<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Perez-Parra (2016)
Title Phylodynamic and phylogeographic profiles of subtype B HIV-1 epidemics in south Spain.
Citation PLoS ONE
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 50
NumPts 50
Subtype B

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
1002090 1002090 None None   V60I, K122E, D123E, I135V, I142V, S162A, D177E, Q207E, L210F V118S 
1010036 1010036 None None   K49R, K122Q, I142V, S162A, D177DE, V179VI, E204ED, Q207E, R211RG S105F 
10220808 10220808 None None   K49R, R83K, R211G  
1022090 1022090 None None   V60I, D123E, I142V, S162A, Q207E, L210F  
10230225 10230225 None None   V60I, D123E, K166R, I178L, G196E, I202V, E204D, R211G, F214L  
10290085 10290085 None None   K43KQ, K46KQ, I50V, R83K, K122KE, E138EA, I142IL, E169ED, R211Q  
10310147 10310147 None None   I135T, E194D, F214L N137H 
10709118 10709118 None None   V60VI, K122E, I178M, I195L, R211K  
11020003 11020003 None None   T39TA, V60I, S68SG, D123E, T139K, I142V, S162HY, I178M, Q207QR, R211E  
11130002 11130002 None None   K49KR, V60I, D123E, I135T, I142V, S162A, Q207E, L210F  
1117800 1117800 None None   V60I, R83K, I135V, I178V, G196E, Q207H, R211K  
11260147 11260147 None None   I50V, V60I, D123E, I135T, D177E, T200A, R211K  
120400192 120400192 None None   K49R, I50V, V60I, D123E, I135V, I142V, S162A, Q207E, L210F  
1210692 1210692 None None M184MV K103KN, V108VI T69S, K102GR, D123E, I142IT, I178IL, H208HY  
12401731 12401731 None None   K49R, R83K, K122E, D123N, T200TA, R211K  
2040165 2040165 None None   R83K, D123E, K166R, D177E, I178M, R211K  
2505104 2505104 None None   R83K, I135V, Q174R, D177DG, R211RK  
25052230 25052230 None None   T39A, S48T, S162C, G196E, R211K  
25091042 25091042 None None   V60I, K102Q, R211K  
25120845 25120845 None None   R83K, A98S, E138A, S162Y, Q174G, R211RK  
2601072 2601072 None None   I135V, K166R, E194EG  
26040956 26040956 None None   L100LF, I142M, I178M, G196E, T200A  
2609058 2609058 None None   V60I, R83K, D123E, I135V, R211K  
26112078 26112078 None None T215L  K122KE, S162C, T200A, R211K  
27011277 27011277 None None K219KN  K64KR, V90VI, I167IF, Q174RS, R211K I135I*KL, Y146Y*S, N147NI, K154KN, G155GV, K201K*, D218DY 
27042032 27042032 None None   V60I, R83K, K102KR, K122P, D123E, K166R, D177E, R211K  
27051504 27051504 None None   V60I, S68G, K82KR, D86E, V106VI, K122E, I135T, K166R  
3160146 3160146 None None T215D  S68G, V106I, I135T, I142IT, L210LF, R211RK  
3240136 3240136 None None M41L, D67N, L210W, T215Y, K219R K103N K43E, E44A, K49R, K101Q, V118I, K122R, D123E, I142V, E169D, D177EK, G196E  
4133001 4133001 None None   V60I, R83K, K122E, R211S  
41500807 41500807 None None   R83K, I202V, Q207QR, R211K  
41600845 41600845 None None   K49KR, I50IV, R83K, T200A, E204D  
5050205 5050205 None None   K49KR, R83K, S162SN, D177DE, I178MV, R211K  
51780109 51780109 None None   K122P, I142V, S162A, N175H, Q207QE, R211RK  
5290806 5290806 None None   K122E, I135M, S162C, E169D, Q174H, G196E, I202V, R211K  
6071437 6071437 None None M184V, T215Y A98G, K101E, G190A E138A, D177E, I178MV, V179I, T200TA, Q207H, R211Q  
60901608 60901608 None None   K49R, R211K E44EV 
6110138 6110138 None None M41L, L210W, T215Y A98A*GS, K103N, G190GA K49R, K101KQ, K122P, D123E, I135IT, E169D, D177E, T200A  
6220011 6220011 None None   R83K, D123E, I135IV, S162C, I178L, T200TI, R211K  
7183000 7183000 None None   V60I, K122KR, I142V, S162A, Q207E  
8040106 8040106 None None   R83K, K122E, S162C, R211RK  
8060080 8060080 None None   V60VI, K122E, I135T, K173KE, D177DE, I202V, Q207NS  
81302144 81302144 None None   K49R, V60I, R83K, T200A  
81370032 81370032 None None   K49R, V60I, K122Q, I142V, S162A, Q207E, R211M  
8177000 8177000 None None   I50V, V60I, S68G, D123E, E169D, D177E, R211S  
9107001 9107001 None None   K122E, Q174H, D177E, R211K, F214L  
91100807 91100807 None None   K49R, D123E, A158AS, E169D, R211K  
9110081 9110081 None None   S162C, P176PQ, D177DN, T200A  
9243000 9243000 None None   D121DH, K122E, I142IT, S162CY, I178IM, T200TI, R211K  
92802254 92802254 None None   R83RK, V111I, I135T, S163ST, K166KR, T200A, R211RK, F214L