<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Sucupira (2007)
Title High levels of primary antiretroviral resistance genotypic mutations and B/F recombinants in Santos, Brazil.
Citation AIDS Patient Care STDS
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 69
NumPts 69
Subtype B, F, CRF12_BF, C


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
BRE_01_99 BRE_01_99 None None   T39D, S48T, K122E, D123S, K173T, D177E, T200A, I202V, Q207K, R211K  
BRE_04_99 BRE_04_99 None None K219Q  K122E, D123E, I135T, A158S, S162A, D177E, R211S  
BRE_08_99 BRE_08_99 None None K70~  S68G, T69S, V106I, I135T, T165I, R211K  
BRE_09_99 BRE_09_99 None None   I135T, E203D  
BRE_10_99 BRE_10_99 None None   I94L, I135T, S162C, R211K  
BRE_11_99 BRE_11_99 None None  V179E D123E, I135T, K173E, T200A, Q207A  
BRE_12_99 BRE_12_99 None None   R83K  
BRE_13_99 BRE_13_99 None None   K122E  
BRE_15_99 BRE_15_99 None None   K49R, V106I, D121H, K122E, D123E, I135T, K166R D218H 
BRE_17_99 BRE_17_99 None None   K122E, D123S, I135T, V179T, R211G, F214L S68C 
BRE_18_99 BRE_18_99 None None   K122E, I135T, S162A, I178M, T200E, R211K G213R 
BRE_19_99 BRE_19_99 None None K219Q  I135T  
BRE_20_99 BRE_20_99 None None   K122E, D123S, K173Q  
BRE_22_99 BRE_22_99 None None K219Q G190GA E40K, K64R, K122E, D123N, I135T, D177E, E194D, G196R, Q197E, T200E, E204D M41P 
BRE_23_99 BRE_23_99 None None   A98S, D123E, I135T, K166R, D177E, G196E, I202V  
BRE_24_00 BRE_24_00 None None   K122E, D123E, I135V, S162C, G196E, T200A  
BRE_25_00 BRE_25_00 None None M184MV  S48E, R83K, D123E, I135T, K166R, D177G, R211K  
BRE_26_00 BRE_26_00 None None   K49R, I135V, S162C, E169D, K173T, Q174K, Q207E, R211K  
BRE_28_00 BRE_28_00 None None   T39A, K49R, K122E, I135T, I142T, E169D, E203D  
BRE_29_00 BRE_29_00 None None   I135T, E204Q, Q207A, R211K  
BRE_30_00 BRE_30_00 None None   T39S, S48E, D123E, I135T, D177E, I178M, T200A  
BRE_31_00 BRE_31_00 None None   V106I, S162C, Q174N, D177E, V189I, E204D, R211K  
BRE_32_00 BRE_32_00 None None   I135T, E138ED, S162C, T200A F61FY, H198HQ 
BRE_33_00 BRE_33_00 None None   K122E, G196E, F214L  
BRE_34_00 BRE_34_00 None None   I135T, K166R  
BRE_35_01 BRE_35_01 None None   S68G, K122E, I135T, S162A, I178M, T200A  
BRE_36_01 BRE_36_01 None None  G190R T39A, S68G, K122E, I135T, N175H, T200A M41I, G51GA, W88Y, G141R, K201E 
BRE_38_01 BRE_38_01 None None   I135T, S162A, T200I  
BRE_39_01 BRE_39_01 None None   K102Q, I135T, T200A  
BRE_40_00 BRE_40_00 None None  V179E K102Q, K122E, D123E, I135T, V189A  
BRE_41_00 BRE_41_00 None None   I135T, R211K  
BRE_42_00 BRE_42_00 None None L74I  T39A, K49R, I50V, E79D, R83K, D123E, K173R, R211K  
BRE_43_00 BRE_43_00 None None   D121H, K122E, I135T, I159IV, K173KN, Q174R, I202V, Q207E, R211K Q85QP, A158AV 
BRE_44_00 BRE_44_00 None None   V60I, D123E, I135T, G196A, Q207E G213V 
BRE_45_00 BRE_45_00 None None   K122E, I135T, M164MI, K173KT, G196GA, T200V  
BRE_46_00 BRE_46_00 None None   S48T, K49R, D121H, K122E, I135T, S162C, E169D, D177E, I202V, R211K S191F 
BRE_47_00 BRE_47_00 None None L74I  I135T, K166I Q182L 
BRE_48_01 BRE_48_01 None None   V60I, T69S, K122E, D123E, I135T, G196E, F214L  
BRE_51_99 BRE_51_99 None None   I135T, S162C, I202V, R211K, W212M F171C 
BRE_52_99 BRE_52_99 None None   I135V, S162C, K173A, Q174K, I178L, T200I  
BRE_54_00 BRE_54_00 None None   D123E, R211K  
BRE_56_00 BRE_56_00 None None   K102R, K104R, S117A, I178M  
BRE_57_00 BRE_57_00 None None   A98S, K104N, K122E, I135T, T200A, I202V, E203D  
BRE_61_01 BRE_61_01 None None   K49R, K122E, I135T, K166R, F214L  
BRE_62_01 BRE_62_01 None None   A98S, D121Y, K122E, I135T, D177E  
BRE_64_01 BRE_64_01 None None   I135T, K166I, F214L  
BRE_65_01 BRE_65_01 None None   D121H, K122E, I135T, I142V, T165I, I202V, R211K, F214L  
BRR_01_99 BRR_01_99 None None   V60I, I135T, D177E, T200A, Q207E, R211K  
BRR_02_99 BRR_02_99 None None M41L, T215F  D123E, I135T, I178L, Q207E  
BRR_03_99 BRR_03_99 None None M184V  S48T, K49R, K122E, I135T, S162C  
BRR_04_99 BRR_04_99 None None   V60I, I135T, D177E, T200A, Q207E, R211K  
BRR_05_99 BRR_05_99 None None   R83K, D123E, I135T, D177E, R211K  
BRR_06_00 BRR_06_00 None None T215Y  K49R, D123E, K166R, Q207E  
BRR_07_00 BRR_07_00 None None   K49R, V60I, R83K, I135T, D177E  
BRR_08_00 BRR_08_00 None None   D123E, I135T, D177E, G196E, T200A, E204Q  
BRR_09_00 BRR_09_00 None None   I135T, K166R, R211S, F214L  
BRR_10_00 BRR_10_00 None None   R83K, T200Q, R211K  
BRR_11_00 BRR_11_00 None None   K49R, D123E, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, Q197E, Q207E, L210V T216I, D218A 
BRR_12_00 BRR_12_00 None None   V60I, K122E, D123N, I135T, T200I  
BRR_13_00 BRR_13_00 None None   V60I, I135M, G196E, T200A  
BRR_14_01 BRR_14_01 None None   P55S, D123E, I135T, I202V, Q207D, R211K  
BRR_15_00 BRR_15_00 None None   I135T, R211K  
BRR_16_00 BRR_16_00 None None   K49R, V60I, K64R, I135T, T200V  
BRR_17_00 BRR_17_00 None None M41L, D67G, K70R  S68G, K122E, I135T, E138A, S162A, T200V D192V 
BRR_18_99 BRR_18_99 None None   S68T, D123E, I178M, E204D, Q207A, R211RG N54NH 
BRR_19_00 BRR_19_00 None None M184V  D123E, S162C, E194K, I195L E89K, D110N, D185N 
BRR_20_00 BRR_20_00 None None   S68R, K122E, I135T, S162A, I178M, T200A  
BRR_21_00 BRR_21_00 None None   V60I, I135M, G196E, T200A  
BRR_22_01 BRR_22_01 None None   S68G, K122E, I135T, S162A, D177G, I178M, T200A