<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Saeng-Aroon (2016)
Title Circulation of HIV-1 multiple complexity recombinant forms among female sex workers recently infected with HIV-1 in Thailand.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 158
NumPts 158
Subtype CRF01_AE, A

 

  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 158 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
110141 110141 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, S68G, K122E, D123N, I135V, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E, E248D  
110151 110151 None None   E6D, V8VI, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178L, T200I, Q207N, R211S, V245E  
110643 110643 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123S, I135T, T165I, K173R, Q174E, D177E, I178M, T200A, E204Q, Q207A, R211S, K238R, V245E  
110648 110648 None None   E6D, K11S, V35T, T39K, K43E, V60VI, D86DE, W88WC, V118VI, K122E, D123N, K166KR, K173I, Q174K, T200TA, I202IV, Q207A, R211S, F214FL, K238KR, V245E  
110684 110684 None None   E6D, V8I, K11T, K20KR, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, I135T, K166KR, K173IT, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245E  
110729 110729 None None   E6D, K20R, V35T, E36A, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, S251SN  
110942 110942 None None  V108VI E6D, V35T, T39K, K43KE, W88C, K102KR, K104KR, K122E, D123N, I135V, K173M, Q174K, D177E, I178M, T200S, E203EK, R206RK, Q207A, R211S, K238R, V245K  
111196 111196 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I142V, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E, E248D  
111284 111284 None None   E6D, K11S, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I142IV, S162A, K173I, Q174EK, D177E, I178M, V179I, T200A, E204K, Q207A, R211S, V245EK V254VG 
112005 112005 None None   E6D, V35T, T39R, K43E, V106VI, K122KE, I135IT, S162C, K173A, Q174K, D177E, I195IL, T200I, I202IV, Q207A, R211S, K238R, V245E, E248D  
112064 112064 None None   E6D, K20R, V35T, T39K, K43E, K102Y, K122E, D123N, S162C, Q174R, D177E, I178M, G196E, Q207A, R211S, K238R, V245E, S251C  
112566 112566 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, T69TS, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
112704 112704 None None  A98G I5V, E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, K49R, K101Q, K102R, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, E204EK, Q207A, R211S, K238R, V245E  
112706 112706 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, D121H, K122E, D123S, I135T, K173M, Q174K, D177E, T200AEV, Q207A, R211S, V245E  
112710 112710 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, K43E, V111I, V118I, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211K, F214L, K238R, V245E  
113777 113777 None None   E6D, V8VI, K11T, V35T, T39E, K43KE, K122E, D123S, S162N, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
114510 114510 None None   E6D, K11T, K22R, V35T, T39K, K43E, K49R, S68G, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, V245D  
114558 114558 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173IT, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238KR, V245EK, K249KQ  
114894 114894 None None   E6D, K11T, K22R, V35T, T39K, K43E, S68G, K102R, V106I, V118I, K122E, D123S, K166KR, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200E, Q207A, R211K, E224D, V245E  
115384 115384 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K166R, K173IV, Q174K, D177E, G196E, T200TI, I202V, Q207A, R211S, K238R, V245E  
115648 115648 None None   E6D, K20R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135IV, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, E203D, Q207A, R211S, V245E, E248D  
116365 116365 None None   K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123NS, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, V245E Q269QH 
116476 116476 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207A, R211S, V245K, K249Q  
116994 116994 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D121HY, K122E, D123DG, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200TA, Q207A, R211S, K238R, V245E  
117098 117098 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, D177E, Q207EK, R211S, K238R, V245E  
117444 117444 None None   E6D, V8I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
117502 117502 None None   E6D, K11T, V35T, T39KR, K43E, K122E, D123N, S162C, K173A, Q174K, D177E, E203EA, Q207A, R211S, K238R, V245K  
117666 117666 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, D121DH, K122E, D123NS, I142V, K173IT, Q174K, D177E, I178M, T200TA, Q207A, R211S, V245E V60VIM 
117688 117688 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, Q174N, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
117721 117721 None None K219KN K103KN E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, E203D, Q207A, R211S, V245E, K249R, S251H  
117749 117749 None None   K11R, V35T, T39K, V60I, S68G, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, I178L, T200E, Q207A, R211S, V245E  
117929 117929 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I135V, I142V, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245E, K249Q  
117936 117936 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135IL, E138EG, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207AST, R211S, V245E, K249KR  
117946 117946 None None   V35T, T39K, K43E, K101KR, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, I244V, V245K  
50740 50740 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, I135T, S162A, K173IT, Q174K, D177DE, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
50781 50781 None None   E6D, V35T, T39A, E40D, K122E, D123S, I135IT, S162C, K173AITV, Q174K, D177E, I195L, Q207A, R211S, K238KR, V245E, S251H  
50966 50966 None None   E6A, K11A, V35T, T39K, K43E, V106VI, K122E, D123NS, K173L, Q174K, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
51149 51149 None None   E6D, K11T, V35T, T39TK, K43KE, K122E, D123S, I135IT, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238KR, I244V, V245E  
51183 51183 None None   K20R, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
51951 51951 None None   E36K, I37F, T39K, K43E, V60VI, K122E, D123NS, I135T, K173T, Q174K, D177E, I178MV, V179I, I202V, Q207A, R211S, V245E  
52109 52109 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K64R, D123N, K173I, Q174N, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
52476 52476 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, K122E, D123S, I135T, Q174K, D177E, I178V, Q207A, R211S, K238R  
53008 53008 None None   E6D, K11S, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173M, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245E  
53212 53212 None None   E6D, K11S, V35T, T39K, K43E, I135T, K173I, Q174K, D177E, V179T, Q207T, R211S, K238R  
53729 53729 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K64R, D121H, K122E, D123S, I142V, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
53787 53787 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135IM, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
53805 53805 None None   E6D, V35T, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174R, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E  
54847 54847 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135IV, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, F214L, K238R, I244V, V245Q  
55105 55105 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174K, D177E, Q197QP, Q207A, R211NS, K238R, V245E  
55344 55344 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, D121H, K122E, D123S, I135V, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200I, Q207G, R211S, K238R, V245E  
55361 55361 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, V60I, D121H, K122E, D123S, F171Y, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, V245E, K249Q  
55437 55437 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K101R, K122E, D123S, S162T, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245E  
55887 55887 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K82KR, K122E, D123S, I135V, I142T, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
56167 56167 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211K, V245E  
56325 56325 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173M, Q174K, D177E, I178IM, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
56795 56795 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245Q  
56903 56903 None None   K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, E138A, I142IT, K173M, Q174K, D177E, I178V, T200I, Q207N, R211S, K238R, I244V, V245E  
70223 70223 None None  V179D E6D, V35T, T39K, K43A, K122E, D123S, K166R, Q174E, D177E, T200I, Q207A, R211K, K238R, V245E  
70311 70311 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
70347 70347 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211KN, K238R, V245A  
70350 70350 None None   E6N, K11T, K20R, V35T, T39K, E40EG, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207D, R211S, K238R, V245E  
70726 70726 None None   E6D, V8I, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, I135T, K166KR, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211K, V245E  
70738 70738 None None   E36K, I37F, T39K, S117*, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, K238R, V245E Y115I 
70770 70770 None None   E6D, K20R, V35T, T39K, K43E, K49KR, V60I, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, V245EK, E248ED  
70800 70800 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245Q, K249KR  
71299 71299 None None   K11T, V35T, T39K, K43E, T58TI, D121H, K122E, I135T, T165I, K173I, Q174K, D177E, R199RT, T200AP, I202V, Q207NS, R211S, K238R, V245K, D250E  
71642 71642 None None   E6D, K11S, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
71704 71704 None None   E6D, V8VI, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162N, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
72167 72167 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I142V, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
73404 73404 None None  V179D E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, T200A, E203ED, Q207A, R211S, K238R, V245E  
73435 73435 None None  V179D E36K, I37F, T39K, K43E, V60I, D121Y, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245K  
73647 73647 None None   I5V, E6D, K11T, V35T, E36A, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, E204K, Q207A, R211S, K238R  
73896 73896 None None   T39K, K43E, S68G, K122E, D123S, I135T, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, L210M, R211S, K238R, V245E  
74287 74287 None None   E36K, I37F, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245D  
74295 74295 None None   E36K, I37F, V60I, W88C, K122E, D123N, K173T, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211N, K238R, V245E  
74908 74908 None None   K30Q, K32G, A33C, L34T, V35L, E36N, I37F, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
75003 75003 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, T69N, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178IM, V179I, Q207A, R211S, V245E  
75357 75357 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68SG, K122KE, D123N, Q174KR, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
75940 75940 None None  K103N E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200IM, Q207A, R211S, K238R, V245E  
76940 76940 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, I135M, S162A, K173I, Q174K, D177EK, I178IM, G196E, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
78249 78249 None None   E36K, I37F, T39K, K43E, D121DH, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
91143 91143 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118VI, K122E, D123N, I142V, K173I, Q174K, I178M, T200I, Q207A, L210M, R211S, F214L, V245E  
91366 91366 None None   E6ED, P9PT, V35T, T39K, K43E, K122E, D123NS, K173I, Q174K, D177E, V179I, G196E, Q207A, R211S, K238R, V245E V8VE, V10VIM 
91731 91731 None None   E36K, I37F, T39K, K43E, K122E, D123S, I135IMT, K173I, Q174K, D177E, E194D, Q207A, R211S, V245E  
91735 91735 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162SC, K173IT, Q174K, D177E, T200TA, Q207A, R211S, K238R, V245E  
91757 91757 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
92453 92453 None None   E6D, K20R, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123NS, S162C, F171Y, K173A, Q174K, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
92579 92579 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, V111I, K122E, D123N, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, P243S, V245E  
94187 94187 None None   E6D, K11T, V35T, E36D, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211N, I244IV, V245E  
94694 94694 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43Q, S68G, W88R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q197EK, Q207A, R211S, K238R, V245E  
95273 95273 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245EK  
95886 95886 None None   E36K, I37F, T39K, K43E, V111VI, K122E, D123S, S162A, K173L, Q174K, D177E, I178IMV, Q207A, R211GS, K238KR, V245E  
95974 95974 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177G, Q207A, R211S, K238R, V245K, E248D  
96197 96197 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, V111I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, F214L, V245E, E248Q, D250E, S251I  
96199 96199 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S105SA, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
97420 97420 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V111I, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200I, Q207A, R211S, F214L, V245E, I257IL  
97738 97738 None None   E36K, I37F, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, V245E  
98802 98802 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K101R, K122E, D123S, I135IV, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200TA, Q207A, R211S, K238R, P243A, V245E, D250DE  
98863 98863 None None   E6A, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, V60I, S68G, K122E, D123S, I135T, E169D, K173I, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207T, R211S, K238R, V245E  
99128 99128 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, Q174R, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E