<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Gashnikova (2016)
Title HIV-1 epidemiology, genetic diversity, and primary drug resistance in the Tyumen Oblast, Russia.
Citation Biomed Res Int
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 68
NumPts 68
Subtype A, A + CRF02_AG, A + B, CRF63_02A1, B


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
Tyumen01 Tyumen01 None None   K11T, V35I, E36D, T39K, S68G, K122E, D123S, I135V, A158S, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I  
Tyumen02 Tyumen02 None None   E6K, K11T, V35T, T39D, S48T, K173L, Q174K, D177E, I178V, V179I, Q207A, R211S, V245I, E248D, A272P, K277R E29EK, N265K 
Tyumen03 Tyumen03 None None   K11T, V35T, E36D, T39E, K64R, K122E, D123ST, I135T, A158S, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, L210M, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I  
Tyumen04 Tyumen04 None None   K11T, V35T, E36D, T39L, K122E, D123S, I135T, A158S, K173S, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Tyumen05 Tyumen05 None None   V35T, T39N, K122E, D123S, I135T, S162C, K173L, Q174K, Q197L, Q207A, R211S, V245K, E248D, Y271F, A272P, T286A, V292I, I293V, P294T S191SF 
Tyumen06 Tyumen06 None None  V108I K11A, V35IT, E36D, T39Q, K122E, D123N, I135K, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207S, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
Tyumen07 Tyumen07 None None   K11T, E28EK, V35T, E36D, T39E, K122E, D123S, I135T, S162SC, K173LS, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Tyumen08 Tyumen08 None None   V35T, T39N, V60I, K103KQ, K122E, D123N, K173S, Q174K, D177E, T200S, Q207A, R211K, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I  
Tyumen09 Tyumen09 None None   V35T, E36D, T39K, K102KR, K122E, D123S, I135T, A158S, S162C, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
Tyumen10 Tyumen10 None None   V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, I135T, A158S, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245I, E248D  
Tyumen11 Tyumen11 None None   S48E, T165I, E169G, K173D, Q174R, G196E, T200A, F214L, V245I, A272P, K281R, A288S, E291D  
Tyumen12 Tyumen12 None None   K11T, V35T, E36D, T39M, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, V179I, Q207A, L210M, R211S, V245M, E248D  
Tyumen13 Tyumen13 None None   V35T, T39N, D123E, I135T, K173I, Q174K, D177E, I180V, Q197L, T200E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, L283I, T286A, E291D, V292I  
Tyumen14 Tyumen14 None None   P4PL, K11T, V35T, E36D, T39K, D121H, K122E, D123S, I135T, S162C, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A S191SF 
Tyumen15 Tyumen15 None None   K11T, V35IT, E36D, T39R, K43E, S68G, K122E, D123S, A158S, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, E248D, A272P, V276VI, K277R, T286A, E291D, V292I S191F 
Tyumen16 Tyumen16 None None   E6K, K11A, V35T, E36D, T39K, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245T, A272P, K277R, E291D, V292I  
Tyumen17 Tyumen17 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, T69S, K122E, D123N, A158S, K166R, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277KR, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T S191SF 
Tyumen18 Tyumen18 None None   K11T, V35T, E36D, T39N, E40D, D121H, K122E, D123S, A158AS, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245K, A272P, T286A, E291D, V292I  
Tyumen19 Tyumen19 None None   V35T, E36A, V60I, D121Y, K122E, I142T, A158T, S162A, K166R, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207A, R211N, P225S, V245Q, E248D, A272P, K277R, K281KR, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T S191SF 
Tyumen21 Tyumen21 None None   V35T, T39N, D123E, I135T, K173I, Q174K, D177E, I180V, G196E, T200A, Q207A, R211S, E248D, A272P, K277R, L283I, T286TA, E291D, V292I  
Tyumen22 Tyumen22 None None  G190E V35T, E36D, T39R, K122Q, D123N, S162N, D177E, R211K Q207~ 
Tyumen23 Tyumen23 None None   V35M, E36D, T39E, S68G, K122E, D123S, A158S, T165I, K173S, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I S191SF 
Tyumen24 Tyumen24 None None A62V  K11T, V35I, T39N, I50IV, V60I, K122E, D123N, I135T, A158S, K166R, K173I, Q174K, D177E, G196E, Q197K, T200I, I202IV, Q207A, R211S, F214FC, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T S191SF 
Tyumen25 Tyumen25 None None   K11T, V35T, E36D, T39M, D123N, A158S, K166R, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, F214L, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T W24WG 
Tyumen26 Tyumen26 None None  Y181C K11T, E28K, K32E, V35T, E36A, T39N, D123DN, I135L, K173L, Q174QK, D177E, V179I, Q207A, R211S, L228R, V245M, E248D, A272P, Q278H  
Tyumen27 Tyumen27 None None   K11T, V35T, E36D, T39L, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245K, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
Tyumen28 Tyumen28 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39N, V90I, D121H, K122E, D123N, A158S, K166R, Q174E, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
Tyumen29 Tyumen29 None None   V35T, E36D, T39K, E40D, K122E, D123S, I135T, S162CY, K173L, Q174K, D177E, V179VI, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I T128TP, S191SF 
Tyumen30 Tyumen30 None None   V35K, E36D, T39E, K122E, D123S, I135T, A158S, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I  
Tyumen31 Tyumen31 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39EK, K122E, D123NS, A158S, K173S, Q174K, T200A, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Tyumen32 Tyumen32 None None   K11T, V35T, T39R, D123DN, A158S, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Tyumen33 Tyumen33 None None   V35T, E36D, T39M, V60I, D121Y, K122E, I135L, S162A, K173G, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Tyumen34 Tyumen34 None None   K11T, V35T, E36D, T39M, D121H, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
Tyumen35 Tyumen35 None None   K11T, E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, E40D, T69S, V118I, D121H, K122E, D123S, I135T, I142T, A158S, T165I, K173S, Q174K, Q207A, R211S, F214L, E248D, A272P, V276I, T286A, E291D, V292I S191SF 
Tyumen36 Tyumen36 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K101KQ, D123N, K173S, Q174K, V179I, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, V276I, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T W266C, A267S 
Tyumen37 Tyumen37 None None   K11T, V35T, T39N, E40D, S48T, V60I, K122E, D123S, S162A, Q174K, D177E, T200E, Q207A, R211S, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Tyumen38 Tyumen38 None None   K11T, V21VI, V35IM, E36D, V118I, D121E, K122KE, D123S, I135T, T165I, E169D, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L, V245VM, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I S191SF 
Tyumen39 Tyumen39 None None   V35I, T39E, S68G, K122E, D123S, I135M, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I S191SF 
Tyumen40 Tyumen40 None None   K11T, V35T, E36ED, T39M, V60I, S68G, K122E, D123S, E138A, K173S, Q174K, D177DE, V179I, Q207A, R211S, E248D, A272P, T286A  
Tyumen42 Tyumen42 None None   K11T, V35T, E36D, T39N, D121H, K122E, D123S, A158S, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245K, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Tyumen43 Tyumen43 None None   K11T, V35T, E36D, T39N, E40D, V60VI, K122E, D123N, I135T, I142V, T165I, K173S, Q174K, D177E, G196E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Tyumen44 Tyumen44 None None   K11A, V35T, E36N, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I S191SF 
Tyumen46 Tyumen46 None None A62V  K11S, V35I, E36D, T39K, K82R, K122E, D123N, I135T, A158S, K173S, Q174N, D177E, Q207A, R211S, E248D, A272P, K277R, A288T, E291D, V292I, I293V, P294T  
Tyumen48 Tyumen48 None None   E6K, K11A, V35T, E36D, T39K, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245T, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, P294T S191SF 
Tyumen49 Tyumen49 None None   V35T, E36D, T39K, V60I, K122E, D123S, I135V, A158AS, S162C, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245KM, E248ED, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T S191SF 
Tyumen50 Tyumen50 None None   K11T, V21I, V35T, E36D, T39K, K102R, V106I, K122E, D123S, A158S, S162C, K166R, K173S, Q174K, D177E, Q207N, R211K, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T F130I, S191SF 
Tyumen51 Tyumen51 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, E36N, T39E, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I  
Tyumen52 Tyumen52 None None   K11T, K20KR, V35T, E36D, T39N, W88C, K101R, D123N, K166R, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L, V245M, E248D, A272P, T286A, E291ED, V292I S191SF 
Tyumen53 Tyumen53 None None   K11T, V35T, T39R, E40D, K43R, V118I, K122E, D123S, I135T, A158S, S162C, K173S, Q174K, Q207A, R211S, F214L, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T L210G 
Tyumen54 Tyumen54 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V S191SF 
Tyumen55 Tyumen55 None None   V35T, E36D, T39K, S48T, K122E, D123S, S162C, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V241VI, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T S191SF 
Tyumen56 Tyumen56 None None   K11A, V35T, T39L, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174E, E204K, Q207A, R211S, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, I293V, P294T S191SF 
Tyumen57 Tyumen57 None None   K11T, V35T, T39K, V118I, K122E, D123S, I135T, A158S, K173L, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211S, F214L, V245M, E248D, A272P, V276I, T286A, V292I, I293V, P294T V261VM 
Tyumen58 Tyumen58 None None   E28K, K32E, V35T, E36S, T39K, K122E, D123S, A158S, S162C, K173S, T200A, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
Tyumen59 Tyumen59 None None   K11T, P14A, V35T, E36D, T39N, E40D, D123N, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178L, T200I, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Tyumen60 Tyumen60 None None   V35T, E36D, V60I, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, V245M, E248D, V254I, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Tyumen61 Tyumen61 None None   V35I, E36D, T39K, S68G, K122E, D123S, I135K, K173L, Q174K, T200A, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V  
Tyumen62 Tyumen62 None None   K11T, V35T, E36D, T39N, K122E, D123S, K173S, Q174EK, D177G, Q207A, V245M, E248D, A272P, V276VI, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
Tyumen63 Tyumen63 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122KE, D123N, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, V276I, T286A, E291D, V292I, I293V  
Tyumen64 Tyumen64 None None   V35T, E36D, T39K, K43Q, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
Tyumen65 Tyumen65 None None   V35I, K122A, D123S, I135IMT, K173AV, Q174K, D177E, I178IL, Q197L, Q207A, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, I293V, P294T S191SF 
Tyumen66 Tyumen66 None None   V35T, T39M, K122E, D123S, E138A, T165I, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D  
Tyumen67 Tyumen67 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, T69S, K122E, D123N, A158S, K166R, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
Tyumen69 Tyumen69 None None   K11T, K20R, V35T, E36N, T39N, K122E, D123S, E138A, K173L, Q174K, Q207A, V245M, E248D, A272P, E291D, V292I S191SF, G285E, T286L 
Tyumen70 Tyumen70 None None   K20R, V35T, E36D, T39R, K43E, K122E, D123S, K173S, Q174K, Q207A, R211S, V245M, E248D A267AT 
Tyumen72 Tyumen72 None None   K11T, K20R, V35T, E36D, T39K, K122E, D123NS, S162C, K173L, Q174K, E203D, Q207A, R211S, V245M, E248D, D250A, A272P, T286A, E291D, V292I  
Tyumen74 Tyumen74 None None   K11T, V35I, E36D, T39K, S68G, K102Q, K122E, D123S, A158S, K173S, Q174K, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D S191SF 
Tyumen75 Tyumen75 None None   K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, T139TAIV, A158S, K173IV, Q174K, T200I, Q207A, R211S, L228LF, V245M, E248D, A272P, V276VI, K277KR, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T I37IL, S191SF