<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Neogi (2015)
Title HIV-1 protease and reverse transcriptase from therapy naive individuals from India.
Citation Direct Genbank Submission
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 297
NumPts 297
Subtype C, A, B


  Page 1 of 3    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query
Page 1   from Isolate 1 to Isolate 100 from Total 297 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
10SJ1004 10SJ1004 None None   V8I, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K103KR, K122E, D123DE, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
10SJ1006 10SJ1006 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, K122E, D123DN, K166KR, E169D, K173A, Q174QK, D177E, T200A, Q207E  
10SJ1008 10SJ1008 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, K173V, Q174K, I202V, Q207E, R211K  
10SJ1010 10SJ1010 None None   S3I, V10L, E28K, V35T, E36S, T39D, S48T, V60I, D121HY, K122E, S162A, K173T, D177E, T200A  
10SJ1012 10SJ1012 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, D123E, I142IV, K173AT, Q174K, D177E, I178IL, T200A, Q207E, R211K  
10SJ1016 10SJ1016 None None   S3I, K11E, K20E, V21G, V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, I159V, S162A, K173A, Q174QK, D177E, T200A, Q207E, R211K V10T, K13M, K22P, W24G, E28P, K30T, H198HQ 
10SJ1022 10SJ1022 None None  V179D P4S, I5V, V35T, T39N, S48T, V60I, W88S, K103R, V118I, D121H, K122E, I135L, I142T, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L, K223R, E224K L109P 
10SJ1023 10SJ1023 None None   V35T, T39N, V60I, K102Q, D121Y, K122E, S162A, K173A, D177E, E194N, T200A, Q207E, R211K  
10SJ1026 10SJ1026 None None   V35T, T39D, K43KR, V60I, D121Y, K122E, D123DE, I135R, S162C, K173A, D177E, Q197QE, T200A, E204ED, Q207K, R211G  
10SJ1027 10SJ1027 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, D121H, K122E, S162H, K173A, T200A, Q207K, R211K  
10SJ1034 10SJ1034 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, K104Q, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173A, D177E, Q197K, T200A, Q207E  
10SJ1036 10SJ1036 None None  K103KN E28K, V35T, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, K173E, D177E, T200A, Q207E  
10SJ1038 10SJ1038 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K102KQ, D121Y, K122E, I135T, I142IV, S162Y, T165I, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211RK  
10SJ1039 10SJ1039 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D121H, K122E, I135IR, S162A, T165I, K173AT, D177E, T200TA, Q207E, R211K  
10SJ1040 10SJ1040 None None   K20R, V35T, T39D, S48T, V60I, K122E, I135T, S162Y, K173L, Q174K, I178IM, T200A, Q207G, R211K  
10SJ1042 10SJ1042 None None   V35T, T39D, K43R, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162C, K173A, D177E, I178L, T200A, E204K, Q207E, R211S  
10SJ1050 10SJ1050 None None  A98AG, V179E K20R, V35T, T39E, V60I, K82KR, V111I, K122E, I135R, K173A, D177E, T200A, E204D, Q207E, F214L  
10SJ1051 10SJ1051 None None D67DN  V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E, D218N, E224K  
10SJ1052 10SJ1052 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207A, R211K  
10SJ1053 10SJ1053 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, T69TI, K103R, K122E, I135T, K173A, Q174K, T200A, Q207G, R211K, F214L  
10SJ1055 10SJ1055 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, A158T, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207D, R211K K30R, W153WR, S156F 
10SJ1057 10SJ1057 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K102R, D121Y, K122E, I135T, S162H, T165I, K166KR, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
11KR1301 11KR1301 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, I135R, S162A, K173AT, D177E, T200A, Q207E, E224K K220E, H221K, Q222K 
11KR1303 11KR1303 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200A, R206K, Q207E, R211K G51R, G112E 
11KR1308 11KR1308 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, K122E, D123E, I135T, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K  
11KR1314 11KR1314 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, K166KR, K173AT, Q174QK, D177E, T200E, Q207E, R211K  
11KR1315 11KR1315 None None   V35T, T39N, S48T, K49R, V60I, D121H, K122E, I135R, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
11KR1321 11KR1321 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135R, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E, E224K  
11KR1323 11KR1323 None None  Y181C V35T, T39E, S48T, V60I, I135K, K173A, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, D218N  
11KR1329 11KR1329 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
11KR1332 11KR1332 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, D121H, K122E, I135R, S162C, K173A, D177E, T200A, E203G, Q207E, R211K  
11KR1335 11KR1335 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, D121H, K122E, I135R, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207E K30R 
11KR1339 11KR1339 None None   I5V, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, D218N, E224X  
11KR1353 11KR1353 None None   V35T, V60I, D121H, K122E, I135K, S162Y, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q197K, T200E, E204N, Q207N, R211S, E233D D218V, L234P 
11KR1357 11KR1357 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K173KT, D177E, T200A, R206I, Q207K, D218N, F227S V118VF, Q161QH, Y232D 
11KR1358 11KR1358 None None   I5V, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, E138A, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207E  
11KR1359 11KR1359 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135K, S162Y, K173A, D177E, T200A, Q207K, R211G  
11KR1361 11KR1361 None None   K32E, V35T, E36A, T39N, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173E, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E  
11KR1363 11KR1363 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E  
11KR1372 11KR1372 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K Q145QR 
11KR1373 11KR1373 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, K122E, I135R, S162Y, K173T, D177E, T200A, Q207K, R211G, E224K, E233G  
11KR1374 11KR1374 None None   K32Q, V35T, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162Y, K173A, D177E, T200A, Q207K, R211G Y232D 
11KR1377 11KR1377 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E  
11KR1386 11KR1386 None None  F227L V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162A, K173T, D177E, I178IM, T200A, Q207E, R211RK  
11KR1387 11KR1387 None None   V35I, T39D, V60I, D123E, K173T, D177E, T200A, Q207E F214S 
11KR1391 11KR1391 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, I135T, S162A, K173A, D177E, I178IV, T200A, Q207EV  
11KR1395 11KR1395 None None   T27S, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121HY, K122E, I135R, S162H, K173A, T200A, Q207E, R211K  
11KR1399 11KR1399 None None   K22N, V35T, T39D, S48T, V60I, K122E, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
11KR1403 11KR1403 None None   V35M, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135T, S162A, K173A, D177E, T200A, E203EQ, Q207E, R211K  
11KR1407 11KR1407 None None   V35T, E36A, T39D, K43KR, S48T, V60I, K122E, D123G, E138EA, K173A, I178IV, T200A, Q207DE  
11KR1412 11KR1412 None None   K32Q, V35T, T39N, S48ST, E53ED, V60I, D121H, K122E, I135R, S162H, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211G G231P 
11KR1413 11KR1413 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, I50F, V60I, D121Y, K122E, D123DE, S162A, E169K, K173E, I178L, T200A, Q207E S134SI, Y232G 
11KR1419 11KR1419 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207K, R211T P59S, Y232G 
11KR1421 11KR1421 None None   V35T, T39D, V60I, D86N, D121H, K122E, I135K, I142V, E169K, K173A, D177E, E194K, T200A, Q207E R72K, R143K 
11KR1425 11KR1425 None None   V35T, E36A, T39D, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162C, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
11KR1428 11KR1428 None None   K32E, V35T, I37F, T39D, I47N, K49Q, V60I, D121Y, K122E, T139A, S162A, K173A, D177E, Q197K, T200A, Q207E, R211K K30R 
11KR1436 11KR1436 None None   V35T, E36A, T39D, M41T, I50F, V60I, D121Y, K122E, I135T, T165I, K173A, D177K, I178V, T200A, Q207A, D218N R143K 
11KR1437 11KR1437 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, T165I, E169G, P170S, K173A, T200A, Q207G, R211Q, D218E I37M 
11KR1440 11KR1440 None None   K32E, V35T, E36A, T39N, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207G  
11KR1455 11KR1455 None None   V35T, E36K, T39D, S48T, V60I, T69I, D121H, K122E, I135R, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207E  
11KR1458 11KR1458 None None   V35T, E36S, T39D, M41T, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207D, R211K I37M, C38W, D76V 
11KR1462 11KR1462 None None   T27S, V35T, E36A, T39D, E40K, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, A158S, S162A, K173A, D177E, T200A, I202V, R211K E53K 
11KR1463 11KR1463 None None   V35T, T39D, S48T, K49R, V60I, D121H, K122E, I135R, S162H, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
11KR1473 11KR1473 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123N, I135T, T165I, K173A, D177E, I178L, T200A, I202IV, E204K, Q207E, R211RK  
11KR1477 11KR1477 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, L109I, D121Y, K122E, T165I, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K Y232D 
11SJ1069 11SJ1069 None None   I5V, V8I, V35T, T39E, S48T, V60I, K64R, D123E, I135T, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207G, R211K  
11SJ1074 11SJ1074 None None T69AD Y188F V35T, T39N, V60I, D121Y, K122E, S162C, K173A, D177E, I178M, T200A, E203V, Q207K, R211Q D123DY 
11SJ1078 11SJ1078 None None   E6D, V35T, T39D, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K I202R 
11SJ1081 11SJ1081 None None   V8I, V35T, T39N, S48T, V60I, K173A, Q174K, D177E, T200A M41I 
11SJ1084 11SJ1084 None None   T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, A98S, D121Y, K122E, I135M, S162C, K166KR, K173A, D177DE, T200A, Q207E, R211K  
11SJ1085 11SJ1085 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135R, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
11SJ1089 11SJ1089 None None   P4S, V8I, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, V118I, D121Y, K122E, I135T, S162Y, T165I, K166R, K173I, T200A, Q207G, R211K, F214L  
11SJ1090 11SJ1090 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121DNY, K122E, I135T, S162A, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K  
11SJ1093 11SJ1093 None None   V35T, E36A, T39E, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
11SJ1097 11SJ1097 None None   E6D, V8I, V35T, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
11SJ1101 11SJ1101 None None   V8I, V35I, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135T, I142V, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207E  
11SJ1102 11SJ1102 None None   K20R, V35T, T39E, S48T, K49R, V60I, D121H, K122E, I135R, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E L209P, G213R 
11SJ1106 11SJ1106 None None   V35T, T39D, V60I, D121Y, K122E, I135K, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207K, R211G  
11SJ1108 11SJ1108 None None   V35T, V60I, K101R, I135V, D177E, I178M, Q207EK, R211RK  
11SJ1109 11SJ1109 None None   K11E, V35T, T39D, V60I, D121Y, K122E, I135K, S162A, K173A, D177E, I178IL, T200A, Q207K, R211RG  
11SJ1115 11SJ1115 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E G51A 
11SJ1119 11SJ1119 None None   V35M, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135K, I142IV, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K E224R, P225T 
11SJ1127 11SJ1127 None None  K103N T27S, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, W88C, D121Y, K122E, D123E, I135T, S162H, T165I, K166R, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L K30R 
11SJ1128 11SJ1128 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, S162A, T165I, K173T, D177E, T200A, Q207E  
11SJ1131 11SJ1131 None None   V35T, T39N, V60I, D121H, K122E, I135T, S162F, K173T, Q174K, D177E, G196R, T200A, Q207E, R211K  
11SJ1132 11SJ1132 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121DH, K122E, D123E, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, K223E  
11SJ1134 11SJ1134 None None   V8I, P14A, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135V, E138D, I142V, T165I, K173A, D177E, T200A S191N, L209P 
11SJ1135 11SJ1135 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207G S105SP, G112GR 
11SJ1138 11SJ1138 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, T139TS, I142IV, S162A, K173ST, D177E, T200A, Q207D, R211K  
11SJ1142 11SJ1142 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K101KQ, K102KR, K104R, D121Y, K122E, I135IT, E138EA, S162G, T165I, K173A, Q174K, D177E, V179VI, T200A, Q207E, R211RK  
11SJ1148 11SJ1148 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, D121Y, K122E, D123E, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E  
11SJ1150 11SJ1150 None None   V35T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162H, K173A, Q174K, D177E, G196E, Q207E  
11SJ1152 11SJ1152 None None   V35T, T39E, M41T, K43M, G45E, I47L, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, E169D, K173A, T200A, Q207G, R211K I37V, C38W, G51R, N57T 
11SJ1153 11SJ1153 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, V90I, D121Y, K122E, S162A, T165I, K173AT, Q174QK, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K D76N, S134T, E233K 
11SJ1156 11SJ1156 None None   P1S, P4S, V35T, E36A, T39D, I47F, I50F, V60I, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E L34F, I37L, C38W, M41P, E42H 
11SJ1157 11SJ1157 None None   V35T, E36D, T39E, V60I, I135R, K166R, K173E, D177E, T200A, Q207E, R211K  
11SJ1162 11SJ1162 None None   V35T, T39E, E40D, S48T, K122E, D123S, K166R, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K Y232G, E233T 
11SJ1167 11SJ1167 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, S162A, K173A, Q174K, D177E, G196KT, T200A, Q207DE, R211K, F214L, E224N  
11SJ1168 11SJ1168 None None   V8I, E28A, V35T, T39N, S48T, V60I, A98S, D121H, K122E, I135T, T165I, K173A, Q174K, D177E, Q197E, T200A, E203K, Q207K, R211K Q222P 
11SJ1169 11SJ1169 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, E224K