Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Hattori (2016)
Title Characteristics of transmitted drug-resistant HIV-1 in recently infected treatment-naive patients in Japan.
Citation JAIDS
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 3090
NumPts 3090
Subtype B, CRF01_AE, C, CRF02_AG, A, F, G, CRF06_cpx, CRF07_BC, CRF10_CD, CRF33_01B, D, B + CRF01_AE


  Page 1 of 31    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 3090 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
15 15 None None K70R  K20R, V60I, K64R, T69N, D121H, K122E, D123E, I135T, I178M, T200I, R211K  
18 18 None None V75L  E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, E138A, I142V, K173I, Q174K, D177G, T200I, Q207A, R211S  
19 19 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123G, S162A, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E  
26 26 None None   W88C, I135V, K173E  
29 29 None None   E6EK, K11KQ, V35T, E36A, T39E, K122E, D123S, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
30 30 None None   V35I, I135L, S162C, G196E, Q207H, R211K  
32 32 None None  V179D E6D, K11T, V35T, T39K, K43AE, V106VI, G112A, K122E, D123S, S163ST, K166KR, K173I, Q174K, D177EG, T200I, I202V, Q207A, R211N  
34 34 None None  V179D E6D, K11T, P14PS, V35T, T39K, K43E, G112A, K122E, D123S, K166KR, K173I, Q174K, D177E, T200I, I202V, Q207A, R211NS  
37 37 None None   K166R, I178M, Q197E, R211K  
39 39 None None   V35I, I135L, S162C, G196E, Q207H, R211K  
40 40 None None   E6EDKN, V35T, V60I, W88C, K122E, D123NS, I135T, T139TS, K173S, Q174K, V179T, T200A, Q207E, R211K, F214L  
41 41 None None   V60VI, A98S, K122KE, I135T, T200A, R211RK  
45 45 None None   K20R, V35I, I135IV, Q207E, R211K  
457 457 None None L74LS V108VI V35I, T69TI, K103KR, Q174K, V179I, T200I, Q207D, R211K  
50 50 None None   V35T, K49R, D123E, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, Q207N, R211K  
51 51 None None   K103R, S105A, D123E, I135T, D177EG, V179VI, G196E, F214L  
55 55 None None   E6D, K11T, V35T, T39M, D123S, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
57 57 None None   V35I, R83K, K173KR, Q174QR, I178IM, V189VI, G196E, R211S  
582 582 None None  V179D K122E, I135V, K173N, Q207E  
584 584 None None   T200V, Q207A, R211K  
585 585 None None   E6D, K11AT, V35T, T39K, K43E, D121H, K122E, D123S, S162C, Q174EK, D177E, I180L, T200E, Q207A, R211S G18GR 
586 586 None None   V8I, E28A, I135T, R211K  
587 587 None None   D177E, T200I, Q207DN, R211K  
588 588 None None   V35T, T39E, E40D, S48T, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
589 589 None None   E6D, K20R, V35K, V60I, K122E, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q207E, R211K  
59 59 None None   E6D, V35T, T39K, K43A, K122E, D123S, S162C, T165I, K173T, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, R211S L92L* 
590 590 None None  V179D P4PS, V35I, K102R, I135L, T139A, A158AT, S162C, G196E, T200A  
592 592 None None   K20R, A98S, D123E, I135RT, E169D, I178L, G196E, T200I, R211K  
593 593 None None   E6D, V35I, D123E, I135L, S162C, G196E, T200I N175ND 
595 595 None None  V179E V35I, R83K, K102R, K104R, E138G, D177G, G196E, Q207V, R211K  
596 596 None None   K49R, R83K, I135IL, I142IV, G196E, L210LS, R211G  
598 598 None None   K122E, S134SN, I135T, T200I, I202IV  
60 60 None None   V35T, E40D, K49KR, V60I, K122E, D123S, I135IT, D177E, I178ILM, T200I, Q207G, R211K  
600 600 None None T215S  V35I, K122KE, I135L, S162C, E194EK, G196AE, I202IV, R211S  
602 602 None None   V35VA, D123E, K173KE, D177E, T200I, R211K  
603 603 None None  V179E V35I, R83K, K102R, K104R, D177G, G196E, Q207V, R211K  
604 604 None None   V35I, R83K, I135V, Q207K  
605 605 None None   E6D, S68G, K122E, I135R, I142L, G196E, T200I, Q207QK, R211G  
606 606 None None   I5V, V35T, K122E, D123E, I135T, S162C, K173Q, I178M, G196GE, E204Q, Q207E  
607 607 None None   G15E, V35T, D123E, S162C, I178M  
608 608 None None   D177E, T200I, Q207D, R211K  
609 609 None None   E6D, V35I, S68SG, D123E, T139IV, D177E, G196E, T200I, R211G  
61 61 None None   E6D, F214L  
610 610 None None   V35I, V60I, I135L, S162C, D177N, I178L, G196E, T200A, R211G  
611 611 None None T215E  V35I, D123E, I135L, S162C, D177E, G196E, T200A  
614 614 None None   V60I, S68SG, T69TN, D123E, I135T, I178M  
615 615 None None  V108I K11Q, K20R, D121H, K122E, I135V, S162C, P176S, G196E  
616 616 None None   V35I, V60I, I135L, S162C, D177N, I178L, G196E, T200A, R211G  
617 617 None None   K11KAET, V35I, K43KR, S68G, D121H, K122KE, I135T, S162C  
618 618 None None T215E  V35I, D123E, I135L, S162C, D177E, G196E, T200A  
619 619 None None   I5IV, V35I, A98S, K101R, I135V, S162C, D177DG, I178M  
620 620 None None   E6A, V8VI, V90VI, A98S, K122KE, I135T, I202V  
621 621 None None T215E  V35I, D123E, I135L, S162C, D177E, G196E, Q197QR, T200A  
622 622 None None   V35I, T39TA, R83RK, I135V, V179A, T200TI, R211G  
623 623 None None   E6EA, K122E, D123E, I178IM, E194A, F214L  
624 624 None None   K20R, V60I, D123DN, I135T, E169D, D177DE, G196E  
625 625 None None   V35M, V60I, I135L, S162C, G196E, T200A, R211G  
626 626 None None  V179DE P4PS, I5IV, E6ED, K11KR, V35T, A98S, K102KQ, D123E, S162C, I178L, R211K  
627 627 None None   E6D, V35I, D123E, I135L, S162C, G196E, T200I, R211K  
628 628 None None   D123E, D177E, T200I, Q207D, R211K  
629 629 None None   E6ED, V35IT, V60I, I135V, T139TA, I142IV, S162C, G196E, T200A, Q207K, R211G  
630 630 None None   I50V, V60I, S68G, G196E, T200I, R211G  
631 631 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, R83K, K122E, D123S, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
632 632 None None   V8I, I135T, E169D, T200I, R211K  
634 634 None None   P4PH, I5V, V35I, I135L, S162C, V179VA, G196E  
635 635 None None   V8I, K11KT, V35T, V60I, I135R, T200S, Q207E, R211K, F214L  
636 636 None None T215S  V35I, I135L, S162C, K173KQ, Q174QH, G196E, R211S  
637 637 None None T215D  V35I, D123E, I135L, S162C, F171Y, G196E, I202V, L210LF  
638 638 None None  V179VD K122E, I135V, K173N, Q207E, R211K  
639 639 None None   V35R, V60I, I135L, S162C, F171Y, G196E, T200A, R211G  
640 640 None None   V8I, V35I, V60I, D123DE, I135L, Q174QH, I178L, G196E, T200A K201IV 
641 641 None None   R83K, G196E, T200TA, I202IV, E204EK, L210LS, R211REGK  
642 642 None None  V179E V35I, R83K, K104R, A158AS, T165TI, D177DG, G196E, Q207V, R211K  
643 643 None None   E6EK, V35I, V60I, I135L, S162C, E194ED, G196E, T200A, E204K, R211G E42EK 
644 644 None None   V35I, I135L, S162C, G196E, R211K  
646 646 None None   V35I, D123E, I135L, T139TA, S162C, Q174QR, P176AT, G196E, Q207QHR, R211REGK  
647 647 None None   A98S, K122E, I135T, Q197E, T200TIM, R211K R78RK 
648 648 None None   E6D, V35I, D123E, I135L, S162C, G196E, T200I  
649 649 None None   K20R, V60I, T69TA, D123E, I135IT, D177E, Q207E, R211K  
651 651 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, A98S, K122E, D123S, I135M, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
652 652 None None   S68G, I135T, E138A, T165I, D192N, G196E, T200V, R211K  
653 653 None None   V35VAIT, A98S, I135T, E138A, I142IT, S162C, T165I, E169D, G196E, T200A, R211RK  
654 654 None None   E6D, V35T, V60I, D123E, I135L, S162C, I180L, G196E, T200A, Q207K  
655 655 None None T215DE  V35I, S68G, D123E, I135L, S162C, D177E, G196E, Q197QK, L210F, R211K  
656 656 None None M41L, L210W, T215D  S48T, A98S, K122E, D123NT, I135T, I178L, T200I  
657 657 None None   D177E, Q197QE, T200I, Q207D, R211K K30KE 
66 66 None None   E6D, K20KR, I31IL, V35IL, I135L, S162C, G196E, R211RG  
660 660 None None M41ML  V35I, I135L, S162C, V189VI, G196E  
661 661 None None   K122E, I135IV, K173N, I202V, Q207E, R211K  
662 662 None None   V35M, V60I, K102R, K122E, I135L, S162C, I178IM, G196E, T200A, R211G  
664 664 None None T215L  V35I, K103R, I135L, S162C, I178M, G196E  
665 665 None None  Y181YC E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68SG, K122E, D123S, I135L, R172K, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S S162SI 
666 666 None None   E6D, V35I, D123DE, I135L, S162C, N175NH, G196E, T200I  
667 667 None None  V179D P4PS, E6DN, V35I, S68G, D123E, I135X, G196E, R211G, F214L  
669 669 None None   V35I, V60I, S68G, F124FL, I135V, S162C, E169EG, G196E, R211G  
67 67 None None   E6ED, K11KT, V21VI, V35T, T39K, K43E, V60VI, D121DH, K122AE, D123S, I142IV, R172RK, K173I, Q174K, D177E, T200TA, Q207A, R211S  
670 670 None None   D123E, I135T, S162C, P170S, G196E  
69 69 None None   E6D, V8I, K20R, K122E, D123E, I135V, S162C, T200I  
70 70 None None   D123E, I135T, S162C, D177E, G196E, Q207E  
None None   K102R, V118I, D123E, I135T, D177E, T200TA, R211K, F214L