Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Lunar (2015)
Title Longitudinal trends of recent HIV-1 infections in Slovenia (1986-2012) determined using an incidence algorithm.
Citation J Med Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 53
NumPts 53
Subtype B, C, A, CRF56_cpx, CRF01_AE, CRF43_02G


Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
SI10015-12 SI10015-12 None None   K64R, K173R, Q174E, I178L, Q197L  
SI10168-11 SI10168-11 None None   K11T, V35A, K122KE, D123X, K173S, Q174N, D177E, T200K, Q207A  
SI11513-11 SI11513-11 None None  K103N I135X, S162C, G196K, R211K  
SI11539-11 SI11539-11 None None T215D  V35I, S48T, S68G, K102Q, I135T, S162C, D177G, V179VI, T200TA, R211K  
SI12622-12 SI12622-12 None None   D123E, I135T, S162C, R211K  
SI13040-12 SI13040-12 None None   K20R, V35T, T39A, E40D, K102KQ, D123E, S162C, P176S, T200A, I202V, R211K  
SI13333-12 SI13333-12 None None   V35I, V106I, D121Y, K122E, I135T, S162C, G196E, R211K  
SI13758-12 SI13758-12 None None   D123E, S162C  
SI13766-12 SI13766-12 None None  V179D K20R, V35I, D121Y, K122E, I135T, K166R, G196E, R211Q, F214L  
SI14152-11 SI14152-11 None None   S48T, K122KE, D123E, E194EA, G196E, R211RK  
SI14199-12 SI14199-12 None None   K122E, I135R, I142IT, T200I, R211K  
SI14700-11 SI14700-11 None None   K20R, S162A, D177DG, R211K, F214L  
SI14710-11 SI14710-11 None None   K32KE, V35I, I135K, T165TI, I178L, Q197L  
SI15297-12 SI15297-12 None None   V35E, T39A, V60I, A98S, K122E, D123N, T139K, I142V, P170PS, T200I, Q207D, L210F, R211K  
SI15350-12 SI15350-12 None None   K104R, D123E, S162C, T200TK, R211K  
SI1555-11 SI1555-11 None None   K122E, I135R, I142IT, D177DE, I178IV, T200I, R211K  
SI18781-11 SI18781-11 None None   T27TA, V35I, I47L, I135M, K166KN, R211Q, W212WG, P225L  
SI19483-12 SI19483-12 None None   K20R, V35I, S48SL, R83K, I178L, G196E, T200A, I202V, Q207X, R211X  
SI20264-11 SI20264-11 None None   V21I, V35T, E40D, K43KR, K49KR, V60I, K122E, D123X, T165I, K173T, Q174X, D177E, I178IM, T200A, I202IV, Q207E, R211K  
SI21002-11 SI21002-11 None None   K20R, D123E, I135T, K166KR, I180V, R211K  
SI22592-11 SI22592-11 None None   I142T, S162A, R211K, F214L  
SI23736-11 SI23736-11 None None   K104KR, V106I, S162C, R211K  
SI25220-11 SI25220-11 None None   V118I, I135V, I142T, S162A, E194EK, R211K, F214L D218DY 
SI25829-11 SI25829-11 None None   D123E, I135T, K166KR, D177E, F214L  
SI261-12 SI261-12 None None   K122E, I135R, I142T, S162SN, D177E, I178V, R199RK, T200I, R211K  
SI2629-12 SI2629-12 None None   D123E, S162C, I178M, R211K  
SI2812-12 SI2812-12 None None   V60I, K104N, K122KE, T139K, I142V, S162A, Q174K, T200K, Q207D, L210X, R211K  
SI3089-11 SI3089-11 None None   V35M, D121Y, K122E, I135IT, T200I, F214L  
SI3176-11 SI3176-11 None None   V35E, V60I, A98S, K122E, D123N, T139K, I142V, T200I, Q207D, L210F, R211K  
SI3179-11 SI3179-11 None None   V35I, I135M, T200TA, R211K  
SI3400-11 SI3400-11 None None   K11KQ, V60I, K82KR, W88WC, K122E, D123N, T139X, I142V, S162A, K173X, Q174X, I202IV, R206RK, Q207D, R211K  
SI3434-11 SI3434-11 None None   V35M, S68SG, D121H, K122E, I142V, T200I  
SI3847-11 SI3847-11 None None   V8VI, V35T, V60I, T69X, A98S, K122E, D123DN, I135X, T139K, I142V, T200TI, Q207N, L210F, R211K  
SI4300-11 SI4300-11 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, D121X, K122E, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
SI4529-12 SI4529-12 None None   E6ED, V8I, K11X, K20KR, V35E, V60I, A98S, D123N, T139K, I142V, T200TI, Q207K, L210F, R211T  
SI5233-11 SI5233-11 None None   V60I, K122E, D123N, T139R, I142V, S162A, Q174K, N175Y, Q207X, L210LF, R211X  
SI5993-12 SI5993-12 None None   K20R, K49R, E53D, A98S, D123E, S162A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
SI6355-12 SI6355-12 None None   V35E, T39A, V60I, A98S, K122E, D123N, I135R, T139K, I142V, K173KE, T200I, Q207E, L210F  
SI6358-12 SI6358-12 None None   K20KR, T27TS, V35X, D121Y, K122E, T200TI, R211RK  
SI672-11 SI672-11 None None   K122E, I135R, I142T, T200I, R211K  
SI7358-11 SI7358-11 None None   K11X, V35T, T39N, K122E, D123N, K173S, Q174K, D177E, T200K, Q207A, R211RK  
SI7867-11 SI7867-11 None None   E6D, V8VI, D121H, K122E, I135T, S162C, D177DE, Q207E  
SI7940-12 SI7940-12 None None  V179D K20R, V35X, E36ED, T39X, K122E, D123N, A158S, K166KR, K173V, Q174K, T200A, Q207D, R211K  
SI8067-12 SI8067-12 None None   E6EK, V35T, T39A, E40D, R83K, D123E, I142IT, I178L, I202V, R211K  
SI8285-11 SI8285-11 None None   I135T, S163SC, G196E, F214FL  
SI8462-12 SI8462-12 None None  V179D K20R, V35T, T39K, K122E, D123N, A158S, K166R, K173V, Q174K, T200A, Q207D, R211K  
SI8734-12 SI8734-12 None None   V35T, E36D, V60I, I135R, Q174H, R211K, F214L  
SI8896-12 SI8896-12 None None   E6D, K11S, V35L, T39K, K43E, R83K, K122E, D123S, S162X, K173R, Q174N, D177E, Q207A, R211S, K238KR  
SI925-12 SI925-12 None None   K20R, V35T, T39A, E40D, V60I, K102Q, D123E, P176S, T200A, I202V, R211K  
SI9547-12 SI9547-12 None None   K122E, I135R, I142T, T200I, Q207K, R211K  
SI9735-11 SI9735-11 None None   D123E, S162C  
SI9812-12 SI9812-12 None None   E40EK, K46KQ, K122KE, I142T, S162A, R211K, F214L, L228H E233EK 
SI9826-12 SI9826-12 None None   I142T, S162A, T200A, R211K, F214L