<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Otecko (2016)
Title Viral and host characteristics of recent and established HIV-1 infections in Kisumu based on a multiassay approach.
Citation Sci Rep
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 100
NumPts 100
Subtype A, D, CRF35_AD, C, CRF01_AE, G, F, B, CRF02_AG, A + D

 

Clinical PR Isolates


SubjectIsolatePIsWksPIMajorPIMinorCommonUnusual
401181 401181 None    L19V, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, L89M  
401410 401410 None    T12S, P39PS, R41K, I62IV, L63P, H69K, V77I, V82VI, L89M, I93L G78GE 
401476 401476 None    K14R, E35D, M36I, N37D, R57K, I62V, L63P, H69K, K70KN, L89M  
401885 401885 None    T12S, K14R, I15V, L19I, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, D60E, H69K, L89M  
402106 402106 None    I13V, K14R, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, H69K, L89M  
402139 402139 None    E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, L89M  
402253 402253 None    I13V, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, K70R, L89M  
402275 402275 None    I13V, K14R, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, L89M  
402559 402559 None    T12K, I13V, K14R, G17D, K20I, M36I, N37S, R41K, H69K, K70R, L89M  
402582 402582 None    I13V, K14R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, L89M  
402651 402651 None    K14R, G16E, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
402775 402775 None    I13V, K14R, E35D, M36I, N37E, R41K, R57K, C67Y, H69K, K70R, V82I, L89M  
402800 402800 None    I13V, E35D, M36I, R41K, R57K, L63P, H69K, L89M  
402822 402822 None    I13V, K14KR, E35D, M36I, N37ND, R41K, K45R, R57K, H69K, L89M  
402833 402833 None    I13V, K20R, E35D, M36I, R41K, K45R, R57K, L63LIPT, I64IL, H69K, L89M  
402844 402844 None    I13V, K14R, G17E, M36I, R41K, K45R, H69K, L89I  
403096 403096 None    I13V, K14KR, I15IV, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, D60E, H69K, L89M  
403176 403176 None   L33F I13V, K14KR, E35D, M36I, N37D, R41K, I62V, L63P, E65D, L89M  
403836 403836 None   V11I I13V, K14R, I15IV, K20R, E35D, M36I, N37D, R41RK, R57K, H69K, L89M  
404431 404431 None    I13V, K14R, E35D, M36I, R41K, R57RK, L63LP, H69K, L89I  
404511 404511 None    I13V, E35D, M36I, R41K, R57K, L63A, H69K, L89M  
404566 404566 None    I13V, K20R, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
404908 404908 None    K14R, E35D, M36I, R41K, R57K, I62V, L63T, H69K, L89M  
405025 405025 None    Q18E, E35D, N37NT, R41K, L63P, I64L  
405467 405467 None    I13V, E35D, M36I, R57K, L63P, H69K, L89M  
405478 405478 None    I13V, K14N, G16E, L19I, E35D, M36I, N37H, R41K, L63N, H69K, I72T, V82I, L89M, T91V, I93L  
405558 405558 None    I13V, E35D, M36I, R41K, K45R, R57K, H69KQ, L89M  
405707 405707 None    I13V, K14R, E35D, M36I, N37DE, R41K, R57K, L63A, H69K, L89M  
406084 406084 None    K14R, I15V, M36MI, R41K, L63T, E65D, I72T  
406482 406482 None    I13V, G16E, E35D, M36I, R41K, R57K, L63A, H69K, K70R, L89M, T91V  
406722 406722 None    I13V, K14R, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, L89M  
406813 406813 None    T12TA, I13IV, K14KR, I15V, K20M, E35D, M36I, R41K, L63T, I64V, H69HY  
406971 406971 None    I13V, G16E, K20R, E35D, M36I, P39S, R41K, L63T, H69K, L89M  
407010 407010 None    T12S, I15V, L19T, M36I, N37K, R41N, L63P, H69K, L89M, I93L  
407043 407043 None    I13V, I15V, E35D, M36I, R41K, R57K, L63I, H69K, L89M  
407203 407203 None    I13V, K14R, E35D, M36I, R41K, K45R, R57K, L63P, H69K, L89M  
407214 407214 None    E35D, M36I, R57K, H69K, L89M  
407485 407485 None    T12S, I13V, K14R, G17E, K20I, M36I, N37S, R41K, Q61QH, C67S, H69K, V82I, L89M  
407634 407634 None    I13V, N37S, R41K, L63P, K70R, V77I  
407781 407781 None    L33V, R41K, I64V, H69Y, V75I  
407850 407850 None    I13V, K14R, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, L89M  
408079 408079 None    I13V, I15V, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, D60E, I64V, H69K  
408206 408206 None    T12I, K14R, I15V, G16E, K20I, E35N, M36I, R41K, K45R, R57K, L63S, I64M, H69K, L89M  
408308 408308 None    I15V, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, L89M  
408397 408397 None    I13V, R41K, K43I, L63P  
408433 408433 None    T12V, I13V, E35D, M36I, R41K, R57K, L63P, H69K, L89M  
408524 408524 None    K14R, E35D, M36I, N37D, R41K, I62IV, L63ADHP, H69K, V77I, L89M  
408546 408546 None    I13V, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
408580 408580 None    I13V, M36I, R41K, I64V  
408660 408660 None    I13V, K14R, L19I, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, L89M  
408762 408762 None    I13V, I15V, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
408808 408808 None    I13V, K14R, I15V, E35D, M36I, R41K, R57K, L63A, H69K, L89M  
408820 408820 None    I13V, M36I, R41K, I62V, I64V  
408933 408933 None    I13V, I15V, K20R, M36I, R41K, L63T, I64L, I72T  
409072 409072 None    T12S, I15V, L19I, E35D, M36I, N37K, R41N, D60E, Q61E, L63P, H69K, L89M, I93L  
409185 409185 None    I13V, K14KR, E35D, R41K, L63AT  
409287 409287 None    I13V, K14R, G16E, R41K, H69Y, I72KR  
409312 409312 None    I13V, K14R, G16E, E35D, M36I, R41K, K45KR, R57K, L63H, H69K, K70R, I72IV, V77I, L89M  
409834 409834 None    I13V, K14KR, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, L89M  
409845 409845 None    I13V, K14R, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, L89M  
409889 409889 None    I13V, K14R, I15V, M36I, N37D, R41K, H69K, L89M  
410025 410025 None    I13V, K14R, I15V, M36I, N37D, R41K, H69K, L89M  
410070 410070 None    I13V, K14R, I15V, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, K70R, L89M  
410207 410207 None    I15V, E35D, M36I, P39S, R41K, R57K, L63T, H69K, L89M  
410296 410296 None    I13V, K14R, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, L89M  
410309 410309 None    I13V, K20I, E35D, M36I, R41K, D60E, H69K, L89M  
410398 410398 None    K14R, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, D60E, H69K, L89M, I93L  
410547 410547 None    I13V, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
410569 410569 None    I13V, M36I, R41K, I64V, E65D  
410650 410650 None    K14R, I15V, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, L89M  
410661 410661 None    I13V, K14R, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
410718 410718 None    I13V, R41K, L63PQ, I64V, E65D, H69Y, I72IV, V77VI  
410730 410730 None    I13V, L19I, R41K, I64V, H69Y  
410876 410876 None    I13V, K14R, E35D, M36I, N37D, R41K, K45R, R57K, H69K, L89M  
411313 411313 None    I13V, K14R, I15IV, G16GE, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
411426 411426 None    I13V, K14R, E35D, M36I, R41K, R57K, L63P, I64M, H69K, L89M  
411482 411482 None    I13V, K14R, G16A, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
411619 411619 None    M36L, R41K, D60E, I64V, K70R  
411799 411799 None    I13V, K14R, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, K45KR, R57K, D60E, L63LP, H69K, L89M  
411835 411835 None    I13V, I15V, E35D, M36I, R41K, R57K, L63AV, H69K, L89M  
411857 411857 None    I13V, E35D, M36I, R41K, R57K, L63AT, L89M  
411891 411891 None    L63A, H69HKNQ, V77VI  
411915 411915 None    I13V, K14R, G16E, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, C67CY, H69K, K70R, L89M  
412009 412009 None    I13V, K14KR, M36I, R41K, L63PQ, I64V, I72V  
412112 412112 None    M36I, R41K, L63P, I64V, E65D, K70R  
412178 412178 None    I13V, K20R, M36I, R41K, I64V  
412190 412190 None    I13V, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, L63P, H69K, K70R, L89M  
412656 412656 None    I13V, L19I, E35D, M36I, R41K, R57K, L63P, H69K, K70R, I72IV, L89M  
412805 412805 None    I13V, I15V, K20R, M36L, N37D, R41K, L63P, I64L  
412850 412850 None    I13V, K14KR, G16GA, E35D, M36I, R41K, I62IV, H69K, L89M  
412952 412952 None    L19I, E35D, P39Q, R41K, L63P, A71T, V77I  
413024 413024 None    I13V, K14R, K20I, E35D, M36I, N37D, R41K, H69K, L89M  
420633 420633 None    E35D, M36I, R41K, R57RK, H69K, L89M  
421498 421498 None    E35D, M36I, N37D, R41K, K55R, R57K, D60E, L63Q, H69K, L89LM  
421954 421954 None    I13V, K20R, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, H69K, K70R, L89M  
422844 422844 None    K14R, E35D, M36I, N37E, R41K, K45R, R57K, D60DE, I62V, L63LF, H69K, L89M  
422913 422913 None    G17E, R41K, L63P, V77I, I93IL  
423541 423541 None    I13V, G16E, K20KR, E35D, M36I, R41K, L63V, H69K, T74S, L89M, T91V, I93L  
423610 423610 None    I13V, G16E, K20R, E35D, M36I, R41K, R57K, H69K, L89M  
424260 424260 None    I13V, E35D, M36I, R41K, R57K, L63T, H69K, L89M