Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Pouran Yousef (2016)
Title Inferring HIV-1 transmission dynamics in Germany from recently transmitted viruses.
Citation JAIDS
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 1943
NumPts 1159
Subtype B, CRF02_AG, A, C, CRF01_AE, G, F, CRF12_BF, D, CRF20_BG, CRF18_cpx, CRF06_cpx


  Page 1 of 20    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 1943 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
1607 99-02954 None None   D123E, K166R, E169D, D177E, I202T, R211K  
1634 00-00005 None None   K122KE, D123DE, I142V, T200IL, R211K A129AG 
1737 01-00314 None None   K20R, T200K  
1738 01-00317 None None   K166R, Q174R, G196E, R211K  
1809 02-00638 None None   V35A, T39A, K103R, S105A, D123E, I135T, S162C, T200I, R211G  
1889 03-00033 None None   I135V, S162C, D177E, R211Q  
1982 03-00262 None None   K122T, D123E, I142V, S162C, Q174E, D177E, I178L, Q207E  
2054 04-00018 None None   I135V, D177E, R211Q  
2131 05-01058 None None  V179E V35M, T39A, R83K, E169D, D177E, T200A  
2138 04-00396 None None  V179D R83K, Q174R, G196E, R211G  
2175 04-00259 None None  K103N V35MT, R83K, D123E, S162C, D177DE, I178L, V179VI, I195L, R211K  
2233 04-00365 None None   V60I, S68G, T139K, I178M, R211K  
  08-00373 None None   V60I, S68G, K122KT, D123DEKN, T139K, I178M, R211K  
  09-00274 None None   V60I, S68G, K122KR, D123DE, T139K, D177E, I178M, R211K  
2238 04-00359 None None   V60I, R83K, S162Y, R172RG, T200I, R211K  
  07-00944 None None   V60I, R83K, S162H, T200I, Q207EK, R211E  
  08-03172 None None   V60I, R83K, S162H, T200I, Q207QK, R211E  
  09-03614 None None   V60I, R83K, S162H, T200I, Q207K, R211E  
2245 04-00377 None None   K11T, T39S, S48T, V60I, S68G, T69N, K102Q, K103R, D121H, K122E, K166R, T200V, I244V  
2473 05-00343 None None   K32R, S162CR, E169ED, F171Y, T200A, E203D, V245K  
2598 05-00595 None None   A98S, I135M, I178L, K201R, Q207E, R211K, V245K  
  08-02896 None None   A98S, I135V, I178L, K201R, Q207E, R211K, V245K  
2604 07-00352 None None   K20R, V60I, I135IV, K166KR, E169D, K173KR, Q207E, R211K, V245Q  
  07-00126 None None   K20R, V60I, I135T, K166R, E169D, Q207E, R211K, V245Q  
2671 05-00850 None None   E6D, E28K, K32KE, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
2692 05-00885 None None   E6D, V21I, I135T, S162C, I202V, Q207K, R211G, H221Y  
2699 05-00904 None None  K103N V35T, R83K, D123E, I142T, S162C, I178L, E194EK, I195L, G196E, V245VM  
  06-00022 None None  K103N V35T, R83K, D123E, I142T, S162C, I178L, I195L, G196E, V245M  
  08-02498 None None  K103N V35K, R83K, D123E, I142IT, S162C, I178L, V179VI, I195L, G196E, I244V, V245M  
  10-02105 None None  K103N V35K, R83RK, S162C, I178L, V179I, I195L, G196E, I244V, V245M  
2754 05-00983 None None   K20KR, T39TN, D121H, K122E, S162C, D177E, I178IM, E204EK, R211G  
  06-01019 None None   T39TN, D121H, K122E, S162C, D177E, I178M, E204EK, R211G  
2766 05-01011 None None   K49R, D123E, S162C, P176ST, I178L, E204D, R211K  
2859 06-00035 None None   S68G, K122P, I135T, D177E, T200E, R211K  
2922 07-00259 None None   I135T, F171Y, D177E, T200A, Q207A, R211K, F214FV, V245E  
2957 06-00343 None None   K103R, I135M, S162C, V245E  
  09-01452 None None   K103KR, I135M, S162C, Q207H, R211RK, V245E  
3067 06-00815 None None   K122E, E169D, Q207R, R211Q, V245K  
3075 06-00828 None None  V179VD R83K, K102Q, S162Y, T200A  
3116 06-00927 None None M41L, T215D  E6EK, T7P, A98S, S162C, Q207E, L228H, V245E  
  07-00609 None None M41L, T215D  T7P, A98S, I135IT, S162C, Q207E, L228H, V245E  
  08-01802 None None M41L, T215D  T7P, A98S, I135T, S162C, Q207E, R211RK, L228H, V245E  
3270 07-00161 None None   E36D, K122E, D123S, I135V, S162A, K166R, K173A, Q174E, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207E, R211K, V245Q  
3294 07-00209 None None V75L, F77L  V118I, D121H, K122E, T165I, D177E, T200A, E204K, Q207E, F214L, V245E  
3343 07-00420 None None   V35L, P55A, V60I, V118I, D123E, S134C, I135T, T139R, R211K, F214L, V245E  
  08-01212 None None   V35L, P55A, V60I, V118I, D123E, S134C, I135T, T139R, R211K, F214L, V245E  
  09-02088 None None   V35L, P55A, V60I, V118I, D123E, S134C, I135T, T139R, R211K, F214L, V245E  
  10-02318 None None   V35L, P55A, V60I, V118I, K122KE, D123DE, S134C, I135T, T139R, R211K, F214L, V245E  
3373 07-00478 None None   G196E, T200A, F214L  
  09-02932 None None   K122KE, G196E, T200A, F214L  
3412 07-00635 None None   K102Q, I135T, T165I, D177E, F214L, V245M  
  09-00217 None None   K102Q, I135T, T165I, D177E, F214L, V245M  
  11-01503 None None   K102Q, I135T, T165I, D177E, T200A, F214L, V245M  
3580 08-00011 None None   V35I, A98S, T107S, D123E, I135T, T200V, Q207D, R211K, F214L, V245Q  
  09-02243 None None   V35IM, A98AS, T107TS, K122KE, D123X, I135T, T200AEV, E204EK, Q207DH, R211K, F214FL, V245Q L193LI 
3618 07-01119 None None   K122E, I135T, A158S, E169D, T200A, Q207K, R211A, F214L, V245E  
  09-01196 None None   K122E, I135T, A158S, E169D, T200A, Q207K, R211A, F214L, V245E  
  10-01837 None None   K122E, I135T, A158S, E169D, T200A, Q207K, R211A, F214L, V245E  
3675 08-00354 None None  K103N V118I, D123E, I135T, T200A, Q207G, R211K, F214L, V245K  
  09-02622 None None  K103N V118VI, K122KR, D123E, I135T, V179VI, T200A, Q207G, R211K, F214L, V245EK  
3755 08-01619 None None   K43N, K49R, E169D, T200A, E204D, Q207E, R211K, V245K  
3766 08-01881 None None   K122E, I135T, I202V, R211K, F214L  
  09-03252 None None   K20KR, K122E, I135T, T165TI, I202V, R211K, F214L  
3784 08-02293 None None  V108I E40K, D123N, I135T, T165I, D177E, R211Q, V245T  
  09-03424 None None  V108I D123N, I135IT, T165I, D177E, R211Q, V245T  
  11-00367 None None  V108I K122KE, D123DN, T165I, D177E, R211Q, V245T  
3799 08-02788 None None   D121Y, K122E, I142V, R211K, V245E  
3841 08-03238 None None   V35I, I135R, I178M, G196E, Q207EK, R211M  
3872 08-03613 None None   K20R, V21I, V60I, S162C, Q197E, T200TA, Q207R, R211S  
3902 09-00306 None None T215TS  V35VAIT, K104KQ, I135IATV, I142IV, S162SAGT, T165TI, D177E, I178IM, Q207QE, R211RG, V245AEKT  
  10-00930 None None   V35VAIT, K49KR, K104Q, I135R, S162A, D177E, R211G, V245K  
3924 09-00737 None None   A98S, K122E, S162D, E194G, I195V, G196E, T200I, R211S, F214L  
  10-00647 None None   V60VI, A98AS, K122E, I135IR, S162SDGN, E194EG, I195IV, G196E, T200TI, R211S, F214L  
3929 09-00775 None None   E6K, K49R, V60I, K122E, I135T, S163A, K166T, K201R, I202V, L210F, R211K  
3933 09-00877 None None   V35T, W88C, D123E, K166R, K173R, D177E, G196E, Q197K, I202V, R211Q, F214L, V245K  
3950 09-01209 None None   V35T, D123E, I159V, T200V, Q207E, R211K, V245K  
3989 09-01723 None None   T69S, I142T, S162C, I202V  
4087 09-03817 None None   A98S, D123E, I135R, A158S, K173N, Q174K, G196E, I202V, E204EK, R211G, F214L, V245M  
  10-02682 None None   E6ED, K11KR, A98S, D123E, I135R, A158S, K173N, Q174K, G196E, I202V, Q207QK, R211G, F214L, V245M  
4096 09-04008 None None   K11R, R83K, K102KR, I135T, S162Y, R211RK  
  11-00816 None None   K11R, V35VA, R83K, I135T, S162Y  
  12-02652 None None   K11R, R83K, I135T, S162Y  
4220 10-02057 None None   K101R, K122KE, S162C, E169D, T200A, E204D, Q207E, F214FL  
4357 11-00084 None None   V21I, V35I, R83K, I178L, Q207E, R211K  
  12-01751 None None   V21I, V35I, R83K, I178L, Q207E, R211K  
4379 11-00453 None None   K20R, T139K, S162C  
4410 11-01469 None None K219R  K64R, I135T, E169D, T200A, Q207E, I244M, V245T  
  12-03355 None None K219R  K64R, I135T, E169D, T200A, Q207E, I244IM, V245IT  
4455 11-03228 None None   V35T, V60I, K122V, D123N, I135T, Q207H, R211K  
4466 11-03458 None None   I135V, T200I, R211Q  
  12-01706 None None   I135V, T200I, R211Q  
4477 11-03674 None None   V35I, V106I, T200A, F214L  
4524 11-04416 None None   V35T, I135T, R211RG, F214L, V245S  
4543 12-00066 None None   A98S, D123E, E138A, K166Q, G196E, R211K, V245E  
4574 12-00949 None None   K20R, E28G, I135V, D177E, T200I, R211K, V245M  
4596 12-01290 None None   T69S, I135R, I142T, S162C, I202V, E204K, Q207E  
4644 12-02493 None None   K104R, S162C, I202V, Q207H, R211K  
4645 12-02604 None None   P4S, V35K, T39E, S48T, I50V, V60I, S68G, T69N, T165I, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
4677 12-02981 None None   K49R, D123E, I135T, D177G, I178M, R211S  
855 98-00951 None None   K49R, A98S, S105A, I135T, T200A, R211S