<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Onywera (2017)
Title Surveillance of HIV-1 pol transmitted drug resistance in acutely and recently infected antiretroviral drug-naïve persons in rural western Kenya.
Citation PLoS ONE
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 87
NumPts 87
Subtype A, D, C, B, G

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
0010704 0010704 None None   K49R, V60I, K122E, D123N, I135R, D177E, I178M, T200A, Q207G, R211K, V245K, K249Q  
0101402 0101402 None None   P4T, V35T, E40D, G45GE, K49R, V60I, D121Y, K122E, R172RK, D177E, T200I, Q207E, R211K, V245K, D250E, S251SN  
0101602 0101602 None None   V35T, T39R, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177G, V179I, G196E, I202V, Q207A, V245K, S251N  
0160301 0160301 None None   K11Q, K20R, V35T, K49R, I50IV, V60I, K64KR, T69S, D86E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200TA, Q207A, R211NS, V245E, D250E, S251SN  
0160803 0160803 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, K43E, V60I, D121DH, K122KE, D123N, I135T, K173A, Q174KR, D177E, V179I, T200EIKV, I202V, Q207A, R211S, I244V, D250E  
0190202 0190202 None None   E6K, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123N, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E  
0210801 0210801 None None M184MV K101H, G190A K20R, E28A, V35T, T39L, V60I, K122E, D123N, I135T, K173A, Q174K, D177E, I178IM, V179I, T200TA, Q207A, R211S, F214L, L228LQ, V245Q, D250E  
0212301 0212301 None None   V35T, V60I, W71*, K101Q, K122E, D123S, I135T, E138A, S162Y, K173S, Q174K, D177G, V179I, E194K, Q207T, R211S, F214L, P243Q, V245K, D250E, S251H R72K 
0241302 0241302 None None   V35T, V60I, K122E, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, D250E  
0260202 0260202 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, V106I, K122E, I135T, D177E, T200I, Q207E, R211K, V245K, D250E  
0300501 0300501 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122KE, D123DG, A158AS, K173AE, Q174K, D177E, T200A, R206RK, Q207E, V245Q, S251D  
0301602 0301602 None None  K103N K11Q, K20R, V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123S, I135T, T165I, K173S, Q174K, D177E, V179I, E194D, T200E, Q207A, R211S, F214L, V245E, D250E  
0330302 0330302 None None   V35T, T39M, V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200V, E203D, Q207A, R211S  
0351701 0351701 None None   I5V, V35IT, D121C, K122E, D123E, D177E, T200A, R211RK, V245E, E248D, S251C  
0361402 0361402 None None   K20R, K32R, V35T, E36D, V60I, K122E, D123N, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245I, D250E  
0391802 0391802 None None   P4S, K11T, V21I, V35T, E36A, D123N, I135T, I142L, K173S, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248D  
0401402 0401402 None None   V35T, V60I, K102KR, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174R, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211N  
0500603 0500603 None None   V8I, V35T, I135T, K173A, D177E, V179I, Q207A, R211S, F214L, V245Q  
0540802 0540802 None None   K11T, K20R, V35T, T39TA, K102Q, K104R, D123N, K173A, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L, V245Q  
0551003 0551003 None None   V21I, V35T, V60I, K122E, D123N, I135T, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245M  
0570901 0570901 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, I135T, K173A, Q174K, D177E, I195L, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E  
0601702 0601702 None None   V35M, K49R, V60I, K122E, D123N, I135T, D177E, T200I, Q207E, R211K, V245E  
0620602 0620602 None None   E28EA, V35T, V60I, T69S, D121H, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245E, D250E  
0630401 0630401 None None   E6D, V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207G, R211S, V245E, D250E  
0630403 0630403 None None   K11KT, K20R, V21I, T27S, V35T, T39X, E40ED, K43R, V60I, D121Y, K122E, D123DG, I135T, S162H, K173S, Q174K, V179VI, T200A, Q207A, R211S, V245Q, D250E  
0631701 0631701 None None   K20R, V35T, T39A, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K166T, K173S, Q174K, D177E, V179I, G196E, Q207A, R211S, V245M, D250E, S251N  
0631702 0631702 None None   P4H, K20R, V21VI, V35IT, T39A, E40ED, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173LS, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, F214FL, V245M, D250E  
0631801 0631801 None None   V35T, T39A, E40D, V60I, D121H, K122E, D123S, I135T, I142V, K173L, Q174K, T200A, Q207A, R211S, E248N, D250E  
0680702 0680702 None None   K11R, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142V, I159V, D177E, V179I, T200I, Q207E, R211K, V245K, D250E  
0681903 0681903 None None   I5V, V35T, E40D, K49R, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178IM, V179VI, I195T, T200A, Q207E, R211K, V245K, D250E  
0691701 0691701 None None   V35T, E36AV, T39E, S48T, K122E, D123G, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207K, R211N, V245Q, D250E P133PS 
0721403 0721403 None None   E6K, V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, E169D, D177E, I178M, Q207E, P243S, V245K, D250E  
0751101 0751101 None None   V35T, K49R, I50IV, V60I, D121Y, D123E, D177E, I178IM, V179I, T200I, Q207E, R211K, V245KM, S251SN K122KEGR 
0751401 0751401 None None   V35T, T39M, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123G, I135T, D177E, Q207A, R211K, P243S, V245E  
0751402 0751402 None None   V21I, V35T, V60I, D121H, K122V, I135T, K173S, Q174K, D177E, D192N, Q207A, R211N, V245EG, D250E  
0760801 0760801 None None   K20R, V35K, V60I, A158AS, T165I, Q174E, D177E, I178M, T200A, K201R, I202IV, E204EK, Q207K, R211N, P243T, V245Q, D250E  
0792002 0792002 None None   E6K, V21I, V35T, T39KR, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211N, V245Q, E248D, D250E, S251H  
0810403 0810403 None None   K11Q, V35T, V60I, K122E, D123G, I135V, K173S, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211K, F214L, V245E, E248D, D250E  
0840201 0840201 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, D121Y, K122E, S162C, D177E, I178M, V189I, I195R, T200L, Q207G, R211K, V245K, P247A, K249Q, D250E  
0841402 0841402 None None   V35T, T39K, E40D, K49R, V60I, K122KE, D123NS, I135IT, K173S, Q174K, I178LV, V179I, Q207A, R211S, F214L, V245E, D250E  
0851401 0851401 None None   E6D, V35T, T39K, K49KR, K122E, D123G, K173S, D177EG, V179I, E194ED, T200TA, I202V, Q207A, V245Q, E248N  
0860701 0860701 None None   K20R, V21VI, E36EK, K49R, V60I, R172K, D177E, I178M, Q207E, R211K, V245H, D250E E79EK, E89EK, D185DN 
0860702 0860702 None None   K20R, K49R, V60I, I142V, R172K, D177E, I178M, Q207E, R211K, V245H, D250E  
0900602 0900602 None None   V21I, V35T, T39M, V60I, T69S, D121Y, K122E, I135T, K173D, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211K, V245E, D250E  
0921502 0921502 None None  K103N V35K, V60I, K122E, D123G, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211N, F214L, V245Q, D250E  
0951302 0951302 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q, D250E, S251N  
0951602 0951602 None None   V35T, T39R, K43Q, D121Y, K122E, E138A, D177E, E194D, Q207D, R211K, V245K, D250E  
0952201 0952201 None None   V35T, V60I, S68SN, D121H, K122E, I135T, D177E, I178M, T200E, Q207E, R211K, F214FL, V245K, D250E  
0991102 0991102 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, D121C, K122E, I135T, D177E, T200A, E204K, Q207E, R211K, P243T, V245K, D250E  
0991602 0991602 None None   E6KT, K11KQ, V35T, T39I, E40D, V60I, D121H, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, V245K, D250E  
1020901 1020901 None None   V35T, T39K, K122E, D123N, K173S, Q174K, D177E, G196E, Q207A, V245K  
1041502 1041502 None None   V35T, T39M, V60I, S68G, T69N, D86DE, D121Y, K122E, I135IT, E138EA, I178M, Q207E, R211RK, P243H, V245E, D250E  
1060801 1060801 None None   V21I, V35T, E36D, T39K, K43E, D121H, K122E, I135T, K173L, Q174K, V179I, Q207A, R211S, V245L  
1071402 1071402 None None   K20R, V21I, V35T, T39A, E40D, V60I, K122E, D123N, I135T, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, V245Q  
1140305 1140305 None None   V21I, V35T, T39M, V60I, T69S, D121Y, K122E, I135T, K173D, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211K, V245E, D250E  
1140902 1140902 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, F214L, L228H, V245E, D250E  
1150201 1150201 None None   V35T, V60I, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211N, D250E  
1150202 1150202 None None   V35T, V60I, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211N, D250E  
1161702 1161702 None None   P4S, K11A, V35T, T39M, V60I, D123N, I135T, K173S, D177E, T200A, Q207A, R211S, F214L, V245Q, E248D  
1170301 1170301 None None   V35T, T39M, V60I, D121Y, K122E, I142IV, D177E, I178M, Q207EG, R211K, K238KR, V245T, D250DE  
1170802 1170802 None None A62V, K65R, M184V K103S, V106M V35T, T39TA, S68N, K122E, D123GS, I135M, K173A, D177E, I178M, T200A, I202IV, Q207E, R211K, V245Q  
1201401 1201401 None None  K103N V35T, V60I, T69S, D121Y, K122E, S163T, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K, V245K  
1211101 1211101 None None   V35T, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179T, T200A, Q207A, R211RKNS, F214FL, I244V, V245EK, D250E  
1211102 1211102 None None   E6D, V35T, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179T, T200A, Q207A, F214L, I244V, V245K, D250E  
1211302 1211302 None None L210LW  K11E, K20R, V35T, E36D, T39I, V60I, D121Y, K122E, D123G, I135T, E138A, T165I, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211K, F214L, V245K, D250E  
1241001 1241001 None None   V35T, E40D, K49R, I50V, V60I, K104R, K122E, I135T, D177E, V179I, Q207D, V245K, D250E  
1241302 1241302 None None   V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, T165I, T200A, Q207E, V245Q, D250E  
1270103 1270103 None None   E6K, K32R, V35T, V60I, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, G196E, Q207A, R211S, F214L, V245E, D250E  
1281602 1281602 None None   V35T, V60I, D123E, I135T, I142V, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L, V245E  
1311802 1311802 None None V75I, K219KN Y181C E28K, I31L, K32E, V35T, T39L, K49R, V60I, V90I, D177E, I178M, T200TI, Q207A, R211K, L228LR, V245K, D250E  
1330501 1330501 None None   V21I, V35T, K49R, V60I, D121H, K122E, R125K, A158T, S162C, D177E, G196R, T200I, I202V, Q207N, R211K, V245K, E248D, D250E  
1331301 1331301 None None   I5IV, K20R, V35T, T39A, K43A, K49KR, I50IV, V60I, K122E, D123N, R125K, I135T, K173S, Q174K, V179I, T200TA, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
1341808 1341808 None None   V35T, T39M, K49R, V60I, K101R, D121Y, K122E, D123E, D177E, I178M, Q207G, R211K, V245K, E248D, D250E  
1360102 1360102 None None   V35T, K49R, V60I, K102R, K103R, D123E, I135T, E169D, T200A, Q207A, R211K, F214L, V245K, S251A  
1370501 1370501 None None   V35T, T39A, E40D, V60I, V118I, K122Q, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, F214L, V245M, D250E  
1401802 1401802 None None   K11Q, K32R, V35T, E40D, V60I, D121DY, K122E, D123G, T165IV, T200I, Q207E, R211K, V245Q, D250E  
1411802 1411802 None None   V35T, V60I, K122E, D123G, I135T, D177E, T200IV, Q207G, R211K, V245K, D250E, S251N  
1431801 1431801 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135IK, I178IM, V179VI, T200A, Q207G, R211K, V245K, D250E  
1472001 1472001 None None   K32R, V35T, V60I, D121Y, D123G, R125K, I135T, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, E203K, E204K, Q207A, R211S, F227Y, V245K, D250E, S251N L149LP 
1480701 1480701 None None   K11T, V35T, K43R, V60I, K101Q, I135R, K173S, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245Q, D250E E29EK 
1490702 1490702 None None   V35T, V60I, K122E, D123S, I142V, T200A, Q207N, R211K, V245Q  
1531302 1531302 None None  V179E P4S, V35T, T39S, V60I, S68G, D123E, A158S, Q174E, D177E, I178M, I195L, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E  
1531703 1531703 None None   I5V, K20R, V35T, E40ED, K49R, V60I, D121H, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, G196GE, Q197QL, Q207A, R211S, F214L, E248N  
1541701 1541701 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, I178IM, V179I, G196E, Q207A, R211S, V245K, D250E  
1561801 1561801 None None   V35T, T39M, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, I178V, V179I, G196E, Q207A, R211N, V245E, D250E, S251I  
1570502 1570502 None None   V35T, K49R, V60I, D121HY, K122E, D177E, V179VI, I195IM, T200TI, Q207E, R211K, V245K  
1580506 1580506 None None   E6EK, V35T, T39A, V60I, T69S, I135T, I142V, S162HY, K173S, Q174K, V179I, I202IV, Q207E, R211K, V245E, D250E