<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Gashnikova (2016)
Title Predominance of CRF63_02A1 and multiple patterns of unique recombinant forms of CRF63_A1 among individuals with newly diagnosed HIV-1 infection in Kemerovo Oblast, Russia.
Citation Arch Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 46
NumPts 46
Subtype A + CRF02_AG, A, CRF63_02A1


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
PRRT_01 None None   V35T, T39A, V60I, S68G, D86E, I135L, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, D250N, A272P, T286A S191F 
10 PRRT_10 None None   V35T, E40D, V60I, K64R, D121Y, K122E, D123E, S162A, K173R, Q174K, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, T286A  
14 PRRT_14 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, E40EK, K122E, D123S, A158S, S162C, K173L, Q174K, D177G, T200I, Q207A, R211S, V245M, E248N, A272P, T286A, E291D K102T 
18 PRRT_18 None None   V35T, E36D, V60I, D121H, K122E, I135V, S162A, T165TA, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, T286A E29EK, P150S 
19 PRRT_19 None None   V35T, E36D, V60I, D121DY, K122E, I135V, S162A, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
21 PRRT_21 None None   V21I, V35T, E36D, T39M, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, T286A  
22 PRRT_22 None None   V35T, V60I, K64R, K102R, S105A, D121Y, K122E, D123R, S162A, Q174N, D177E, T200A, Q207G, R211N, V245Q, L246V, E248D, A272P, K277T, T286A  
23 PRRT_23 None None   D17E, V21D, V35T, E36D, T39I, T58I, D121Y, K122E, I135V, S162A, K173R, Q174K, D177E, I178V, T200V, Q207N, R211K, V245Q, E248D, A272P, L283I, T286A M16R, V60K 
24 PRRT_24 None None   K32I, V35T, E36D, V60I, D121Y, K122E, S134N, I135V, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200V, Q207N, R211K, V245Q, E248D, A272P, L283I, T286A  
25 PRRT_25 None None   V35T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173R, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P  
26 PRRT_26.1 None None  G190A K11T, V35T, E36D, T39K, S105A, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, Q197L, T200A, Q207D, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D  
29 PRRT_29 None None M41L  V35T, E36D, T39A, V60I, K122E, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D  
PRRT_03 None None   V35T, E36A, T39D, V60I, K122E, D123S, I135T, S162A, K173R, Q174N, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, K277R, Q278H, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
30 PRRT_30 None None  Y188L V35T, E36D, V60I, D121Y, I135V, E138A, S162A, K173R, Q174K, D177E, I180V, T200A, I202V, Q207A, R211N, F214L, V245Q, E248D Q145L 
31 PRRT_31 None None   T39N, K122E, D123S, I135T, I142T, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248N  
32 PRRT_32 None None   V35T, E36D, I47F, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200A, E203D, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, E291D, V292I, I293V, P294T E29K 
33 PRRT_33 None None   V35T, V60I, A98S, D121H, K122E, I135T, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200V, I202IV, Q207AD, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D  
36 PRRT_36 None None   V35T, V60I, A98S, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D K13R 
37 PRRT_37 None None   V35T, E36D, V60I, D121Y, K122E, S162A, E169D, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, K277T, T286A, E291D  
39 PRRT_39 None None   V35T, E36D, V60I, D121Y, K122E, I135V, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I  
PRRT_04 None None   V35T, E36D, V60I, S68G, K122E, D123S, I135T, S162A, Q174K, D177E, T200A, E203EG, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, T286A  
40 PRRT_40 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K43E, D121H, K122E, D123S, K173IL, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I A267T 
41 PRRT_41 None None   V35T, E36A, V60I, D121Y, K122E, S162A, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I  
42 PRRT_42 None None   V35T, E36D, V60I, D121Y, K122E, I135V, S162A, K173G, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248N, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
43 PRRT_43 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V90I, K122E, D123S, A158S, K166R, K173L, Q174K, D177E, Q207S, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D  
44 PRRT_44 None None  K103N V35I, V60I, D121HY, K122E, I135L, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, T286A, V292I, I293V  
45 PRRT_45 None None   V35T, E36D, V60I, D121Y, K122E, I135V, S162A, K173I, Q174K, P176S, D177E, T200A, I202V, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277T, T286A, E291D, V292I  
46 PRRT_46 None None   V35T, V60I, D121Y, K122E, I135L, S162A, K173G, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, K277T, T286A, E291D, V292I  
47 PRRT_47 None None   V35T, E36D, V60I, D121Y, K122E, I135V, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I K13R 
48 PRRT_48 None None   E36D, V60I, D121Y, K122E, I135L, K154R, S162A, K173G, Q174K, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I  
49 PRRT_49 None None   V35T, E36D, T39M, V60I, S68G, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, K277T, T286A, E291D, V292I  
PRRT_05 None None   V35T, E36D, T39N, V60I, K122E, D123N, I135IT, K173L, Q174K, D177E, I178IV, T200A, Q207AT, R211N, V245Q, E248D, A272P, K277R, Q278H, T286A  
50 PRRT_50 None None   V35I, E36D, D121Y, I135L, S162A, K173R, Q174R, D177E, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I  
51 PRRT_51 None None  V108I K11T, V35T, E36D, T39N, K122E, D123G, S162C, K173L, Q174K, Q207A, R211S, V245M, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
52 PRRT_52 None None   V21VI, V35T, E36D, V60I, D121Y, K122E, I135V, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211H, V245Q, E248D, A272P, K277T, T286A, E291D, V292I  
54 PRRT_54 None None   V35T, E36D, T39M, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, K173GR, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I  
55 PRRT_55 None None   V35T, E36D, V60I, D121Y, K122E, I135V, S162A, K173G, Q174E, D177E, Q197H, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I I94V 
56 PRRT_56 None None   V35T, E36D, V60I, D121Y, K122E, I135V, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
57 PRRT_57 None None   D17E, V35T, E36D, T39A, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, T200I, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248D, A272P, K277T, T286A, E291D, V292I L264LP 
58 PRRT_58 None None   V35T, E36D, V60I, D121Y, K122E, I135V, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211D, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
59 PRRT_59 None None   V35T, E36D, V60I, D121Y, K122E, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I D186E 
PRRT_06 None None   V35T, I47L, V60I, D121Y, K122E, I142T, S162A, K173R, Q174N, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D  
61 PRRT_61 None None   V35T, E36D, V60I, D121Y, K122E, S134N, I135V, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245R, E248D, A272P  
62 PRRT_62 None None   V35T, E36D, V60I, D121Y, K122E, I135V, S162A, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, K277T, L283LI, T286A, E291D, V292I  
PRRT_07 None None   V35T, E36S, V60I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, K277R, Q278H, T286A  
PRRT_09 None None   V21I, V35T, T39K, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162A, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207A, R211N, V245Q, E248D, A272P, K277T, T286A, E291D