<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Verhofstede (2017)
Title Decision tree for accurate infection timing in individuals newly diagnosed with HIV-1 infection.
Citation BMC Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 539
NumPts 539
Subtype B, CRF02_AG, F, A, C, CRF01_AE, G, D, CRF06_cpx, B + C, CRF25_cpx, B + CRF01_AE, CRF09_cpx, A + G

 

  Page 1 of 6    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 539 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
3071 3071 None None   K49R, V60VI, K122E, K166R, K173X, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211K  
3078 3078 None None   K122E, D123N, I135T, A158S, T200A, E204D  
3084 3084 None None   K43E, S68G, T69N, K122E, D123S, I142IT, Q174N, D177E, I178X, V179I, G196GE, Q207A, R211RS, K238R  
3086 3086 None None   A98S, K122E, D123S, A158S, T165I, K173A, Q174K, G196E, T200A, Q207E  
3087 3087 None None   K49R, D123E, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, G196E, Q207K, R211A G45R 
3090 3090 None None   K49R, D123E, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, Q207D, R211A  
3107 3107 None None   V60I, I135R, S162A, K173T, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L  
3114 3114 None None   V60VI, S68SG, D123E, I132IV, I135IV, K166KR, D177E, Q207QE, L210LF, R211K  
3122 3122 None None   S68SG, I135T, E169N, G196E  
3134 3134 None None   S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, E138A, D177E, I178IM, T200E, R211K, F214FL  
3138 3138 None None   K49R, K122R, D123E, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, Q207E, R211A  
3147 3147 None None   D123E, S162A, Q207E, R211K  
3155 3155 None None   D123E, I132V, I135V, S163SC, T165TI, D177E, Q207E, L210F, R211K  
3159 3159 None None   S68G, T69TA, V90I, K104KR, K122E, A158S, K173A, Q174R, D177E, V179I, Q207A, R211S  
3161 3161 None None   K49R, D123E, I135L, T139TA, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, Q207D, R211A, E224ED  
3164 3164 None None   K49R, K104KR, D123E, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, Q207E, R211A  
3170 3170 None None   K82R, I142V, S162C, I178L, V179I, T200A, Q207G, R211K  
3178 3178 None None   K101KR, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K  
3183 3183 None None   K49R, D123E, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, Q207D, R211A  
3189 3189 None None   K101R, I178IL, G196E, T200A, F214L  
3196 3196 None None   S68G, V90I, K122E, A158S, K173A, Q174K, D177E, V179X, Q207A, R211S  
3197 3197 None None   V60VI, R83RK, K104KN, D121DH, K122E, E138A, K166KR, D177E, T200A, I202V, R211K  
3199 3199 None None   K122E, D123DE, K173Q, D177E, G196E, R211K  
3211 3211 None None   S48T, K104R, K122E, I135T, K173A, Q174K, D177E, I178M, E194ED, T200A, Q207E, R211K  
3212 3212 None None   K49R, D123E, I135L, S162C, E169D, K173X, Q174K, D177E, I178L, G196E, Q207K, R211A  
3216 3216 None None   S48T, K122E, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207D, R211RK  
3228 3228 None None   D123E, I142V, D177E, I178X, T200A, Q207E  
3245 3245 None None   K64R, K103R, D123E, S162C, T200I, R211K  
3248 3248 None None   V60I, K103R, D123E, I135V, S162A, Q174E, D177E, T200A, Q207G, R211K, F214L  
3249 3249 None None   I135V, S162C, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
3260 3260 None None   K49R, D123E, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, Q207D, R211A  
3264 3264 None None   I135V, I142V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200E, E203Q, Q207D, R211K  
3267 3267 None None   D123E, T139K, S162C, I178M, G196E, E204D, R211K  
3281 3281 None None   I135T, S162C, T200I, R211Q  
3282 3282 None None   V106I, K122KE, D123N, S162C  
3285 3285 None None   S68G, D123E, I135T, S162A, D177E, R211K, L228F  
3287 3287 None None   K49R, D123E, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, Q207X, R211T  
3295 3295 None None   A98S, I178M, G196GE, T200A, R211Q  
3297 3297 None None  K103N A98S, D123E, I135IV, I142IT, D177G, T200A, R211K L187LF 
3302 3302 None None   K49R, D123E, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, Q207D, R211A  
3303 3303 None None   V60I, K103R, D123E, I135V, S162A, Q174E, D177E, T200A, Q207G, R211K, F214L  
3311 3311 None None   A98S, I142T, Q207E  
3312 3312 None None   S68SG, R83K, K122P, S162C, P176PS, I178L, T200A, R211K  
3315 3315 None None   K64R, K103R, S162C, R211K  
3316 3316 None None K70KT  I50V, A98S, I135T, Q174K, I202V, Q207E, R211K  
3323 3323 None None   V60I, K103R, K122R, D123E, I135V, S162A, Q174E, D177E, T200A, Q207G, R211K, F214L  
3324 3324 None None   I142V, E169D, R172K, G196E  
3331 3331 None None   K43E, K64KR, S68G, V90I, D123E, I142V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211S  
3335 3335 None None   K43KR, K49R, I135L, S162C, E169D, K173X, Q174K, D177E, I178L, Q207E, R211A  
3344 3344 None None   V60I, S68G, V90I, K102Q, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174X, D177E, T200A, Q207QK, R211K  
3346 3346 None None   K49R, R83K, I135T  
3352 3352 None None   K43E, K64KR, S68G, V90I, D123E, I142V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211S  
3354 3354 None None   K49R, I50V, V106I, K122E, D123E, I135T, S162C, T165I, D177E, I178V, T200A, I202V, E204K, Q207E, R211K  
3359 3359 None None T215D  V60I, S68G, R83K, V90I, A98S, K122P, I135L, S162X, D177E, T200I, R211K  
3369 3369 None None   D123E, T139K, S162C, I178M, G196E, E204D, R211K  
3371 3371 None None   G45E, K49R, D123E, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211A  
3372 3372 None None   K82KR, W88WC, K122KE, D123DE, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195L, T200A, E203D, E204D, Q207A, R211K E53A 
3377 3377 None None   D123E, T139K, S162C, I178M, G196E, E204D, R211K  
3379 3379 None None D67N, K70R, M184V, K219Q K101E, Y181C, G190A, P225H K46KQ, V60I, T69N, K103KR, D121C, K122E, I135T, E169D, K173A, Q174K, D177E, V179VI, G196E, T200X, K201X, Q207A, R211S  
3382 3382 None None   V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
3384 3384 None None   D123E, T139K, S162C, I178M, G196E, E204D, R211K  
3389 3389 None None   K43KE, K49R, I135V, S162C, F171Y, G196E, T200A, I202V, R211G  
3390 3390 None None   K49R, V60I, D123E, I135T, I159V, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, R211K  
3392 3392 None None M41L  V60I, E169G, K173E, R211K, L228Q  
3394 3394 None None   V60I, K122E, D123N, S162C, E169D, D177E, I178M, Q207E  
3399 3399 None None   A98S, Q207E, R211K  
3413 3413 None None   S68G, T107S, D121C, K122E, I135T, T139A, S162A, T200A, Q207A, R211K  
3415 3415 None None   K49R, V60I, K122E, D123S, T139K, S162C, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207D  
3417 3417 None None   V60I, K122E, D123X, I135T, K173X, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, F214L  
3419 3419 None None   S48E, V60I, V90VI, D121H, I142IT, K173S, Q174K, D177DE, I178L, V179I, T200A, Q207X, R211RK  
3420 3420 None None   D121Y, K122E, S162C, G196E, R211K  
3426 3426 None None   I135T, S162C, E169D, D177E, Q207E, R211K  
3430 3430 None None  Y188L K43E, V60I, K122E, D123X, I135V, T139A, I142V, S162H, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200L, Q207S, R211RK, F214FL  
3439 3439 None None   K104R, S162A, K173T, D177E, T200A, I202V, Q207K, R211K, F214L  
3441 3441 None None   V60I, K104R, K122KQ, D123DE, T165I, Q174E, I178IM, T200A, I202IV, Q207A, R211K  
3443 3443 None None   I135R, S162A, K173T, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L  
3448 3448 None None   K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142V, S162A, E169D, D177E, T200A, Q207E N81NK 
4187 4187 None None   S48T, V60I, D123E, I142V, T165I, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211RK  
5302 5302 None None   R83K, D123E, I142V, K166R, D177E, I178M, R211K  
5303 5303 None None   A98S, D123E, I135T, D177E, T200E, R211K  
5304 5304 None None   A98S, K102KR, E138A, D177DG, G196GE, Q207X, R211K  
5305 5305 None None   K104N, K122E, I142V, S162C, T200I, Q207QR, R211RK  
5306 5306 None None K70KR, M184MV  Q207X  
5307 5307 None None   A98AS, K122X, D123DE, E138EA, I142IT, S162C, D177DE, I202V, H208HY, R211RK  
5308 5308 None None   V60I, A98S, I135T, I178M, R211K  
5309 5309 None None   V60I, R83K, V90I, K122P, I135V, I142V, S162C, D177E, T200A, Q207K, R211A  
5312 5312 None None   V60I, V90I, K122E, D123S, I135X, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
5313 5313 None None   V60I, K173X, Q174K, D177E, T200V, Q207E, R211K  
5314 5314 None None   V60I, R83K, V90I, K122P, I135V, I142V, S162C, D177E, T200A, Q207K, R211A  
5316 5316 None None   K122E, D123S, I135T, K173E, Q207L, R211K  
5317 5317 None None   D86E, V118I, D123E, R211K, F214L  
5318 5318 None None   K122Q, I142V, S162A, G196E, Q207QH, L210LS, R211G  
5319 5319 None None   K122A, I135V, S162A, K173A, D177E, I178M, T200A, Q207E, F214L  
5320 5320 None None   K166KR, F171Y, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
5321 5321 None None   K43E, R83K, K122E, D123S, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200TA, Q207A, R211S  
5322 5322 None None  A98G, V179D S48T, K122E, D123N, K173T, D177E, T200A, I202V, Q207E, F214L, W229X  
5323 5323 None None   K122E, D123E, I135X, Q174R, D177E, I202V, Q207E  
5325 5325 None None   K102Q, D123E, I135R, S162C, K173T, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K  
5326 5326 None None   V60I, K122E, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
5327 5327 None None   V60I, D121H, K122E, D123DG, D177E, T200A, R211K