<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Ghafari (2017)
Title Prevalence of HIV-1 transmitted drug resistance in recently infected, treatment-nave persons in the Southwest of Iran, 2014-2015.
Citation Arch Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 52
NumPts 52
Subtype CRF35_AD


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
IR.AHV10P IR.AHV10P None None  K101KE, K103KN, G190GA E6D, V8I, K32R, V35T, T39M, V60I, D121Y, K122E, I135X, E169ED, Q174H, D177E, V179I, Q207A, R211K  
IR.AHV11P IR.AHV11P None None  K103N V35T, T39TA, K43R, V60VI, K101Q, D121Y, K122E, I135K, K166R, D177E, I178L, V179I, T200I, Q207A, R211K  
IR.AHV12P IR.AHV12P None None   E6D, V8I, K20R, V35T, T39K, V60I, D121Y, K122E, I135R, Q174N, D177E, V179I, Q207A, R211K  
IR.AHV14P IR.AHV14P None None   V35T, V60I, K101R, K166R, D177E, V179I, T200M, Q207A, R211K  
IR.AHV15P IR.AHV15P None None   E6D, K11R, V21I, V35T, T39M, V60I, K101R, V106VI, D121Y, K122E, I135R, D177E, I178L, V179I, Q207A, R211K  
IR.AHV16P IR.AHV16P None None   E6D, V8VI, K11R, V35I, V60I, D121Y, K122E, I135M, S162X, D177E, V179I, T200X, Q207A, R211K  
IR.AHV17P IR.AHV17P None None   V35T, V60I, K122E, I135R, Q174H, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K  
IR.AHV18P IR.AHV18P None None   E6D, K11R, V35T, K43R, V60I, K101R, I135T, I142T, S162A, D177E, T200I, Q207D, R211K  
IR.AHV19P IR.AHV19P None None   E6D, V35T, T39L, V60I, K104R, K122E, I135X, S162Y, Q174H, D177E, V179I, T200I, I202V, Q207A, R211K  
IR.AHV1P IR.AHV1P None None   E6D, K11KR, K32KE, V35X, K49R, V60I, S68T, V118VI, I135R, K173KR, D177E, I178L, V179I, T200I, Q207A, R211K  
IR.AHV20P IR.AHV20P None None   E6D, K11R, V35T, T39M, V60I, K122E, I135R, Q174H, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K  
IR.AHV21P IR.AHV21P None None   E6D, V8I, K11R, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135R, Q174H, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K  
IR.AHV22P IR.AHV22P None None   E6D, V35T, T39A, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142T, D177E, T200A, Q207A, R211K  
IR.AHV23P IR.AHV23P None None   E6D, V8I, V35T, T39L, V60I, D121Y, K122E, I135R, K166R, Q174H, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K  
IR.AHV24P IR.AHV24P None None   E6D, V35T, E36A, V60I, D121Y, K122E, D177E, V179I, Q207D, R211K  
IR.AHV25P IR.AHV25P None None   E6D, V8I, K11R, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135R, Q174H, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K  
IR.AHV26P IR.AHV26P None None   E6D, K11M, V35T, T39E, V60I, D121Y, K122E, I135R, D177E, I178M, V179I, V189I, T200I, I202V, Q207A, R211K  
IR.AHV28P IR.AHV28P None None   E6D, V35T, T39TA, E40D, V60I, I135R, Q174H, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211K  
IR.AHV29P IR.AHV29P None None   E6D, K11R, V35T, T39L, V60I, K122E, I135T, D177E, V179I, Q207A, R211K K13R 
IR.AHV2P IR.AHV2P None None   E6D, V8I, K11R, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135T, D177E, I178IM, V179I, T200I, Q207A, R211K  
IR.AHV30P IR.AHV30P None None   V35T, V60I, K122E, Q207A, R211K  
IR.AHV31P IR.AHV31P None None   E6D, K11R, V21I, V35T, T39M, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178L, V179I, Q207A, R211K  
IR.AHV32P IR.AHV32P None None   E6D, V35T, V60I, D121Y, K122E, K173N, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K P225A 
IR.AHV33P IR.AHV33P None None   E6D, V8I, K32R, V35T, T39M, V60I, D121Y, K122E, I135R, Q174H, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K  
IR.AHV34P IR.AHV34P None None   K20R, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135R, Q174H, D177E, V179I, T200TI, Q207A, R211K  
IR.AHV35P IR.AHV35P None None   E6D, V8I, K11KR, V35T, V60I, K101R, D121Y, K122E, I135T, D177E, I178L, V179I, T200I, Q207A, R211K  
IR.AHV37P IR.AHV37P None None   E6D, V21I, K22R, V35T, T39A, V60I, D121Y, K122E, I135L, E138A, T139I, I142V, D177E, Q207D, R211K  
IR.AHV38P IR.AHV38P None None   E6D, K11KR, V35T, T39A, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142X, Q174H, V179I, Q207A, R211K  
IR.AHV39P IR.AHV39P None None   E6D, E28D, V35T, T39S, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162N, Q174H, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K  
IR.AHV3P IR.AHV3P None None   V35T, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142V, R172K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K  
IR.AHV40P IR.AHV40P None None   E6D, K11KR, V35T, T39K, V60I, K101Q, K122E, I135R, K166KR, Q174H, D177E, V179I, G196E, T200R, Q207A, R211K  
IR.AHV41P IR.AHV41P None None   E6D, K20R, V35T, T39I, V60I, D121H, K122E, D123E, A158S, T165I, Q174H, D177E, V179I, Q207A, R211K  
IR.AHV42P IR.AHV42P None None   E6D, V8I, T27TS, V35T, T39M, V60I, D121Y, K122E, D123G, T165I, D177E, T200I, Q207A, R211K  
IR.AHV46P IR.AHV46P None None   E6D, K11R, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135T, V179I, T200I, Q207A, R211K  
IR.AHV48P IR.AHV48P None None   E6D, V35T, V60I, S68G, K122E, I135T, E138A, V179I, T200I, Q207A, R211K  
IR.AHV49P IR.AHV49P None None   E6D, K11R, K20R, V35T, V60I, D123E, D177E, V179I, T200L, Q207A, R211K  
IR.AHV4P IR.AHV4P None None   E6D, V8I, K11R, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135T, N175Y, D177E, I178L, V179I, T200I, Q207A, R211K I167T 
IR.AHV50P IR.AHV50P None None   E6D, V35T, V60I, D121Y, K122E, D123E, I159IV, Q207A, R211K  
IR.AHV51P IR.AHV51P None None   E6D, V8I, V35T, V60I, K64R, D121DY, K122KE, I135R, K166KR, D177E, T200I, Q207A, R211K W24R 
IR.AHV52P IR.AHV52P None None   E6D, K11R, V21VI, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162N, D177E, I178L, V179I, G196GR, T200TI, Q207A, R211K  
IR.AHV53P IR.AHV53P None None   E6ED, V35T, K43Q, K49R, V60I, K122E, D123E, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211K  
IR.AHV54P IR.AHV54P None None   E6D, V35T, V60I, D121Y, K122E, V179I, Q207A, R211K  
IR.AHV55P IR.AHV55P None None   E6D, V8I, V35T, V60I, K122V, K166KR, Q174H, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K  
IR.AHV56P IR.AHV56P None None   E6D, K11R, V21I, V35T, T39M, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178L, V179I, Q207A, R211K  
IR.AHV57P IR.AHV57P None None   E6D, K11R, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135M, D177E, V179S, T200M, Q207A, R211K  
IR.AHV58P IR.AHV58P None None   E6D, V21I, V35T, T39L, V60I, D121DY, K122E, S162A, Q174QH, D177DE, T200TA, Q207A, R211K  
IR.AHV5P IR.AHV5P None None   I5IV, E6D, V8I, K11R, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135T, D177E, I178L, V179I, T200I, Q207A, R211K  
IR.AHV60P IR.AHV60P None None   E6D, V35T, V60I, K101R, D121H, K122E, I135T, I142V, S162H, K166R, D177G, T200I, Q207A, R211K  
IR.AHV61P IR.AHV61P None None   E6D, V35T, V60I, K122KE, D123E, D177E, V179I, T200TI, Q207A, R211K  
IR.AHV6P IR.AHV6P None None   E6D, V21VI, V35T, K49R, V60I, K122E, I135R, S162C, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K  
IR.AHV7P IR.AHV7P None None   E6D, K11R, V21I, V35T, T39M, V60I, K101R, V106I, D121Y, K122E, I135R, D177E, I178L, V179I, Q207A, R211K  
IR.AHV8P IR.AHV8P None None   V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K, K238R