<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Faria (2012)
Title Phylogeographical footprint of colonial history in the global dispersal of human immunodeficiency virus type 2 group A.
Citation J Gen Virol
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV2
SelectedType Clinical
NumIsolates 84
NumPts 84
Host Human

 

Clinical PR Isolates


SubjectIsolatePIsWksPIMajorPIMinorCommonUnusual
05-1019652 05-1019652 None    T43S, N68D Y14H, D17G, D40N, N41D, K57R, K65E 
06-1022838 06-1022838 None   I46V   
06-1048808 06-1048808 None    T43S, K60N Y14H, D17G, D40S, K65E, N68G 
06-1048809 06-1048809 None    F3L, T43S, V71I, T91S K7Q, D17N, D40N, N41D, K65R, L93I 
07-1005732 07-1005732 None     D17G, D40S, T43D, R70K 
08-1009179 08-1009179 None   I89V T43S D17G, D40S, K65E 
08-1013611 08-1013611 None   A73AG, I89V T43S Y14H, D17G, D40S, N41D, K65E, N68G 
08-1017348 08-1017348 None     Y14H, D17G, D40S, T43D, R70K 
09-1012576 09-1012576 None   I46V T43S, T77TI D17G, V20VA, G35GE, D40CS, K57KR, K65E, N68G, R70K, L99LF 
09-1017295 09-1017295 None    K7KR, T43S, E63ED, R72K, T91A, A92T Y14YH, E16EG, D17G, E21EDHQ, D40C, N41ND, K60KR, K65E, N68G, R70K 
09-1019599 09-1019599 None    V71I, A92L K60R, K65R 
09-1020943 09-1020943 None   I46V, I89V  K57R, V62I 
09-1022492 09-1022492 None    W6L, K7KR, T43S D17G, D40S, N41D, K65R 
116505 116505 None    T91TA, L93M Y14H, D17G, D40N, K65E, S96ST 
131732 131732 None    D17E, T43S, N61D, V71I, R72RK, D79N D40S, N41D, R70K, T77V 
132232 132232 None    I36V, T43S Y14H, D17G, D40S, K65E, N68G, R70K, A92V 
137566 137566 None   I89V T43S Y14H, D17G, D40S, N41D, K65E, N68G 
138487 138487 None     Y14L, D17G, D40S, N41D, T43K, R70K 
138768 138768 None    T43S, T91TA, A92AT Y14H, D17G, D40S, K65E 
139329 139329 None    T43S Y14H, D17G, D40S, K65E, N68G 
139637 139637 None    T43S Y14H, D17G, D40S, K65E, R70K 
140874 140874 None    I15V, T43S D17G, D40S, N41D, K65E, N68G, R70RK 
141361 141361 None   I89V G39E, T43S W6Q, Y14H, D17G, G27E, D40S, G52R, K65E, N68G, R70K 
142831 142831 None   I46V V20L K7N, Y14H, D17G, D40S, K65E, R70K 
143877 143877 None    I36V, T43S, N61D D17G, D40N, N41D 
143991 143991 None    V20VI, T43S Y14H, D17G, D40S, K65E, N68G 
144035 144035 None   I46T W6R, Y14R, V20L, E21D, E37D, T43S, R72K, T77TI K7N, D17G, D40C, N41ND, K65E, N68G 
144251 144251 None   I89V P19S, T43S Y14H, D17G, D40S, N41D, K65E, N68G 
147873 147873 None   I46V W6R, T43S, T91TA K7Q, D17G, D40S, E63EK, K65E, R70RK, A92IS 
148686 148686 None   V33VI I15V, I36V, T43S, N61D, V71I, D79N D40S, T77V 
149807 149807 None   I89V T43S, R72RK D17G, D40S, K65E 
150281 150281 None   I89V T43S, R72RK Y14YH, D17G, D40S, N41D 
150965 150965 None    T43S, N61D W6W*R, D17G, D40S, K60R, K65E, N68G, R70K, A92AITV 
151533 151533 None    T43S D40E, R70RK 
151833 151833 None    T43S D17G, D40S, N41D, K60RT, K65E, R70RK 
152792 152792 None  I46IT I89V E21EK, E37ED, T43S Y14H, D17G, D40NS, N41ND, K65KE, N68G 
153658 153658 None   I89V T43S, E63R Y14H, D17G, D40C, N41D, K65E, N68G, R70K, I75L 
153776 153776 None    T12TP, E37D, T43S Y14H, D17G, D40S, N55IT, K65E, A73G 
154427 154427 None   I89V T43S Y14H, D17G, D40S, K60R, K65E, N68G, I75IV 
156209 156209 None   I46T T43S Y14H, D17G, D40S, K57R, K65E, N68G, I75V 
156260 156260 None   I46V I36V, T43S Y14H, D17G, D40S, K65E, D79E 
156294 156294 None   I89V T43S Y14YH, D17G, D40S, N41D, T56TI 
156529 156529 None    T43NS, N61ND Y14H, D17G, D40S, K65E, N68G, R70RK 
156927 156927 None    F3L, T43S, V71I D17DG, D40S, N41ND, R70K, L93I 
157554 157554 None    T43S, L93M Y14H, D17G, D40S, K65*EQ, N68G 
157780 157780 None    T43S, R72K D17G, D40N, N41D, R70K 
158425 158425 None    I15V, E21D, T43S, T91A, A92T Y14H, D17G, D40S, K65E, N68G, I75L 
160439 160439 None   I46T Y14R, E37ED, T43S D17G, D40C, N41ND, K57R, K65E, N68G, R70RK 
160664 160664 None   I89V T43S D17G, D40S, K60R, K65E 
160930 160930 None   I89V V20L, E37D, T43S, R70T Y14H, D17G, D40N 
161360 161360 None   I89IV W6R, K7R, V20L, T43S, R70T Y14H, D17G, D40S, K65KR 
161453 161453 None    F3L, T43N, V71I Y14H, D17G, D40N, N41D, K65R, L93I 
161735 161735 None   I89V T43S Y14H, D17G, D40S, N41D, K65E 
161738 161738 None   I89V T43S Y14H, D17G, D40S, N41Y, K65E, N68G, S96T 
161798 161798 None    E21K, E37D, T43S, T91A, A92T K7N, D17G, D40S, N41D, R70RK 
162071 162071 None   I89V T43S K7Q, D17GS, V20VA, D40C, K65E, N68G 
162136 162136 None    T43S, N61D D17G, D40S, R70K 
162648 162648 None    T43S D17G, D40C, K60KR, K65E, N68G, R70K 
163290 163290 None    K7R, T43S, N61D, L97LI Y14H, D17G, D40S, T56TP, R70K 
163556 163556 None    I15V, T43S D17G, D40S, N41D, K65E, R70K 
164339 164339 None   I89IV S4P, K7E, T43S, K60N P1A, D17G, D40S, N68G 
164788 164788 None  I46IV T43TS I36IV, T77TI, T91TA Y14H, D17G, D40CS, K65E, D79DE 
165389 165389 None  I54IL  I15IV, T43S D17G, D40S, K65E, N68G 
165434 165434 None    F3L, I15V, T43S D40S, K65R, L93I, L99F 
34306 34306 None   I32L, I89V T43S Y14H, D17G, D40S, K65E, N68G 
34399 34399 None    T43S Y14H, D17G, D40S, R70K 
39601 39601 None    T43S Y14H, D17G, D40S, K57R, K65E, N68G, D79E 
39604 39604 None   G48GE I15IV, T43S Y14H, D17G, D40S, K65E, N68G 
42449 42449 None   I89IV T43S Y14H, D17G, D40NS, N41D, K57KR, K65E, N68G, R70RK 
43021 43021 None   I89V E21D, T43S, N61D, E63ED Y14H, D17G, D40S, N68G, R70RK 
60042 60042 None    T43S D17G, D40S, K65E, R70RK 
67157 67157 None   I89IV T43S Y14H, D17G, D40S, N41D, K65E, N68G 
68752 68752 None    T43S, T91A K7N, Y14H, D17G, D40S, N41D 
83695 83695 None    T43S, T91A D17G, D40S, K65R, A92N 
A/BO/BRESC A/BO/BRESC None    T43S, T77I Y14H, D17G, D40S, N41D, G94D 
A/DM/BRESC A/DM/BRESC None   I46T, I89V T12R, T43S, R72K D17G, D40S, K57R, K65E, N68G 
A/KA/BRESC A/KA/BRESC None    T43S D17G, D40S, K60R, K65E, N68G 
BM10767 BM10767 None   I46V, I89IV T43S Y14H, D17G, D40C, K65E, D79E 
BM11874 BM11874 None    F3L, T43S, V71I D40S, R70K, L93I 
BM13272 BM13272 None   I46V, I89V T43S, R72RK, A92AT W6W*, Y14H, D17G, D40S, K65E, N68G 
BM13370 BM13370 None   T43TS K7R, E37ED, N61ND, T91A, A92T Y14YH, D17G, D40S, K65E 
BM16229 BM16229 None   I89V T43S D17G, D40NS, K65E, R70RK, I75IV 
BM16582 BM16582 None    S4P, K7E, T43S Y14YH, D17G, D40N, K60R, K65E, N68G 
BM17066 BM17066 None   I46T W6R, T12TI, Y14R, E37D, T43S, R72K K7N, D17G, D40C, N41ND, K65E, N68G