<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Zhang (2016)
Title Phylogenetic characteristics of HIV-1 among travelers entering China from Myanmar: A retrospective study.
Citation J Med Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 81
NumPts 81
Subtype CRF01_AE, CRF08_BC, B, C, CRF07_BC, B + C + CRF01_AE


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
03023 03023 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135R, V245Q, A272P, V276I, K277R  
03025 03025 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135L, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E, E248D, A272P  
03026 03026 None None  V179D V35K, T39D, S48T, V60I, K101R, D121Y, K122E, V245Q, A272P, K277R  
03040 03040 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, K64R, T69S, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
03043 03043 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, V245E  
03046 03046 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245K  
03105 03105 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, K122E, V245Q, A272P, K277R  
04005 04005 None None   K11A, V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, I135V, S162C, Q207E, V245Q, A272P, K277R  
04015 04015 None None   G15E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, K173A, D177E, Q207E, R211K, V245H, A272P, K277R  
04048 04048 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K166R, Q174R, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P  
04055 04055 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I142V, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272S  
04089 04089 None None   E6D, K11A, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, G196R, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, V276I  
05131 05131 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
05132 05132 None None   V35T, E36A, T39N, S48T, V60I, D121Y, K122E, E169D, V245Q, E248D, A272P, K277R  
05133 05133 None None   V8I, V35T, K43E, V60I, K122E, I135V, E138A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
05134 05134 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, E224G, K238R, V245E  
05212 05212 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, T200I, V245Q, A272P, K277R  
05240 05240 None None   V8I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, V245E, V276I  
05257 05257 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
05274 05274 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, L228H, K238R, V245E, V276I  
05275 05275 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, G196E, Q207A, R211K, K238R, V245E  
05320 05320 None None   E6D, V8I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178V, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P, V276I  
06010 06010 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245K  
06011 06011 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
06038 06038 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, S162C, D177E, I178L, Q207E, R211K, K238E, V245Q, A272P, K277R  
06039 06039 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
06059 06059 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123N, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
06060 06060 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, V60I, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
06145 06145 None None   V35T, T39K, K43E, I135T, K173V, Q174K, D177E, V179T, T200I, Q207A, R211S, V245Q, A272P, K277R  
06146 06146 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, F171Y, K173I, Q174K, D177E, I178M, V245E  
06150 06150 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, G196E, Q207A, R211K, K238R, V245E  
06152 06152 None None   E6D, V8I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173V, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
06323 06323 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
07020 07020 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207A, R211S, V245E, P247L, I257V W229C, P236S, K249L 
07033 07033 None None   K11E, V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P V10E 
07034 07034 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, K122E, D123N, I135T, K166R, K173M, Q174K, D177E, T200R, Q207A, L210S, R211S, V245E P4A 
07084 07084 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, D123E, I135L, S162C, Q207E, K238R, V245Q, A272P  
07085 07085 None None   E6D, K11A, V35T, T39K, K43A, V60I, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K223R, K238R, V245N, A272P  
07117 07117 None None   V35T, T39D, V60I, D121Y, K122E, S162C, K173I, Q174K, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
07137 07137 None None   V35T, T39D, S48T, E53D, V60I, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
07184 07184 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245K  
07201 07201 None None   V35T, T39D, S48T, E53D, V60I, I135V, S162C, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
07208 07208 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, I142V, K173I, Q174K, D177E, T200E, Q207N, R211S, K238R, V245A, V276I  
08083 08083 None None   E6D, K11T, V35T, D121H, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
08117 08117 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178M, R211S, V245E, A272P G15R 
08132 08132 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
08133 08133 None None   E6D, K20R, V35T, T39K, K122E, D123T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, K238R, I244V, V245E, A272P, K277R  
08149 08149 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, E53D, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, G196E, T200I, Q207A, R211K, K238R, V245E, A272G  
08178 08178 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, V60I, T107S, K122E, D123N, I135V, S162C, V179I, T200A, R211K, V245M, Q278E  
08222 08222 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I135T, E138A, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q197P, Q207E, R211S, V245E, A272P G15Q 
08238 08238 None None   G15E, V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, E53D, V60I, I135V, E138A, S162C, Q207E, V245Q, A272P, K277R  
08265 08265 None None   E6D, V8I, V35T, T39N, S48T, E53D, V60I, T69S, D121Y, K122E, D123E, S162C, E169D, E204D, Q207D, R211K, D218N, K223R, K238R, V245E, A272P, K277R Q222R 
09011 09011 None None   E6D, K11A, V35T, T39K, K43E, D123N, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245Q  
09089 09089 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V90I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P, V276I  
09096 09096 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69N, I135V, S162C, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
09106 09106 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, Q207E, R211K, V245E, A272P  
09116 09116 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, S162H, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q, A272P  
09129 09129 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, E53D, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, G196E, T200I, Q207A, R211K, K238R, V245E, A272G, V276I  
10017 10017 None None   E6D, V8I, K11A, V35T, T39K, K43E, V60I, K102Q, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, L210M, R211S, K238R, V245E  
10018 10018 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P  
10019 10019 None None   E6D, K11T, V35T, E36D, T39K, V60I, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
10021 10021 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, V60I, S162C, Q207E, R211K, V245E, A272P, K277R  
10022 10022 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, D123E, S162C, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
10026 10026 None None   I135V, S162C, T200A, H208Y, K275R, Q278E  
10050 10050 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, E53D, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, G196E, T200I, Q207A, R211K, K238R, V245E, A272G  
10062 10062 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
10072 10072 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, K122E, D123S, I135T, K166R, K173M, Q174K, D177E, G196R, Q207A, R211S, V245E, V276I  
10098 10098 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, I135V, S162C, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K275R, K277R  
11015 11015 None None   V35T, E36V, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162C, E169D, K275R, Q278E  
11063 11063 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123S, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200M, Q207A, R211S, K238R, V245Q G18A 
11096 11096 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, V60I, K173L, Q174K, D177E, V179T, T200A, Q207E, R211K, V245M, A272P, V276I, K277R  
11097 11097 None None   K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, S162A, K173R, Q174E, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E, V276I  
11098 11098 None None   K11T, V35T, T39K, K43E, K173V, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245E  
11099 11099 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K101R, K122E, I135V, T165I, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R  
11100 11100 None None   E6D, A98S, D123E, I135V, S162C, E169D, D177E, T200A, I202V, V245E, K277R, Q278E  
11101 11101 None None   E6D, A98S, D123E, I135V, S162C, E169D, D177E, T200A, I202V, V245E, K277R, Q278E  
11103 11103 None None   E6D, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K102R, D121Y, K122E, K173I, Q174K, D177E, I178L, T200I, Q207A, R211S, V245E, A272P, K277R  
12028 12028 None None   V8I, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, K173V, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, V245E, K277R  
12032 12032 None None   V35T, T39E, S48T, E53D, V60I, D123E, I135V, S162C, I178L, I202V, Q207E, V245Q, A272P, K277R  
12071 12071 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248I, K249Q, A272P, V276I, K277R  
12126 12126 None None   E6K, K20R, V35I, D121Y, K122E, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R