, K49R, K122E, D123S, E138A, S162C, K173A, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K  
DR219 DR219 ABC, DDI None   V35T, K49R, V60I, K122E, I135T, S162C, D177E, I178M, T200M, Q207E, R211K  
  DR219-16-1 ABC, DDI, AZT, 3TC None K70KR, M184V K101P, K103S V35T, T39A, K122E, D123N, I135T, K173S, D177E, V179X, D192N, T200A, Q207A, R211RK, F214L  
DR22 DR22-14 None None D67N, K70R, M184V, K219E K103N, V108I I31IM, V35T, T39L, V60I, V118VI, K122E, D123N, I135T, I142T, K173S, Q174K, I178IL, V179I, Q207E, R211S, F214L, D218DN  
DR229 DR229-16-1 ABC, 3TC None  Y181C E6D, V35T, K49R, T69A, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
DR238 DR238-14 TDF, 3TC None D67N, M184V, L210W, T215Y A98G, K103N, V108VI K20R, V21I, V35T, T39E, E44D, V111I, K122E, D123N, I135L, T165TI, K173S, D177E, T200A, I202V, Q207A, R211K, H221HY  
  DR238 TDF, 3TC, AZT NVP D67DN, K70KR, M184V A98AG, Y181C K49R, T69TN, K101KR, K122E, I135T, S162SN, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K219X, H221HY  
DR241 DR241-16-1 TDF, 3TC None M41ML, M184V, T215Y  K20KR, V35I, S48T, V60I, S68SG, K122E, D123N, T139K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S  
DR252 DR252-13RTPR None None  Y188L V35T, K49R, V60I, T69TA, K122E, D177E, I178M, G196E, Q207E, R211K  
DR259 DR259-16-1 TDF, 3TC None   K20R, K32I, V35T, E36ED, T39R, V60I, K122E, D123N, I135R, A158AS, S162A, K173S, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211K, F214L  
DR26 DR26-16-1 TDF, 3TC None M184V K103N V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
DR266 DR266 AZT, 3TC NVP M184V, T215F V108VI, Y181C K103X, K122E, D123G, T139R, K173T, Q174K, T200A, E203EK, Q207E, R211K  
  DR266-16 AZT, 3TC, TDF NVP D67DN, M184V A98AG, K103N K11T, K20R, V35T, V60I, K101Q, K122E, D123S, E138A, K173S, V179I, I202V, Q207A, T215X  
DR268 DR268 AZT, 3TC NVP M41L, M184V, L210W, T215Y G190A K43KQ, K49R, V60I, V75X, D121Y, K122E, I135T, D177E, I178M, V179I, T200M, Q207X, R211K  
  DR268-16 AZT, 3TC, ABC NVP   K11KT, V35T, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, I178IV, V179VI, T200A, Q207A, R211S  
DR27 DR27 TDF, 3TC EFV K65R, Y115YF, M184V L100I, K103N K49R, V60I, S68N, K122E, I135V, E169A, K173E, I178IM, T200A, I202V, Q207E, R211K  
  DR27-17 TDF, 3TC EFV  G190GA E6N, K20KR, V35T, T39TA, E40D, G45GE, V60I, V118VI, K122E, D123DG, K173X, Q174K, D177DE, V179X, G196E, Q207A, R211S, F214L  
DR271 DR271 ABC, 3TC None   K11KT, V35T, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
DR272 DR272 TDF, 3TC None  G190A E6D, V35T, S48ST, K49KR, V60I, V90VI, K122E, I135T, K173X, Q174K, I178IM, V179I, T200A, Q207A, R211S, T215X  
DR282 DR282-15 None None M41L, M184V, L210W, T215Y K103N K11T, K20R, K32I, V35T, T39N, K43KQ, E44ED, V60I, A98S, V118VI, K122E, D123N, I135M, E138Q, K173L, D177G, Q197E, T200A, Q207A, R211K L80LF 
DR286 DR286 AZT, 3TC None M184V K103N, P225H K20R, V35T, T39R, K43Q, V60I, K102Q, D121H, K122E, I142T, D177E, I178M, Q207E, R211K, L228Q  
DR289 DR289 TDF, 3TC None   K20R, V35T, V60I, K122E, I135T, K173S, Q174K, V179I, T200A, Q207E, R211S, F214L  
DR29 DR29-16-1 3TC EFV K65KR, D67H, Q151M, M184I, K219E V108VI, Y181C P4S, I31L, V35T, K46KQ, S68G, V90I, K101X, K122E, I135L, K173S, D177E, G196E, T200A, E203EK, Q207A, R211S, D218E  
DR292 DR292 TDF, 3TC None   V35T, T39K, K49R, V60I, D121X, K122E, D123E, D177E, I178M, T200X, Q207G, R211K  
DR293 DR293-15-1 ABC, 3TC EFV M41L, D67N, K70R, V75M, M184V, T215F, K219E V108I V60I, K101X, K102KQ, K122E, D123N, I135T, F171Y, K173A, Q174K, V179I, G190X, T200A, E203EK, Q207X, R211S, F214L, L228H  
  DR293-16-1 ABC, 3TC, TDF EFV M41ML, L74LV, M184MV L100LI, K103N K20R, E28A, V35T, T39M, E44D, K49R, V60I, K101KR, D121Y, K122E, D123E, I135T, I142V, D177E, I178M, T200X, Q207E, R211K, T215X  
DR294 DR294-15 None None K219KR  V35T, V60I, K122E, I135IT, D177E, I178M, G196E, T200I, Q207E  
DR295 DR295 TDF, 3TC None T215D Y181C V35T, T39E, K49R, V60I, K122E, D123X, I135T, T165L, D177E, I178V, T200E, Q207E, R211K  
DR296 DR296-13 TDF, 3TC None M184MV  V35X, S48T, V60I, V90I, D121H, K122E, I135T, D177E, I178V, Q207E, R211K N54NI 
  DR296 TDF, 3TC, ABC NVP L74V, V75S, Y115F, M184V V108I, Y181C, G190A K122E, D123N, A158S, K173S, D177E, V179I, T200A, Q207A, L210S, R211S, H221Y  
DR30 DR30-16-1 ABC, 3TC None M41L, D67N, T69D, M184V, L210W, T215Y A98G, G190S K11KQ, V35T, E44D, K49R, V60I, V111I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211N  
DR300 DR300 TDF, 3TC None M41L, M184V  K20KR, V21VI, V35T, T39A, V60I, D121X, K122E, I135IT, I142V, D177E, I178IM, T200X, Q207E, R211K  
DR303 DR303 ABC, 3TC None M184V, T215F Y188L K11T, K20R, V35T, T39A, K49R, S68G, K102H, I135T, K173S, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, F214L  
DR311 DR311 ABC, 3TC EFV D67N, T69D, K70R, L74LI, M184V, T215F, K219Q K101P, G190A, K238T K122E, D123N, I167V, K173S, D177E, V179I, G196K, T200A, I202V, Q207A, R211K, L228H  
  DR311-16-1 ABC, 3TC, TDF EFV  K103KN K32KE, V35X, K49R, V60I, V90VI, K102KQ, K122E, D177E, T200X, Q207E, R211K  
DR32 DR32 AZT, 3TC NVP D67N, K70R, M184V, T215TI, K219Q K103N K49KR, V60I, K101KQ, K122E, D123G, I135T, E138Q, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200TA, I202V, Q207X, R211X, D237DE D186DH 
  DR32-16-1 AZT, 3TC, TDF NVP D67N, M184V, T215Y, K219N V108I, M230L P4H, K11T, E28K, K32E, V35T, T39A, K43R, V60I, A98S, K102KR, K103X, V106I, V111I, V118I, K122E, D123N, I135T, I142V, K166R, K173T, T200A, E203K, Q207D, H208Y, L210T, R211S, K223Q, L228H  
DR321 DR321 AZT, 3TC NVP D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q A98G, V108VI, Y181C V60VI, T69N, K122E, D123N, I135T, A158T, T165I, F171Y, K173X, Q174X, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, F214L, H221HY Q182H 
  DR321-16-1 AZT, 3TC NVP M184V K103N, V108I P4S, K11T, K20R, V35T, T39N, K101R, D123N, E169D, K173S, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207D, F214L, H221Y  
DR322 DR322-16-1 AZT, 3TC None V75M, M184V, T215F V106A, G190A, F227L P4S, E6D, M16MT, K20R, V21I, V35T, T39E, K64R, T69A, A98S, L109I, K122E, D123S, S162Y, K166R, K173S, Q174QK, V179I, T200A, I202V, Q207T, H208Y, R211K, L228H  
DR326 DR326 TDF, 3TC None M41L, L74I, M184V, L210W, T215Y A98G, K101E, G190A P4T, E6EK, V35I, K49R, S68G, V118I, D121Y, K122E, I135T, T139A, I142L, Y144F, V179I, E194X, G196X, T200M, E203K, Q207E, R211K, L228Q  
DR331 DR331-16-1 TDF, 3TC None   I5IV, K20R, V35T, T39K, K43Q, K122E, D123N, K173X, D177E, T200A, Q207A, R211S  
DR34 DR34 TDF, 3TC None  G190A V21VI, K32I, V35K, T39A, T69TN, K122E, D123X, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, E203ED, Q207E, R211K, F214FL, D237E  
  DR34-17 TDF, 3TC None M41L, V75M, M184V, L210W, T215Y K103N, Y188L E6D, K11T, V35T, T39A, E44D, V118I, K122E, D123S, E138A, I142V, K173A, Q174K, D177N, V179I, G196GE, I202V, Q207A, R211S  
DR340 DR340-16-1 ABC, 3TC None M41L, D67N, T69D, L74I, Y115YF, M184V, L210W, T215Y A98G E6ED, K11KR, V35T, T39TA, K43R, E44D, V60I, K101Q, V118I, K122E, D123S, I135T, E138G, K173X, V179VI, T200A, I202V, Q207A, R211N  
DR342 DR342-13 TDF, 3TC None   K11T, K20KR, V35T, K122E, D123N, K173S, Q174K, V179I, Q197K, T200E, Q207A, R211S  
  DR342-16-1 TDF, 3TC None D67N, K70R, M184V, K219E K101H, Y181C, G190A, K238T K20R, V21I, V35L, T39E, K122E, D123S, I167V, K173S, Q174K, D177E, V179I, V189I, T200A, I202V, Q207A, R211Q, T215X, L228H  
DR346 DR346-16-1 TDF, 3TC None M184I K101E, Y181C, G190A V35T, T39M, E40D, K49R, V60I, K122E, D177E, I178M, T200A, Q207G, R211K, H221Y  
DR35 DR35-13 None None M184MV V108VI, G190GA V21G, V35T, K49R, V60I, K101X, K122E, D123S, I135T, K166Q, E169D, P170PS, K173S, Q174K, D177E, I178L, V189I, D192DN, T200A, Q207A, R211S, F214L L12F, K30E 
DR358 DR358 TDF, 3TC None  K101E, G190A, P225H V35T, V60I, K122E, D123S, E138G, K173A, Q174K, Q207X  
DR365 DR365 AZT, 3TC None D67N, M184MV, T215E, K219Q K103N, P225PH, K238T V35T, E40Q, V60I, D121H, K122E, I135T, I142V, D177E, E194D, T200A, Q207E  
DR370 DR370-16 None ETR  K103N, Y181C V35T, E40D, K43N, K49R, I50V, V60I, K122E, D123S, I135T, E138Q, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211K, L228R  
DR386 DR386-16-1 TDF, 3TC None   K11Q, V35T, T39K, E40D, K49R, V60I, V118VM, D121Y, K122E, E138A, A158S, E169D, F171Y, D177DE, T200Q, Q207E, R211K, F214L  
DR397 DR397-16-1 TDF, 3TC None D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q P225H, K238T K20R, V35T, T39A, E40D, K46Q, V60I, T69N, V118I, K122E, D123N, I135T, I142V, K173S, Q174K, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L, L228Q  
DR41 DR41-17 TDF, 3TC None  A98AG, K103KN K11T, P14PL, K20R, V35T, T39N, V60VI, K122KE, D123X, K173S, D177E, V179I, T200K, I202V, Q207A, R211S, F214FL  
DR419 DR419-16 None None  Y188L V35T, K49R, V60I, T69A, K122E, D177E, I178M, G196E, Q207E, R211K  
DR42 DR42 None None  Y181C K20R, K32N, V35I, E40D, K49R, V60I, V90I, D121Y, K122E, D123E, I135R, S162SC, V179I, Q197H, Q207E, R211K, L228LH  
DR45 DR45-15-1 AZT, 3TC NVP M184V A98G, K103N, K238T V60I, S68SG, D123E, I135T, S162Y, K173S, Q174K, V179I, T200A, I202V, Q207X, T215X  
DR471 DR471-16 None None  F227FL T7TA, K11T, V35T, T39N, E79X, K122E, D123N, K173A, D177E, V179I, I202V, Q207A, L210LV R78K, F214FS 
DR472 DR472 AZT, 3TC None   V35T, T39A, E40D, K43R, K49R, K122E, D123N, I135IT, K173X, D177E, V179I, T200I, I202IV, Q207A, R211S, F214FL  
DR481 DR481 TDF, FTC None K65R, Y115F, M184V  V35X, T39L, E40EK, K46Q, S68G, K122E, D123S, I142T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211K, F214L, L228H  
DR485 DR485 None EFV  K103N, Y181C V35T, E40D, K43N, K49R, I50V, V60I, K122E, D123S, I135T, E138Q, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211K, L228R  
DR486 DR486-16 AZT, 3TC None M41L, M184V, L210LW, T215Y Y188L E6S, V35T, K49R, I50V, V60I, V90I, I94IL, K122E, D123S, S162D, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
DR487 DR487 None None M41L, M184V, T215I A98G, K101E, G190A K11T, K20R, V21I, V35T, K43R, V60I, S68SG, K122E, D123N, I135M, E138A, T139TA, K173L, D177G, V179I, T200A, I202V, Q207A, L210S, R211K, W212G F214S 
DR491 DR491 AZT, 3TC None K65R, L74I, M184V, K219Q K103N, P225H, M230L V35T, E40D, V60I, S68G, V90I, V111I, K122E, D123E, D177E, T200TA, Q207E, R211K, L228X  
DR511 DR511-16 ABC, 3TC None M41L, M184V, T215Y A98G, K101E, G190A K11T, K20R, V21I, V35T, K43R, V60I, S68SG, K122E, D123N, I135M, E138A, T139TA, K173L, D177G, V179I, T200A, I202V, Q207A, L210S, R211K  
DR524 DR524 ABC, 3TC None   K20KR, V35T, T39X, K122E, D123N, A158AS, T165TI, K173S, Q174K, V179I, G196E, T200A, Q207A, R211S, F214L  
DR532 DR532 ABC, 3TC None M184MV K103KN E6D, K11T, K20R, V21I, V35T, T39E, K101KQ, K122KE, D123X, K173S, D177E, I178L, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, T215X  
DR533 DR533-15 None None K219E Y181C V35T, E40D, K49R, V60I, V90I, T200I, Q207K, R211K  
DR537 DR537-15 None None   V35T, D121H, K122E, D123S, E169D, K173X, Q174K, D177E, V179I, Q197E, T200A, Q207A, R211S, F214FL  
DR572 DR572-16 TDF, 3TC None K70R K103N V35T, T39N, E40D, V60I, T69S, K122E, D123S, I135L, E138A, K166R, K173S, Q174R, V179I, T200A, Q207A, R211K  
DR575 DR575 AZT, 3TC None M184V  K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, K43E, V60I, D123N, K166R, D177E, V189I, Q207A  
DR576 DR576-16 ABC, 3TC None   V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, I142V, K173X, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
DR618 DR618 TDF, 3TC None M41L, D67N, K70R, V75M, M184V, T215F, K219Q K103N E6K, K11H, V35T, V60I, K101Q, K102R, K122E, D123N, I135T, K173A, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A  
DR620 DR620 TDF, 3TC None M41L, D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q A98G V35T, T39E, V60I, T69X, D121Y, K122E, I135M, S162C, D177E, G196E, Q207E, R211K, L228H  
DR7 DR7-16-1 TDF, 3TC None   E28A, V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, A158S, S162A, T165I, K173T, Q174K, N175Y, D177E, T200E, Q207E, R211K  
  DR7-17 TDF, 3TC None   V35T, K49R, V60I, V90I, K122X, D123DG, E169D, K173R, D177E, I178L, T200I, Q207R, R211K  
DR70 DR70-14 None None   E6D, V8I, V35T, T39L, K43N, I47L, K49R, I50V, V60I, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
DR91 DR91-13 None ETR  Y181C V35X, K49R, I50V, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, E203EG, Q207A, H208HY, R211K, L228X S191SF 
DR93 DR93-13 None None   V35T, E36D, T39K, K43E, V60I, T69S, D121H, K122E, I135T, F171Y, D177E, I178V, V179I, T200E, Q207A, R211K  
EN0002 EN0002 None None  K103N V35T, E40D, K49R, V60I, D121H, D123E, I142V, D177E, T200A, E203ED, E204X, Q207D, R211K