Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Hachiya (2017)
Title Trends in transmitted drug-resistant HIV-1 and demographic characteristics of newly diagnosed patients: Nationwide surveillance from 2013 to 2015 in Japan.
Citation Direct Genbank Submission
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 2134
NumPts 2132
Subtype B, CRF01_AE, CRF02_AG, C, CRF07_BC, A, G, B + C, F, CRF06_cpx, B + CRF01_AE, D, CRF55_01B, CRF24_BG, CRF11_cpx, CRF28_BF, B + G, CRF25_cpx

 
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Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 2134 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
A13-2010160 LC161640 None None   D123E, D177E, T200I, R211K  
A13-2010161 LC161641 None None   E6ED, K20R, T39TS, D123DE, I135V, S162C, K173Q, Q207QK, R211G, D250DE  
A13-2010162 LC161642 None None   K122E, I135T, D177E, Q207E, T240S  
A13-2010163 LC161643 None None   T39TA, V60I, I135T, I202V, R211Q, F214L  
A13-2010164 LC161644 None None   I5V, E6ED, V35I, D123E, I135L, S162C, I178M, G196E  
A13-2010165 LC161645 None None   P4PH, E6ED, V35I, K43KR, I135L, S162C, I178M, G196E, R211G  
A13-2010166 LC161646 None None  V179D V35I, S68G, K102Q, D123E, I135L, S162C, G196E, V241L  
A13-2010167 LC161647 None None   V35I, K102R, I135L, S162C, K173KE, I178IM, G196E, R211G, V245X  
A13-2010168 LC161648 None None   V35X, D123E, I135L, S162C, G196E, Q207R, R211K Y127F 
A13-2010169 LC161649 None None  V179E P9PS, V35I, D123E, I135L, S162C, D177G, G196E  
A13-2010170 LC161650 None None   V35I, K122E, I135T, T200X, I202IV, H208HY, R211K  
A13-2010171 LC161651 None None T215E  V35I, K104N, V106VI, K122E, I135L, S162C, E194Q, G196E, I202V, R211G, V245X  
A13-2010172 LC161652 None None   V35I, I135L, S162C, N175Y, G196E, R211G  
A13-2010173 LC161653 None None   E6D, V35I, D123E, I135L, S162C, D177E, G196E, T200TA  
A13-2010174 LC161654 None None   K122KE, T200TI, V245I  
A13-2010175 LC161655 None None   V35I, E36D, D123E, I135L, S162C, G196E  
A13-2010176 LC161656 None None  V179E V35I, D123E, I135L, S162C, G196E  
A13-2010177 LC161657 None None   K122KE, I135IT, K166KR, T200I  
A13-2010178 LC161658 None None A62V  I5V, V35M, I135T, S162C, I178L, V179I, T200I, I202V  
A13-2010179 LC161659 None None L210LW  E6D, V35VL, K122KE, I135T, S162C, T200TI, Q207QH, R211RG  
A13-2010180 LC161660 None None   E28EA, S68SN, K122E, I135T, T200X, I202IV, R211K, V245I  
A14-2010181 LC161661 None None   K22R, V35I, K101Q, K104KR, D123E, I135V, S162C, E169D, D177E, V179I, G196E, T200TI  
A14-2010182 LC161662 None None  K101E A98S, D123E, I135R, T165I, Q174R, V179T, Q207D, R211K  
A14-2010183 LC161663 None None   E6D, V35I, D123E, I135L, S162C, G196E, L210M  
A14-2010184 LC161664 None None   E6ED, V35I, K103KR, I135L, S162C, I178M, G196E, R211RG  
A14-2010185 LC161665 None None   K20R, I135V, S162C, K173Q, Q207X, R211G  
A14-2010186 LC161666 None None  V179D V35I, S68G, D123E, I135L, S162C, G196E, R211G, V241L  
A14-2010187 LC161667 None None   K11KR, K122E, I135V, T200TI, V245I  
A14-2010188 LC161668 None None   V35I, K103R, K122KR, D123E, I135L, S162C, D177E, I178IL, G196E, T200A  
A14-2010189 LC161669 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V106VI, K122KE, I135T, S162C, K173A, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211N, K238R, V245Q  
A14-2010190 LC161670 None None T215L  V35I, K122E, I135L, S162C, I178M, E194EQ, G196E  
A14-2010191 LC161671 None None   I5V, E6D, K20R, V118I, K122KE, D123DE, I135T, E138A, T200TI, I202V, H208HY, R211K, F214L, D237N  
A14-2010214 LC161672 None None  V179D V35I, K122KE, D123E, I135L, S162C, G196E, Q197QK  
A14-2010215 LC161673 None None   I5V, V35M, I135T, S162C, I178L, V179I, G196E, I202V, E204G I47IV 
A14-2010216 LC161674 None None   V35I, E36ED, T39TS, K122KE, D123E, I135L, S162C, G196E, H208HY, R211RK  
A14-2010217 LC161675 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, V245E  
A14-2010218 LC161676 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K104R, D121Y, K122E, R211K, V245Q, E248V, K249Q  
A14-2010219 LC161677 None None  V179D E6D, V35I, S68G, D123E, I135V, S162C, G196E, R211G, V241L  
A14-2010220 LC161678 None None   V35I, D123E, I135L, S162C, D177DG, G196E, R211G  
A14-2010221 LC161679 None None   V35I, T69TA, K122KE, D123E, I135L, S162C, G196E, V245M  
A15-2010200 LC161680 None None   V35I, I135T, G196E, Q207R, R211K, F214L, V245M  
A15-2010201 LC161681 None None  K103N K20R, T69TN, A98S, V118I, K122KE, I135R, S162C, K173E, V179I, T200A  
A15-2010202 LC161682 None None   E6D, V35I, D123E, I135L, S162C, I178IV, G196E, T200A, Q207E, T240S, V245E, D250DE  
A15-2010203 LC161683 None None   I5V, V35M, I135T, S162C, I178L, V179I, G196E, I202V  
A15-2010204 LC161684 None None   I5V, V35M, I135T, S162C, I178L, V179I, G196E, I202V, E204EG  
A15-2010205 LC161685 None None   V35I, T69TA, K122KE, D123E, I135L, S162C, V179VA, I180V, G196E, T200TA, R211G  
A15-2010206 LC161686 None None  V179E V35I, D123E, I135L, S162C, D177G, G196E  
A15-2010207 LC161687 None None   E6D, K11T, V35T, K64KR, K122KE, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, V245E, V254VI, I257IV  
A15-2010208 LC161688 None None  V179E V35I, K104R, K122P, D123DE, I135L, S162C, D177E, G196E, Q207K, R211S  
A15-2010209 LC161689 None None   V35L, I50IV, R83RK, K102KR, K103R, K122KE, D123E, I135R, S162C, D177E, G196E, T200TA, Q207E, R211K, D237N, V245VI  
A15-2010210 LC161690 None None   E6ED, V35VI, K122E, I135X, D177E, I178X, G196E  
A15-2010211 LC161691 None None  V179D K20R, V35I, D123E, I135L, S162C, G196E  
A15-2010212 LC161692 None None  V179E V35I, D123E, I135L, S162C, G196E  
A15-2010213 LC161693 None None   E40ED, D123E, I135T, K173E, Q174K, V179I, G196E, I202V, Q207E, R211K  
A15-2010214 LC161694 None None   V35I, T39TI, K49KR, D123E, I135L, S162C, G196E, R211G  
A15-2010215 LC161695 None None   V35I, D123E, I135L, S162C, G196E, R211G  
A15-2010216 LC161696 None None   V35I, D123E, I135L, S162C, G196E, R211G  
A15-2010217 LC161697 None None  V179D V35I, S68G, D123E, I135L, S162C, G196E, T200TA, R211G  
A15-2010218 LC161698 None None   K20R, V35I, V60I, I135L, S162C, E194D, I195L, G196E, T200A, E204D, R211G  
A15-2010219 LC161699 None None   I50IV, K122E, S162C, I178L, E203D, R211K  
A15-2010220 LC161700 None None   V35I, I135L, S162C, I178IM, G196E, Q207X, R211RG  
A15-2010221 LC161701 None None  V179D V35I, S68G, D123E, I135L, S162C, G196E, R211G, V241L  
A15-2010222 LC161702 None None  V179E V35I, D123E, I135L, S162C, D177G, G196E, I202IV  
A15-2010223 LC161703 None None   E28K, K32E, D123E, I135T, S162C, K173KR, D177DE, I178IL, V179VI, T200X  
A15-2010224 LC161704 None None   K122E, D123E, I135T, E138A, T200TA, R211K, V245K  
A15-2010225 LC161705 None None   V35I, D121Y, K122E, I135L, S162C, Q174K, P176S, G196E, R211G  
A15-2010226 LC161706 None None  V179E V8I, V35I, D123E, I135L, S162C, G196E, Q207QR, R211RG  
B14-5110103 LC161716 None None   K122KE, I135T, G196E, I202V, L210LF, R211G  
B14-5110105 LC161718 None None  V179E E6D, K20R, T69TS, E79D, K102R, D123E, I135V, S162C, D177E, T200A, R211K  
B14-5110106 LC161719 None None   E6ED, V60I, S68G, V90I, D123E, I135T, I178M, T200A  
B14-5110107 LC161720 None None   E6D, V35T, K122E, D123N, I135L, S162C, G196E, R211G  
B14-5110108 LC161721 None None   V35VI, D123E, I135T, K173E, D177E, Q207X  
B14-5110109 LC161722 None None   K11KR, K20R, D123DE, I135T  
B14-5110110 LC161723 None None   E6D, V35I, K49KQ, D123E, I135L, S162C, P176S, G196E, T200TI K20K*, K32K* 
B14-5110111 LC161724 None None   V35T, T39L, A98S, D123E, I135V, A158S, S162A, K173A, Q174N, D177E, I178V, T200A, Q207E, R211K  
B14-5110112 LC161725 None None   E6EG, K49R, I50V, R83K, K103KR, K122E, D123DN, T200TA  
B14-5110113 LC161726 None None   E6D, V35I, D123E, I135L, S162C, D177E, G196E, R211K  
B14-5110114 LC161727 None None   E6D, V35I, V106I, V118VI, D123E, I135L, S162C, G196E, T200I, R211G  
B14-5110115 LC161728 None None   V35I, D123E, I135L, S162C, I178IM, G196E, E203D  
B15-5110116 LC161729 None None   E6D, V8VI, K11A, V35T, T39K, K43E, V60I, K104KN, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178V, T200I, Q207A, R211S, K238R  
B15-5110117 LC161730 None None   V35VL, T39A, K101Q, V106I, D123E, I135R, S162C, D177E, G196E, Q207E, D237N  
B15-5110118 LC161731 None None  V179D V60I, S68G, D123E, I135T, G196E  
B15-5110119 LC161732 None None   K20R, K122E, I135T, I195IT, I202V, R211K  
B15-5110120 LC161733 None None  V108VI E6D, V35I, T39S, T69TA, K122P, D123DE, I135L, S162C, D177E, G196E, I202IV  
B15-5110121 LC161734 None None   E6ED, D121H, K122E, I135V, S162C, D177E, R211T  
B15-5110122 LC161735 None None   K22KR, V35I, T39S, D123E, I135L, S162C, Q174QK, G196E, L228LH  
B15-5110123 LC161736 None None   V35I, T39S, D123E, I135L, S162C, G196E, E204EG  
C10-000710058419 LC161744 None None  V179E S68G, K102Q, K122E, I178L, T200A, I202V, Q242X, P243X, I244X, V245X, L246X, P247X, E248X, K249X, D250X, S251X, W252X, T253X, V254X, N255X, D256X, I257X, Q258X, K259X, L260X, V261X, A272P, K277R, L283I, R284K, T286A, A288S, L295F  
C12-000710695869 LC161746 None None   V35I, I135L, S162C, E194Q, G196E, Q207E, Q242X, P243X, I244X, V245X, L246X, P247X, E248X, K249X, D250X, S251X, W252X, T253X, V254X, N255X, D256X, I257X, Q258X, K259X, L260X, V261X, A272P, K277R  
C12-00077198884 LC161745 None None   K20R, V35I, V118I, K122E, I135T, T165I, Q207E, F214L, Q242X, P243X, I244X, V245X, L246X, P247X, E248X, K249X, D250X, S251X, W252X, T253X, V254X, N255X, D256X, I257X, Q258X, K259X, L260X, V261X, L283I  
C12-00078834059 LC161747 None None   V35I, K64R, K101Q, K122E, I135V, S162C, G196E, R211K, Q242X, P243X, I244X, V245X, L246X, P247X, E248X, K249X, D250X, S251X, W252X, T253X, V254X, N255X, D256X, I257X, Q258X, K259X, L260X, V261X, A272P, K277R  
C13-000710639349 LC161749 None None T215E  V35I, D123E, I135L, S162C, I178M, G196E, L210F, R211K, Q242X, P243X, I244X, V245X, L246X, P247X, E248X, K249X, D250X, S251X, W252X, T253X, V254X, N255X, D256X, I257X, Q258X, K259X, L260X, V261X, A272P  
C13-000710805346 LC161737 None None   K11R, V35I, K103R, K104R, D123E, I135L, S162C, G196E, T200I, Q207H, R211K  
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