<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Otecko (2016)
Title Viral and host characteristics of recent and established HIV-1 infections in Kisumu based on a multiassay approach.
Citation Sci Rep
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 100
NumPts 100
Subtype A, D, B, C, CRF10_CD

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
401181 401181 None None   E6D, V8I, K11Q, V35T, E40ED, V60I, D121H, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245K M41MI, K126I 
401410 401410 None None   E6K, K20R, V35E, K49R, V60I, A98S, K102KQ, K122E, D123G, I135T, E138A, A158S, K173T, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
401476 401476 None None   V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, V179VI, T200A, I202IV, Q207A, R211S, V245E  
401885 401885 None None   V35T, V60I, K102KR, D121H, I135T, K173T, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S  
402106 402106 None None   K20KR, V35T, V60I, K122E, D123G, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K, V245E  
402139 402139 None None   K11KE, V35T, V60I, D121H, K122E, D123S, I135T, S162C, K173S, Q174K, D177E, T200A, E204D, Q207A, R211S, V245K  
402253 402253 None None   V35T, E40D, V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245Q  
402275 402275 None None   V35T, V60I, K122E, D123N, I135T, E138A, S162C, K173LS, Q174K, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245Q  
402559 402559 None None   V35T, V60I, D121DH, D123G, K173AS, Q174K, D177E, I178IL, V179I, T200A, I202V, Q207K, R211E, V245Q  
402582 402582 None None   V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211K, V245I  
402651 402651 None None   V8VI, V35T, D177E, I178M, T200I, I202IV, Q207E, R211K, V245Q  
402775 402775 None None   V21I, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245E  
402800 402800 None None   V35T, E40D, V60I, K122E, D123N, I135T, E169D, K173A, Q174K, T200V, Q207A, R211S, V245Q  
402822 402822 None None   E6EK, V21I, T27TS, V35T, V60I, K122E, D123NS, I135T, I142T, K173S, Q174K, D177E, I178IL, V179T, Q207A, R211S, I244V, V245E  
402833 402833 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, K49R, V60I, D123DN, K173IL, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207K, R211S, V245Q K43KIN 
402844 402844 None None   K11T, V21I, V35T, T39A, E40D, V60I, D121H, K122E, D123NS, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, G196E, Q207A, R211S, V245M  
403096 403096 None None   V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, I142IV, D177E, T200TA, Q207E, R211K, V245K  
403176 403176 None None   P4H, E6Q, K11T, K20R, V35A, T39A, V60I, K102Q, D121Y, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S, F214L  
403836 403836 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123G, I135T, A158AS, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207D, R211S, V245E  
404431 404431 None None   P4S, K11T, K20R, V21I, V35T, E36D, T39R, V60I, V111I, V118I, D123N, I135T, T165IV, K173A, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, F214L, V245Q  
404511 404511 None None   P4S, K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, V60I, K122KE, D123N, K173S, D177E, V179I, I195IL, T200A, I202V, Q207A, R211K, V245Q  
404566 404566 None None   K11KE, V35T, T39LM, V60I, D121H, K122E, D123S, I135T, K173AS, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
404908 404908 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, D123N, K173L, Q174K, D177E, V179VI, T200A, Q207A, R211N, V245Q  
405025 405025 None None   V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D177E, V179A, Q197QE, T200A, Q207GR, R211K, V245M  
405467 405467 None None   E6D, K11A, K20R, V21I, V35T, T39K, D121Y, K122E, T165I, D177E, Q207E, R211K, V245E  
405478 405478 None None  V108VI V35A, T39K, D121H, K122E, I135T, I142T, T165I, I178L, Q207E, F214L, V241A, V245K  
405558 405558 None None   V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, I142T, K173LS, Q174K, V179I, Q207A, R211S  
405707 405707 None None   V35T, T39TI, V60I, K122E, D123N, I135T, T139TI, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
406084 406084 None None   K11Q, K20KR, V35IM, V60I, S68T, V118I, D121Y, K122E, I135T, K173KE, D177E, I178L, T200A, E204D, Q207G, R211K, V245EK  
406482 406482 None None   E28K, K32E, V35T, E40D, V60I, D121H, K122E, I135T, P170PS, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207D, R211S, V245K  
406722 406722 None None   V35T, V60I, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L, V245E  
406813 406813 None None   K20R, K49R, V60I, K122A, I135T, D177G, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
406971 406971 None None   V35T, T39N, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211K, V245Q  
407010 407010 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K173A, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207E, R211K, V245Q  
407043 407043 None None   V35K, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211S, V245E  
407203 407203 None None   P4T, E6D, K11T, K20R, V35T, T39KR, D123N, K173S, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211E, F214L, V245Q  
407214 407214 None None   V35T, T39A, V60I, D121Y, K122E, D123DN, A158S, K173A, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245E  
407485 407485 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, V60I, K122E, D123S, I135V, T139TS, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245Q  
407634 407634 None None V75I  I5V, V35T, T39A, E40D, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123G, K126Q, I132L, E169D, D177E, I178M, T200A, Q207E, I244V, V245EK G231GD 
407781 407781 None None   E28K, K32E, V35T, T39M, K49R, V60I, K64R, D121Y, K122E, I135T, I159V, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K, V245K  
407850 407850 None None   K20R, V35T, V60I, K122E, D123N, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L  
408079 408079 None None   P14T, V21I, E28EA, V35T, V60I, K102KR, I135T, S162Y, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245E  
408206 408206 None None   V35T, T39L, E40ED, V60I, K122E, D123S, I135T, K173AS, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245K  
408308 408308 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, K49R, K122E, D123G, I135IV, K173A, Q174QR, D177E, T200A, Q207E, R211RK, V245Q  
408397 408397 None None   K20R, V35T, T39A, E40D, K49R, V60I, A98S, K122E, I142V, D177E, T200TA, Q207E, R211K, V245Q  
408433 408433 None None   E6D, K20R, V35T, V60I, V118I, K122E, D123S, S163T, K166R, K173L, Q174K, D177E, V179I, E194EK, T200A, E203EK, Q207A, R211K, F214L  
408524 408524 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, K122E, D123N, K173S, D177G, V179I, I202V, Q207A, R211K, V245Q  
408546 408546 None None   E6D, V21I, V35T, V60I, K122E, D123NS, I135T, I142IT, T165TI, K173LS, Q174K, V179I, T200A, I202V, Q207N, R211RS, V245E  
408580 408580 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K101KR, K122E, D123G, E138A, K173R, D177E, I178V, T200TI, Q207G, R211K, V245HQ  
408660 408660 None None   P4H, V35T, E40D, V60I, K122E, D123NS, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200V, Q207A, R211S, F214L, V245E  
408762 408762 None None   K20R, V35K, V60I, K122E, D123S, I135T, I142IV, K173S, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211S, F214FL, V245E  
408808 408808 None None   K32R, V35T, K49R, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
408820 408820 None None   V21I, V35T, T39M, K49R, V60I, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K  
408933 408933 None None   V35T, K49R, V60I, K64KR, D121Y, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
409072 409072 None None   V35T, E36EA, T39E, E40ED, S48T, K122KE, K173A, T200A, Q207EK, P243S, V245Q  
409185 409185 None None   V35T, K49R, V60I, K122E, D123N, D177E, T200A, E204D, Q207E, R211RK, F214L, V245K E29EG 
409287 409287 None None   V8I, K20R, V35T, T39M, E40D, K49R, V60I, I135T, D177E, E194EA, Q207E, V245K  
409312 409312 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39K, E40D, K49R, A98S, T165I, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, V245Q  
409834 409834 None None   K20R, V35T, E36ED, T39L, V60I, K122E, D123N, I135T, S162SAGT, K173S, Q174K, D177E, T200TA, Q207T, R211N, V245E  
409845 409845 None None   K20R, V35T, V60I, K122E, D123N, I135T, S162C, K173S, Q174K, D177E, Q207T, R211N, V245E  
409889 409889 None None   V35T, V60I, D121HY, K122E, I135T, I142IT, K173S, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211RKNS, D237E  
410025 410025 None None   V35T, V60I, D121H, K122E, D123E, I135T, K173S, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245E  
410070 410070 None None   I5V, V35T, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245M  
410207 410207 None None   I5V, K11T, L34I, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K, V245K  
410296 410296 None None   K11T, V21I, V35T, E40D, V60I, D121H, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, V189I, T200A, Q207A, R211N, V245L  
410309 410309 None None   K32I, V35T, T39R, K122KE, D123G, D177E, I178L, G196E, T200A, E204K, Q207D, V245Q  
410398 410398 None None   K11KT, V35T, T39TI, V60I, T69TS, D121Y, K122E, D123G, I135T, K173E, Q174K, D177E, V179I, V189I, T200A, Q207A, R211S, V245K  
410547 410547 None None   K11T, V21I, V35T, T39K, K122E, D123S, S162A, K173S, D177E, V179I, E194D, T200A, I202V, Q207D, V245Q  
410569 410569 None None   V21VI, V35T, T39I, V60I, K122E, D123N, I135T, K173LS, Q174KR, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245E  
410650 410650 None None   E28A, V35T, V60I, D121Y, K122E, D123DGNS, I135T, S162A, K173LS, Q174K, D177E, I178M, V179VI, T200A, Q207A, R211S  
410661 410661 None None   K11T, K20R, V21VI, V35T, T39R, K43E, K122KE, D123S, K173S, D177G, V179I, T200E, I202V, E203Q, Q207A, R211RK, V245Q  
410718 410718 None None   V35T, E40ED, V60I, K122E, D123S, D177EG, I178IM, T200AE, Q207A, R211K, V245K  
410730 410730 None None   V35T, K49R, V60I, K64KR, V90I, K101Q, K122E, I135T, F171Y, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, I244V, V245E  
410876 410876 None None   K20R, V35T, E36D, T39A, V60I, D121H, I135T, S162A, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245M  
411313 411313 None None   P4S, K11T, V35T, V60I, D121H, I135T, K173S, Q174K, D177E, V189I, T200TA, Q207A, R211S, V245K  
411426 411426 None None   E6D, K11Q, V35T, T39M, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162C, D177E, Q207E, R211S, V245K  
411482 411482 None None   K11T, V35T, E40D, D121H, K122E, D123S, I135T, S162C, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200TA, Q207A, R211S, V245Q  
411619 411619 None None   V35I, K49R, V60I, K101Q, D121Y, K122E, I135R, D177E, I178M, T200I, Q207G, R211K, P243S, V245E N54T 
411799 411799 None None   P4H, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245E  
411835 411835 None None   V35T, T39A, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142T, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211NS, P243PS, V245E  
411857 411857 None None   E6D, V35T, T39Q, V60I, D123E, I135T, S162CY, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245Q  
411891 411891 None None   I5IV, V35T, T39N, V60I, K122E, D123G, I135T, I142IV, Q174QR, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245E  
411915 411915 None None   V35T, T39TA, E40D, V60I, D121H, K122E, D123E, I135T, I142V, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245E  
412009 412009 None None   V21VI, V35T, T39M, K49R, V60I, D177E, V179VI, T200I, Q207E, R211K  
412112 412112 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123S, D177E, I178V, T200M, Q207E, R211K, V245Q  
412178 412178 None None   V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D177E, T200I, E204K, Q207E, R211K, V245K  
412190 412190 None None   V35T, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q197R, T200A, Q207A, R211S  
412656 412656 None None   E6K, K11R, V35T, T39M, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, T139V, Y144F, D177E, I178M, Q207E, V245Q  
412805 412805 None None   V8I, V35T, T39M, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135M, D177E, Q207E, R211K, V245KQ  
412850 412850 None None   V35T, T39A, V90VI, D121H, K122E, D123S, A158AS, S162SDGN, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, E204D, Q207A, R211S  
412952 412952 None None   V8I, V35T, T39M, E40D, K49R, V60I, K122E, I135M, S162D, D177E, I178V, T200A, Q207E, R211K, V245K  
413024 413024 None None  V108I V35T, V60I, K122A, D123N, D177E, I178V, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
420633 420633 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, V60I, K122E, D123N, A158S, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245E  
421498 421498 None None   I5IV, E6EK, V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, I178IV, Q207A, R211S, V245LQ  
421954 421954 None None   V35T, E36D, T39D, V60I, K122E, D123N, I135T, E138A, K173T, Q174N, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245K  
422844 422844 None None   V35T, T39Q, V60I, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, V245Q  
422913 422913 None None   V35T, T39N, E40D, V60I, D121H, K173E, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, V245K  
423541 423541 None None   V35T, T39R, D121Y, K122E, I135IT, S162C, D177E, Q207E, R211K, V245T  
423610 423610 None None   E6A, E28A, V35T, V60I, D121NY, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, G196R, T200E, Q207D, R211K, V245K  
424260 424260 None None   E6D, V35T, T39MR, K122E, D123N, S162C, K173L, Q174K, D177E, V179T, Q207A, R211S, V245E