Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Damond (2005)
Title Polymorphism of the human immunodeficiency virus type 2 (HIV-2) protease gene and selection of drug resistance mutations in HIV-2-infected patients treated with protease inhibitors.
Citation J Clin Microbiol
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV2
SelectedType Clinical
NumIsolates 94
NumPts 94
Host Human

 

Clinical PR Isolates


SubjectIsolatePIsWksPIMajorPIMinorCommonUnusual
11001 11001 None    V20I, K70R Y14L, N40S, A73G 
12001 12001 None   S43T G17D, N61D, K70R, T91A E65I 
12004 12004 None   S43T K7R, T12K, Y14N, K70R, T91N, A92T N40S, N41D, L67V, N68G 
12007 12007 None   S43T K7R, T12K, Y14S, P19S, K70R, T91N, A92T N40S, L67V, N68G 
12010 12010 NFV  L90M S43T N61D, E65K, K70R  
12012 12012 None   S43T K7R, T12K, I15V, T91N, A92T N40S, N41D, L67V, N68G, I75V 
12013 12013 None    I15V, K70R Y14H, N40S, N68G 
12014 12014 None    I36V D29DY, N40S 
12015 12015 None    S43N, E65K Y14YH, N40S, N41D, G94GS 
12017 12017 None   S43T G17D, E65K, K70R Y14H, N40D 
12021 12021 IDV  I82F, I84V, L90M I89V V10I, S43I, E65K, F85L N40D 
12022 12022 IDV  I82F  V10I, E65K, R72K, F85L K7N, N40D 
12028 12028 None    I15V, E65K Y14F, N40S 
12032 12032 None   S43T K7R, T12K, K70R, V71I, T91N Y14H, N40S, K60R, L67V, N68G, I75V 
12033 12033 None    E65K, K70KR, T91TA Y14YH, N40S 
12034 12034 None   I46T K7R, V10I, N41H, S43I, Y59F, E63N, K70T, V71I, A92E Y14H, N40P, K60H, N68G, A73G, I89L, L99F 
12035 12035 None    E65K, R72K Y14H, N40D 
12037 12037 None    G17D, N61D, E65X, K70KR, T77X N40S, G94GS 
12040 12040 None   S43T K60E, N61D, E65K, K70R K7N, N40S 
12046 12046 None   I89V K70R Y14H, N40S 
12047 12047 None    I36IV, E37D Y14H, N40S, N41D, E65R, G94GS 
12049 12049 None    K70R Y14H, N40S 
12050 12050 None    E65K, K70R Y14H, N41D 
12052 12052 None   S43T G17X, E21ED, E65K, K70R G94GS 
12056 12056 None   S43T L5LF, T12X, Y14X, Q18QH, E65K, K70R, V71VI, T91A V10VL, E16EK, N40D, A92S 
12057 12057 None    K7R, T12TS, I36V, N61D, E65K, K70T Y14H, N40S, D79E 
12058 12058 None   S43T, I46V G17D, E65K, K70R N40D 
12059 12059 None    G17D, S43X, E65K, K70R N40S 
12062 12062 None  I46IV  K7R, I36V, N61D, E65K, K70T P1PS, Y14H, N40S 
12068 12068 None    G17D, E65K, R72RK, N98K N40S 
12071 12071 None   S43T K7R, Y14N, K70R, V71I, T91N N40S, L67V, N68G, I75IV, A92S, G94GS 
13001 13001 None    T12TI, I15V, N61D, E65K, K70R N40S, N41D, N68G 
13004 13004 None   S43T K7R, T12K, Y14N, K70R, T91N N40S, N41D, V62I, L67V, N68G 
13010 13010 None    I15V, N61D, E65K, K70R N40S, N41D, N68G 
13011 13011 None  I54M S43T T12TS, G17E, N40X, E65K, K70R V62VI 
13012 13012 None     N40S, E65R 
18001 18001 None   S43T G17D, N61D, K70R E65I, L90R 
18004 18004 None   S43T, I46V, I54K G17D, N55T, E65K, K70R N40D, T56P, E58S, Y59I, A92V 
18006 18006 None    G17D, E65K, K70R Y14F, N40E 
18013 18013 None    T12I, E65K, K70T Y14H, N40S 
18014 18014 None   S43T K7R, T12K, Y14X, K70R, T91N N40S, N41D, L67V, N68G, I75L, A92S 
18016 18016 None    E65K N40S, N41D 
19003 19003 None   S43T K7R, V10I, T12K, P19S, T91N N40S, L67V, N68G, A92I 
19004 19004 None    K70R Y14H, N40S 
19005 19005 None   S43T K7R, T12K, G17D, K70R, T91N, A92T Y14C, N40S, L67V, N68G 
19007 19007 Unknown  I82S I46V G17E, E65K, K70R N40D, S43V, K60R, V62I, D79E 
2001 2001 None  I54M S43T K7R, T12K, E21D, K45R, E58K, K70R, V71L, T91N, A92T Y14C, N40S, T56V, V62I, L67V, N68G 
2004 2004 None   S43T K7R, T12K, Y14N, K70R, T91N, A92X N40S, L67V, N68G 
22006 22006 None   S43T K7R, T12K, Y14N, K70R, T91S, A92T N40S, L67V, N68G 
28001 28001 None    E65K, K70R Y14H, N40S, N41D 
28002 28002 None    E65K, K70R Y14H, N40S, N41D 
28005 28005 None   S43T K7R, T12K, K70KR, T91N, A92T N40S, V62VI, L67V, N68G, G94GS 
28010 28010 None   S43T K7R, G17D, N61D, K70R, A92T N40D, E65T, G94GS 
31006 31006 None    N61D, E65K, K70R Y14H, N40S 
31007 31007 None    N61ND, E65X, K70R Y14H, N40S, N41D 
32001 32001 None    G17D, E65K N40S, N41D, K60R, N88NY 
38002 38002 None   S43T, I89V G17D Y14H, N40D, E65R 
45001 45001 None    N61D, E65K, T91A, A92T Y14H, N40S, I75R 
47003 47003 None   S43T, I46V G17D, E65K, K70R, F85V Y14F, N40D, K57R 
48001 48001 None   S43T G17D, E65K, K70R Y14H, N40S 
48004 48004 None   S43T K7R, T12K, P19S, N61D, K70R Y14C, N40S, L67V, N68G 
50001 50001 None   S43T G17D, E65X, K70R Y14H 
51003 51003 None    I15V, E65K N41D, D79E 
51005 51005 None    I36V, K70R N40S, N41D 
51007 51007 None    N61D, E65K, K70KR Y14H, N40S 
51010 51010 None  I54M, L90M S43T, I46V G17D, E65K, K70R N40E, V62A, T74N 
51011 51011 None   S43T K7R, T12Q, T91N, A92T S4SF, E21E*, D29DG, N40S, N41D, V62I, L67V, N68G 
519001 519001 None   S43T K7R, V10VI, T12Q, N61D, K70R, T91N, A92T Y14H, N40S, V62I, L67V, N68G 
519002 519002 None   S43T K7R, Y14N, K70R, V71I, T91N N40S, L67V, N68G, I75V, A92S 
52004 52004 None   I89V K7R, E65K, K70R Y14H, N40S 
55001 55001 None   S43T K7R, T12Q, Y14S, K70I, V71I, T91N S4SF, N40S, K60R, V62VI, L67V, N68G, A92S 
56003 56003 None    K70R, T91A, A92T Y14H, N40S, N41ND, N68G, G94GS 
58003 58003 None    I15V, E65K N40S, N41D, N68NS 
58004 58004 None    E65K Y14H, N41D, G94GS 
58006 58006 None    K70R, T91A Y14H, N40S, A92S 
61001 61001 None    S43SN, E65K Y14YH, N40S, N41D 
63001 63001 None   S43T V10I, P19S, E65K, K70R N40D, K57R, D79E 
63003 63003 None    L5LF, T12TI, E65K, V71I Y14H, N40D, T77V 
65001 65001 None   S43T K7R, T12K, N61D, K70R, T91N, A92T Y14C, N40S, L67V, N68G 
67002 67002 None    K70R Y14H, N40S 
68001 68001 None   S43T K7R, T12R, Y14N, P19S, K70R, V71I, T91N N40S, L67V, N68G, I75L, A92S 
69001 69001 None    K7R, I15V, P19S, S43I, N61D, V71I, T91N N40S, L67V, N68G, A92S 
7001 7001 None    K70R, T91A Y14H, N40S, A92S 
7002 7002 None    I15V N40S 
7003 7003 None    V10VI, I15V N40S 
7004 7004 None   I46V V10I, G17D, S43I, E65K, K70R N40D 
7012 7012 None   S43T K7R, T12K, Y14S, K45R, T56A, E65K, V71I, T91N V22I, N40S, K60R, L67V, N68G, K70V, A92S 
7013 7013 None   S43T T12X, G17D, V20VL, E65K E16EG, L23L*, G35G* 
7016 7016 None   S43T G17D, K70R Y14H, N40S, E65R 
72000 72000 None   S43T K7R, P19S, N61D, K70R, T91N N40S, V62I, L67V, N68G, A92S 
74001 74001 None   S43T T12X, G17D, V20VL, E65K E16EG, L23L*, G35G* 
75001 75001 None    E21D, E65K, R72K N40S 
76001 76001 None   S43T K7R, P19S, N61D, K70R, T91S, A92T Y14C, N40S, F53FS, L67V, N68G, I75V 
9002 9002 None   S43T T12I, G17D, E65K, K70R, V71L, T91A Y14H, N40D