Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Dauwe (2015)
Title Characteristics and spread to the native population of HIV-1 non-B subtypes in two European countries with high migration rate.
Citation BMC Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 410
NumPts 410
Subtype CRF02_AG, A, CRF01_AE, C, G, F, B, CRF06_cpx, D, H, CRF05_DF, CRF27_cpx, CRF11_cpx, CRF09_cpx, CRF25_cpx, CRF45_cpx, CRF49_cpx, A + G


  Page 1 of 5    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 410 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
06_9035 06_9035 None None   K122E, K173A, Q174K, D177A, I178M, T200A, Q207E, R211K  
14_01_15 14_01_15 None None   K43R, V60I, A98S, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, T200A, Q207K, R211S  
14_01_73 14_01_73 None None K219K*E  V60I, A98S, K122E, D123S, I135T, N147NH, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211S N57ND, D186DH, D192Y, K201KN 
A1_02015 A1_02015 None None   T39K, K122E, D123S, I142T, A158S, K173L, Q174K, D177DEG, I195IT, T200TA, Q207A, R211S  
A1_03001 A1_03001 None None   T39A, K49R, V60I, D121H, K122E, D123S, I135T, Q145C, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, F214I  
A1_03090 A1_03090 None None   T39K, K43E, V106I, K122E, S162Y, F171Y, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211K  
A1_04094 A1_04094 None None   T39K, K43E, K122E, D123G, I135T, I142V, S162H, K173S, Q174QK, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211K, F214L  
A1_05013 A1_05013 None None   T39M, K122E, D123N, I135T, I142V, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L  
A1_05077 A1_05077 None None M184V K103N S48T, V60I, D121H, K122E, D123S, E138A, S162SC, K173S, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, D218DE  
A1_05083 A1_05083 None None   T39K, K43A, K64R, K102E, K122E, I135T, I142V, S162Y, K173A, D177E, V179I, T200A, I202V, E204K, Q207E, R211N  
A1_09040 A1_09040 None None   T39G, S162AT, K173A, Q174R, D177E, V179I, Q207A, R211S  
A1_09082 A1_09082 None None A62V  T39LM, K122E, D123N, A158AS, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
A1_10019 A1_10019 None None   T39K, K122E, D123S, S162A, K166R, K173S, D177E, I180V, T200A, Q207N, R211K  
A1_10042 A1_10042 None None   T39G, K122E, D123N, K173S, Q174K, V179I, I202V, Q207A, R211S  
A1_10052 A1_10052 None None   K122E, D123G, I135T, K173S, Q174G, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, F214L  
A1_11024 A1_11024 None None   K122E, D123G, I135T, E169D, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S  
A1_2546 A1_2546 None None A62V, M184MV G190GS T39K, K46Q, K122E, D123N, K166R, K173L, Q174R, D177E, V179VI, T200A, Q207A, R211S  
A1_29990 A1_29990 None None M184V  K122E, D123N, I135V, I142T, T165I, K173A, D177E, Q207A, R211S, F214L  
A1_5038 A1_5038 None None   E40ED, S68G, D121H, K122E, I135T, E169D, K173A, Q174K, D177E, G196E, Q207A, R211S, D218DN  
A1_8795 A1_8795 None None   T39M, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142T, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
A2_11023 A2_11023 None None   T39R, K49R, D121H, K122E, D123E, I135IT, A158S, K166R, E169A, K173S, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207A, R211K  
AE_02023 AE_02023 None None   T39K, K43E, K122E, I135L, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S  
AE_03007 AE_03007 None None   T39K, K43E, A98S, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
AE_03015 AE_03015 None None   T39KR, K43E, S48SL, K122E, D123X, F124X, R125X, K126X, Y127X, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, V179I, Q207A, R211S T128TAPS 
AE_03060 AE_03060 None None   T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, E169D, K173I, Q174K, D177E, I178ILM, V179I, Q207A, R211S  
AE_04007 AE_04007 None None   T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
AE_04559 AE_04559 None None M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y, K219E K103N T39R, K43M, E44D, V118I, K122E, D123S, I135T, I142V, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200R, Q207A, R211S  
AE_06006 AE_06006 None None  A98AG T39E, V60I, S68G, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
AE_06011 AE_06011 None None   T39K, K43E, V60I, S68G, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
AE_07008 AE_07008 None None   T39K, K43E, K122E, D123N, R125RK, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207D, R211K  
AE_07074 AE_07074 None None   T39K, K43E, D123S, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
AE_07_92 AE_07_92 None None   T39K, K43E, K49R, K64R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, I202V, Q207A, R211S  
AE_18236 AE_18236 None None   T39K, K43E, K122E, D123S, I159V, K173T, Q174R, D177E, I178M, Q207A, R211S  
AE_20657 AE_20657 None None   T39K, K43E, V60I, S68G, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A  
AE_29164 AE_29164 None None   T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
AE_39313 AE_39313 None None   T39K, K43E, V60I, K64KR, K122E, D123S, I135L, R172K, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
AE_65785 AE_65785 None None   T39D, K122KE, D123S, K173IM, Q174K, D177E, V179I, T200TA, Q207A, R211S  
AE_71534 AE_71534 None None   T39KR, K43E, K49KR, W88S, G112GA, K122E, D123NS, I135IV, S163ST, K166KR, K173I, Q174K, D177E, V179IT, G196GE, T200A, R206K, Q207A, R211S  
AE_91760 AE_91760 None None   T39K, K43E, W88WS, V118VI, K122E, D123N, K173IT, Q174K, D177E, I178M, T200TA, Q207A, R211S  
AG_01015 AG_01015 None None L210W  E40D, K43S, K49R, I50V, V60I, K101Q, S162A, K173T, Q174K, D177E, V189I, I195L, T200A, Q207E, R211K  
AG_01019 AG_01019 None None   I135V, S162A, K173IT, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
AG_02041 AG_02041 None None   T39A, K122E, D123S, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177EG, T200A, Q207E, R211N  
AG_02909 AG_02909 None None  K103N T39TILS, V60I, I135V, S162A, K173AITV, Q174K, D177E, T200A, R211T  
AG_03080 AG_03080 None None   K104R, K122E, D123S, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
AG_05041 AG_05041 None None   T39A, D121Y, K122E, I135L, S162A, K173IMT, Q174K, D177E, T200A, Q207A  
AG_05044 AG_05044 None None   K43N, K49R, K122E, D123S, R125RK, I135R, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214FL  
AG_05094 AG_05094 None None   T39M, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211EK  
AG_06_02 AG_06_02 None None   K49R, A98AS, I135V, S162A, K173T, Q174KR, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
AG_07026 AG_07026 None None   V60I, K64R, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, F214L  
AG_07562 AG_07562 None None   V60I, K122E, D123G, I135V, S162A, Q174E, D177E, T200A, Q207K, R211S, F214FL  
AG_07_42 AG_07_42 None None   T39L, K122P, S162A, K173R, Q174A, D177E, T200A, I202IV, Q207E, R211K  
AG_07_44 AG_07_44 None None  K103N T39A, E40D, K122E, I135T, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207EG, R211K  
AG_09033 AG_09033 None None   T39I, E44D, V60I, S68G, V90I, I135V, S162A, K166R, K173A, Q174K, P176S, D177E, I178M, T200A, Q207G, R211K  
AG_09081 AG_09081 None None   T39M, K122R, D123E, S162A, K173A, D177K, V179I, T200A, Q207E  
AG_09510 AG_09510 None None   I135V, A158S, S162A, T165I, K173T, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207V, R211K, F214L  
AG_10090 AG_10090 None None   K43N, K49R, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, R211K  
AG_11009 AG_11009 None None   K43N, K49R, K122KE, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, R211K  
AG_11031 AG_11031 None None   K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174QK, D177E, T200A, Q207E  
AG_13002 AG_13002 None None   K122E, I135V, S162A, K173T, Q174NS, D177E, I178M, T200A, Q207K, R211E  
AG_13603 AG_13603 None None   E40ED, D121H, K122E, I135IT, S162A, E169Q, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
AG_23168 AG_23168 None None M184I K103N, V108VI K49R, I50V, K122E, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, E203Q, Q207E  
AG_42861 AG_42861 None None   D123E, I135V, S162A, F171Y, K173AT, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207E, R211RK  
AG_6023 AG_6023 None None   T39A, K104KR, K122E, D123G, A158S, K173T, Q174EK, D177E, T200A, Q207K, R211T  
AG_68902 AG_68902 None None M184V  V60I, K122E, I135V, S162A, E169A, K173A, Q174E, D177E, I178M, T200A, Q207E  
AG_7_78 AG_7_78 None None   T39L, K122EV, D123DN, I135V, S162A, Q174E, D177E, T200A, Q207E  
C_03033 C_03033 None None   T39E, S48T, V60VI, D121H, K122E, D123DGNS, I135V, E138A, K173T, Q174K, D177E, T200E, R211K  
C_03045 C_03045 None None   T39E, S48T, E53D, T69I, K122E, T165I, K173A, D177E, T200A, E204K, Q207N, R211K  
C_04_35 C_04_35 None None   T39E, S48T, K122E, D123X, I135T, K173T, Q174QK, D177E, T200A, Q207E  
C_06045 C_06045 None None   T39E, S48T, K122KE, D123GS, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207AT, R211RK, F214FL  
C_07038 C_07038 None None   T39D, K43R, I142T, A158S, K173AT, D177E, I178V, G196E, T200A, Q207EGKR, H208X, L210LM, R211RS, W212WG L209LFI 
C_09092 C_09092 None None   T39E, K101KR, K122E, D123S, A158S, Q174DN, T200A, Q207E, R211K  
C_331442 C_331442 None None   T39E, K122E, D123DG, A158S, K173A, D177E, I195L, Q197K, T200A, Q207E, R211K  
D_00_02 D_00_02 None None   V60I, D121Y, I135L, S162G, R172RK, D177E, I178V, V189I, D192DN, T200I, Q207E, R211K, F214L H96HN, D113DY, K122*E, N136NK 
D_03028 D_03028 None None   T39EGKR, K43KE, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, T200TA, E204K, Q207E, R211K, F214L  
D_04065 D_04065 None None   E40D, K49R, V60I, V118I, I135T, E138A, S162C, R172K, K173KN, N175NH, D177E, I178L, V179I, E204K, Q207E, F214L  
D_05069 D_05069 None None   T39TS, K49R, V60I, K122A, D123E, I135RT, E204EQ, Q207E, R211K  
D_10081 D_10081 None None   K49R, V60I, K101R, K102Q, K104KR, D121Y, K122KE, D177E, I178V, I195L, T200A, Q207D  
F_06033 F_06033 None None   K122Q, D123E, I135IL, S162C, K173I, Q174K, Q207A, R211S  
F_07065 F_07065 None None  A98G K49R, D123E, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, Q207EK, R211A  
F_11003 F_11003 None None   K49KR, V60I, K122E, S162C, E169ED, K173T, Q174K, T200E, Q207D, R211K, F214L, D218E  
G_03020 G_03020 None None   D121H, K122E, I135V, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207D  
G_09_96 G_09_96 None None   V60I, A98S, K122E, D123S, I135V, Q174A, D177E, I195K, T200A, R211S  
G_11018 G_11018 None None   V60I, D121Y, K122E, S162D, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K  
i43_05046R i43_05046R None None   E40D, V60I, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, I178IV, G196E, T200A, E203EG, Q207AG, R211S  
i9_05068 i9_05068 None None   K102E, I135V, K173I, Q174K, T200A, Q207E P59PS, Y127H 
iAG_01009 iAG_01009 None None   K49R, E53D, V60I, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
iAG_04071R iAG_04071R None None   D123E, I135V, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
iAG_07_96R iAG_07_96R None None   K122E, I135V, A158S, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177G, T200A, I202V, Q207E, R211K  
iAG_11017R iAG_11017R None None   I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I195IV, T200A, Q207DN, R211K  
iAG_5016R iAG_5016R None None   T39A, K122KE, D123DN, I135V, S162AT, K173AV, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211E  
NA_00_36 NA_00_36 None None   K122E, K173I, Q174K, D177E, Q207E, R211K  
NA_01_29 NA_01_29 None None   T39A, R83K, D123E, K173A, Q174K, D177E, I178IV, G196E, R211K  
NA_06050 NA_06050 None None   E40D, V60I, D121H, K122E, K173A, Q174K, D177E, I178V, V189VI, T200A, Q207E, R211RK  
NA_06054 NA_06054 None None   T39N, V60I, K122E, I135V, I142V, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K  
NA_08004 NA_08004 None None   T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, I142V, S162Y, K173S, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211K  
NA_08006 NA_08006 None None   T39S, K122E, A158S, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, Q207N, R211RK  
NA_09007 NA_09007 None None   T39N, E40D, K49R, V60I, T69S, D121Y, K122E, D123K, S134C, T139R, D177DE, I180V, G196E, T200A, Q207T, F214FL  
NA_1020 NA_1020 None None   T107S, K122E, D123E, I135T, S162C, G196GE, Q207A, R211S  
NA_40955 NA_40955 None None   E40D, V60I, D121H, K122E, I135T, S162A, K173S, Q174N, D177E, V179I, T200AV, Q207A, R211S  
NA_98781 NA_98781 None None   T39A, K122E, D123S, I142V, Q174K, D177E, G196E, Q207E, R211K