<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Zeh (2016)
Title Molecular epidemiology and transmission dynamics of recent and long-term HIV-1 infections in rural western Kenya.
Citation PLoS ONE
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 258
NumPts 258
Subtype A, D, C, B, G

 

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Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 258 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
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0513660_04 0513660_04 None None   V35T, V60I, K122E, D123G, I135T, I142IT, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
0513910_04 0513910_04 None None   E6ED, K11T, V35T, V60I, K64R, D121H, K122E, D123S, I135T, T165I, K173LV, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211N  
0514010_04 0514010_04 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39K, K122E, D123N, K173A, D177G, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211RS  
0514300_04 0514300_04 None None   V35T, T39L, V60I, D121H, K122E, K126R, I135T, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, F214L  
0515470_04 0515470_04 None None   K11T, V21I, K32KI, V35T, E36ED, T39KR, V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174R, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211K  
0515680_04 0515680_04 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D177E, T200A, Q207E, R211K  
0515900_04 0515900_04 None None   V21VI, V35T, E36A, T39E, S48T, D121H, K122E, A158S, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207DN, R211K  
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0517200_04 0517200_04 None None   V35T, V60I, D121H, K122E, D123S, I135T, K173S, D177E, V179I, T200A, Q207A D17N 
0517260_04 0517260_04 None None   P4PT, V35T, K43R, V60I, D121H, K122E, I135T, S162C, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S  
0517920_04 0517920_04 None None   E6D, V35T, V60I, K102KR, K103R, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L  
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0518380_04 0518380_04 None None   K11T, V21I, V35T, T39A, E40D, V60I, D121H, K122E, D123S, I135T, A158S, K173S, Q174K, V179I, T200A, Q207A  
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0520330_04 0520330_04 None None   V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, I142V, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
0521450_04 0521450_04 None None   V35T, T39M, V60I, D121Y, K122E, D123G, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
0522040_04 0522040_04 None None   E6N, V35T, T39TI, E40D, K49R, D121H, K122E, I135IT, D177DE, I178IM, Q207A, R211K  
0522130_04 0522130_04 None None   V35T, E40D, K43R, K49R, V60I, K64KR, K122E, K173S, Q174K, D177E, I178M, V179VI, Q197E, T200K, Q207A, R211S  
0542740_05 0542740_05 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, D177E, I178IM, E194D, T200I, Q207EG, R211K  
0560900_04 0560900_04 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, D121H, K122E, D123S, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207E  
2001590_05 2001590_05 None None   K20R, V35T, K43R, K49R, V60I, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211N  
2005190_05 2005190_05 None None   K32R, V35T, T39M, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200V, Q207A, R211S  
2005290_05 2005290_05 None None   V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, G196E, Q207D, R211S  
3000290_05 3000290_05 None None   V35T, V60I, K122A, D123N, I135T, K173T, Q174K, D177E, V179I, G196E, Q207A, R211K  
3000340_05 3000340_05 None None   K11M, V35T, V60I, D121Y, K122E, D123G, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
3000490_05 3000490_05 None None   P4Q, K20R, V35T, V60I, D121H, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200TA, I202V, Q207N, L210S, R211S, F214L  
3000590_05 3000590_05 None None   V35T, V60I, K122E, D123G, I135T, I159IV, K173S, Q174K, V179I, I195T, T200A, Q207A, R211S  
3000690_05 3000690_05 None None   V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173T, Q174K, D177E, I178IM, V179I, T200A, Q207A, R211S  
3000780_05 3000780_05 None None   E6S, K11H, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K  
3000800_05 3000800_05 None None   V35T, T39A, E40D, K49R, V60I, D121H, K122E, I135T, I142T, S162A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
3000820_05 3000820_05 None None   P4PS, K20R, V21I, V35T, T39TA, K49KR, V60I, R83RG, K104KR, D123S, I135T, E169D, K173S, Q174QR, D177E, I178L, V179I, T200A, I202V, Q207T, H221Q  
3000850_05 3000850_05 None None   E6D, V35T, T39G, K122E, D123N, I135T, K173S, D177E, V179I, T200K, I202V, Q207A, R211K  
3000870_05 3000870_05 None None   K11T, V35T, T39R, K49KR, K122E, D123N, I142V, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S  
3000960_05 3000960_05 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
3001060_05 3001060_05 None None T215TA  K20KR, V21VI, V35IT, T39TA, V60I, D121H, K122E, I135T, I142T, K173S, Q174K, D177E, V179IT, T200TA, I202IV, Q207A, R211S  
3001470_05 3001470_05 None None   V35T, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L  
3001670_05 3001670_05 None None   V35T, T39TA, V60VI, K122E, D123DN, I135IT, I142IV, K173S, D177E, V179VI, T200A, I202IV, Q207A, R211NS  
3001680_05 3001680_05 None None   V35T, E40D, V60I, K122E, D177E, I178M, T200V, Q207A, R211K  
3001780_05 3001780_05 None None   V35T, E40D, V60I, D121H, K122E, I135T, K173A, Q174K, V179I, Q207A, R211S  
3002050_05 3002050_05 None None   E28EA, V35T, T39TK, V60I, D121H, K122E, I135T, D177EG, T200A, Q207A  
3002150_05 3002150_05 None None   V35T, E36D, T39A, V60I, D121Y, K122E, R125K, I135L, I142V, S162C, D177E, T200A, Q207G, R211K N57ND 
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3002660_05 3002660_05 None None   K20KR, V35T, V60I, I135T, S162A, K173S, Q174K, D177E, I178IM, V179I, T200A, Q207A, R211S  
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3006080_05 3006080_05 None None   V21I, V35T, V60I, I135T, K173I, Q174K, V179I, Q207A, R211S  
509870_04 509870_04 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K104R, K122E, D123G, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E