<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Wu (2015)
Title The predominant cluster of CRF01_AE circulating among newly diagnosed HIV-1-positive people in Anhui Province, China.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 99
NumPts 99
Subtype CRF01_AE


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
AQAFKB0610 AQAFKB0610 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, E138ED, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, G196E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
AQAFKB0613 AQAFKB0613 None None  V179D E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, R211S, V245E  
AQAFKB0615 AQAFKB0615 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D123N, K173I, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, R211S, V245E  
AQAFKB0624 AQAFKB0624 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162SN, K173I, Q174K, D177E, I178V, V179I, G196E, T200IR, Q207A, R211S, V245E  
AQAFKB0625 AQAFKB0625 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
AQAFKB0626 AQAFKB0626 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162SN, K173I, Q174K, D177E, I178V, V179I, G196E, T200I, Q207A, R211S, V245E  
AQAFKB0628 AQAFKB0628 None None   I5IV, E6D, K11T, K22KR, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162W, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207T, R211S, K238R, V245E  
AQAFKB0631 AQAFKB0631 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, V111I, K122E, D123S, S162Y, K173N, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, E248A  
AQAFKB0637 AQAFKB0637 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
AQAFKB0639 AQAFKB0639 None None   E6D, K11T, V35T, T39EK, K43KE, K122E, D123S, I135V, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, T200TI, E203ED, Q207AD, R211S, K238R, V245E  
AQAFKB0641 AQAFKB0641 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, I202V, Q207A, R211S, K238R, V245E  
AQAFKB0645 AQAFKB0645 None None   E6N, K11T, V35T, T39TN, E40ED, K122E, D123S, S162C, Q174N, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
AQAFKB0646 AQAFKB0646 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K66R, K122E, D123S, S162C, Q174K, D177DE, I178IM, V179VI, V189VI, E194EQ, I195ILM, T200TI, Q207A, R211S, K238R, V245K  
AQAFKB0647 AQAFKB0647 None None   E6D, K11T, V35IT, E36ED, T39K, K43E, S68G, K122E, D123N, S162N, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, I202V, Q207A, R211S, V245E  
AQAFKB0648 AQAFKB0648 None None  V179D E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
BBAFKB0659 BBAFKB0659 None None   E6D, K11T, V21VI, V35T, T39K, K43A, K102KR, K104KR, K122E, D123S, I142IT, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
BBAFKB0660 BBAFKB0660 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I135IT, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
BBAFKB0661 BBAFKB0661 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43A, K122E, D123S, S162C, K173KR, Q174N, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
BBAFKB0669 BBAFKB0669 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, E169D, K173R, Q174R, D177E, I178M, T200TI, Q207A, L210LM, R211S, K238R, V245E  
BBAFKB0674 BBAFKB0674 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43KE, K103KR, K122E, D123S, I135T, K173IR, Q174K, D177E, V179VI, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
BBAFKB0716 BBAFKB0716 None None  V106VM E6D, K11T, V35T, T39K, K43A, K102R, K122KE, D123NS, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
BZAFKB0516 BZAFKB0516 None None  V179D P4S, E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K102R, D123N, S162C, K173N, Q174K, D177E, Q207A, R211N, K238R, V245E  
BZAFKB0542 BZAFKB0542 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, G196K, T200K, Q207D, R211S, F214L, K238R, V245D  
BZAFKB0559 BZAFKB0559 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200R, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245D  
BZAFKB0562 BZAFKB0562 None None   E6D, V21I, V35I, T39K, K43E, K122E, D123S, I135V, S162C, K173R, Q174R, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, I244V, V245E  
BZAFKB0564 BZAFKB0564 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43A, K122E, D123S, S162C, K173KR, Q174N, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
BZAFKB0567 BZAFKB0567 None None   E6D, K11T, L12*, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, V189I, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
BZAFKB0568 BZAFKB0568 None None M184V  E6D, V35T, T39A, K102KQ, K103KR, V118I, K122E, D123S, I135T, F171FY, K173IT, Q174K, D177E, Q207D, R211S, F214L, V245E  
BZAFKB0570 BZAFKB0570 None None   E6D, K11T, K20KR, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, I178M, G196S, E203K, Q207A, R211S, K238R, V245E, E248EK  
CZAFKB0784 CZAFKB0784 None None   E6D, V8I, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I142V, S162C, K173KM, Q174K, D177E, T200K, Q207A, R211S, F214FL, K238R, V245T  
CZAFKB0787 CZAFKB0787 None None K219KR  E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
CZAFKB0788 CZAFKB0788 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179I, G196E, T200V, Q207A, R211S, V245E  
CZAFKB0791 CZAFKB0791 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200R, E203D, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245D  
CZAFKB0792 CZAFKB0792 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, S162N, K173I, Q174K, D177E, T200R, E203D, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245D K73KR 
FYAFKB0802 FYAFKB0802 None None   E6D, K11T, V35T, T39KR, K43E, V118I, K122E, D123NS, I135T, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
FYAFKB0803 FYAFKB0803 None None T215TA  E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123N, S162C, K173N, Q174K, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245K  
FYAFKB0804 FYAFKB0804 None None  V179D E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, D123N, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207NS, R211S, K238R, V245K  
FYAFKB0808 FYAFKB0808 None None  V179E E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135IT, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
FYAFKB0810 FYAFKB0810 None None L210LW  E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200R, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245D  
FYAFKB0814 FYAFKB0814 None None   V35T, T39KR, K43E, K122E, D123S, S162C, P170S, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203ED, Q207A, R211S, K238R, V245E  
FYAFKB0816 FYAFKB0816 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43Q, V60I, K122E, D123S, I135R, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211NS, K238R, V245E  
FYAFKB0841 FYAFKB0841 None None   E6N, K11T, V35T, T39R, K43E, S68G, K122E, D123S, I135R, S162C, D177E, I178M, E203ED, Q207A, R211S, K238R, V245E  
FYAFKB0845 FYAFKB0845 None None   E6NS, K11T, V35T, T39R, K43E, S68G, K122E, D123S, I135R, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
FYKB0802 FYKB0802 None None   E6D, K11T, V35T, T39KR, K43E, V118I, K122E, D123NS, I135T, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
FYX312 FYX312 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123X, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207T, R211S, K238R, V245E  
HFAFKB0675 HFAFKB0675 None None  V179D E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, K102R, D123N, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211N, K238R, V245EK  
HFAFKB0677 HFAFKB0677 None None   P4H, E6D, K11T, V21I, V35T, T39R, K43E, K102R, K104R, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, E203D, Q207A, R211S, K238KR, V245E, K249Q  
HFAFKB0678 HFAFKB0678 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, S162C, F171Y, K173R, Q174E, D177E, I178M, E204K, Q207N, R211S, K238R, V245E  
HFAFKB0679 HFAFKB0679 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I195L, R206RK, Q207A, R211N, K238R, V245IK  
HFAFKB0680 HFAFKB0680 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K102R, K122E, D123N, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HFAFKB0681 HFAFKB0681 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135IT, K173R, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214FL, K238R, V245E  
HFAFKB0688 HFAFKB0688 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39R, K43E, K102R, K122E, D123S, I135IR, S162C, D177E, I178IM, V179I, T200TA, Q207A, R211S, K238R, V245KQ  
HFAFKB0691 HFAFKB0691 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, K173R, D177E, T200A, E204K, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HFAFKB0692 HFAFKB0692 None None   E6D, V35T, T39KR, K43E, T69N, K102R, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, V179I, V189I, Q207A, R211S, K238R, V245E, K249R L210LFPS 
HFAFKB0694 HFAFKB0694 None None   E6D, K11T, V21VI, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207T, R211S, K238R, V245E  
HFAFKB0698 HFAFKB0698 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I135T, S162C, K173KR, Q174KR, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R  
HFAFKB0701 HFAFKB0701 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123N, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HFAFKB0702 HFAFKB0702 None None   I5V, E6D, V35T, T39K, K43E, K49R, K122E, D123N, I135T, S162W, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207T, R211S, K238R, V245E  
HFAFKB0704 HFAFKB0704 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123NS, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HFAFKB0708 HFAFKB0708 None None   E6ED, V35T, T39K, K122E, D123S, I135R, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, V245E  
HFAFKB0711 HFAFKB0711 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68SG, K122E, D123N, S162C, Q174K, D177E, I178M, Q207A, L210M, R211S, K238R, V245E  
HFM10 HFM10 None None   V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, P170S, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HFM13 HFM13 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D123N, S162C, F171Y, K173Q, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
HFM15 HFM15 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D123N, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HFM16 HFM16 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D123N, S162C, K173R, Q174R, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HFM17 HFM17 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K103R, K122E, D123S, Q174R, D177E, V179VI, T200R, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
HFM3 HFM3 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HFM6 HFM6 None None V75VL  E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, K122E, D123N, I135T, S162C, E169D, K173KR, Q174K, D177E, I178M, T200TA, Q207A, R211S, V245E  
HFM7 HFM7 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K103R, K122E, D123S, K173KE, Q174K, D177E, T200R, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
HNAFKB0604 HNAFKB0604 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HNAFKB0605 HNAFKB0605 None None   E6D, V8I, K11T, V21I, V35T, T39E, V111I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
HNAFKB0607 HNAFKB0607 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K103R, K122E, D123S, S162C, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HNAFKB0609 HNAFKB0609 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I135T, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HNAFKB0612 HNAFKB0612 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49KR, K122E, D123S, I135T, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HNAFKB0614 HNAFKB0614 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122KE, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, L210LMST, R211S, K238R, V245E, E248D  
MASAFKB0573 MASAFKB0573 None None M184V  E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, I142V, T165I, K173A, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
MASAFKB0575 MASAFKB0575 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D123S, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, K238R, V245E  
MASAFKB0582 MASAFKB0582 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162Y, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207T, R211S, K238R, V245EK  
MASAFKB0584 MASAFKB0584 None None   E6N, K11T, L12*, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179VI, T200TA, E203D, Q207ADE, R211RKNS, K238R, V245E  
MASAFKB0586 MASAFKB0586 None None   E6N, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MASAFKB0587 MASAFKB0587 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, G45E, K122E, D123N, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, I195L, G196E, Q207A, R211S, K238R, V245K E89K, E233K 
MASAFKB0594 MASAFKB0594 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162SC, K173KNRS, Q174K, D177E, I178M, V189VI, I195L, G196E, T200TA, E203EG, Q207A, R211S, V245K  
MASAFKB0596 MASAFKB0596 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162SC, K173KNRS, Q174K, D177E, I178M, V189VI, I195L, G196E, T200TA, E203EG, Q207A, R211S, V245K  
MASAFKB0598 MASAFKB0598 None None  G190A V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, R125K, I142V, S162T, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MASAFKB0601 MASAFKB0601 None None   E6D, V8VI, K11T, V35T, T39K, K43E, V60VI, S68G, K122E, D123S, I135R, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, V245E  
SZAFKB0712 SZAFKB0712 None None   E6D, K11T, V35T, T39KR, K43A, K122E, D123N, I135IRT, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, G196GE, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SZAFKB0714 SZAFKB0714 None None   E6D, V35T, T39K, E40Q, K43E, K122E, D123N, K126KR, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
WHAFKB0494 WHAFKB0494 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K49R, K122E, D123S, I135IR, S162C, K173A, Q174K, D177E, I178M, I195L, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, K249KQ  
WHAFKB0495 WHAFKB0495 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K49R, K122E, D123S, I135R, S162C, K173A, Q174K, D177E, I178M, I195L, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
WHAFKB0496 WHAFKB0496 None None  V179E E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, V111I, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, L210LM, R211S, V245E  
WHAFKB0498 WHAFKB0498 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43A, K122E, D123S, S162C, P170S, K173R, Q174K, D177E, V179T, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
WHAFKB0502 WHAFKB0502 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173A, Q174K, D177E, I178M, Q207A, L210M, R211S, F214L, K238R, V245E  
WHAFKB0504 WHAFKB0504 None None   P4T, E6D, K11S, V35T, T39K, E40Q, K43E, V118I, D121H, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211N, F214L, K238R, V245E  
WHAFKB0509 WHAFKB0509 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, L210M, R211N, K238R, P243S, V245K  
WHAFKB0511 WHAFKB0511 None None   E6ED, K11T, V35T, T39K, K43E, D121DH, K122E, D123NS, S162C, D177E, E204Q, Q207A, R211S, K238R, V245AE  
XCAFKB0649 XCAFKB0649 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V90VI, K104KR, S105A, K122E, D123N, S162SC, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200R, Q207A, R211S, V245E, K249Q  
XCAFKB0653 XCAFKB0653 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68SG, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, L210M, R211S, K238R, V245E  
XCX275 XCX275 None None   E6D, K11T, K32R, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123N, S162C, K173N, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
XCX276 XCX276 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, K103R, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174N, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E