Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Bercoff (2010)
Title Polymorphisms of HIV-2 integrase and selection of resistance to raltegravir.
Citation Retrovirology
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV2
SelectedType Clinical
NumIsolates 47
NumPts 47
Host Human


Clinical PR Isolates

19970068 97068 None    V10I, G17X, P19PS, E65X N40S, N41D 
19980385 98385 None    F3L, G17E, E65K N41D, L93I, L99F 
19990547 96288 None    N61D, E65K, K70R, R72K N40S 
20010473 2001473 None    S4P, K7E, T12I, E65K, K70R N40S, N68G 
20010866 2001866 None    K70R Y14H, N40S 
20040941 2004941 None   S43T N68ND, K70R Y14H, N40S 
20050011 2003026 None    K70R N40S 
20050388 20050388 None    I36V, K70T Y14H, N40S, E65R 
20050508 20050508 None    P1L, I15V, K70R Y14H 
20050775 20050775 None    T12L, S43N, E65K Y14H, N40S, N41D 
20070313 20070313 None    K70R, T91A Y14H, N40S, N41D, A92S 
20080321 20080321 DRV, RTV  L90M  P19R, E65K N40S 
20080511 20080511 None    K70R, T91A Y14H, N40S, N41D, A92S 
20080618 20080618 LPV  I54M, I82F I46V S43I, K45R, K70R, V71I, T91A, M95V Y14H, N40S, A73G, L99F 
20080869 20080869 None    K70R N40S 
20081032 20081032 SQV, RTV  I54L, L90M  E21K, N61D, K70R, V71I, R72RK N40S 
20081313 20081313 None    I36V, S43R, N61D, E65K, K70T Y14H, N40S 
20090342 20090342 None  I46IT I89V K70R Y14H, N40S, N68G 
ITG12880 195603 None    S4P, E65K, K70R Y14YH, N40NS, N68G 
ITG17659 195911 None   S43T, I46V G17D, E65K, K70R, D79DN N40E, K57R 
ITG24071 ITG_24071 NFV    V20I, E21ED, E65K Y14YH, N40S 
ITG2545 196207 None    E65K, R72K Y14H, N40S, N41D 
ITG28175 ITG_28175 LPV  V47A I89V S43I, K45R, E65K, K70R, V71I, M95MV V62A, N68G, L99F 
V060880 V06-0880 None     Y14H, N40S, N68G 
V061132 194310 None   S43T K7R, T12K, Y14N, P19S, K70R, T91S N40S, L67V, N68G, A92S, S96T, L99F 
V061139 V06-1139 None   S43T T12M, G17D, E65K, K70R Y14H, N40D 
V063475 V06-3475 None   I89IV E37G, N61D, E65K Y14H, N40NS, D79E 
V063553 V06-3553 SQV, RTV, ATV  I46IV S43T T12X, G17D, N61ND, E65K, K70R N40D 
V071200 V07-1200 None   S43T G17D, K70R N40D, K60Q, L99F 
V071737 V07-1737 Unknown  I50V, I54M V33I, I89V S43I, K45R, I64V, E65K, K70R, V71I, F85L, A92T, M95V L99F 
V074155 V07-4155 Unknown    G17GD, N61D, E65K, K70R Y14H, N40S 
V080553 V08-0553 None    W6WR, K7R, K70R Y14H, N40S, N68G 
V082661 196310A None   S43T K7R, T12K, Y14N, K70R, R72K, T91N N40S, N55Y, K60R, L67V, N68G, A92S, S96T, L99F 
V086011 V08-6011 RTV, IDV  I82F S43T V10VI, K60N, E65K, V71I, A92T N40D, V62VI, T77V 
V086050 V08-6050 None   S43T, I46V E65K, K70R, V71I, T91A N40E, K57R, K60R, A92N 
V086051 V08-6051 LPV   S43T K7R, T12KR, P19S, K70R, V71I, T91N, A92T Y14C, N40S, K60R, L67V, N68G, S96T, L99F 
V086052 V08-6052 None   S43T T12L, G17D, N61D, K70R Y14H, N40D, E65R 
V086119 V08-6119 None   S43T, I46V V10VI, G17D, E65K, K70R, A92T N40D 
V086120 V08-6120 Unknown  V47A S43T V10VI, G17D, K45R, V62X, K70R, V71I Y14YF, N40D, E65R, L99F 
V086121 V08-6121 None   S43T K7R, T12K, Y14N, T91N N40S, V62I, L67V, N68G, S96T, L99F 
V086122 V08-6122 None   S43T K7R, T12K, Y14N, T91N N40S, V62I, L67V, N68G, S96T, L99F 
V086123 V08-6123 None   S43T K7R, T12R, Y14S, E21D, N61D, K70R, T91N, A92T N40S, L67V, N68G, S96T, L99F 
V086124 V08-6124 None   S43T, I46V V10VI, G17D, E65K, K70R, A92T N40D 
V086127 V08-6127 None   S43T, I46V K7KR, G17D, E65K, K70R N40D 
V086130 V08-6130 Unknown  I54M, I82F L24LI, S43T, I46V K7R, V10VI, G17D, E65K, K70R, V71I N40D, L99LF 
V086136 V08-6136 None   S43T I36V, N40X, K70R Y14H, L99F 
V086139 V08-6139 None    G17D, K70R Y14L, N40S, S43V, E65R