<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Wang (2016)
Title HIV prevalence and phylogenetic characteristics among entry travelers in Xishuangbanna prefecture, Yunnan province, between 2003 and 2012.
Citation J Med Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 223
NumPts 223
Subtype CRF01_AE, C, B, CRF08_BC, CRF07_BC, B + C + CRF01_AE, B + C, A

 

  Page 1 of 3    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 223 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
10014 10014 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, S68G, K101R, K173M, Q174K, D177E, V179T, T200I, Q207A, R211S, V245T  
10015 10015 None None   E6D, K11T, V35T, D123S, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245K  
10029 10029 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, Q207E, R211K, V245Q, A272S  
10036 10036 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q, A272P  
10054 10054 None None  A98G V35T, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, K173T, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P  
10080 10080 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, K102R, K104R, K122E, D123S, I135T, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, I244V, V245E, D250E  
10082 10082 None None  V179D E6D, V35T, T39K, S162C, K173V, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245Q  
10110 10110 None None   S162C, Q207E, V245I, A272P  
10115 10115 None None   E6D, V35I, I135V, S162C, V245L, A272P  
11042 11042 None None   E6D, V8I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E I270L 
11043 11043 None None   S162C, E169D, R211Q, V245M, A272P  
11068 11068 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, S68G, I135T, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, V245E, A272P  
12015 12015 None None   E6D, V35T, T39K, V60I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, Q207A, R211N, K238R, V245Q  
12031 12031 None None M184V  E6D, K32R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245E, K249Q  
12041 12041 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162Y, Q207E, V245Q, E248V, K249Q, A272P  
12055 12055 None None   D121Y, K122E, S162C, T200A, Q207E, A272P  
12066 12066 None None   K11Q, K49R, V106I, I135V, S162C, I202V, E224D  
12067 12067 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, D121Y, K122E, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250T, A272P  
12127 12127 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173S, Q174K, Q207E, R211N, K238R, V245Q  
12129 12129 None None   E6D, K11A, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245E, A272P  
12165 12165 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135V, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P  
12167 12167 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, K166R, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
12168 12168 None None   K20R, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, I202V, Q207A, R211S, K238R, V245E  
12199 12199 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, S68G, T69N, K122E, D123S, I135T, S163A, K173I, Q174K, D177E, I195L, T200A, Q207A, R211S, V245E  
3031 3031 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173A, T200A, I202V, Q207G, R211K, V245Q, K249R, A272P  
3079 3079 None None   K102R, D121Y, K122E, S162Y, Q174R, G196E, F214L, V245M  
3090 3090 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K101R, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3091 3091 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162A, K166R, K173A, D177K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
3095 3095 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, K173V, Q174K, D177E, V179T, T200A, Q207E, R211K, V245E, K259R, A272P  
3102 3102 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D121H, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, I178M, E204K, Q207A, R211S, V245N  
4032 4032 None None   S162C, Q207E  
4040 4040 None None   K101R, I135V, S162C, V245M  
5004 5004 None None   E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, I135T, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E  
5013 5013 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, N175H, D177E, T200I, Q207A, K238R, V245E  
5017 5017 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173M, Q174K, D177E, Q207A, R211S, I244V, V245E, E248D, K249Q  
5019 5019 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, D121H, K122E, D123S, T165I, K173I, Q174K, D177E, G196E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
5031 5031 None None   V35I, K101R, I135T, S162C, T200A, E204K, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P  
5037 5037 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, V90I, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
5046 5046 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123N, I135T, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
5062 5062 None None   E6D, V35M, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, S162Y, Q174N, D177E, I180V, T200I, Q207A, R211K, E224G, K238R, V245Q, A272P  
5247 5247 None None   I135V, S162C, T200A, V245Q, D250E, A272P  
5270 5270 None None   I135V, S162C, R211K, V245Q  
5272 5272 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, S162C, K173R, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
6012 6012 None None   V35T, E36A, T39D, V60I, D121Y, K122E, S162C, K173A, P176T, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
6020 6020 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178V, T200I, I202V, Q207N, R211K, F214L, V245Q, A272P  
6021 6021 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D121H, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
6022 6022 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K166R, K173A, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
6056 6056 None None   V60I, K122E, D123S, I135T, F214L  
6057 6057 None None   V35T, T39E, S48T, E53D, V60I, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
6063 6063 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173S, Q174K, D177E, E203D, Q207A, R211S, E224D, K238R, V245E, A272P  
6296 6296 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K101R, D121Y, K122E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
7012 7012 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, Q207A, V245K  
7016 7016 None None   S162C, T200A, I202V, E204D, R211M, V245L, E248D  
7029 7029 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, V90I, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, G196E, T200A, E203D, E204D, Q207A, R211K, K238R, V245N, A272P  
7048 7048 None None   V8I, K11T, V35T, K122E, D123S, S162Y, K173M, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R  
7050 7050 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
7059 7059 None None   S162C, T200A, I202V, E204D, V245L, E248D, A272T  
7067 7067 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, I135V, S162C, T200A, V245E  
7068 7068 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K173V, Q174K, D177E, V179T, T200A, Q207E, R211K, V245Q, P247T, A272P  
7073 7073 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, I135T, K173V, Q174K, D177E, I178L, V179T, G196E, T200A, Q207A, R211S, V245E, E248V  
7081 7081 None None   E6N, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P  
7202 7202 None None   S162C, Q174L, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
7269 7269 None None   S162C, K173E, D177E, I178L, Q207K  
8026 8026 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
8030 8030 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162C, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
8054 8054 None None  A98G V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162A, K173A, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
8097 8097 None None   K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, T131P, S134R, S162T, S163T, K173I, Q174T, D177E, E194A, Q207A, R211S, K238R, V245E R78K, V108E, Y127N, D192A 
8111 8111 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, I142V, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P G262V 
8144 8144 None None   V35L, K103R, K122E, I135V, S162C, T200A, Q207S, R211K, F214L, A272P  
8153 8153 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K104R, D121Y, K122E, I135T, K173T, I178L, T200A, Q207G, R211K, E224D, V245Q, A272P  
8196 8196 None None   E6D, V21I, V35T, T39K, K43E, K122E, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
8204 8204 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, D123E, I135T, S162C, K173A, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, V245Q  
8214 8214 None None   E6D, V8I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E  
8259 8259 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, V90I, D123E, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
8260 8260 None None M184V K101E, Y181C, G190A E6D, K11T, G15E, V35T, T39E, K122E, D123S, I135T, K166R, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, H221Y, K238R, I244V, A272P  
8277 8277 None None   E6D, K11T, V35T, E36D, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
9011 9011 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D123N, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245E, K249R  
9016 9016 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K102R, K122E, S162H, K166R, K173A, T200A, Q207G, R211K, V245Q, A272P  
9024 9024 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, S68G, S162Y, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245E  
9027 9027 None None   V35T, E36A, T39D, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, Q207E, V245Q, A272P  
9037 9037 None None   E6D, V35T, T39K, I135T, K173I, Q174K, D177E, V179T, G196E, Q207A, R211S, F214L, V245K  
9043 9043 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, T107S, D121Y, K122E, I135T, T139A, S162C, K173A, T200A, E204K, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
9045 9045 None None   V35T, T39K, K43A, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178V, V179I, Q207A, R211S, V245E, A272P  
9051 9051 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, K173I, Q174K, G196E, T200I, Q207A, R211T, K238R, V245E  
9066 9066 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, T107S, K122E, I135V, T165I, K173A, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
9069 9069 None None   V35K, T39D, D121Y, K122E, S162C, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
9073 9073 None None   E6D, K20R, V35T, T39K, K43E, I135T, K166R, K173T, Q174K, D177E, V179I, E203Q, Q207A, R211S, K238R, V245K, A272E  
9076 9076 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, K238R, V245D  
9081 9081 None None   V35T, T39N, V60I, D121H, K122E, S162C, I178L, V179I, Q207E, R211K  
9084 9084 None None   V106I, S162C, I178M, R211G, V245I, S251I  
9085 9085 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V106I, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200I, Q207A, R211S, V245K  
9090 9090 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123N, S162H, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q, A272P  
9097 9097 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K101R, K122E, I135V, T165I, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P  
9107 9107 None None   I135V, S162C  
9109 9109 None None   V35T, T39K, K43E, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245E  
9112 9112 None None   E6D, E28A, V35T, T39E, S68G, I135T, T165I, Q174K, D177E, Q207A, R211N, K238R, V245E  
9114 9114 None None   V35A, T39A, I135V, S162C, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
9123 9123 None None   K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173V, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
9136 9136 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, D121H, T165I, K173L, Q174K, D177E, G196E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
9141 9141 None None   V21I, T27S, V35T, T39M, K101R, D121Y, K122E, E138A, I142V, S162C, T200A, Q207E, R211K, V245Q, K249Q, S251N, A272P