<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Nanfack (2017)
Title Multimethod Longitudinal HIV Drug Resistance Analysis in Antiretroviral-Therapy-Naive Patients.
Citation J Clin Microbiol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 61
NumPts 61
Subtype CRF02_AG, F, A + G, A, G, B, CRF18_cpx, D, CRF11_cpx

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
MDC007_1_Sanger MDC007_1_Sanger None None D67N, M184V  K122E, D123S, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
MDC041_1_Sanger MDC041_1_Sanger None None   K122E, D123E, I135V, I142V, S162A, F171Y, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207G, R211K, E224D  
MDC042_1_Sanger MDC042_1_Sanger None None   D123E, I135V, E169D, K173A, Q174K, N175Y, G196E, T200A, E203Q, Q207D, R211K  
MDC043_1_Sanger MDC043_1_Sanger None None   V90I, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, R211K  
MDC044_1_Sanger MDC044_1_Sanger None None   K122E, D123S, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
MDC058_1_Sanger MDC058_1_Sanger None None M184V, T215F A98G, Y181C S68G, V90I, K122V, D123N, I135V, T139R, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
MDC065_1_Sanger MDC065_1_Sanger None None   V106I, V118I, D123N, I142V, K173S, Q174K, I178L, T200A, Q207A, R211S, F214L  
MDC068_1_Sanger MDC068_1_Sanger None None   K173V, Q174K, D177E, Q207E, R211K  
MDC071_1_Sanger MDC071_1_Sanger None None   V60I, I142V, K173T, D177E, T200A, Q207D, R211K  
MDC076_1_Sanger MDC076_1_Sanger None None   K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K  
MDC078_1_Sanger MDC078_1_Sanger None None   V60I, K122E, D123S, I135V, S162A, K173M, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
MDC080_1_Sanger MDC080_1_Sanger None None   V60I, K122E, D123S, S162C, E169D, K173R, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K  
MDC083_1_Sanger MDC083_1_Sanger None None   V60I, K102E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
MDC090_1_Sanger MDC090_1_Sanger None None   V60I, D121Y, K122E, D123G, I135T, S162A, K173M, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N  
MDC091_1_Sanger MDC091_1_Sanger None None M184V K103N V90I, K101Q, D123E, I135V, T139K, A158S, S162A, K173T, Q174K, T200A, Q207N, R211K  
MDC091_2_Sanger MDC091_2_Sanger None None M184V K103N V90I, D123E, I135V, T139K, A158S, S162A, K173T, Q174K, T200A, Q207N, R211K  
MDC092_1_Sanger MDC092_1_Sanger None None   V60I, D123E, I135T, S162C, R172K, D177E, I178L, V179I, T200A, Q207A, R211K, F214L Q182S 
MDC093_1_Sanger MDC093_1_Sanger None None   V90I, K122R, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207N, R211K  
MDC094_1_Sanger MDC094_1_Sanger None None D67V  S68G, D123E, I135V, E169D, K173A, Q174K, N175Y, G196E, T200A, E203Q, Q207D, R211K K73N 
MDC098_1_Sanger MDC098_1_Sanger None None   K102Q, K122E, D123S, S162A, K173T, Q174N, D177E, Q197E, T200A, E204Q, Q207E, R211K, F214L K220S 
MDC098_5_Sanger MDC098_5_Sanger None None  Y181C K122E, D123S, S162A, K173T, Q174S, D177E, Q197E, T200A, E204Q, Q207E, R211K, F214L  
MDC100_1_Sanger MDC100_1_Sanger None None   K122E, D123S, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200E, E204Q, Q207G, R211K, F214L  
MDC109_1_Sanger MDC109_1_Sanger None None   S68G, V90I, K122E, I135V, K173A, Q174E, D177G, I178M, T200A, Q207G, R211K  
MDC119_1_Sanger MDC119_1_Sanger None None   K122E, D123N, S162A, K173T, Q174D, D177E, G196K, T200A, Q207E, R211K  
MDC123_1_Sanger MDC123_1_Sanger None None   K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
MDC124_1_Sanger MDC124_1_Sanger None None   V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, Q207E, R211K  
MDC126_1_Sanger MDC126_1_Sanger None None   V118I, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, F214L  
MDC127_1_Sanger MDC127_1_Sanger None None   I135V, I142V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200V, Q207A, R211K  
MDC128_1_Sanger MDC128_1_Sanger None None   V60I, K122E, K173T, Q174K, D177E, I178M, E194D, T200A, Q207E, F214L  
MDC129_1_Sanger MDC129_1_Sanger None None   D123E, I135V, K173V, Q174K, D177E, Q207E  
MDC146_1_Sanger MDC146_1_Sanger None None   V60I, D121H, K122E, D123S, A158S, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
MDC150_1_Sanger MDC150_1_Sanger None None   D123E, I135V, S162A, K173A, Q174N, P176Q, D177E, T200A, Q207E  
MDC151_1_Sanger MDC151_1_Sanger None None   V60I, I135L, I142V, S162A, K173I, Q174N, D177E, T200A, Q207E, R211K  
MDC156_1_Sanger MDC156_1_Sanger None None   V60I, D121H, K122E, I142T, S162C, D177E, T200A, Q207A, R211K  
MDC158_1_Sanger MDC158_1_Sanger None None   V90I, I135V, S162A, K173S, D177E, V179I, Q207D  
MDC162_1_Sanger MDC162_1_Sanger None None   K104R, D123E, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200E, I202V, Q207K  
MDC163_1_Sanger MDC163_1_Sanger None None   F87L, K122E, D123N, K173T, Q174R, D177E, T200E, I202V, Q207K, R211K  
MDC166_1_Sanger MDC166_1_Sanger None None  K103N D123E, I135V, S162A, K173T, Q174A, D177E, T200A, Q207E, R211K K73R 
MDC167_1_Sanger MDC167_1_Sanger None None   K122P, I135V, I142V, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, F214L  
MDC169_1_Sanger MDC169_1_Sanger None None   S162A, K173T, Q174K, D177E, I195L, T200A, Q207A, R211K, F214L  
MDC180_1_Sanger MDC180_1_Sanger None None   K122E, D123S, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, Q207E  
MDC181_1_Sanger MDC181_1_Sanger None None   V60I, D123E, F171Y, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
MDC183_1_Sanger MDC183_1_Sanger None None   S162A, K173T, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, F214L  
MDC189_1_Sanger MDC189_1_Sanger None None   K122E, D123S, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, L210M  
MDC194_1_Sanger MDC194_1_Sanger None None   T69S, K104R, K122E, D123S, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
MDC195_1_Sanger MDC195_1_Sanger None None   V60I, K104R, D121H, K122E, D123G, I135T, I142V, D177E, G196E, T200A, Q207A, R211T  
MDC196_1_Sanger MDC196_1_Sanger None None   V60I, D123E, F124L, I135L, S162T, K173V, Q174K, D177E, Q207E  
MDC197_1_Sanger MDC197_1_Sanger None None   D123E, I135V, K173V, Q174K, D177E, Q207E  
MDC199_1_Sanger MDC199_1_Sanger None None   D123E, K173A, Q174K, D177E, I202V, Q207E  
MDC201_1_Sanger MDC201_1_Sanger None None   K122E, D123G, S162A, K173T, Q174K, D177E, Q197K, T200A, I202V, Q207D, R211K, F214L R78S 
MDC203_1_Sanger MDC203_1_Sanger None None   A158S, S162A, K166Q, E169D, K173T, Q174K, D177E, T200E, E203Q, Q207E, F214L  
MDC217_1_Sanger MDC217_1_Sanger None None   D121H, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, G196E, T200A, E204V, Q207A, R211K  
MDC218_1_Sanger MDC218_1_Sanger None None   D123E, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207G, R211K, F214L  
MDC220_1_Sanger MDC220_1_Sanger None None   K104R, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
MDC225_1_Sanger MDC225_1_Sanger None None   V60I, I135T, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207E, R211K  
MDC226_1_Sanger MDC226_1_Sanger None None   K102Q, K122E, D123N, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178M, V189I, T200A, Q207G, E224D  
MDC230_1_Sanger MDC230_1_Sanger None None   K122E, D123S, I135T, I142V, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
MDC231_1_Sanger MDC231_1_Sanger None None   K122Q, I135V, I142V, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207E  
MDC246_1_Sanger MDC246_1_Sanger None None  K103N V60I, K104R, D123N, I135T, I142V, T165I, K173A, D177E, D192N, Q197P, T200A, Q207A, R211K  
MDC246_2_Sanger MDC246_2_Sanger None None   V60I, K101Q, K104R, K122E, D123N, I135T, T165I, K173A, Q174K, D177E, I178L, D192N, Q197P, T200A, Q207A, R211K  
MDC246_6_Sanger MDC246_6_Sanger None None   V60I, K104R, K122E, D123N, I135T, T165I, K173A, Q174K, D177E, I178L, D192N, Q197P, T200A, Q207A, R211K