Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author de Felipe (2011)
Title Prevalence and resistance mutations of non-B HIV-1 subtypes among immigrants in Southern Spain along the decade 2000-2010.
Citation Virol J
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 91
NumPts 91
Subtype B, CRF02_AG, G, F, A, C, CRF06_cpx, CRF11_cpx

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
SE10 RT_SE10 None None   K122KE, D123DN, D177E, R211RK  
SE100 RT_SE100 None None   K49R, V60I, K102KR, K122Q, I142V, S162A, Q207E  
SE101 RT_SE101 None None   K122R, D123E, I135V, S162A, K173I, Q174N, D177E, T200A, Q207K, R211E, V245M  
SE102 RT_SE102 None None   V106VI, K122P, D123E, I135IV, S162C, D177E, I178V, R211K, P243A  
SE103 RT_SE103 None None   V60I, K122E, D123DG, K173T, Q174S, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K, V245Q  
SE104 RT_SE104 None None   K49R, V106I, D123E, E169D, D177E, I178L, Q207E, R211K, F214L G231V 
SE105 RT_SE105 None None  K103N D123E, I135T, D177E, V179I, T200V, Q207K, R211K, V245M  
SE106 RT_SE106 None None   D86E, D123E, D177E, R211K, V245E  
SE107 RT_SE107 None None   S68T, K122E, E169D, R211RK  
SE108 RT_SE108 None None   I135T, I142IT, S162Y, E169N, K173A, Q174K, Q197E, T200I, Q207E, R211K, F214L  
SE109 RT_SE109 None None  K103N V60I, K102Q, K122P, I142V, I178M, T200TA, Q207E  
SE11 RT_SE11 None None   T39N, S48T, V60I, S162G, K173T, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E, V245Q  
SE110 RT_SE110 None None   T39TI, V60I, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174T, D177E, T200E, Q207E, R211K, V245Q T216TI 
SE111 RT_SE111 None None   V60I, V90I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211RK, V245Q  
SE112 RT_SE112 None None   T39P, I135IV, I142M, E204D, F214L  
SE113 RT_SE113 None None   E40D, M41MV, V60I, S163T, T165I, K173V, Q174R, D177E, I178V, T200A, E204Q, Q207E, R211Q, V245Q  
SE114 RT_SE114 None None  K103N I50IFLM, D113X, D121DE, I142IL, S162C, T200A, Q207G, R211K, V245VM K46KI, S48S*, G51GA, A114AS, K122*E, R143RT, Q145Q*L, L149LF, W153WL 
SE115 RT_SE115 None None   E40D, D121Y, K122E, I135T, S162C, E169ED, K173A, Q174N, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q  
SE12 RT_SE12 None None K70KQ  K49R, K122E, I135T, S162C, D177E, I178M, G196E, T200A, R211S S68SC, K73I, K220T 
SE14 RT_SE14 None None   K122E, I178IM, G196K, Q207E, R211K  
SE15 RT_SE15 None None   W88C, V90I, L109LV, K122E, D123E, I135V, A158T, T200I, I202V L168LS 
SE16 RT_SE16 None None   V60I, K122A, E169D, K173A, Q174R, D177E, I178L, G196E, T200A, E204Q, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
SE17 RT_SE17 None None   S68G, K104N, K122E, S163SC, G196R, T200A, Q207E N57Y, E79GV, Q161QH 
SE18 RT_SE18 None None   I135T, S162C, T200E, I202V, E204D Y56YF 
SE19 RT_SE19 None None   T39I, E40Q, V60I, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178IL, Q207E, R211K, V245Q C38F 
SE20 RT_SE20 None None   K49R, V118I, K122E, I135T, T165TI, E169D, R211K, F214L, V245T  
SE21 RT_SE21 None None   V35I, A98S, K122E, I135T, I142T, A158S, R211K  
SE22 RT_SE22 None None  K103KN T27TA, V35VI, K43KN, I47IF, S48SP, R83RK, K122KE, N147NY, V189VI, T200AE, E204ED, Q207R, R211RK Q23Q*, W24WR, L26LMST, D218DH, K220KT 
SE23 RT_SE23 None None   V35I, I135K, S162H, P176S, V179I, T200A  
SE24 RT_SE24 None None   K49R, K122E, I135R, S162C, Q207A, R211S  
SE25 RT_SE25 None None   S68G, K122E, D123N, T139K, I142V, S162A, Q207E  
SE27 RT_SE27 None None   I50F, V60I, I142V, N147Y N57Y, D123V 
SE28 RT_SE28 None None   S68G, T69N, K122E, D123N, I135T, D177E, G196Q, Q197L, T200A, E204D, R211K  
SE29 RT_SE29 None None  K101KE R83K, K102KE, S162C, V179VI, E224D P95PR, H96HY, K104KIR, Y115Y*, N147ND 
SE30 RT_SE30 None None   V21A, V35I, K49R, K64R, I135T, E169D, K173R, Q174K, T200A, I202V Y183H 
SE31 RT_SE31 None None   V35K, K49R, K122E, D123N, I135T, S162F, K173T, Q174H, D177E, T200E, I202V, Q207K  
SE32 RT_SE32 None None   K122E, I135T, P176T, T200A, F214L  
SE33 RT_SE33 None None   T39A, K49KR, K101KQ, K122E, A158AS, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207G, R211K, P243PS, V245Q  
SE34 RT_SE34 None None  L100I V35T, T39A, K102Q, K122E, D123E, I135T, N147Y, S162Y, K173S, D177E, V179I, I202V, Q207A, V245M F87Y, N136Y, G155GR, T216H 
SE35 RT_SE35 None None   K122E, D177E, I178M  
SE36 RT_SE36 None None   V35T, V60I, S105A, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211K  
SE37 RT_SE37 None None K70R A98AG V60I, K104R, K122E, D123S, N147Y, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E N57Y, L149LR 
SE38 RT_SE38 None None   K20R, E28D, V35I, K43Q, R83K, I135T, K166R, R211K  
SE39 RT_SE39 None None   V35L, G45E, V90I, K102R, K103R, D121H, I135T, E169K, K173N, D192N, T200A, E203K, R211K L12I, A33S, M41I, E44I, Q91L, D110N, D186N 
SE41 RT_SE41 None None   T39G, D86E, D123N, I142N, S162Y, Q207H  
SE42 RT_SE42 None None   T39G, D86E, T139K, S162Y E42Q 
SE43 RT_SE43 None None   V35I, A98S, K122E, I135T, I142T, A158S, R211K  
SE44 RT_SE44 None None M41L  E40ED, K122E, E169D, I178M  
SE45 RT_SE45 None None   V35I, E36K, T39TS, R83K, D86DE, D121N, K122E, D123E D76N, A98PS 
SE46 RT_SE46 None None   G45E, D123E, D177E, I202V, R211K  
SE47 RT_SE47 None None   K122E, I178M, T200E  
SE48 RT_SE48 None None   K20R, V35I, T39S, V118I, K122E, E169D, Q174QK, D177E, R211K, F214L  
SE49 RT_SE49 None None   T39A, K102N, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207G, R211K, T240S, P243PS, V245Q  
SE50 RT_SE50 None None   V90I, A98S, K102E, D123DG, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, D192N, T200A, Q207E, V245Q  
SE51 RT_SE51 None None   S68G, T69TN, K122E, D123N, I135T, D177E, I178IV, G196Q, Q197L, T200A, E204D, R211K  
SE52 RT_SE52 None None   V118I, K122E, I142V, T165I, E169D, D177E, I178IV, T200A, R211K, F214L R143RK 
SE53 RT_SE53 None None   K20R, V35I, T39S, I50N, V118I, K122E, E169D, D177E, R211K, F214L Y146N 
SE54 RT_SE54 None None  V179D K32N, V60I, V118I, K122E, I135R, Q174K, G196E, F214L  
SE55 RT_SE55 None None   V35I, K49R, I50V, V60I, R83K, K122E, I135T, I202V, R211Q  
SE56 RT_SE56 None None   K20R, V35I, T39S, V118I, K122E, E169D, D177E, R211K, F214L  
SE57 RT_SE57 None None   K166R, T200V, R211K  
SE59 RT_SE59 None None   T39I, E40Q, V60I, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178IL, Q207E, R211K, V245Q C38F 
SE60 RT_SE60 None None  K103N T39N, K122E, D123S, A158S, K173S, Q174K, D177E, V189VI, Q207A, R211S, V245M  
SE61 RT_SE61 None None   T39K, I50V, V60I, S68G, V90I, T200I, R211K  
SE62 RT_SE62 None None   T39K, K122E, D123S, A158S, K173S, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211S, F214L, V245M  
SE63 RT_SE63 None None   I50V, V60I, S68G, V90I, V179VI, T200I, R211K N137ND, L205LV 
SE64 RT_SE64 None None   V60I, A98S, D123E, I135R, I142T, E203D, R211K  
SE65 RT_SE65 None None   D123E, I135T, D177E, I178M  
SE66 RT_SE66 None None   V35T, V60I, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211K N57K, S105G 
SE67 RT_SE67 None None   T39A, K102N, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q  
SE68 RT_SE68 None None D67N, L210W  S68G, D86DN, K102E, E224D F160FS, K219P 
SE69 RT_SE69 None None   V35I, S68G, K82R, K122E, I135T, S162C, R211K  
SE70 RT_SE70 None None   R83K, G196E, E204K  
SE71 RT_SE71 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, V118I, K122E, I135T, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
SE72 RT_SE72 None None   V35IT, V60I, K122E, D123S, S163ST, I178IL, Q207E  
SE73 RT_SE73 None None   V35T, V60I, D123E, I135L, S162H, Q174K, T200E, Q207N, R211K  
SE74 RT_SE74 None None   K20R, D86N, K102Q, D177E, E203D, R211K  
SE75 RT_SE75 None None   D121H, K122E, D177E, F214L  
SE76 RT_SE76 None None   K20R, K102Q, D177E, E203D, R211K  
SE77 RT_SE77 None None  V179D K20R, K32N, V60I, V118I, D123E, I135R, Q174K, G196E, F214L  
SE79 RT_SE79 None None  K101KE R83K, K102KE, S162C, V179VI, Q197L, E224D P95PR, H96HY, K104KIR, Y115Y*, N147ND, P157L 
SE90 RT_SE90 None None   K122E, I142T, S162C, I202IV, R211K R206RI, H235HL 
SE91 RT_SE91 None None   T39N, E40D, V60I, K104KR, D123S, E138EA, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q  
SE92 RT_SE92 None None   R83K, K122V, D123N, K166R, P176PS, D177DE, E194D, G196E, T200A, E204EK, R211A  
SE93 RT_SE93 None None M184V L100LI, K101KE, K103N, V108VI K82R, T200V, R211K  
SE94 RT_SE94 None None M184V K101KE, K103KN, Y181C V60I, D123E, I142IV, D177DN, V179I, T200E, E203EK, R211K  
SE95 RT_SE95 None None   E42G, S48T, V60VI, K104R, V106I, T107TA, K122E, I135L, E169D, Q207E, R211K P52T 
SE96 RT_SE96 None None   T39L, E40ED, V60I, I135A, S162A, K173KIR, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q  
SE97 RT_SE97 None None   D121H, K122E, I135T, A158AS, I178M, T200A, E204D, Q207D, R211K, I244V R143RI 
SE98 RT_SE98 None None   V60I, D123E, I142IT, S162C, E169D, R211K, V245E  
SE99 RT_SE99 None None   E40D, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, G196E, T200A, Q207A, R211K, V245Q D113DN 

Database

Resources

Team