<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Villabona-Arenas (2015)
Title HIV-1 group O infection in Cameroon from 2006 to 2013: Prevalence, genetic diversity, evolution and public health challenges.
Citation Infect Genet Evol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup O
SelectedType Clinical
NumIsolates 38
NumPts 38
Host Human

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
03-096-A66 03-096-A66 Unknown Unknown  A98G, V179E, Y181C E6A, T7P, V21X, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, I50V, V60I, K101R, K102Q, K103R, K104Q, V118C, K122P, I135V, I142V, T165I, E169X, K173KN, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200K, K201R, I202V, Q207D, L210Y, R211K E204L 
2778-07 2778-07 Unknown Unknown  A98G, V179E, Y181C E6A, T7P, V21I, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43KQ, K49KR, I50V, V60I, K102Q, K104Q, V118C, K122P, I135V, E138EA, K166KR, E169D, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200K, K201R, I202V, Q207E, L210Y, R211Q E204M 
C1-002-ZAXA C1-002-ZAXA Unknown Unknown D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q A98G, V179E, Y181C, G190A P4PH, E6A, T7P, V21I, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, K103R, K104Q, V111I, V118C, K122P, I135V, T165I, I167V, E169D, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200K, K201R, I202V, E204A, Q207E, L210Y, R211Q, D218E, H221Y  
C1-1036-NDAM C1-1036-NDAM Unknown Unknown M41L, D67N, K70R, V75M, M184V, T215Y, K219Q A98G, V179E, Y181C, G190A E6A, T7P, V21I, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, E44ED, K49R, V60I, K102Q, K104Q, V111I, V118C, K122P, I135V, T165I, I167IV, E169D, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200E, K201R, I202V, E203K, Q207E, L210Y, R211Q, D218E, H221Y E204L 
C1-1066-AGBE C1-1066-AGBE Unknown Unknown D67N, K70R, M184V, L210W, T215E, K219Q A98G, V108I, Y181C E6A, T7P, K20R, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, K64H, T69N, K101Q, K102Q, K103R, K104Q, V111VI, V118C, K122P, I135V, I167V, E169D, Q174E, D177E, I178L, E194P, I195L, G196A, Q197E, T200R, K201R, I202V, E203Q, Q207D, R211Q, D218E V179Q, E204L 
C1-1912-MBEM C1-1912-MBEM Unknown Unknown M184V A98G, V179E, Y181C E6A, T7P, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, K102Q, K103R, V106I, V118C, K122P, I135V, E169D, Q174N, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200K, K201R, I202V, Q207E, L210Y, R211Q K126P, E204M 
C1-1922-DOTH C1-1922-DOTH Unknown Unknown  A98G, V179E, Y181C E6A, T7P, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, K102Q, K103R, K104Q, V118C, K122P, I135V, T165I, E169D, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200K, K201R, I202V, Q207E, L210Y, R211Q E204L 
C1-2265-BIPR C1-2265-BIPR Unknown Unknown  A98G, V179E E6A, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, K102Q, K104Q, V118C, I135V, I142V, E169D, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196A, Q197E, T200K, K201R, Q207E, L210Y E204L 
C1-251-NKPI C1-251-NKPI Unknown Unknown D67N, K70R, M184V, K219Q A98G, V179E, Y181C E6A, T7P, T27S, E28K, K32E, A33G, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, K102Q, V118C, K122P, I135V, E169D, Q174E, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200N, K201R, I202V, E204K, Q207E, L210Y, R211Q, D218E  
C1-973-ETEM C1-973-ETEM Unknown Unknown M184V, T215Y A98G, V179E, Y181C E6A, T7P, K11KT, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, S68SG, K102Q, K104Q, V111I, V118C, K122P, D123S, I135V, I142R, E169D, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200N, K201R, I202V, E204K, Q207E, L210Y, R211Q  
CM1070 CM1070 Unknown Unknown D67N, K70R, M184V A98G, V179E, Y181C E6A, T7P, T27S, E28K, K32E, V35T, E36EA, T39Q, K43Q, K49R, V60I, K102Q, K103KR, K104Q, V118C, K122P, I135V, I142R, E169D, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200K, K201R, I202V, Q207E E204L 
CM2080 CM2080 Unknown Unknown M184V A98G, V179E, Y181C E6D, K11Q, V21L, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, I50V, V60I, K102Q, K103R, K104Q, V118C, K122P, D123S, I135V, I142V, E169D, Q174E, D177E, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200K, K201R, I202V, Q207E, L210Y E204L 
HJ100 HJ100 Unknown Unknown  A98G, V179E, Y181C E6A, T7P, V21I, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, K102Q, K103R, K104Q, V118C, K122P, I135V, T165I, E169D, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200K, K201R, I202V, Q207E, L210Y, R211K E204M 
HJ1230 HJ1230 Unknown Unknown  A98G, V179E, Y181C E6A, T7P, V21L, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, I50V, V60I, K104Q, V118C, K122P, D123E, I135V, T165V, E169D, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200K, K201R, I202V, Q207E, L210Y, R211K E204L 
HJ1322 HJ1322 Unknown Unknown M184V A98G, V179E, Y181C, G190A E6A, T7P, V21I, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, I50V, V60I, K102Q, K103R, K104Q, V118C, K122P, D123A, I135V, E169D, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200K, K201R, I202V, Q207E, L210Y, R211X E204L 
HJ1357 HJ1357 Unknown Unknown  A98G, V179E E6A, T7P, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, K102Q, K104Q, V118C, K122P, D123DG, I135X, E169D, Q174E, D177E, E194P, I195L, G196V, Q197E, T200K, K201R, I202V, Q207E, L210Y, R211Q E204L 
HJ162 HJ162 Unknown Unknown  A98G, V179E, Y181C E6A, T7P, V21I, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, K102Q, K104Q, V118C, K122P, K126Q, I135V, I142V, T165I, E169D, Q174X, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200K, K201R, I202V, Q207E, L210Y, R211Q E204L 
HJ1977 HJ1977 Unknown Unknown D67G, K70R, M184V, T215I, K219E A98G, Y181C E6A, T7P, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, I50V, V60I, S68G, K102Q, K103KQ, K104Q, V118C, D121H, K122P, I135V, I142R, I167V, E169D, Q174D, D177E, I178L, V179T, D192DN, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200K, K201R, I202V, Q207E, L210Y, R211K E204L 
HJ2044 HJ2044 Unknown Unknown M41L, M184V, T215Y A98G, V179E, Y181C E6A, T7P, V21I, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, K101R, K102Q, K104Q, V118C, K122P, I135T, S162D, E169D, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200K, K201R, I202V, Q207E, L210Y Q145I, E204L 
HJ2656 HJ2656 Unknown Unknown  A98G, V179E, Y181C E6A, T7P, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, I50V, V60I, K104Q, V118C, K122P, D123E, I135V, T165I, E169D, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200K, K201X, I202V, Q207E, L210Y, R211K E204L 
HJ2734 HJ2734 Unknown Unknown M184V A98G, V108I, V179E, Y181C P4PL, E6A, T7P, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, D86E, K101Q, K102Q, K103R, K104Q, V118C, K122P, I135V, S162SN, T165X, E169D, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200N, K201R, I202V, E204K, R206*, Q207E, L210Y, R211Q  
HJ2764 HJ2764 Unknown Unknown D67N, K70R, M184V, T215I, K219Q A98G, V179E, Y181C E6A, T7P, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, K102Q, K104Q, V111I, V118C, K122P, I135V, I142R, E169D, Q174N, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200K, K201R, I202V, E203D, E204*, Q207E, L210Y, R211Q  
HJ367 HJ367 Unknown Unknown D67E, V75A A98G, V179E, Y181C E6A, T7P, V21I, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, V60I, S68G, K101R, K102Q, K104Q, V111I, V118C, K122P, D123N, I135V, S162D, S163A, K166R, E169D, R172RK, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200N, I202V, E204K, Q207E, L210Y, R211Q, D218E K73L, K82KT, P157A 
HJ736 HJ736 Unknown Unknown  A98G, V179E E6T, T7P, T27S, E28R, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, K102Q, K104Q, V118C, K122P, I135V, I142V, E169D, Q174D, D177E, E194P, I195L, Q197E, T200K, K201R, I202V, Q207E, L210Y, R211K E204L 
M1-024-FOEM M1-024-FOEM Unknown Unknown  A98G, V179E P4H, E6A, T7P, K20R, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, S68G, K102Q, K104Q, V118C, K122P, I135T, E169D, Q174D, D177E, I178V, E194P, I195L, G196A, Q197E, T200K, K201R, I202V, Q207E, L210Y, R211Q E204S 
M1-457-EDCY M1-457-EDCY Unknown Unknown M41L, M184V, T215Y A98G, V179E, Y181C, G190A E6A, T7P, K11Q, V21I, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, E44D, K49R, V60I, K102Q, K103R, K104Q, V111I, V118C, K122P, D123N, I135V, I167V, E169D, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200K, K201R, Q207E, L210Y, R211K E204L 
MR140 MR140 Unknown Unknown  A98G, V179E, Y181C E6A, T7P, V21I, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, K102Q, K104Q, V118C, K122P, I135V, T165I, E169D, Q174D, D177E, I178L, V189I, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200R, I202V, Q207E, L210Y, R211K E204M 
SK6078 SK6078 Unknown Unknown  A98G, V179E E6A, T7TP, T27S, E28R, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, K102Q, K104Q, V118C, K122P, I135V, I142V, E169D, Q174E, D177E, E194P, I195L, G196A, Q197E, T200K, K201R, I202V, Q207E, L210Y, R211Q E204L 
YD1396 YD1396 Unknown Unknown D67N, Y115F, M184V A98G, V179E E6A, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, K82R, K102Q, K104Q, V118C, I135V, I142V, E169D, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200K, Q207E E204L 
YD1431 YD1431 Unknown Unknown  A98G, V179E, Y181C E6A, T7P, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, K102Q, K104Q, V118C, K122P, D123N, I135T, E169D, Q174N, D177E, E194P, I195L, G196A, Q197E, T200K, I202V, Q207E, L210Y, R211Q E204S 
YD1447 YD1447 Unknown Unknown  A98G, V179E, Y181C E6A, T7P, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, K102Q, K104Q, V118C, K122P, D123S, I135V, E169D, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200K, K201R, I202V, Q207E, L210Y, R211Q D110N, E204L 
YD1517 YD1517 Unknown Unknown M41L, D67N, V75M, F77L, M184V, T215Y A98G, V179E, Y181C T7P, T27S, E28K, K32E, V35T, T39R, K43Q, E44A, K49R, V60I, T69N, K101R, K103R, V111I, V118C, I135V, S162D, S163T, I167V, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200K, K201R, I202V, E203V, Q207E, R211K K126P, N147ND, E204M 
YD1538 YD1538 Unknown Unknown M41L, V75T, M184V, T215F A98G, V179E, Y181G E6A, T7P, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, S68G, K101R, K102Q, K103R, K104Q, V111I, V118C, K122P, I132V, I135V, E138Q, S162D, S163T, T165V, K166R, E169D, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200R, K201R, I202V, Q207E, L210Y, R211K, D218E K20T, E204L 
YD207 YD207 Unknown Unknown D67N, T69D, K70R, M184V, K219Q A98G, V179E, Y181C E6T, T7P, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, K103R, K104Q, V106I, V118C, I135V, S163A, E169D, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200K, K201R, I202V, E203A, Q207E, L210Y K126P, E204L 
YD593 YD593 Unknown Unknown  A98G, V179E E6A, V8I, T27S, E28K, K32E, V35T, E36T, T39Q, K49R, V60I, K102Q, K104Q, V118C, K122X, I135V, E169D, Q174A, D177E, I178L, E194P, I195L, G196E, Q197E, T200K, K201KR, I202V, Q207E, L210Y, R211K D186DN, E204L 
YD603 YD603 Unknown Unknown  A98G, V179E, Y181C E6A, T7P, V21I, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, K49R, V60I, K102Q, K104Q, V118C, K122P, K126Q, I135V, I142V, T165I, E169D, Q174N, D177E, I178L, E194P, I195L, G196T, Q197E, T200K, K201R, I202V, Q207E, L210Y, R211Q E204L 
YD656 YD656 Unknown Unknown M41L, D67N, V75M, T215Y, K219E A98G, V108I, V179E, Y181C, G190A E6A, T27S, E28K, K32E, V35T, T39Q, K43Q, K49R, V60I, K102Q, K104Q, S117A, V118C, K122P, D123DE, I135V, S162D, S163R, E169D, Q174D, D177E, I178L, E194P, I195L, G196X, Q197E, T200K, K201R, E203K, Q207E, L210Y, R211Q, D218E, K223Q E44M, E204L 
YD966 YD966 Unknown Unknown  A98G, Y181C E6A, G15GE, T27S, E28K, K32E, V35T, E36A, T39Q, K43Q, G45GE, K49R, V60I, K102Q, K103R, K104Q, V118C, K122P, I135V, S163A, T165I, E169D, Q174X, D177E, I178L, V179X, E194T, I195L, Q197E, T200K, K201R, I202V, Q207E, L210Y, R211K E42EK, G51GE, E79EK, G196P, E204L