<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Yao (2015)
Title Clinical and epidemiologic characteristics of 92 HIV-1 clinical isolates from antiretroviral-naive HIV-1-infected individuals in Yunnan province, China.
Citation Direct Genbank Submission
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 92
NumPts 92
Subtype CRF08_BC, B, CRF01_AE, CRF07_BC, B + C, A, C


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
CN.iso100 CN.iso100 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, V90I, D121Y, K122E, K166R, V179I, I202V, H208Y, R211K, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso101 CN.iso101 None None   P4H, E6D, K11T, V35T, E36D, T39K, K43E, V118I, D123N, K173I, Q174K, N175H, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, F214L, V245E, K281R  
CN.iso102 CN.iso102 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, D121H, K122E, I178L, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso103 CN.iso103 None None   I5V, E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E, K275Q  
CN.iso105 CN.iso105 None None   I135V, S162C, R211Q, Q278E  
CN.iso106 CN.iso106 None None   E6D, K11T, V35T, E36D, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P, K281R  
CN.iso108 CN.iso108 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, S162C, Q174R, D177E, I178M, Q207A, L210M, R211S, K238R, V245E  
CN.iso109 CN.iso109 None None   K122E, A272P, K277R  
CN.iso110 CN.iso110 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, D123E, I135V, S162C, I178L, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso112 CN.iso112 None None   E6D, K20R, V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, I135V, E138A, S162C, Q207T, R211K, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso113 CN.iso113 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, K122E, F214L, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso114 CN.iso114 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso115 CN.iso115 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, K122E, D123E, I135V, E138A, S162C, Q207E, R211K, V245K, A272P, V276T, K277R  
CN.iso116 CN.iso116 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, I135T, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
CN.iso117 CN.iso117 None None   V35T, T39N, S48T, E53D, V60I, S162F, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245K, D250E, A272P, K277R  
CN.iso118 CN.iso118 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, K122E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P  
CN.iso119 CN.iso119 None None   V8I, V35T, T39N, S48T, E53D, V60I, I135V, I142V, D177N, T200A, Q207E, V245Q, D250E, A272P L282S 
CN.iso120 CN.iso120 None None   P4H, E6D, K11T, V35T, E36D, T39K, K43E, V118I, D123N, K173I, Q174K, N175H, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, F214L, V245E, K281R  
CN.iso121 CN.iso121 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K166R, T200I, R211K, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso123 CN.iso123 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, V90I, K101R, I135V, S162A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso124 CN.iso124 None None   E6D, V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso125 CN.iso125 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, A158S, R211K, V245E, A272P, K277R  
CN.iso126 CN.iso126 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, V60I, I135V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, V276T, K277R  
CN.iso127 CN.iso127 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207K, R211S, K238R, V245E  
CN.iso128 CN.iso128 None None   I5V, E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, E169D, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
CN.iso130 CN.iso130 None None   E6D, V8I, D121H, K122E, K166R, T200V, I202V, Q207E, R211K, V245M, A272P, K277R, Q278E  
CN.iso131 CN.iso131 None None   E6D, V8I, V35T, I37F, T39D, E53D, V60I, S162Q, Q207E, R211K, V245Q, A272P C38G, P55R 
CN.iso132 CN.iso132 None None   K43E, V60I, S68G, K122E, D123N, F214L, Y232H, K238R, V245E  
CN.iso134 CN.iso134 None None   K64R, K122E, F214L, Y232H, K238R, V245E  
CN.iso136 CN.iso136 None None   E6D, V35M, T39K, K43E, K122E, F214L, Y232H, V245M, A272P, K277R, Q278E  
CN.iso137 CN.iso137 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43Q, K122E, D123N, I178M, Q207P, F214L, Y232H, V245Q, A272P  
CN.iso138 CN.iso138 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, I135V, S162C, D177E, I178L, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K275R, V276I, L283I  
CN.iso139 CN.iso139 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, K122E, D123R, I135V, S162C, I178L, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso140 CN.iso140 None None   K20R, V35T, T39A, S48T, E53D, V60I, T69S, S162Y, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P  
CN.iso142 CN.iso142 None None   K102Q, S162C, E169K, E194K, R199K, D218N  
CN.iso143 CN.iso143 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S I159K 
CN.iso144 CN.iso144 None None   V35T, T39K, K122E, D123S, F214L, A272P, K277R I159K 
CN.iso145 CN.iso145 None None  Y181C I5V, E6D, K20R, V35T, T39K, K43E, T69N, D123S, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207A, R211S, V245E, E248D  
CN.iso155 CN.iso155 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, D121H, K122E, K238R, V245E  
CN.iso156 CN.iso156 None None   W88S, D123E, I135V, S162C, I178L, T200A, Q207E, A272P, K277R W71C 
CN.iso25 CN.iso25 None None   E6D, V35M, T39K, K43E, K166R, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, L210M, R211S, V245E G262A 
CN.iso27 CN.iso27 None None  V179D E6D, K11T, V35T, T39K, K43Q, K122E, D123S, T139A, S162C, Q174E, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P, V276I, K281R  
CN.iso31 CN.iso31 None None   K102Q, S162C, K277R  
CN.iso34 CN.iso34 None None  Y181H E6D, K11T, K32R, K102Q, S162C, Y232H, V245E A33P, E233T, L234V, H235F, G262A 
CN.iso35 CN.iso35 None None   V35K, T39D, S48T, V60I, K122E, V245Q, A272P, V276T, K277R  
CN.iso43 CN.iso43 None None   K122E, I135V, S162C, D177E, R211H, V245M, Q278E  
CN.iso44 CN.iso44 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, R211K, Y232H, V245E E233T, L234V, H235F, G262A 
CN.iso45 CN.iso45 None None   V35T, T39E, S48T, E53D, V60I, T107S, D121H, K122E, S162C, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso46 CN.iso46 None None   K11T, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I202V, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R  
CN.iso47 CN.iso47 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K64R, D121H, K122E, D123S, I202V, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R  
CN.iso49 CN.iso49 None None   K32E, V35T, E36A, T39N, S48T, V60I, D121H, K122E, I135R, R211T, V245E, A272P, K277R  
CN.iso50 CN.iso50 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso51 CN.iso51 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso52 CN.iso52 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S  
CN.iso53 CN.iso53 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, I135V, S162C, Q174R, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso54 CN.iso54 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, L210M, R211S, K238R, V245E, V276I  
CN.iso55 CN.iso55 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso57 CN.iso57 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso58 CN.iso58 None None   E6D, V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, K122E, D123N, I135L, T139A, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, L210M, R211S, K238R, V245E, V276I  
CN.iso59 CN.iso59 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, Y232H, V245E L34F, G262A 
CN.iso60 CN.iso60 None None   V35T, T39N, S48T, E53D, V60I, K101R, K122E, D123N, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, E248V, A272P  
CN.iso61 CN.iso61 None None   T27S, V35T, E36A, T39D, V60I, D121H, K122E, T200I, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso62 CN.iso62 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, D121H, K122E, K166R, I202V, Q207K, R211G, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso63 CN.iso63 None None   V35T, T39N, S48T, E53D, V60I, K101R, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso64 CN.iso64 None None   E6D, V35M, T39K, K43E, S48T, V60I, K101R, K122E, D123N, Y232H, V245E G262A 
CN.iso65 CN.iso65 None None   V35T, T39N, S48T, E53D, V60I, D123E, I135V, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso66 CN.iso66 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K104R, D121Y, K122E, Q197K, Q207E, V245Q, A272P  
CN.iso67 CN.iso67 None None   E6D, K122E, I135V, S162C, T200E, R211I, K277R, Q278E  
CN.iso68 CN.iso68 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, Q207D, R211S, K238R, V245E, A272P  
CN.iso69 CN.iso69 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, V245K, A272P, K277R  
CN.iso70 CN.iso70 None None   V35T, T39N, S48T, E53D, V60I, K101R, K104R, K122E, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso71 CN.iso71 None None   V35T, E36A, T39D, S48E, E53D, V60I, T69S, T107S, S162C, E169D, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
CN.iso72 CN.iso72 None None   E6D, V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, K104R, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R  
CN.iso73 CN.iso73 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174E, D177E, I178M, E204K, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P, K275R, L283I  
CN.iso74 CN.iso74 None None   K20R, V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, D123E, D177E, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso76 CN.iso76 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
CN.iso78 CN.iso78 None None   V8I, A98S, K102R, D121H, K122E, E169D, N175Y, T200E, I202V, Q207E, R211K, V245M, A272P, K277R, Q278E  
CN.iso79 CN.iso79 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, E169D, N175Y, T200E, I202V, Q207E, R211K, V245M, A272P, K277R, Q278E H96Q 
CN.iso80 CN.iso80 None None   V35T, E36A, T39N, S48T, E53D, V60I, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, V276I, K277R  
CN.iso81 CN.iso81 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D121H, K122E, D123S, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, Q207A, L210M, R211S, K238R, V245E, A272P L205V, L209V, L283V 
CN.iso82 CN.iso82 None None   I135M, S162H, R211K, V245M, Q278E  
CN.iso83 CN.iso83 None None   I135V, S162C, R211Q, Q278E  
CN.iso85 CN.iso85 None None   I135V, S162C, R211Q, A272P  
CN.iso87 CN.iso87 None None   K20R, V35T, T39E, S48T, E53D, V60I, I135V, E138A, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
CN.iso88 CN.iso88 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, K101Q, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, V245E  
CN.iso89 CN.iso89 None None   K20R, V35T, T39N, E40D, S48T, E53D, V60I, T69S, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso90 CN.iso90 None None   K20R, V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, S162C, Q174H, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso91 CN.iso91 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, V60I, I135V, I142V, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso92 CN.iso92 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, K122E, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
CN.iso93 CN.iso93 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D123N, I142V, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, Q207A, L210M, R211S, K238R, V245E, A272P  
CN.iso96 CN.iso96 None None   K102Q, S162C, K277R  
CN.iso97 CN.iso97 None None   E6K, V8I, V35T, T39N, S48T, E53D, V60I, K122E, I135V, S162C, Q207E, V245Q, A272P, K277R