<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Han (2013)
Title Identification of 3 distinct HIV-1 founding strains responsible for expanding epidemic among men who have sex with men in 9 Chinese cities.
Citation JAIDS
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 544
NumPts 544
Subtype CRF01_AE, B, CRF07_BC, CRF55_01B, B + C, C, A, CRF59_01B, CRF67_01B, CRF68_01B, CRF58_01B

 

  Page 1 of 6    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 544 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
09BJ150 09BJ150 None None   I5V, E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, I202V, Q207A, R211S, K238R  
09BJ170 09BJ170 None None   V35I, V118I, K122E, I135T, S162N, T200I, F214L  
09BJ171 09BJ171 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T  
09CS520019 09CS520019 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R  
09JN410035 09JN410035 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, S48T, V60I, D121Y, K122E  
09JN410055 09JN410055 None None   D17E, V35I, V106I, V118I, D121Y, K122E, I135T, E169D, I202V, F214L  
09JS14 09JS14 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, V111I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L  
09JS3 09JS3 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E  
09JS7 09JS7 None None   E6D, V35T, T39K, V118I, K122E, D123N, K166R, T200I, R211K, F214L, K238R  
09LN300402 09LN300402 None None   E6D, V35I, I135L, S162C, G196E  
09LN300443 09LN300443 None None   V35I, I135L, I142M, S162C, G196E, Q207QLPR, R211RKMT L205LMV 
09LN300455 09LN300455 None None   E6D, K11KT, E28A, V35T, T39K, K43E, V60I, V118I, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200E, Q207A, R211S, F214L, K238R  
09LN320670 09LN320670 None None   E6D, K11R, K22R, V35T, T39K, S68G, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211N, F214L, K238R  
09SC115 09SC115 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R  
09SC124 09SC124 None None   V60I, R83K, V90I, K122E, S162Y, I178M, T200E, R211K  
09SC127 09SC127 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K102R, K122E, D123S, I135T, S162W, D177E, I178M, G196R, Q207A, R211S, K238R  
09SC148 09SC148 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K102R, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R  
09SC168 09SC168 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S  
09SC177 09SC177 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39V, S48T, V60I, D121Y, K122E  
09SC192 09SC192 None None   V60I, I135V, I142V, D177E, I178V, T200I, Q207E, R211K  
09SC26 09SC26 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, S68N, D121H, K122E P133L 
09SC36 09SC36 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135R, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R  
09SC38 09SC38 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174N, D177E, I178M, V179I, E203D, Q207A, R211S, K238R  
09SC45 09SC45 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E  
09SC65 09SC65 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R  
09SC68 09SC68 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E  
09SH900144 09SH900144 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200K, Q207A, R211S  
09SH900402 09SH900402 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R  
09SH900411 09SH900411 None None  V179D E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211N, K238R  
09SH900415 09SH900415 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R  
10BJ148 10BJ148 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R  
10CS101017 10CS101017 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E  
10CS101134 10CS101134 None None  E138K E28K, K32E, V35T, E36A, T39A, S48T, V60I, D121Y, K122E, E169D  
10KM220476 10KM220476 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207D, R211S, K238R  
10LN300467 10LN300467 None None   E6N, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, T165I, K173A, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238KR  
10LN300474 10LN300474 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R  
10LN300486 10LN300486 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R  
10LN300493 10LN300493 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K103R, K122E, D123N, K173T, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R  
10LN300495 10LN300495 None None   E6D, K11T, V35IT, T39TK, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R  
10LN300516 10LN300516 None None   E6D, V35I, D123E, I135L, S162C, I178IM, G196E  
10LN300521 10LN300521 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, E53D, K122E, D123S, I135T, I142T, S162Y, Q174R, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R  
10LN300538 10LN300538 None None   E6D, K11T, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R  
10LN300561 10LN300561 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R  
10LN300564 10LN300564 None None   K20R, K32N, V35I, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135R  
10LN300584 10LN300584 None None T215A  E6D, V35I, I135L, S162C, D177E, I178V, G196E, Q207L, R211K  
10LN300602 10LN300602 None None   E6D, V35T, T39R, K43E, V118I, K122E, D123S, S162SN, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R  
10LN300618 10LN300618 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, I142V, T165I, K173V, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R  
10LN300620 10LN300620 None None   E6D, K11KT, V35T, T39K, K122E, D123N, I135IT, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R  
10LN300633 10LN300633 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173M, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R  
10LN300642 10LN300642 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, I202V, Q207A, R211S, F214L, K238R  
10LN300830 10LN300830 None None   E6D, V35I, T107S, I135V, S162C, G196E, T200I  
10LN320862 10LN320862 None None  V179E D121Y, K122E, I135T, I180V, T200A, Q207E, F214L D177T 
10LN321014 10LN321014 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, I142V, T165I, K173V, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R  
11GD235 11GD235 None None M184V K101H, G190A E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V111I, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R  
11LN300430 11LN300430 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R  
11LN300565 11LN300565 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D121H, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S  
11LN300656 11LN300656 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R  
11LN300724 11LN300724 None None   E6K, V35I, V60I, K82R, R83K, K122E, I135T, I142V, K173E, I195K, G196E, T200A, E204K, Q207E  
11LN300729 11LN300729 None None   E6D, K11T, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R  
11LN300736 11LN300736 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, K173IT, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214FL  
11LN300744 11LN300744 None None   E6D, K11T, V35T, T39EK, K122E, D123N, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R  
11LN300769 11LN300769 None None  V179E V35VI, T39TA, D121Y, K122E, I135T, D177A, T200A, Q207E, R211K, F214L  
11LN300774 11LN300774 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R S68SDGN 
11LN300775 11LN300775 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K102R, K122E, D123S, I135V, S162G, E169D, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R  
11LN300784 11LN300784 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T N137S 
11LN300815 11LN300815 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R  
11LN300819 11LN300819 None None   P4PT, I5IV, E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I195IT, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R  
11LN300823 11LN300823 None None   E6D, V35I, I135L, S162C, G196E, T200I, R211G  
11LN300832 11LN300832 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173T, Q174K, D177E, T200R, I202V, Q207A, R211S, F214FL, K238R  
11LN300851 11LN300851 None None   D123E, I135IV, S162C, D177E, T200A, R211K  
11LN300870 11LN300870 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123N, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179VI, E203D, Q207A, R211S, K238R  
11LN320017 11LN320017 None None   I5V, E6D, K11T, V35T, T39K, K43Q, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R T58~, P59~, V60~ 
12GD317 12GD317 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T  
12GD328 12GD328 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, T200E  
12GD342 12GD342 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135R, I202V, R211K, F214L  
12GD343 12GD343 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, E169D  
BJ10 BJ10 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K64R, V118I, K122E, D123S, I135T, S162N, K173T, Q174R, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R  
BJ12 BJ12 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, E203D, Q207A, R211S, K238R P133PL 
BJ136 BJ136 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K103R, S117SP, K122E, D123S, S162C, Q174N, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R S156SP 
BJ138 BJ138 None None K219KQ  E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162CY, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, E203D, Q207A, R211S, K238R  
BJ146 BJ146 None None   E6D, K11T, K32KR, V35T, T39KR, S68G, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, I178M, E194K, G196GE, E203D, Q207A, R211S, K238R V8IT, G93GE 
BJ159 BJ159 None None   V118I, K122E, I135T, S162N, T200I, F214L  
BJ204 BJ204 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39DN, S48T, V60I, D121Y, K122E  
BJ212 BJ212 None None   I5V, E6D, K11T, K20R, V35T, T39R, K43E, K49R, K122E, D123S, I135R, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211A, K238R R143RS, Y144YD 
BJ214 BJ214 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E  
BJ216 BJ216 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E  
BJ229 BJ229 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K166R  
BJ235 BJ235 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, R211K K82KE 
BJ26 BJ26 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, I142V, T165I, K173A, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R  
BJ35 BJ35 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, V111I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R  
BJ48 BJ48 None None   K102Q, S162C  
BJ50 BJ50 None None   V118I, D121Y, K122E, R211G, F214L  
BJ54 BJ54 None None   K103R, K104R, V118I, K122E, I135T, E169D, I202V, R211K, F214L  
BJ57 BJ57 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E  
BJ65 BJ65 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E  
BJ79 BJ79 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39A, S48T, D86N, D121Y, K122E, I135IT, I142X, R143X, Y146YF, P170PS Y144G 
BJ86 BJ86 None None   E6N, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S134SC, I135T, N147NH, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R T128TS, Q145Q*, W153WR, S156SF, P157PS 
BJ90 BJ90 None None   I5V, E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, W88WR, K122E, D123S, S162C, K173N, Q174K, D177E, Q207A, R211T, K238R F87FY 
BJ93 BJ93 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, K64KR, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R R206RG 
BJ94 BJ94 None None  K238N I5V, V118I, I135V, K166N, T200A, F214L