Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Tamalet (2015)
Title Emergence of clusters of CRF02_AG and B human immunodeficiency viral strains among men having sex with men exhibiting HIV primary infection in southeastern France.
Citation J Med Virol.
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 73
NumPts 73
Subtype B, CRF02_AG, F, A, C


Clinical PR Isolates

1001225 1001225 None    M36I, N37S, H69K, L89M, I93L  
1010481 1010481 None    T12V, E35D, N37D, R57K, I62V, L63P, I64L, A71T  
1082117 1082117 None  L90M  I13V, I15V, K20T, I62V, L63P, A71V, I72T, V77I, I93L  
1082327 1082327 None    E35D, N37D, L63T, K70T, I72V, V77I, I93L  
1082528 1082528 None    E35D, M36I, N37D, R57RK, L63P, I93L  
1082551 1082551 None    I15V, M36I R87RK 
1082564 1082564 None    L19T, R41K, A71T, I93L  
11000557 11000557 None    I15V, L63P, I72E E35EV 
11001286 11001286 None    K14R, N37S, R41K, I62V, L63S, V82I, I93L  
11001537 11001537 None    K14R, G16E, E35D, M36I, I64L, H69K, L89M  
11001633 11001633 None    R41K, R57K, L63P, C67S, H69Y, A71T, I72V, V77I  
11002109 11002109 None    L10I, T12V, E35D, N37D, R57K, I62V, L63P, I64L, A71T  
11002313 11002313 None    L63T, I64V, I93L  
11002462 11002462 None    I13V, K14R, K20I, M36I, R41K, I64L, H69K, V82I, L89M, C95CW  
11002554 11002554 None    L10I, K14R, L33V, E35D, N37C, R41K, L63P, A71T, I72V, V77M, I93L  
11002577 11002577 None    I13V, I15V, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, I64L, H69K, K70R, L89M  
11002606 11002606 None    T4TI, L19I, N37S, P39S, R41K, L63S, A71V, I72IT, V77I, I93L  
11011882 11011882 None    T12S, L63P, V77I, I93L R87RK 
11062665 11062665 None    L10I, N37NS, I62V, L63T, C67H, A71V, I72E, V77I, I93L  
12000079 12000079 None    I13V, K14R, I15V, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, I64L, H69K, K70R, L89M  
12000122 12000122 None    I13V, K14KR, I15V, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, I64L, H69K, K70R, L89M  
12000141 12000141 None    I13V, K14R, I15V, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, I64L, H69K, K70R, L89M, C95F  
12000341 12000341 None    K14Q, I15V, L63P, I72E  
12000416 12000416 None    I15V, L63P, I72E  
12000430 12000430 None    I13V, I15V, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, I64L, H69K, K70R, L89M  
12000544 12000544 None    N37C, L63P  
12000632 12000632 None    E35Q, M36I, N37E, R57K, I62V, L63S, I64V, A71V, I93L  
12000711 12000711 None    I15V, L63P, I72E  
12000737 12000737 None    I13V, K14R, I15V, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, I64L, H69K, K70R, L89M  
12001327 12001327 None    I15V, E35D, L63P, I72V  
12001576 12001576 None    T12S, L63P, I64V, V77I  
12001779 12001779 None    I13V, K14R, K20I, M36V, P39S, R41K, H69K, L89M  
12001788 12001788 None    I13V, I15V, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, I64L, H69K, K70R, L89M  
12002036 12002036 None    N37S, R41K, V77I  
12005626 12005626 None    I13V, K14R, I15V, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, I64L, H69K, K70R, L89M  
12011389 12011389 None    K14R, R41K, D60E, I62V, L63T, I64M, I72V, V77I  
5101089 5101089 None    T12K, I13V, K14R, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, H69K, L89M  
5101816 5101816 None    N37NT, L63AT, V77VI  
5101847 5101847 None    N37NS, R41K, L63G, I64V  
5102079 5102079 None    I15V, E35D, M36I, R41K, R57K, D60E, I62V, L63S, I64V, E65D  
5210025 5210025 None    I15V, G16E, E35D, M36I, R41K, L63V, H69K, L89M, I93L  
5210920 5210920 None    R41K  
6101074 6101074 None    T12N, L19V, V77I, I93L  
6101085 6101085 None    I64V, V77I, I93L  
6101370 6101370 None    L10I, I15V, L19I, E35D, R41K, D60E, L63T, I93L  
6101520 6101520 None    L63P, V77I, I93L  
6101685 6101685 None    K14R, R41RK, I62V, L63PT, E65D, I72IT, V77VI, I93IL  
6324831 6324831 None    Q18IL, N37ND, R41RK, D60DE, I62IV, L63P, E65ED, I72IATV, V77VI R87RK 
6329909 6329909 None    L10I, K14KR, G16E, I62V, L63T, I64L, E65D, I72T, V77I, I93L  
7100120 7100120 None    N37A, L63I, I64V, I72V, V77I  
7100357 7100357 None   L33I L63Q, I64V, E65D, I93L  
7100358 7100358 None    I13V, I15V, G16A, N37T, H69K  
7100359 7100359 None    M36I, L63T, I64V, I72V  
7101268 7101268 None    G16E, M36MI, N37ST, R41RK, I72V, V77I  
7101270 7101270 None    E35D  
7101388 7101388 None    L10V, I15V, G16E, K20R, E35D, M36I, R41K, I62V, H69Q, T74TS, L89M  
7200060 7200060 None    I13V, K14R, G16E, K20I, M36I, R41K, C67Y, H69K, K70R, P79PS, L89M P9Q 
7200768 7200768 None    N37D, L63S, I64M  
7206874 7206874 None    I13V, I15V, L19I, N37D, D60E, L63P, I72E  
7208566 7208566 None    T4S, N37C, L63P  
7300953 7300953 None    I13V, L19T, M36I, L63P  
8100537 8100537 None    I13V, K14R, G16E, K20R, E35D, M36I, R41K, H69K, I72V, L89M  
8101684 8101684 None    I15V, L63P, I72E  
8102506 8102506 None    I13V, K14R, E35D, N37E, R57K, L63P  
8210808 8210808 None    N37S, L63Q, I64V  
9100247 9100247 None    I13V, K14R, I15V, G16E, K20I, L33LV, E35D, M36I, R41K, I64L, H69K, L89M  
9100592 9100592 None    I13V, K14R, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, I64L, H69K, K70R, L89M  
9101181 9101181 None    E35D, P39Q, L63P  
9101245 9101245 None    I15V, G16E, L19I, E35D, M36I, K45R, L63P, H69Q, K70E  
9101249 9101249 None  M46I  K14R, E35D, N37D, L63P, E65D  
9102101 9102101 None    T12A, I15V, E35D, P39Q, R41K, L63P, A71V, I93L  
9206480 9206480 None    N37C, L63P  
9324954 9324954 None    I13V, K14R, G16E, K20I, E35D, M36I, R41K, K43R, H69K, K70R, L89M