<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Abdoel Wahid (2016)
Title HIV-1 genetic diversity and drug resistance mutations among treatment-naive adult patients in Suriname.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 95
NumPts 95
Subtype B

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
T00UCJM T00UCJM None None   D121H, K122E, S162Y, K173Q, I178L, V179I, Q207E P236H 
T01QNDQ T01QNDQ None None   I142V, S162C, Q174H, D177E, I178L, V179I, T200E, E204N, Q207E, R211K  
T02DJXQ T02DJXQ None None   V35VIL, K102Q, I142V, S162Y, I178L, V179I, T200A, Q207E, R211K, T216TP P236H 
T08YUAQ T08YUAQ None None   V35VI, D121Y, K122E, I142V, S162C, I178L, Q207E, R211K P236PH 
T09EXIA T09EXIA None None   V35I, E40ED, T58TN, K122P, T165I, Q174R, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K  
T10AGCA T10AGCA None None   V35VI, K122E, I135L, S162C, D177NS, G196E, R211RK, E233EG W24WR 
T11MEZL T11MEZL None None  V179D K20R, V21I, V35R, V60I, D123E, F214L Q23QH 
T12VCQB T12VCQB None None   K122E, S162A, K173E, Q207E, R211K P236PH 
T13HTCF T13HTCF None None   K104R, V118I, D123N, T165I, D177E, G196E, Q207E, R211K, F214L  
T14QGOQ T14QGOQ None None   E28EG, K32R, V35T, I135IMV, I142V, S162C, I178L, Q197L, T200A, Q207E, R211K G45R, L100L* 
T15FSIO T15FSIO None None   K49R, D123E, S162C, E169D, G196V, T200S, Q207E  
T16XAAC T16XAAC None None   V35I, E40D, I135T, Q174K, Q207E, F214L  
T17KUCE T17KUCE None None   V35IT, V60VI, F87L, S162HY, E169D, G196GE, T200TI, Q207E, R211RK, V245M  
T18TOHO T18TOHO None None   V35I, T39A, E40D, V118I, I135T, K166R, Q207E, R211K, F214L, E233EG P236H 
T19KQKI T19KQKI None None   T107S, D123E, S162C, I178IM, R211K P236H 
T20JJOH T20JJOH None None   K49KR, D123E, I135V, S162C, E169D, I178M, T200A, Q207E  
T21BPEP T21BPEP None None   V35I, D123E, I135T, I142V, Q174H, D177N, I202V, F214L W24WR 
T22XHKR T22XHKR None None   E6D, V35I, E40ED, I135T, T200I, Q207D, R211K, F214L  
T23CFSJ T23CFSJ None None   K122Q, S162C, D177DE, T200TA, Q207E, R211K  
T37LNSJ T37LNSJ None None   K102Q, K122KE, T165I, G196E, T200A, I202IV, E204K, Q207E, F214L, E233EG  
T38TZXQ T38TZXQ None None  V108I V35T, T39A, K122P, D123E, I142IV, S162C, D177DE, I178L, V179I, T200A, Q207E, R211K, F214FL, E233G  
T39DNFD T39DNFD None None   D123E, I142V, I178L, V179I, G196E  
T40HQNB T40HQNB None None   K49R, D123E, I135V, Q145C, S162C, E169D, I178IM, T200A, Q207E  
T42CBIP T42CBIP None None   S48T, K122E, D123N, S162C, I195L, Q207E, V245M P236PH 
T42VGYL T42VGYL None None   V35T, I142V, S162C, D177DE, I178L, V179I, T200A, E204N, Q207E, R211K  
T43TXBN T43TXBN None None   D123E, I135R, S162C, R211K  
T43XPOG T43XPOG None None   V35M, E40D, Q207E, R211K, F214L, V245M  
T44HEYP T44HEYP None None   K122E, S162C, T200A, Q207E, R211K  
T44HZLD T44HZLD None None   K49R, D123E, I135V, S162C, E169D, I178M, T200A, Q207E, E248D  
T45EXSI T45EXSI None None   V35I, E40D, V118I, I135T, Q174L, V189I, Q207E, R211K, F214L, V245E  
T46KIMH T46KIMH None None   K32R, V35T, I142V, S162C, Q174H, I178L, V179VI, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245I  
T46ORAE T46ORAE None None   V35I, E40D, V118I, K122E, D123E, I135T, Q207E, R211K, F214L  
T47CUIP T47CUIP None None   K32KE, S162C, E169D, G196GE, T200A, Q207E, R211K, P243T, V245E  
T47KMSE T47KMSE None None   K64R, K122E, D123E, I135IATV, D177E, T200A, Q207T, R211K G99GR 
T48ZLNF T48ZLNF None None   V35E, K49R, K104R, I135R, S162C, I178L, V179I, Q207E, V245VL  
T48ZXUQ T48ZXUQ None None   I142V, I178M, Q207QP, R211K  
T49MJLA T49MJLA None None   T39TAPS, E40D, Q197H, E204K, Q207E, F214L K66KN 
T50KTLE T50KTLE None None   K11KE, P14S, I142K, S162A, G196E, Q207G, R211K, E233X K20KI, Y232Y*, L234LV 
T51IJPO T51IJPO None None   K11R, V35M, Q207E, R211K, F214L  
T53VPFJ T53VPFJ None None   V35I, K122E, S162C, G196E, Q207E, F214L  
T54RIGI T54RIGI None None   E53D, I142IV, S162A, E204D, Q207A, R211K  
T55VTZC T55VTZC None None   V106I, D123E, I142V, S162C, I178L, V179I, T200A, Q207E, R211K  
T59OEFP T59OEFP None None   P14Q, K32R, D123E, I142V, S162C, I178L, V179I, T200A, Q207E, R211K  
T61USUN T61USUN None None   K11KR, K122E, S162C, T200A, Q207DEKN, R211KT, V245M, E248D E6E* 
T62SDDQ T62SDDQ None None   D121Y, K122E, T165I, D177E, I178L, G196E, T200TA, E204K, Q207E, R211K, F214L, V245M  
T63LPHD T63LPHD None None   V35I, E40D, I135T, K166KR, D177E, I178M, Q207E, R211K, F214L  
T64QLRA T64QLRA None None   V35VI, D177E, I178V, G196S, T200V, R211K, F214L  
T65OBDA T65OBDA None None   M16MT, K64R, D121H, K122E, D177E, T200A, Q207EGKR  
T67JLDQ T67JLDQ None None   K20R, K49R, K122E, D123DN, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245M  
T68CACL T68CACL None None   V35T, E40Q, V60I, D123DE, I135T, K166KR, Q207E, R211K, F214L  
T69GHDN T69GHDN None None V75M  T69A, E79D, K82KR, K122KE, D123E, S162C, K173R, I178M, G196GE, R211K  
T69IVGK T69IVGK None None   K49R, D121Y, K122E, I135T, S162C, I178IM, I195V, T200TA, Q207E, R211K E29EG, P236PH 
T70FBZN T70FBZN None None   V35I, E40D, V118I, K122KE, T200A, Q207E, R211K, F214L  
T70PEXN T70PEXN None None   K20KR, K82KR, K122E, E169D, T200A, R211K, F214L E29EG, E42EK 
T71LKCG T71LKCG None None   V35I, E40D, Q207E, R211K, F214L  
T72GCBP T72GCBP None None   K104R, S162C, I178L, V179VI, T200A, Q207E, R211K  
T72PTSG T72PTSG None None   V35T, T39A, D123DE, I135T, Q174E, T200A, R211K, F214L  
T73HZEG T73HZEG None None   V35I, E40D, K49R, D123N, F171Y, I178IL, Q207E, R211RK, F214L  
T73TDZD T73TDZD None None   V35T, K122KE, D123DN, S162C, I178L, V179I, T200A, E204K, Q207D, R211K  
T74GQSJ T74GQSJ None None   K49R, K104R, K122E, I135RT, S162C, I178L, V179I, G196E, Q207G  
T74XVOP T74XVOP None None   E169D, D177E, G196D, T200A, F214FL  
T75DFMF T75DFMF None None  V179D V35M, K122E, T200A, I202IV, Q207E, P243H, V245E  
T76HKRI T76HKRI None None   V35I, K122Q, I142T, S162C, Q207E, R211K  
T76PIXP T76PIXP None None   V35I, V106VI, I135V, S162C, E169D, I178M, V179I, T200A, Q207E, R211K, V245M  
T77QHUE T77QHUE None None   V60VI, K122E, I135V, I142IV, T165TI, V245Q  
T77VDBF T77VDBF None None   K102R, K122E, I142V, I178M  
T78CIZN T78CIZN None None   S162C, I178L, V179I, Q197E, Q207E, R211K, E233EG  
T78YYYP T78YYYP None None   V35I, E40D, V60VI, K122E, I135T, Q207E, R211K, F214L E79EG 
T79KNOI T79KNOI None None   V35I, E40EK, Q207E, R211K, F214L E204E* 
T79ZRNH T79ZRNH None None   V35I, E40ED, I50N, K122E, D123DE, I135IT, K173KDEN, I178IM, Q197QK, T200TAEK, Q207ADE, R211RK, F214FL, H221HY, E233EG L34LF, P236H 
T80PZFI T80PZFI None None   V35IK, K49KR, V60I, I142IV, I178M, G196E, E248D  
T80SGQO T80SGQO None None   K32KE, E36EQ, S162C, G196E, Q197KR, E204ED, Q207E, R211RK I37M, K46KN, P236H 
T81NORQ T81NORQ None None   V35I, E40ED, I135T, K173KE, I178IL, G196GE, Q207E, R211K, F214L  
T81YIRI T81YIRI None None   S48T, K122KE, S163T, N175Y, D177E, T200A, P243H P236PH 
T82QMDH T82QMDH None None   K20KN, V21X, K22X, Q23X, K32R, V60VI, I142V, S162C, I178L, V179I, T200A, Q207E, R211K  
T83DRFK T83DRFK None None   V35T, D123E, I135R, I142V, D177E, T200A, I202IV, R211RK, F214L, L228LF, E233G  
T83RLBA T83RLBA None None   K20KN, K32R, D121H, K122E, I142V, S162C, I178L, V179I, T200A, Q207E, R211K W24WR 
T84NVSF T84NVSF None None   V35I, E40D, V118I, K122E, D123E, V179VI, Q207E, R211K, F214L  
T84VYON T84VYON None None   P4S, T69TA, K122E, S162C, T200A, Q207E, R211K  
T85XTJG T85XTJG None None   V35T, K49R, I135T, S162C, E169D, T200A, Q207E, E233G  
T86HFHK T86HFHK None None   K32R, V35T, I142V, S162C, Q174H, I178L, V179VI, D192DE, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245I  
T86IZCG T86IZCG None None   K20R, V35I, E40D, I135V, K173R, P176PS, T200A, Q207E, R211K, F214L, E233EG P236PH 
T87KRTK T87KRTK None None   V35I, E40D, K49KR, K173T, I202V, Q207E, F214L P236PH 
T88XGBC T88XGBC None None   V35I, K64R, V106I, K122E, D123E, I135T, S162C, I178M, T200A, R211RK  
T89RUBI T89RUBI None None  G190GR K49R, D123E, R125RK, D177E, Q197H, I202V, R211K, V245M, E248D G93GR, G99GR 
T90JXII T90JXII None None   E79D, K122E, I142V, K173R, Q207E  
T91UMPB T91UMPB None None   K49KR, K122E, D123N, S162C, G196GRS, Q207E, R211RK P236PH 
T92IMNA T92IMNA None None   D123E, I135T, F171FY, D177E, T200A, I202IV  
T93CMCJ T93CMCJ None None   A33X, L34X, V35X, D123DE, I142V, S162C, I178L, V179VI, T200A, Q207G, R211K  
T94GFHK T94GFHK None None   D123DEKN, I142V, S162C, D177E, I178L, V179I, T200A, Q207K, R211AT  
T95RRJA T95RRJA None None   V35I, E40ED, K122E, D123E, A158S, S162SN, T165I, Q207E, R211K, F214L F160FC, P236PH 
T96OQLA T96OQLA None None   S162NY, D177E, V179I, Q207E  
T97CUOG T97CUOG None None   I135V, I142T, S162C, I178L, V179I, T200A, Q207G, R211K L187LW, P236H 
T98XLXH T98XLXH None None   K32R, D123E, I135T, I142V, S162C, I178L, V179T, V189VI, T200A, Q207G, R211T  
T99CXGO T99CXGO None None   K32R, K122E, D123N, I142V, S162C, I178L, V179I, T200A, E204N, Q207E, R211K P236PH