<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Boerma (2016)
Title High levels of pre-treatment HIV drug resistance and treatment failure in Nigerian children.
Citation J Int AIDS Soc
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 90
NumPts 90
Subtype CRF02_AG, G, A, C, F, J, CRF01_AE, CRF11_cpx, CRF06_cpx


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
CP107100001 CP107100001 None None  K103N, E138K V35T, S48T, V60I, K101Q, K104R, V118I, D121H, K122E, I135T, T139A, K173A, Q174K, D177E, I178V, T200A, I202V, Q207G, R211K, F214L  
CP107100003 CP107100003 None None   E6Q, T7A, V35T, K122E, D123S, A158S, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, F214L  
CP107100004 CP107100004 None None  K101P, K103N K20R, V21I, V35T, T39L, V60I, K173T, D177E, Q197K, T200Q, I202V, Q207G, R211K  
CP107100005 CP107100005 None None   V35T, T39A, E40D, E53D, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
CP107100006 CP107100006 None None D67N, K70R, M184V, T215Y, K219E K101E, G190A V35T, T39S, E40D, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
CP107100009 CP107100009 None None   V35T, T39N, D121H, K122E, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
CP107100012 CP107100012 None None   V35T, E36D, T39A, E40D, K49R, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207G, R211K  
CP107100018 CP107100018 None None   V35T, V60I, K122E, F171L, R172G, K173T, Q174K, I178M, G196E, T200A, Q207E, R211K T165R, L168S 
CP107100019 CP107100019 None None   V35T, E36D, K49R, E53D, K122E, I135V, S162A, T165I, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
CP107100020 CP107100020 None None   E6D, V35T, K122E, K173S, D177E, T200E, Q207E, R211K  
CP107100021 CP107100021 None None   V35T, T39K, K43E, K49R, I50V, V60I, T69N, K122E, D123S  
CP107100022 CP107100022 None None   V8I, V35T, T39A, E40D, V60I, D121Y, K122E, I135L, K173T, Q174K, D177E, T200E, Q207E, R211K  
CP107100025 CP107100025 None None   E6N, V35T, W88S, K122E, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
CP107100026 CP107100026 None None   V35T, V60I, I135V, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211S  
CP107100027 CP107100027 None None   V35K, E36D, V60I, S68G, K122E, D123E, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, Q197L, T200A, Q207E, R211K  
CP107100028 CP107100028 None None   V35T, K49R, V90I, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, V189I, T200A, Q207E, R211K  
CP107100029 CP107100029 None None   V35T, T39K, K43E, K122N, D123N, I142V, S162Y, K173S, D177E, I178L, V179I, T200A, Q207A, R211K  
CP107100030 CP107100030 None None   V21I, V35T, T39A, V60I, T69N, K104R, D121H, K122E, T165I, Q174R, D177E, T200E, I202V, Q207D, R211K  
CP107100031 CP107100031 None None   V35T, E36D, K43N, K49R, D123E, I135V, S162A, E169Q, F171FL, Q174E, D177E, T200A, Q207E  
CP107100033 CP107100033 None None   V35T, D123E, I135V, S162A, E169G, F171L, R172G, K173T, Q174K, D177E, I178V, T200A, I202V, Q207E L168A 
CP107100037 CP107100037 None None   V35T, T39A, E40D, E53D, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
CP107100038 CP107100038 None None   I5V, V35T, T39A, T69N, K122E, D123S, I142V, S162C, K173T, Q174N, D177E, T200E, I202V, Q207K, R211S  
CP107100039 CP107100039 None None   V35T, K49R, V90I, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, V189I, T200A, Q207E, R211K  
CP107100041 CP107100041 None None   K20R, V35T, T39L, V60I, K122E, F171Y, K173A, Q174K, D177E, Q207E, R211K  
CP107100042 CP107100042 None None   K22R, V35T, T39A, K64R, I135V, S162A, T165I, E169G, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
CP107100044 CP107100044 None None   K11T, V35T, T39M, K49R, K122E, D123N, E138G, I142V, F171Y, K173T, Q174N, D177E, I178M, T200A, Q207E  
CP107100045 CP107100045 None None   K20R, V35T, E36D, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178V, G196E, T200A, E203A, Q207D  
CP107100047 CP107100047 None None   P4S, V35T, E36D, T39A, V60I, S68G, V90I, K122E, I135V, I142IT, S162A, E169G, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211K  
CP107100050 CP107100050 None None   V35T, E36D, T39M, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, R211H  
CP107100051 CP107100051 None None   V35T, V60I, A98AS, K104R, K122E, D123S, D177E, I178M, T200A, E204EK, Q207D, R211K L168LS 
CP107100052 CP107100052 None None   V35T, V60VI, K122E, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K  
CP107100053 CP107100053 None None   V35T, V60I, K104R, K122E, D123S, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207D, R211K L168V 
CP107100057 CP107100057 None None   V35T, V60I, K173T, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207D, R211K  
CP107100058 CP107100058 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I142T, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
CP107100061 CP107100061 None None   V21I, V35I, V60I, D121H, K122E, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K  
CP107100062 CP107100062 None None  K103N P4T, V35T, K122P, D123G, I135R, S162A, K173T, Q174R, D177E, Q207E, R211K  
CP107100064 CP107100064 None None  Y181C V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, S162A, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178M, V179M, T200A, Q207E, R211K  
CP107100069 CP107100069 None None   V35T, E36A, T39K, K43E, V90I, S162A, K173T, Q174K, T200A, R211K  
CP107100070 CP107100070 None None   K20R, K104R, D121H, K122E, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
CP107100075 CP107100075 None None   V35T, T39M, S48T, S162A, K173T, Q174K, T200A, Q207E  
CP107100077 CP107100077 None None   V35T, K122E, D123N, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
CP107100079 CP107100079 None None   V35T, E36D, V60I, I135V, E138A, S162A, K173A, Q174K, T200A, Q207K, R211K  
CP107100080 CP107100080 None None   V35T, T39V, K49R, E53D, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, I202V, Q207N, R211K  
CP107100084 CP107100084 None None   V35T, T39A, E53D, K102Q, I135V, S162A, K173V, Q174N, D177E, T200A, I202V, Q207K, R211N  
CP107100085 CP107100085 None None   V35K, E36D, D123E, I135V, S162A, E169EG, K173N, Q174R, D177E, I178V, G196E, T200A, I202V, Q207E, R211K  
CP107100087 CP107100087 None None  Y181C V35T, K49R, V60I, K122E, I135T, S162A, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178M, V179M, T200A, Q207E, R211K  
CP107100089 CP107100089 None None   K20R, V35T, E40D, V60I, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K Q197M 
CP107100091 CP107100091 None None M184MI  T7P, K11T, V35T, E36A, T39K, K43E, V60I, K64R, D121H, I135T, I142V, F171Y, K173S, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211K, F214L Q23Q*, K73E 
CP107100092 CP107100092 None None   V35T, T39L, V60I, K104R, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
CP107100099 CP107100099 None None   V35T, K122P, D123E, I135T, S162C, K173A, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207E  
CP107100100 CP107100100 None None   E6D, K11T, V35T, D123E, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207N, R211K  
CP107100105 CP107100105 None None   V35T, E36D, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207E, E224D P59PA 
CP107100106 CP107100106 None None   V21I, V35T, K49R, K122E, D123G, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E E169L 
CP107100107 CP107100107 None None   V35T, E36D, K49R, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211Q  
CP107100108 CP107100108 None None   V35T, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
CP107100110 CP107100110 None None   K102Q, I135V, S162A, K173V, Q174N, D177E, T200A, I202V, Q207K, R211N N136K 
CP107100111 CP107100111 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123S, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207N, R211K  
CP107100112 CP107100112 None None   E28A, V35T, E36D, T39V, V60I, I135V, S162A, Q174G, D177E, T200A, Q207E, R211K  
CP107100116 CP107100116 None None   V21I, V35T, T39A, E40D, V60I, K104R, D121H, K122E, I135T, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K  
CP107100118 CP107100118 None None   V21I, V35T, T39A, E40D, V60I, K104R, D121H, K122E, I135T, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K  
CP107100119 CP107100119 None None   V35T, K122E, D123S, S162A, K173T, Q174K, D177DG, T200A, Q207D, R211K  
CP107100121 CP107100121 None None   E6N, V35T, W88S, K122E, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
CP107100123 CP107100123 None None   V35T, E36D, K49R, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211Q  
CP107100125 CP107100125 None None   V35T, T39L, K102R, D121Y, K122E, S162A, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K  
CP107100130 CP107100130 None None   V35T, E36D, K49R, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207K, R211Q  
CP107100133 CP107100133 None None K219N Y181C V35T, T39K, E40D, D121H, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K, F214L  
CP107100135 CP107100135 None None   K20R, V35T, T39L, V60I, K122E, D123N, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E G15R 
CP107100140 CP107100140 None None   V35T, T39A, V60I, I135V, I142V, S162A, F171Y, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211K  
CP107100181 CP107100181 None None   V35T, E36A, T39E, K122E, D123N, I142T, A158S, K173A, D177E, I178L, T200A, Q207G, R211K  
CP107100182 CP107100182 None None  V179E V35T, E36D, V60I, S68G, K122R, D123E, I135V, E138A, S162A, K173D, Q174K, D177G, Q197L, Q207D, R211K  
CP107100183 CP107100183 None None   V21I, V35T, T39E, V60I, W88C, K122E, D123N, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200V, I202V, R211K  
CP107100184 CP107100184 None None M184V K101E, G190S V35T, T39M, W88C, K122E, D123N, I135T, E138A, S162C, K173A, Q174K, N175H, D177E, I178V, T200A, K201R, E203K, Q207D  
CP107100188 CP107100188 None None   E6D, V8I, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123N, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207T, R211K  
CP107100190 CP107100190 None None M184V G190A K20R, V35T, E40D, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S Q197M 
CP107100191 CP107100191 None None   K11S, V35T, T39X, K43R, V106I, D121H, K122E, I135T, K173S, D177E, T200I, I202V, Q207K, R211N  
CP107100194 CP107100194 None None M184V K101E, G190S V35T, T39M, V60I, W88C, K122E, D123N, I135T, E138A, S162C, K173A, Q174K, N175H, D177E, I178V, G196E, T200A, K201R, E203K, Q207D  
CP107100197 CP107100197 None None   K20R, V35T, E36D, T39S, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, V189I, G196V, T200A, Q207K, L210M, F214L  
CP107100202 CP107100202 None None   V35T, E36D, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207D  
CP107100203 CP107100203 None None   V35T, V60I, K122E, I135T, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
CP107100206 CP107100206 None None   V35T, V60I, K122E, I135T, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
CP107100207 CP107100207 None None  G190A E28K, K32E, V35T, E36D, T39A, K122E, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, F214L  
CP107100213 CP107100213 None None M184V Y181C, G190A V21I, V35T, T39K, K43E, K49R, I50V, V60I, K122E, D123S, T139K, S162N, K173T, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E, E224D  
CP107100214 CP107100214 None None   V35T, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200E, Q207T, R211K  
CP107100215 CP107100215 None None   V35T, T39L, V60I, T69A, I135L, S162A, K173T, Q174X, D177E, V179I, I180V, T200A, Q207E, R211K  
CP107100221 CP107100221 None None   V21I, V35I, V60I, K64R, D121H, K122E, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K  
CP107100222 CP107100222 None None D67N, M184V K103N, V106A T7TA, V35T, V60I, K104R, K122E, D123S, I135L, I142L, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207D, R211K  
CP107100226 CP107100226 None None  K101E, G190A K20R, V35K, V60I, K122E, D123N, S162C, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K  
CP107100227 CP107100227 None None   K11X, V35T, E36ED, T39M, E40ED, K49R, K122E, D123N, E138G, I142V, F171Y, K173T, Q174N, D177E, I178M, T200A, Q207E  
CP107100237 CP107100237 None None   V35T, E40D, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200E, Q207T, R211K  
CP107100240 CP107100240 None None   V35M, K43Q, S68T, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178L, G196E, T200A, Q207E, R211K