<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Kannangai (2015)
Title Frequency of transmitted drug resistance mutations among treatment-naive HIV-1-infected individuals at a tertiary care centre in South India.
Citation Mol Diagn Ther
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 127
NumPts 127
Subtype C

 

  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 127 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
101043 101043 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
101044 101044 None None   V35T, T39A, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211G, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
101050 101050 None None  G190A K11S, V35T, T39D, S48T, D121Y, K122E, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207K, R211K, V245Q, A272P, T286A, E291D, V292I, E297T  
101051 101051 None None   T27S, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, E169D, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, I293V  
101066 101066 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, S162A, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, P294S  
101198 101198 None None   V35T, T39D, S48E, V60I, D123E, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
101243 101243 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, K101Q, D121H, K122E, I135K, K173T, I178L, T200A, V245L, D250E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, E297A  
101253 101253 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173T, D177E, T200E, Q207R, V245Q, A272P, K275R, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294S  
101254 101254 None None   P14S, V21I, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K166R, K173T, D177E, T200E, Q207R, V245Q, A272Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294S  
101320 101320 None None   P14A, V35T, T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, K173A, D177E, I178M, T200E, E204K, Q207D, R211M, V245Q, A272P, E291D, V292I, I293V  
101334 101334 None None   V35M, E36A, T39S, S48T, V60I, K122A, I135M, S162H, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
101400 101400 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
101401 101401 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173A, D177E, G196R, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, P294Q  
10463 10463 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162D, K166R, K173A, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, V292I, I293V, E297A  
10473 10473 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, D121H, K122E, I142V, K173A, Q174K, D177E, Q197L, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272S, E291D, V292I, I293V  
10485 10485 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q, D250E, S251C, A272P, K277R, E291D, V292I  
10489 10489 None None   K20R, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123G, S162N, K166R, K173A, D177E, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
10508 10508 None None   V35T, T39E, S48T, E53D, V60I, D121H, K122E, I135R, S162H, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211G, V245Q, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
10566 10566 None None   K20R, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, S162H, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
10594 10594 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K281R, E291D, V292I, I293V  
10617 10617 None None   V8I, V35K, T39E, S48T, V60I, K122E, I135L, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
10672 10672 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K166R, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207N, V245Q, S251N, A272P, K275R, K281R, E291D, V292I, I293V, E297A  
11311 11311 None None   V35T, T39D, V60I, D121Y, K122E, I135R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, I293V, T296S, E297K  
11C1248 11C1248 None None  K101E V35T, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173E, T200A, Q207A, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
11C1405 11C1405 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, D86E, K122E, I135T, S162H, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245K, A272P, K277R, E291D, V292I  
11C1408 11C1408 None None   V35T, E36V, T39E, S48T, E53D, V60I, D121Y, K122E, I135K, S162H, K173T, Q174K, D177E, T200V, Q207E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
11C1439 11C1439 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, I135R, K166R, K173A, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P, K277R, T286A, I293V, E297K  
11C159 11C159 None None   V35K, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, E138A, S162H, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K275R, K277R, T286A, E291D, V292I  
11C459 11C459 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135V, K173T, D177E, T200A, Q207E, L210F, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I  
11C487 11C487 None None   V35K, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173A, D177E, I178L, G196K, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297K, A304E  
11C608 11C608 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162C, K173T, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
11C647 11C647 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, D123G, I135V, S162A, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I  
11C776 11C776 None None   K32E, V35I, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, K173A, D177E, T200A, Q207E, K238R, V245Q, A272P, V276I, E291D, V292I, I293V  
11N1130 11N1130 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162H, T165I, K173T, D177E, T200A, I202V, Q207E, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
11N126 11N126 None None   V35K, E36A, T39D, S48T, V60I, W88C, D121Y, K122E, E138A, S162H, T165I, K166R, K173T, T200L, Q207E, R211K, F214L, V245Q, D250E, A272P, K277R, K281R, T286A, A288T, E291D, V292I, I293V  
11N1300 11N1300 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D121F, K122E, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
11N1304 11N1304 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142V, S162H, T165I, K173A, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245K, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V  
11N136 11N136 None None   K11R, V35T, T39D, S48T, V60I, K166R, K173A, D177E, I178M, T200A, Q207K, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
11N1444 11N1444 None None   E6K, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, S162H, K166R, K173I, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
11N1675 11N1675 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, D121Y, K122E, S162A, E169Q, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, I293V, E297A  
11N1677 11N1677 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, A158S, S162A, T165I, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, T286A, V292I, I293V  
11N584 11N584 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, I135V, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, D237N, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
11N588 11N588 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K166R, K173E, D177E, T200A, Q207A, V245Q, E248V, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
11N605 11N605 None None   V35T, T39D, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P, V276I, L283I, E291D, V292I, I293V  
11N686 11N686 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, K173A, D177E, T200E, Q207N, R211K, V245Q, S251N, A272P, K275R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
11N699 11N699 None None   K20R, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162H, T165I, K166R, K173A, D177E, Q197K, T200A, Q207E, V245Q, A272P, V276I, K281R, E291D, I293V, P294Q, E297A  
12C102 12C102 None None   K11S, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, V118M, D121Y, K122E, D123G, I135T, S162D, S163G, K166R, E169K, K173E, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, V292I, I293V, E297A  
12c155 12c155 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135K, S162H, K173A, D177E, T200A, E204D, Q207K, R211G, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
12c247 12c247 None None   K32E, V35K, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, K173A, D177E, T200A, Q207D, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
12C255 12C255 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
12C290 12C290 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121C, K122E, I135T, I142M, S162H, T165I, Q174R, I178V, V179I, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
12C476 12C476 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, K166R, K173T, D177E, I195T, T200A, Q207E, V245Q, D250E, A272P, T286V, E291D, V292I, I293V  
12C478 12C478 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K103R, D121H, K122E, D177E, Q197L, T200A, Q207E, V245Q, A272P, V276I, K277R, E291D, V292I, I293V  
12C487 12C487 None None   V35T, T39N, E40D, S48T, V60I, K102Q, K122E, I135T, S162A, K173A, Q174H, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q, A272P, V276I, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
12c537 12c537 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121H, K122E, I142V, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
12C542 12C542 None None   V35T, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162N, T165I, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
12N1756 12N1756 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, S162Y, K173R, D177E, T200A, Q207E, R211G, V245Q, D250E, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
12N248 12N248 None None   E6P, V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, V60I, D121H, K122E, I135T, S162D, K166R, K173A, D177E, T200E, Q207T, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
12N856 12N856 None None   M16T, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
7325 7325 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162A, K173T, D177E, I178L, T200A, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
7339 7339 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207R, R211A, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
7549 7549 None None   V35T, T39D, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162C, K173A, D177E, I178L, Q197L, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
7553 7553 None None   V35T, T39D, S48T, K49R, V60I, I135V, S162C, T165I, K173A, Q174R, D177E, I178L, Q197K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
7556 7556 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, L283I, R284K, T286A, E291D, V292I, I293V, E297R  
7561 7561 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K102Q, I135R, S162H, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K275R, K277R, E291D, V292I, I293V  
7567 7567 None None  Y181C V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162H, T165I, K166R, K173A, D177E, T200A, I202V, Q207E, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
7588 7588 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, V90I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, I178V, V179I, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
7609 7609 None None   V35T, T39E, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135R, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, K281R, E291D, V292I, I293V  
7614 7614 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162H, T165I, K166R, K173A, D177E, Q207E, F214L, V245H, A272P, T286V, E291D, V292I, I293V  
7638 7638 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162H, T165I, K173T, D177E, T200A, I202V, Q207E, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
7643 7643 None None   T27S, E28A, V35T, T39N, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173A, Q197H, T200A, Q207E, R211K, V245E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
7651 7651 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, K101R, D121Y, K122E, I135T, S162A, T165I, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, T286V, E291D, I293V  
7663 7663 None None   T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q197E, Q207E, V245H, A272P, V276I, K277R, E291D, V292I, I293V, P294T  
7676 7676 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173A, D177E, I178M, T200A, Q207G, R211G, V245Q, A272P, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297K  
7792 7792 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, K281R, E291D, V292I, I293V, E297A  
7800 7800 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, V276I, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T  
7821 7821 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162H, T165I, K166R, K173A, D177E, Q207E, F214L, V245H, A272P, T286V, E291D, V292I, I293V  
824 824 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, A158P, K173A, D177E, R199T, T200A, E204K, Q207E, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
8321 8321 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162H, K173A, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
833 833 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K166R, K173A, D177E, I178L, Q197K, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K281R, E291D, V292I  
8334 8334 None None   V35T, T39D, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135R, S162A, K173T, D177E, I178L, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, I293V  
8336 8336 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, V90I, D121H, K122E, D123E, I135T, S162H, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
8352 8352 None None   V35T, T39E, V60I, K122E, I135R, S162T, K173T, T200A, Q207N, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
8590 8590 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142V, S162H, T165I, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
8599 8599 None None   V10L, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, P294T  
866 866 None None   V35T, E36A, T39D, V60I, K102Q, K122E, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
867 867 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173A, D177E, T200A, I202V, E204N, Q207G, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
8682 8682 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142V, S162Y, T165I, K173A, D177E, T200E, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K281R, E291D, V292I, I293V  
8703 8703 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162A, K173T, D177E, I195L, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, T286V, E291D, V292I, I293V  
8720 8720 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, K173N, Q174K, T200E, Q207E, R211K, V245Q, E248N, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
91000 91000 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135L, A158S, S162A, T165I, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, T286V, E291D, V292I, I293V  
91010 91010 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173T, D177E, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A  
91065 91065 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
9383 9383 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K281R, E291D, V292I, I293V  
9390 9390 None None   K11T, E28A, V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173A, D177E, I178V, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
9476 9476 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135V, S162A, K166R, K173A, D177E, Q197K, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272S, E291D, V292I, I293V  
9566 9566 None None   K20R, V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173T, D177E, Q197K, T200A, Q207T, R211K, F214L, V245Q, A272P, K281R, V292I, I293V  
9599 9599 None None   V35M, T39D, S48T, V60I, K101R, D121Y, K122E, D123E, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, K281R, R284K, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
9602 9602 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
9610 9610 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135R, S162A, D177E, T200A, E204K, Q207E, R211Q, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V