Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Tamalet (2015)
Title Emergence of clusters of CRF02_AG and B human immunodeficiency viral strains among men having sex with men exhibiting HIV primary infection in southeastern France.
Citation J Med Virol.
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 73
NumPts 73
Subtype B, CRF02_AG, F, A, C


Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
1001225 1001225 None None   D123E, I135T, S162C, D177E, I178M, T200A, Q207H, R211K  
1010481 1010481 None None   T139TI, S162A, T200I  
1082117 1082117 None None D67N, T215L, K219E  V35L, E40A, S68G, T69N, D121Y, K122E, I135T, I178M, R211K  
1082327 1082327 None None   T39A, I142V, S162Y, T200E, R211K  
1082528 1082528 None None   V35L, K49R, R83K, I142L, E169D, Q174QK, T200E, I202IV, R211K, F214L, L228H  
1082551 1082551 None None  V179E K102Q, K122E, S162C, I178L, V189I, Q207E  
1082564 1082564 None None   K104KR, K122E, S162C, G196E  
11000557 11000557 None None   K20R, E28ED, D123E, I135T, S162C, K238KR K22KI 
11001286 11001286 None None   S162C, T200A, R211K  
11001537 11001537 None None   K20KE, E28D, V35T, K102Q, K104R, D123N, S162A, E169Q, K173T, Q174N, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L D17DN, P19S, L26LF 
11001633 11001633 None None   E28K, V35I, R83K, V90I, S162H  
11002109 11002109 None None   K104R, D123E, S162A  
11002313 11002313 None None   V60I, N175Y, V179I, G196E, I202V  
11002462 11002462 None None  A98G V35T, E40D, K122E, D123N, S162A, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K, F214L  
11002554 11002554 None None   R211K  
11002577 11002577 None None   V35R, V60I, D123E, I135T, S162A, E169Q, K173T, Q174N, D177E, G196E, T200A, I202V, Q207E, R211A, F214L Y127YC, P133PR, I180IT, P217PR 
11002606 11002606 None None   V60I, V118I, K166R, K173KE, R211Q, F214L  
11011882 11011882 None None   V60I, K122E, D123N, I142V, K166R, T200A, Q207E  
11062665 11062665 None None   K20R, V35L, K102KQ, S162C, K173E, Q207AT, R211K  
12000079 12000079 None None   V35R, V60I, D123E, I135T, S162A, E169Q, K173T, Q174N, D177E, G196E, T200A, I202V, Q207E, R211A, F214L, E224EG, K238Q Y183YN, L234LP 
12000122 12000122 None None   V35R, V60I, D123E, I135T, S162A, E169Q, K173T, Q174N, D177E, G196E, T200A, I202V, Q207E, R211A, F214L  
12000141 12000141 None None   V35R, V60I, S68G, D123E, I135T, S162A, E169Q, K173T, Q174N, D177E, G196K, T200A, I202V, Q207E, R211A, F214L  
12000341 12000341 None None   K20R, D123E, I135T, S162C, D177E, K238R  
12000416 12000416 None None   K20R, D123E, I135T, S162C, I178M, T200A, R211K, K238R  
12000430 12000430 None None T215N  V35T, V60I, D121DN, D123E, I135T, S162A, E169Q, K173T, Q174N, D177E, G196E, T200A, I202L, Q207E, R211A, F214L D186H, E194R, K223N 
12000544 12000544 None None   K20R, V60I, K122E, D123N, S162C, I178L, R211T N137T 
12000632 12000632 None None   K20R, V35M, V60I, I135T, S162H, K166R, V179I, Q207A, R211K  
12000711 12000711 None None   K20R, D123E, I135T, S162C, I178M, R211K, K238R  
12000737 12000737 None None   V35R, V60I, D123E, I135T, S162A, E169Q, K173T, Q174N, D177E, G196E, T200A, I202V, Q207E, R211A, F214L Q161QE 
12001327 12001327 None None   K20R, V35R, K49R, I50V, V60I, D123E, I135T, S162C, D177G, I180V, K238R  
12001576 12001576 None None   K20R, K122E, S162Y, Q174H, G196E, Q197K, T200S, Q207E, R211K, F214L  
12001779 12001779 None None   V35T, S68N, V106I, D121C, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207G  
12001788 12001788 None None   V35R, V60I, D123E, I135T, S162A, E169Q, P170T, K173T, Q174N, D177E, E194ED, G196E, T200A, I202V, Q207E, R211A, F214L I195ILST, H198HNPT 
12002036 12002036 None None   K122E, I135V, Q174K, R211K  
12005626 12005626 None None   V35R, V60I, D123E, I135T, S162A, E169Q, K173T, Q174N, D177E, G196E, T200A, I202V, Q207E, R211A, F214L  
12011389 12011389 None None  K103N, P225H K49R, T200A, R211K  
5101089 5101089 None None   V35T, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200V, Q207D, R211K, D237E  
5101816 5101816 None None T215E  R83K, K122E, S162C, I202V  
5101847 5101847 None None   K122E, D123S  
5102079 5102079 None None   T39A, K49R, K104R, I135T, S162C, D177G, T200A, Q207A  
5210025 5210025 None None   V35T, T39TAEK, E40ED, D123E, S134SG, A158S, K173I, Q174K, D177E, I180V, T200A, Q207A, R211K  
5210920 5210920 None None   R83K, K122E, G196E, T200I  
6101074 6101074 None None   V35T, K103R, D123N, I135T, I142T, Q207E, F214L  
6101085 6101085 None None   V35I, R83K, I135T, R211K  
6101370 6101370 None None   V35T, V60I, I135T, S162Y, Q174N, G196E, Q207H, R211K  
6101520 6101520 None None   K173T  
6101685 6101685 None None  K103N V60VI, Q207E, R211K  
6324831 6324831 None None   T27TS, K49KR, V60VI, R83RK, V90VI, K102KQ, E138EA, T139TI, S162NY, V179VI, G196GE, T200TA, R211RK  
6329909 6329909 None None  K103N T200A, Q207E, R211K  
7100120 7100120 None None   V35I, R83K, S162C, R211K  
7100357 7100357 None None   K49R, I50V, R83K, D123E, I135T, I178L, R211E  
7100358 7100358 None None   K49R, K122E, D123E, S162C, E169D, I178L, Q207E  
7100359 7100359 None None   K43KR, S162C, Q197R, R211K  
7101268 7101268 None None M41ML, T215N  K20R, V35M, T39A, V60VI, T139K, S162C, I202V  
7101270 7101270 None None   S68G, E138A, A158S, S162A, R211K  
7101388 7101388 None None   V35T, T39TI, K122R, D123E, I142V, K173A, Q174K, D177E, T200TA, Q207AT, R211K  
7200060 7200060 None None   V35T, E36D, K43N, D121Y, K122E, D123E, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
7200768 7200768 None None   K20R, I167V  
7206874 7206874 None None   E28K, V35M, K122E, I135M, A158S, S162C  
7208566 7208566 None None   K20R, V60VI, K122E, D123N, S162C, I178IL, R211T  
7300953 7300953 None None   D121H, K122E, A158S, I178L, F214L  
8100537 8100537 None None   V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K  
8101684 8101684 None None   K20R, K101R, D123E, I135T, S162C, K238R  
8102506 8102506 None None   V60I, R83K, I135T, K166R, T200A, E204Q, R211K  
8210808 8210808 None None   K173Q, Q207E  
9100247 9100247 None None   V35T, V60I, F87L, D123E, I135V, S162A, E169Q, K173T, Q174N, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211A, F214L  
9100592 9100592 None None   V35T, I135V, S162A, E169Q, K173T, Q174N, D177E, T200A, E203EQ, R206RK, Q207E, R211K, F214L, K223KT Y183Y*KN, L209LAPV 
9101181 9101181 None None   T39A, R83K, K173KR  
9101245 9101245 None None   A98S, K102Q, V118I, D121H, K122E, I135T, K166R, K173T, D177E, T200A, E204D, R211S, F214L  
9101249 9101249 None None   D17DV, A98S, K102Q, K122E, D123N, S162C, E169D, R211K  
9102101 9102101 None None   K49R, D123E, I142V, K173Q, Q174R, I178L, R211K, F214L  
9206480 9206480 None None   K20R, V60I, K122E, D123N, S162C, I178L, R211T  
9324954 9324954 None None   V35T, E36D, K49R, I50V, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L