Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Ariffin (2014)
Title Antiretroviral drug resistance and HIV-1 subtypes among treatment-naive prisoners in Kelantan, Malaysia.
Citation J Infect Dev Ctries
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 26
NumPts 26
Subtype B + CRF01_AE, CRF01_AE, B, CRF33_01B

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
MYKE413 MYKE413 None None   E6D, K11A, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, Q207A, L210F, R211S, K238R, V245E, D250E  
MYKE423 MYKE423 None None  K103N D121Y, K122E, I135V, S162C, D177E, I178L, T200I, F214L  
MYKE441 MYKE441 None None   V60I, K122E, D123S, I135R, K173T, Q174K, D177E, I180V, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245K  
MYKE443 MYKE443 None None   K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211N, K238R, V245K  
MYKE461 MYKE461 None None   T107S, K122E, D123S, I142L, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211N, K238R, V245K, K249Q  
MYKE463 MYKE463 None None   T107S, K122E, D123S, I142L, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211N, K238R, V245K  
MYKE483 MYKE483 None None   T107S, K122E, D123N, I135V, S162C, T200I, V245M  
MYKE493 MYKE493 None None  K103N, Y188L K20R, V35M, W88C, K122E, D123S, I159V, K173R, Q174K, D177E, G196E, K201T, Q207A, R211N, F214L, D237N, I244M  
MYKE501 MYKE501 None None   K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245N  
MYKE503 MYKE503 None None   V60I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245N  
MYKE511 MYKE511 None None   E6D, K11A, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I142V, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200I, Q207A, R211S, V245E, E248K  
MYKE513 MYKE513 None None   E6D, K11A, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I142V, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200I, Q207A, R211S, V245E, E248D  
MYKE521 MYKE521 None None   K32N, W88C, K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R  
MYKE523 MYKE523 None None   K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211T, K238R, V245E  
MYKE533 MYKE533 None None   K32N, W88C, K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MYKE561 MYKE561 None None   V60I, D121E, K122E, D123S, I135R, S162Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MYKEZ023 MYKEZ023 None None   V35M, K122E, D123S, S162C, Q174D, D177E, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MYKEZ033 MYKEZ033 None None   K104R, V106I, I135V, S162C, V179I  
MYKEZ043 MYKEZ043 None None   V35I, K49R, R83K, K122E, D123S, T165I, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211N, K238R, V245E  
MYKEZ063 MYKEZ063 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, W88C, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MYKEZ073 MYKEZ073 None None   D86E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211N, K238R, V245E  
MYKEZ083 MYKEZ083 None None   E6D, V35T, T39K, K101Q, I135V, S162C, R172K, K173Q, Q174K, D177E, Q207D  
MYKEZ093 MYKEZ093 None None M41L, L74I, M184V, T215Y K103N, Y181C V35T, T39K, K43E, V60I, T69N, R83K, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211E Q222H 
MYKEZ111 MYKEZ111 None None   I135V, S162C, V245K  
MYKEZ143 MYKEZ143 None None   K49R, V60I, L109I, K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, I178M, Q207D, R211K, K238R, V245E D76Y 
MYKEZ153 MYKEZ153 None None   V60I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, I178M, G196E, Q207A, R211S, V245E  

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