Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Castley (2016)
Title Longitudinal Trends in Western Australian HIV-1 Sequence Diversity and Viral Transmission Networks and Their Influence on Clinical Parameters: 2000-2014.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 1022
NumPts 1022
Subtype B, CRF01_AE, C, A, CRF02_AG, D, F, CRF12_BF, CRF59_01B, G, CRF35_AD, B + CRF01_AE, CRF33_01B, CRF44_BF, CRF07_BC, B + C


  Page 1 of 11    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 1022 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
P060102120 P060102120 None None   K20R, V21I, V35T, T39K, K43E, D121H, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, I178V, Q207A  
P060102152 P060102152 None None   V35T, T39L, K122KI, D123DE, I135V, S162A, E169DN, K173I, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207EG, R211K  
P060112981 P060112981 None None T215S  I31IV, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162C, D177E, Q207E, R211RG W153WG 
P060113247 P060113247 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, S105SL, K122E, D123GS, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211RK  
P060119628 P060119628 None None   V35T, T39G, S48T, V60I, K122E, D123S, I135V, E138A, I142V, A158AS, K173A, D177E, G196K, T200A, R211K  
P060124744 P060124744 None None   K122E, T200I, F214L  
P060148405 P060148405 None None M184V  K104N, K122E, D123S, K173KR, T200A  
P060156237 P060156237 None None   K32R, V35T, T39E, K122E, D123S, I135R, A158S, I159V, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
P060157961 P060157961 None None   V35T, E36D, T39K, K43E, K122E, D123S, K173M, Q174K, D177E, T200R, Q207A, R211S  
P060158455 P060158455 None None   V35T, K104N, K122E, I142V, K166R, T200A, I202V, Q207L, R211K  
P060175756 P060175756 None None   I135T, S162C, T200I, Q207E, R211K  
P060175991 P060175991 None None   R83K, K122E, S162C, T200A  
P060180458 P060180458 None None   V35T, V60VI, K122KE, D123DN, I142V, K166KR, T200A, I202V, Q207L, R211K W153W* 
P060189475 P060189475 None None   K104N, I142V, R172K, V179VI, I202V, R211K  
P060195567 P060195567 None None   V60I, R83K, K102Q, K122E, D123E, E138A, I142V, S162Y, G196E, T200I, R211G  
P060198959 P060198959 None None   K122E, D123E, T200I, F214FL  
P060203426 P060203426 None None A62V, M184MR, T215D  V35T, V60VI, K104N, K122E, D123NS, I135V, K166R  
P060203446 P060203446 None None  K103NS D123E, G196E, F214L  
P060203464 P060203464 None None   K32KN, V35T, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, Q207E  
P060213415 P060213415 None None   V35L, P55A, V60I, V118I, D123E, S134C, I135T, T139R, K173D, Q174K, D177E  
P060223164 P060223164 None None   V35T, T39R, K43E, V60I, S68G, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
P060228406 P060228406 None None   V35I, I142V, K166KR, T200A, I202V, Q207L, R211K Q222Q*EK 
P060230299 P060230299 None None A62V, T215D  V35T, K104N, K122E, D123S, I135V, K166R  
P060230389 P060230389 None None   V35T, V60I, I135IV, I142V, K166R, T200A, I202V, Q207L, R211K  
P060234715 P060234715 None None M41L, T215C  D123E, D177E, I178M, T200A, R211K  
P060239987 P060239987 None None   D123E, I135T, I180V  
P060240029 P060240029 None None   A98AS, D123DE, S162C, D177E, I178L, V179I, T200TKN, R211K  
P060241894 P060241894 None None M41L, M184V, L210W, T215Y L100I, K103N K122E, D123N, I135T, I178M, G196E, E203D  
P060243397 P060243397 None None   S48T, D123E, I135T, S162C, E169D, Q207E, L210M  
P060252196 P060252196 None None   A98S, K122E  
P060252222 P060252222 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211RK, F214L  
P060252225 P060252225 None None T215TA  V35PT, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, K166KR, K173AT, Q174QK, D177E, T200A, Q207A, R211RK, F214L I37IT 
P060261531 P060261531 None None   V35T, E36D, T39L, K122KE, S162A, K173T, Q174K, D177E, Q197K, T200A, Q207EGKR, R211K, F214FL  
P060262292 P060262292 None None   V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123N, K173M, Q174K, D177E, I178M, E194D, T200A, I202V, E204K, Q207A, R211S  
P060262477 P060262477 None None   V35T, K122E, I142V, K166KR, I195IM, T200A, I202V, Q207V, R211K  
P060262544 P060262544 None None   V35I, S68N, I135T, K166R, T200A, Q207E  
P060277745 P060277745 None None   V35I, K43N, R83K, D123E, P176S, G196E, Q197K, T200A, Q207E  
P060284958 P060284958 None None   V35T, T39EK, K43KE, S68SG, K122E, D123N, E138A, S162C, K173T, Q174KN, D177E, I178IM, V179I, V189VI, I202V, Q207N, R211S V111VIM 
P060289386 P060289386 None None  V179D V35T, I142V, K166KR, E169ED, K173KE, T200A, I202V, Q207IL, R211K  
P060289724 P060289724 None None   K122E, D123AT, I135T, I178M, Q207E, R211K  
P060292550 P060292550 None None   K49KR, K104KR, D123E, A158S, Q174QK, I178M, R211G  
P060295397 P060295397 None None   T107TS, D123E, S162SC, V189VI, T200TI, F214L  
P060297398 P060297398 None None   K122P, I135T, Q207E, R211K, F214L  
P060300854 P060300854 None None   K104R  
P060305989 P060305989 None None   R83K, K122E, D123DN, S162C, I178IM, Q197QK, T200AE, K201KR, R211RK  
P060306077 P060306077 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E  
P060306337 P060306337 None None   A98S, K122KE, D123E, T200A, R211K  
P060308191 P060308191 None None   V35T, T39K, K43E, R83K, K103R, K122E, D123S, R172K, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
P060308923 P060308923 None None   K122P, D123DEKN, I135T, Q207E, R211K, F214L  
P060311792 P060311792 None None   E42ED, D123E, T200I, F214L  
P060323454 P060323454 None None   E28K, K32E, V35T, V60I, R83K, V90I, V106I, T200I, R211G  
P060329284 P060329284 None None   K20R, E42ED, K104KR, D123DN, S162C, I178L, T200I, Q207E, R211K, F214L  
P060333764 P060333764 None None   V35T, K122KE, D123NT, I142V, K166R, T200A, I202V, Q207L, R211K  
P060340587 P060340587 None None   V60I, L100LV, D121H, K122E, I135T, E138EG, I142V, S162A, D177DG, T200A, Q207K, R211A R72RG, V111VG 
P060344001 P060344001 None None   V35T, K49R, V60I, D123E, D177E, T200I, Q207G, R211K  
P060350359 P060350359 None None V75VL  V35T, T39KR, K43E, K122E, D123GS, K173IT, Q174K, I178IM, E194EK, Q207A, R211S  
P060353720 P060353720 None None  V108I V35T, E36A, T39D, K49KR, V60I, D121H, K122E, I135T, K173AV, Q174K, D177E, I178L, V179I, T200A, Q207E, R211K  
P060360384 P060360384 None None  K103N V35IT, V60VI, V118VI, D123E, I135R, R211RK, F214L  
P060365793 P060365793 None None   I31X, V111I, K122IV, K166R, E169X, D177X, I178M, R199K, T200A, R211X, F214L K20KN, C38C*W 
P060365970 P060365970 None None   K20R, S105L, K122E, D123S, I135T, T200A, F214L  
P060369790 P060369790 None None M184V E138K V21I, V35T, T39E, E40D, S48T, K64R, K122E, K173A, T200A, Q207E, R211K  
P060371133 P060371133 None None   V60I, D123E, G196E, I202V, Q207N  
P061382652 P061382652 None None   T27S, V35T, T39E, S48T, E53D, K122E, D123NS, S162C, T165TA, K166KR, K173A, D177E, G196K, T200A, I202V, Q207AEKT, R211K P133PT 
P06252196L P06252196L None None   S68G, K122Q, I178L, V179I, Q207E, R211K Q23QH, G93GR 
P065056036 P065056036 None None   R83K, K102KR, G196E, E204K A98AP 
P068090393 P068090393 None None   V35I, I50V, R83K, V118I, K122E, D123E, I135T, I202V, R211K, F214L  
P068104833 P068104833 None None   V35I, I50IV, R83K, D123E, K173KR, I178L, Q207E, R211K  
P068127879 P068127879 None None   V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
P068152628 P068152628 None None   V35A, T39K, K43E, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, I202V, Q207D  
P070181695 P070181695 None None   K32R, V35T, T39E, K122E, D123S, I142IV, A158S, I159V, K173AT, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207E, R211RK  
P070185731 P070185731 None None   E53ED, D123E, I178IM  
P070190492 P070190492 None None   V35T, T39M, I142V, E169D, T200A, I202V, Q207L, R211K  
P070197698 P070197698 None None   V35I, P55PA, I142V, T200E, I202V, Q207L, R211K  
P070200662 P070200662 None None   V35T, T39K, E40EQ, K43E, T58TI, S68G, K122E, D123N, Y144YF, Q145QH, S162SN, K166R, R172RK, K173I, Q174K, I178M, G196E, E203EG, Q207A, R211S M41MK, G51GW, E53EV, P55PL, K64K*LM, R78R*, R143RK, N147NI, V148VL, P150PS, D177AEKT, Q182QP, Y183YS, D186DE, L187S 
P070208342 P070208342 None None   K20R, K104KN, K122KE, D123DEG, E169D, P170PS, R211M, F214FL L149LP 
P070220186 P070220186 None None   V21VI, V35T, K122E, I135R, I142V, A158S, K166R, T200A, I202V, Q207L, R211K  
P070223967 P070223967 None None   K20R, A98S, K101KR, K102R, K104R, I135V, S162A, K166KR, V179I, R211K  
P070234968 P070234968 None None A62V, K65R, M184V Y181C E169D, T200A, I202V, Q207A, R211K  
P070255847 P070255847 None None  K103N I31ILV, V35I, D123E, I135R, F214L  
P070273617 P070273617 None None D67N, K70R, M184V, K219Q K103N I50V, R83K, K122P, T139R, S162C, D177E, I178M, G196GE, T200A  
P070277400 P070277400 None None A62V  V35T, E40A, K102KR, K104N, K122E, D123S, I142IT, K166R  
P070278063 P070278063 None None K70KE  V35T, K122E, I142V, K166KR, T200A, I202V, Q207LV, R211K  
P070278163 P070278163 None None   V21VG, V35T, T39E, K122E, D123S, I135V, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S  
P070278221 P070278221 None None   V35T, T39E, K122E, D123S, I135V, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S  
P070283977 P070283977 None None   V35T, D123DE, I135R, I142V, T165TI, D177DEKN, I178IM, G196E, T200A, I202V, Q207L, R211K  
P070283987 P070283987 None None   V35T, K122E, I142V, K166R, G196E, T200A, I202V, Q207L, R211K  
P070284901 P070284901 None None  V179D V35T, T39K, K43E, K64KR, K102R, K104R, K122E, D123S, I135IT, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S  
P070301901 P070301901 None None   K49R, V106I, D123E, S162C, E169D, I195IKRT, T200A, E204ED, Q207E, R211K, E224D R72R*G, N81IM, K82K*EQ, R83E, I180IM 
P070307551 P070307551 None None   V35T, T39E, K122E, D123S, I135T, E169D, K173N, Q174K, D177E, I178M, E194D, T200I, Q207A, R211N, P225PL  
P070307630 P070307630 None None   S48E, T69NS, V118I, D123E, K166R, F214L  
P070307667 P070307667 None None   S68G, T69N, V106I, D123E, S162C, K173E, Q174R, P176PS, I178IM, R211Q  
P070312097 P070312097 None None   K32E, E36K, I135K, S162A, K173IT, Q174K, T200A, Q207A, R211K, F214L Q161Q* 
P070339546 P070339546 None None  K103N V35T, T39E, S48T, K102KR, K122E, D123E, I135T, R172RG, K173A, Q174QK, D177E, V189I, T200A, Q207E K22K*, D113DN 
P070340284 P070340284 None None   F116FS, K122E, S162C, R211RK R83RT, R143RI 
P070342280 P070342280 None None   D123DEKN, S162C, R211K  
P070346922 P070346922 None None   V35T, T39K, K43E, K102Q, K122E, D123NS, S162C, K173KR, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S  
P070350790 P070350790 None None M41ML, T215C  S68G, K122P, K166R, I178L, V179I, T200I, R211K  
P070352586 P070352586 None None   V35T, T39K, S68G, K122E, D123S, I135V, A158AS, T165I, R172RK, K173I, Q174K, D177E, I178LM, V179I, Q207A, R211S  
P070358008 P070358008 None None   A98S, K166KR, P176K, D177N, G196E, T200A, Q207QL, R211K  
P070358047 P070358047 None None   V35I, T107S, S162C, T165TA, E194K, G196E, Q207K, R211G Q23E, G152GR