Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Ross (2014)
Title HIV-1 transmission patterns in antiretroviral therapy-naive, HIV-infected North Americans based on phylogenetic analysis by population level and ultra-deep DNA sequencing.
Citation PLoS ONE
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 690
NumPts 690
Subtype B, C, CRF02_AG, CRF01_AE, A, D, G, CRF05_DF, A + D


  Page 1 of 7    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 690 Clinical PR Isolates

100 100 None    I15V, E35D, N37H, R41K, R57K, L63P, I72V  
1004 1004 None    N37S, R41K, L63A, I72V, V77I, I93L  
1005 1005 None    L19I, M36I, N37S, R41K, R57K, D60E, Q61D, I62V, L63AT, H69K, T74S, L89M, I93L  
1008 1008 None    I13V, E35D, D60DE, L63P, I64ILM, V77VI G17GV 
1011 1011 None    T12P, L19T, K20R, E35D, M36I, R41K, K43R, L63S, I93L  
1018 1018 None    T12P, K14R, G16E, N37T, L63T, E65ED, I72T, V77I, P79AS  
102 102 None    K14KR, N37S, L63P, I72V, V77I, I93L  
1048 1048 None    K14R, I15V, E35D, N37E, R41RK, I62V, L63P, C67Y, V77I  
1052 1052 None    L19I, N37NH, R41K, D60E, Q61E, H69K, V77I, L89M, I93L  
1053 1053 None    I13V, I15IV, N37S, R57K, L63P  
1057 1057 None    E35D, L63AP  
1065 1065 None    I13V, K14R, I15V, K20KR, E35D, M36I, N37D, R41K, K55KR, H69K, L89M  
1075 1075 None    I15V, E35D, M36I, I72V  
1076 1076 None    E35D, N37D, L63P, I64L, I93L  
1078 1078 None    Q18E, I62IV, L63APS, I64IV, I72IV, V77I  
1079 1079 None    R41K, L63LP, V77I, I93L  
1091 1091 None    W6LS, T12TA, I13IV, I15IV, E35D, M36V, N37T, R41K, R57RK, I62IV, I64IV, E65ED  
1113 1113 None    I64V, K70KN  
1118 1118 None    L63P, H69HQ, I72IM, V77I Q18IV 
1139 1139 None    E35ED, L63CST, V82I  
1153 1153 None    T12S, E35D, N37H, R41K, R57K, I62V, L63P, V77I, I93L  
1163 1163 None    I15IV, E35D, M36I, N37E, K45R, R57K, I85IV  
1174 1174 None    I15V, G16GE, N37S, R41K, I62IV, L63AT, V77I  
1208 1208 None    T12E, I15V, L19I, R57K, L63AS, A71T, I93L  
1221 1221 None    T12TA, E35D, N37D, R57K, D60E, L63P  
1223 1223 None    L63AS, I64IM, E65ED, I72V, V77I  
1304 1304 None    E35D, N37S, L63P, I93L  
1305 1305 None  M46ML, I54IV, V82VA, L90LM L24LI, N83ND L10IV, I13IV, I15IV, L19LI, E35ED, M36MI, N37NDGS, R41RK, I62IV, L63LP, I64IV, H69HY, A71AV, I72IT, V77VIM, I93IL  
139 139 None  M46I, I84V  L10I, E35D, N37S, R41K, D60E, I62IV, L63P, V77I, I93L  
144 144 None    N37E, D60E, L63T  
148 148 None    Q18QH, N37S, I72V, V77I  
149 149 None    L10I, I15IL, M36MI, R41K, I62V, L63PS, A71AV, V77VI, I93L  
153 153 None    T12N, I62V, L63H, V77I  
176 176 None    I13V, N37E, D60E, I62V, L63P, I64IV, H69Y, I72V  
194 194 None    L33V, I64V  
227 227 None   L33LF I13V, K14GR, I15V, E35D, N37NDEK, R41RK, I62IV, G68GE, H69HR, I72IV, V77VI  
234 234 None    T12S, L19I, V77I, V82I, I93L  
241 241 None    N37S, R41K, I72V  
27 27 None    K14KR, I15V, E35D, N37D, I62V, A71T, I93L  
286 286 None    E35D, N37D, L63P, I72IT, I93L  
33 33 None    L10V, E35D, P39Q, R41K, L63P, A71T, I72V  
37 37 None    I13V, K14R, L33V, N37D, R41K, L63H, I64V, E65D  
381 381 None    T12E, I13V, L19I, E34EG, M36MI, N37NCSY, L63P, V77I  
419 419 None    E35D, M36I, R57K, I64V, K70R W6W* 
421 421 None    T12P, I15V, L19I, N37S, I62V, L63A, I93L  
424 424 None    L10V, R41K, I62IV, L63P, I93L  
434 434 None    L19I, E35D, L63P  
438 438 None    L10I, I13V, L19I, L63X, I64V, E65ED, C67S, V77I  
453 453 None    G17GE, L19LI, L33V, E35D, R41RK, R57K, I62IV, L63CPRS, A71V, I72IV, I93L  
458 458 None    L10V, I13V, L63LP, I64V, V77I  
474 474 None    I15V, R41K, V77I  
51 51 None    L10I, K14R, L63T, H69Q, V77I, I93L  
514 514 None    T12S, I15V, R57K, L63P, I93L  
539 539 None    T12A, D60DE, Q61QK, I62IV, L63LP, I64V  
55 55 None    K14R, E35D, R41K, I62V, L63P, H69Q  
564 564 None    L19T, M36I, N37D, R41K, I64V, E65D  
569 569 None    I15V, E35D, R57K, I62V, L63P, I64IM, H69Y  
572 572 None    I13IV, K20KR, Q61QK, L63LP, A71AT  
58 58 None    A71T, I72T, V77VI, I93L  
586 586 None    T12E, L19I, E35D, R41K, D60E, L63P, A71T, I93L  
593 593 None    N37S, L63P, H69Q, V77I, I93L  
594 594 None    T12TP, I13V, L19LI, E35D, N37D, D60E, I62IV, L63P, V77I, I93L  
611 611 None    I13V, K43KR, I64V, V77VI  
634 634 None    L33LV, E35D, N37E, R41RK, D60E, Q61N, L63S, I64M  
644 644 None    E35D, D60E, L63P, A71T, V77I  
652 652 None    T12E, L19I, E35D, L63P, H69Q  
664 664 None    R41K, L63P, I64L, K70R, V77I  
679 679 None    K43KR, R57K, L63A, V75VI  
681 681 None    W6WG, I15V, L19T, R41RK, L63A, I64M, I85IV  
684 684 None    I13V, K14R, I15V, K20I, E35D, M36I, R41K, H69K, K70R, V82I, L89M  
695 695 None    M36I, R41K, D60E, I62V, L63P, I93L  
698 698 None    K14KR, I15V, K20KR, M36MI, R41K, R57K, L63P, E65D, I72V  
710 710 None    R57K, I62V, L63P, C67DGNS, I72EV  
719 719 None    I13V, K14KR, I15IL, L19I, L33LV, I62V, L63S, I64V, E65ED  
74 74 None    L19T, N37NS, I64V, T74A, V77I  
756 756 None    I13V, N37NS, R41RK, I62IV, I64IV, V77I  
765 765 None    K14R, L19I, R57K, L63H, H69Q, V77I  
777 777 None    K14R, E35D, N37T, R41K, I62V, L63P, I93L  
781 781 None    I15V, N37S, R57RK, D60E  
795 795 None    K14R, E35D, M36I, N37D, R57K, L63P, I93L  
801 801 None    E35D, N37S, I64V  
809 809 None    I13V, E35D, N37S, P39PS, K43R, R57K, L63P, I64V, I72V  
815 815 None    R41K, R57K, D60E, I62IV, L63P, I93L  
819 819 None    L10I, T12I, I13V, E35D, R41K, I62V, L63P, A71T  
822 822 None    R57K, L63P, V77I, I93L  
825 825 None    L10LI, K14R, I15IV, I62IV  
842 842 None    L19V, K43KR, L63Q, V77I  
843 843 None    E35D, N37NS, R41K, I62IV, L63LP, A71AT, I93L  
849 849 None    I13V, L33V, E35D, N37S, I64V  
850 850 None    L10IV, T12PS, I13V, G16GE, L19I, K20R, M36I, N37T, P39S, R41RK, K43R, L63P, H69K, K70KR, L89I  
86 86 None    L63S, V77VI  
87 87 None    K20R, M36I, I62V, L63S, I64V  
873 873 None    T12P, K14R, L63P, I72IV, V77I, I93L  
876 876 None    E35D, N37S, R41K, L63Q, A71V, V77I, I93L  
879 879 None    N37S, I62V, L63P, H69Q  
883 883 None    W6R, A22AT, N37NS, R41K, I62IV, L63HQ, C67X, I72IV, V77VI, I93L  
888 888 None    T12A, E35D, M36I, R41K, R57K, I62V, L63P, A71T, I93L  
892 892 None    E35N, N37D, I62V, L63P, I93L  
908 908 None    T12TS, I13IV, K14R, I15V, K20R, M36I, N37K, R41N, L63T, H69K, L89M, I93L  
911 911 None    T12P, I13IV, K14KR, L19IT, K20R, M36I, R57K, L63CS, A71AITV, I72V, I93L