<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Zain (2017)
Title Identifications of drug resistance mutations among antiretroviral treatment naive HIV-1 patients in Peninsular Malaysia.
Citation Asian Pac J Trop Med
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 41
NumPts 41
Subtype CRF01_AE, B + CRF01_AE, B, CRF33_01B, CRF54_01B, G

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
HIVDR001 HIVDR001 None None   V35T, T39TA, V60I, D121H, K122E, I135R, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211KN, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
HIVDR004 HIVDR004 None None   V35VI, K122E, D123S, I135IV, I142IT, T165I, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245Q, V276I, T286A, E291D, I293V  
HIVDR005 HIVDR005 None None   E6D, K11AT, V35T, T39K, K43E, V60VI, V106I, K122E, D123NS, I135IT, S162SC, K173I, Q174K, D177E, Q197E, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P, V292I, I293V, E312T  
HIVDR009 HIVDR009 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D121H, I142IV, K173R, Q174K, D177E, T200I, I202V, Q207A, R211S, K238R, I244V, V245E, A272P, T286A, E291D, I293V  
HIVDR023 HIVDR023 None None   K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, I244V, V245E, T286A, I293V, E312N  
HIVDR028 HIVDR028 None None  V179VD V35IL, R83RK, W88WS, K122E, D123N, S162CY, Q174N, D177E, I178IM, T200TA, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272AP, T286A, E291D, V292VI, I293V, E312A  
HIVDR029 HIVDR029 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A, E291D, I293V, E312T, A327AP  
HIVDR030 HIVDR030 None None   E6D, V35T, T39R, K43E, K49R, K82R, R83K, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E, K249Q, A272P, V276I, T286A, V292I, I293V, E312T  
HIVDR031 HIVDR031 None None   V35I, W88WC, K122E, D123S, I135R, K166KR, K173V, Q174K, Q207A, R211N, K238R, V245E, V276I, T286A, I293V, E312T  
HIVDR035 HIVDR035 None None   V60I, I135R, T139A, V179I, G196E, I202V, Q207E, A272P, I293V  
HIVDR042 HIVDR042 None None   E6S, V8I, K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I135V, K173I, Q174K, D177E, I178M, E204EK, Q207A, R211S, K238R, V245E, E291D, I293V, P294Q, E312T  
HIVDR101 HIVDR101 None None   V35T, T39K, K43A, V60I, K122E, D123S, A158S, S162A, E169D, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E, K277R, E291D, V292I, I293V, P294Q, E312NT  
HIVDR103 HIVDR103 None None   V35I, I135L, S162C, P170S, I195L, G196E, T200I, A272P, V276I, L283I, I293V, E297ST, E298EK T296TP 
HIVDR107 HIVDR107 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K64KR, K122E, D123S, I135T, S162C, K173M, Q174K, D177E, T200I, I202V, Q207A, R211S, K238R, V245EK, A272P, V292I, I293V, P294Q, E312T  
HIVDR112 HIVDR112 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, S162N, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V, P294Q, E312T  
HIVDR113 HIVDR113 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200V, Q207A, R211S, K238R, V245E, E291D, V292I, I293V, E312T K126KE 
HIVDR114 HIVDR114 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, R83K, K104R, K122E, D123S, I142IT, R172K, K173I, Q174K, D177G, I202V, Q207A, R211K, K238R, V245K, A272P, E291D, V292I, I293V, E312T  
HIVDR115 HIVDR115 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123DN, K173M, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, V245E, A272P, E291D, I293V, E312T  
HIVDR139 HIVDR139 None None   S105A, V106I, K122E, D123E, R211T, F214L, V245E, D250E, T286A  
HIVDR140 HIVDR140 None None   V35I, W88S, T107S, K122E, I135R, S162C, D177DN, K238R, V245E, T286V, E291D, V292I, I293V, E312T  
HIVDR141 HIVDR141 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, D177E, R211RK, V245A, T286A, E291D, I293V, E312T  
HIVDR142 HIVDR142 None None   K122E, D123S, I135R, S162C, K173I, Q174K, Q207T, R211N, K238R, V245E, K249R, A272G, T286A, E291D, V292I, I293V, E297K, E312A  
HIVDR143 HIVDR143 None None   E6D, K11KT, I31IV, V35T, T39K, K43E, S105A, K122E, D123S, S162C, K173V, Q174K, D177E, I178L, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, E312T  
HIVDR144 HIVDR144 None None   V35T, E36D, T39M, V60I, V90I, A98S, K122E, D123N, I135V, K166R, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, I202V, Q207E, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, I293V, V317A  
HIVDR145 HIVDR145 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, I135T, S162N, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, V276I, T286A, E291D, V292I, I293V, P294Q, E312T  
HIVDR146 HIVDR146 None None   D121H, K122E, E138A, T139TA, I142IV, S162C, R211KQ, V245M, K277R, Q278E, I293V, E297A, V317A  
HIVDR147 HIVDR147 None None   V60I, A98S, K122E, D123S, I142IV, K173I, Q174K, D177E, E204EK, Q207A, R211S, K238R, V245E, D250DE, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E312T  
HIVDR148 HIVDR148 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, K122E, D123S, I135M, T165I, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245K, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E312T  
HIVDR149 HIVDR149 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, V148VG, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200TI, I202IV, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P, V276I, L283I, V292VI, I293V, P294Q, E312T  
HIVDR150 HIVDR150 None None   E6D, K11S, V35T, T39K, K43E, S68G, K102R, K122E, D123N, I135T, R172K, K173L, Q174K, D177E, T200R, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P, K281R, T286A, E291D, V292I, E312T K275KE 
HIVDR153 HIVDR153 None None   K32KR, V35VL, K102KR, S162C, K166KR, G196E, R211K, F214L, V245M, K277KR, Q278E, E298A, E312EA, V317VA  
HIVDR157 HIVDR157 None None   V35M, K46KQ, V111I, K122E, I135T, K166Q, K173E, I178M, T200A, I202V, R211Q, F214L, I244V, S251H, A272P, V292I  
HIVDR162 HIVDR162 None None   V35T, T39K, K43E, V60VI, K101R, T107S, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272K, V276I, I293V, V317M  
HIVDR168 HIVDR168 None None   V35T, E36ED, T39TI, V60I, V90I, A98S, K122E, D123G, I135V, K166R, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
HIVDR337 HIVDR337 None None K65R, Y115F, M184V K103N, Y188L K20KR, V35M, T39A, V60I, K101Q, K122E, D123N, I135K, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200TAEK, I202IV, Q207A, R211S, K238R, V245I, T286A, E291D, V292I, I293V, E312T  
HIVDR351 HIVDR351 None None   E6ED, K11KR, D121H, K122E, I135R, E169ED, I202V, L210LS, R211K, T286A, I293V  
HIVDR352 HIVDR352 None None   K32N, A98S, K104KN, K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A, V292I, I293V, E312T  
HIVDR353 HIVDR353 None None   E6D, V35I, E36EK, T39K, K43E, R83K, V118I, D121H, K122E, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P, L282LP E29EK, G262GE 
HIVDR354 HIVDR354 None None   V8VI, V60I, T69TN, K122E, D123S, K166KR, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200TI, Q207A, L210LF, R211S, V245E, T286A, A288AT, E291ED, V292I, I293V, E297T, E312T  
HIVDR355 HIVDR355 None None   E40ED, D123DE, S162C, K238R, V245E, T286V, E291D, V292I, I293V, E312T  
HIVDR356 HIVDR356 None None K219R  E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, T165TI, K173IT, Q174K, D177E, I178M, T200V, Q207A, R211S, K238R, V245E, E291D, V292I, I293V, E312T