<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Vubil (2016)
Title Genetic Diversity and Transmitted Drug Resistance of HIV-1 Subtypes in Blood Donors Candidates in Northern Mozambique.
Citation J AIDS Clin Res
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 95
NumPts 95
Subtype C, A, D, G, B


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
NP001 NP001 None None   T39K, K49KR, V60I, D121Y, K122E, T139A, A158AS, D177E, I178M, V179VI, E194D, T200V, Q207E, R211K, V245E  
NP004 NP004 None None   T39E, S48T, K122E, D123G, I135T, E138A, S162C, K173A, D177G, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
NP008 NP008 None None   T39E, S48T, V60I, W88L, D121Y, K122E, I142V, S162T, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245K L80F 
NPL022 NPL022 None None   T39E, S48T, K122E, D123N, K173A, D177E, G196K, T200A, Q207K, R211A, V245N  
NPL023 NPL023 None None   V60I, K64R, K122KE, D123S, I135T, K173A, D177E, V179I, T200A, E203ED, Q207A, R211S  
NPL026 NPL026 None None   E40D, K49R, I50V, V60I, K122KR, I135T, S162D, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, F214L, V245E  
NPL028 NPL028 None None   T39E, S48T, K122E, D123N, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211K, V245K  
NPL030 NPL030 None None   T39E, S48T, K122E, D123N, K173T, Q174K, T200A, Q207E, V245Q  
NPL039 NPL039 None None   T39E, E40D, S48T, K122E, D123S, K173A, D177G, T200A, Q207E, V245T  
NPL041 NPL041 None None   T39E, S48E, K166R, D177E, I178M, T200A, R211K, P243T, V245Q  
NPL046 NPL046 None None   T39E, S48T, K122E, D123N, K173A, D177G, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
NPL047 NPL047 None None   T39K, S48T, K122E, K173A, D177G, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
NPL048 NPL048 None None   T39E, S48T, K122E, D123S, T165I, D177Q, G196E, T200A, I202V, Q207E, L210M, R211K, F214L, V245Q  
NPL051 NPL051 None None   T39R, V106I, D123S, Q145C, K173S, D177G, V179I, I202V, Q207A, R211S, F214L, V245Q  
NPL054 NPL054 None None   K49R, V60I, K122E, I135T, I142T, D177E, Q197P, Q207E, R211K, V245Q  
NPL057 NPL057 None None   T39E, S48T, K122E, I142V, K173I, T200A, Q207A, R211T, V245K  
NPL059 NPL059 None None   T39E, S48T, V60I, K122E, D123N, I135T, S162T, K173A, Q174K, D177E, T200A, E203D, Q207A, R211K, V245Q  
NPL065 NPL065 None None   T39E, S48T, V60I, I142T, K173T, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
NPL067 NPL067 None None   V60I, V106I, K122E, D123N, K173I, Q174K, V179I, T200A, Q207X, R211S, F214L, V245VM  
NPL070 NPL070 None None   T39G, V60I, K122E, D123G, D177E, V179I, E194D, T200I, Q207E, R211K, K238KR, I244IV, V245L  
NPL071 NPL071 None None   T39E, S48T, V60I, V118I, K122E, D123N, I135T, E138A, I167F, F171Y, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
NPL073 NPL073 None None   T39E, S48T, T107S, D123N, K173A, D177G, T200A, Q207E, R211K, V245H  
NPL077 NPL077 None None   T39E, S48T, K122E, D123N, I135V, I142V, S162C, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211M, V245Q  
NPL079 NPL079 None None   T39E, S48T, K122E, D123E, K173A, Q174K, D177E, G196T, T200A, I202V, R211K, V245Q  
NPL081 NPL081 None None   T39E, S48T, D123N, A158S, S162N, S163R, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, V245K  
NPL082 NPL082 None None   T39E, S48T, K122E, D123N, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207D, V245Q  
NPL085 NPL085 None None   T39D, K173A, Q174K, D177E, T200E, Q207E, E224D  
NPL087 NPL087 None None   T39E, S48T, K122E, D123S, K173V, D177N, T200A, Q207G, R211K, V245Q  
NPL088 NPL088 None None   E40D, V60I, K122E, I135T, K173S, Q174QK, D177E, V179I, E203X, Q207D, R211S, F214L, V245X  
NPL090 NPL090 None None   T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, I135R, K166R, K173A, D177E, I178M, T200A, Q207K, V245K  
NPL092 NPL092 None None   T39K, S48T, K122E, S162C, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
NPL093 NPL093 None None   T39E, S48T, K122E, D123N, K173T, D177E, T200A, Q207A, V245Q  
NPL095 NPL095 None None   T39E, E40D, S48T, K122E, K173A, D177G, T200A, Q207A, V245Q  
NPL096 NPL096 None None   T39E, S48T, K122E, D123G, K173V, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245K  
NPL097 NPL097 None None   T39E, S48T, K122E, D123N, K173T, D177E, I178L, T200A, Q207N, P243A, V245Q  
NPL099 NPL099 None None   T39E, S48T, K122E, D123S, K173A, D177G, Q207E, R211K, V245Q  
NPL100 NPL100 None None   T39E, S48T, V118I, K122Q, K173T, G196M, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q E53N 
NPL105 NPL105 None None   T39E, S48T, D121Y, K122E, D123G, T139L, K173A, D177E, G196K, T200A, Q207N, R211K, V245K  
NPL106 NPL106 None None   T39E, E40D, S48T, D123N, D177N, T200E, I202V, Q207G, R211K, F214L, V245L  
NPL109 NPL109 None None   T39E, E40D, S48T, K122E, K166R, K173T, T200A, Q207K, R211K, V245K  
NPL111 NPL111 None None   T39E, S48T, K122E, D123N, Q145C, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
NPL112 NPL112 None None   T39E, S48T, V60I, D123E, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
NPL116 NPL116 None None   T39E, S48T, K122E, D123N, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
NPL117 NPL117 None None   T39E, S48T, K122E, D123S, I142T, K173A, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q  
NPL119 NPL119 None None   T39E, E40D, K122E, D123N, A158S, K173T, Q174R, T200A, Q207E, R211K, F214L  
NPL120 NPL120 None None   T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, K173A, D177E, T200A, R211K, V245Q  
NPL122 NPL122 None None   T39A, S48T, K122E, D123S, T139A, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
NPL123 NPL123 None None   V60I, K122E, D123S, K166R, Q174H, D177H, G196E, T200A, I202V, Q207K, R211K, F214L, V245Q  
NPL126 NPL126 None None   T39E, K43R, S48T, W88C, K122E, D123N, K166R, K173A, Q174K, D177E, T200V, I202V, Q207A, R211Q, F214L, V245Q  
NPL127 NPL127 None None   T39E, S48T, K122E, S162C, K173A, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
NPL130 NPL130 None None   T39E, S48T, K122E, D123G, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
NPL131 NPL131 None None   T39E, S48T, V60I, S68G, K122E, D123G, I135T, K173T, T200A, Q207K, V245M  
NPL138 NPL138 None None   T39D, S48T, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, G196T, T200A, I202V, R211K, P225S, V245Q G141R 
NPL140 NPL140 None None   T39D, S48T, K122E, E138A, K173A, D177G, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
NPL143 NPL143 None None   V60I, K122E, I135T, K173S, D177E, V179I, I202IV, Q207A, R211RS, F214L, V245M  
NPL146 NPL146 None None   T39E, S48T, E53D, V60I, K122E, D123E, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
NPL147 NPL147 None None   T39E, K122E, I142V, A158S, K173A, D177E, L193F, Q197K, T200A, Q207A, F214L, V245K  
NPL153 NPL153 None None   T39E, S48T, E53D, K122E, D123S, I135R, K173A, Q174K, D177E, G196K, T200A, Q207E, V245Q  
NPL156 NPL156 None None   T39E, A98S, K173A, Q174K, I195L, T200A, Q207R, V245Q  
NPL160 NPL160 None None   T39E, E40D, S48T, V118I, D123N, E138A, T139A, K166R, K173I, Q174K, P176S, T200A, R211K, F214L, V245Q  
NPL163 NPL163 None None   T39E, S48T, V60I, K122E, D123N, I135V, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
NPL165 NPL165 None None   T39K, S48T, K122E, D123G, K173V, D177E, T200A, Q207E, V245R  
NPL166 NPL166 None None   T39E, S48T, V60I, K122E, D123N, I142V, K173A, Q174K, D177E, Q207N, R211K, V245K  
NPL170 NPL170 None None   T39E, S48T, K122E, D123N, E138A, K173I, Q174K, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
NPL172 NPL172 None None   T39E, S48T, K122E, D123N, K173A, D177E, G196K, T200A, I202V, Q207E, V245K  
NPL174 NPL174 None None   T39E, S48T, K122E, D123H, K173T, Q174R, D177E, T200E, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
NPL176 NPL176 None None   T39E, S48T, K122E, I135R, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, P243A, V245Q  
NPL178 NPL178 None None   T39K, S48T, K104R, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245K  
NPL190 NPL190 None None  K101KE, G190GA V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207G, R211K, V245K  
NPL191 NPL191 None None   T39G, S48T, K122E, D123N, T165I, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
NPL192 NPL192 None None   T39E, S48T, K122E, K173V, T200A, Q207E, V245Q  
NPL197 NPL197 None None   T39E, E40D, S48T, K122E, S162Y, K173A, Q174H, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
NPL199 NPL199 None None   T39E, S48T, K122E, D123G, K166R, K173A, D177E, G196R, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q  
NPL200 NPL200 None None   T39K, E40ED, S48T, V60I, K122E, K173KR, D177E, T200A, Q207E, V245K  
NPL202 NPL202 None None   T39E, S48T, I142T, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207N, V245Q  
NPL206 NPL206 None None   T39E, S48T, K122E, D123G, K173V, D177E, T200A, E204K, Q207D, V245M  
NPL209 NPL209 None None   T39K, V60I, K122E, D123S, I135T, D177E, I178M, T200TA, Q207X, R211S  
NPL214 NPL214 None None   T39K, S48T, V60I, K122E, D123G, K173A, D177E, T200A, P243A, V245Q  
NPL216 NPL216 None None   T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, T200A, Q207K, R211T, V245R  
NPL235 NPL235 None None   T39R, S48T, K122E, D123S, T139I, K173A, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
NPL240 NPL240 None None  K101E T39K, S48T, V60I, K122E, D123S, E138A, S162C, K173A, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
NPL255 NPL255 None None   T39E, S48T, K122E, K173A, T200A, Q207A, V245Q  
NPL256 NPL256 None None   T39E, E40D, S48T, K122E, K173A, D177E, T200A, V245Q  
P001 P001 None None   V60I, A98AS, K122E, D123S, K173KR, Q174X, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207D, R211K, V245Q  
P002 P002 None None   V60I, K122E, I135T, K173L, Q174K, V179I, Q207A, R211S, F214L, V245K  
P003 P003 None None   S48T, V60I, K122E, D123N, K173T, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
P004 P004 None None   T39M, V60I, K122E, D123N, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K, V245Q  
P005 P005 None None K219KE  T39E, S48T, V118I, D123S, I135T, E138A, T139A, S162C, T165TI, K173A, Q174R, I178IL, T200A, K201R, Q207E, R211S, F214L, V245Q  
P008 P008 None None   T39E, S48T, K122E, D123S, E138A, T165I, K173A, Q174K, T200A, Q207N, R211K, V245K  
P013 P013 None None  K101H, G190A V60I, K122E, D123N, K173S, Q174A, V179I, Q207A, R211S, I244V, V245R  
P016 P016 None None  K103N T39E, S48T, K122E, D123S, K173A, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245I  
P019 P019 None None   T39E, S48T, V118I, D121E, K122E, D123S, E138A, K173I, Q174K, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
P023 P023 None None   V60I, K122E, I135T, K173L, Q174K, V179I, T200N, Q207A, R211S, F214L, V245E  
P027 P027 None None   T39A, V60I, K122E, D123G, I135T, S162SN, K173S, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211K, V245T  
P029 P029 None None   T39E, S48T, K122E, D123N, K166R, K173T, D177E, T200E, Q207E, R211K, V245Q