<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Moura (2015)
Title HIV-1 transmitted drug resistance and genetic diversity among patients from Piaui State, Northeast Brazil.
Citation J Med Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 89
NumPts 89
Subtype B, C, F, CRF05_DF, B + C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
BRPI_100 BRPI_100 None None   K20R, K49R, D123E, I135T, D177E, I178M, G196GE, I202IV, Q207K, R211M, E224K R78RK, E79EK, E204GIRV 
BRPI_101 BRPI_101 None None   K49R, K122E, T165I, E169D, D177E, T200A, Q207E  
BRPI_102 BRPI_102 None None   E6ED, K11HQ, V60I, D123E, K166KR, D177E  
BRPI_106 BRPI_106 None None   K49R, K122A, I135T, I142V, T165I, D177E  
BRPI_107 BRPI_107 None None   S68G, E79D, V90I, K122E, D123S, K173KR, R211K  
BRPI_108 BRPI_108 None None   I135T, S162C, T200A, R211K, F214L  
BRPI_109 BRPI_109 None None   K122P, I142V, R211RK  
BRPI_11 BRPI_11 None None   K49R, V106I, K122E, D123N, I135T, E169D, I178M, Q207E  
BRPI_110 BRPI_110 None None   K49R, V60I, I135T, S162SN, K173R, Q197P, Q207E, R211K  
BRPI_111 BRPI_111 None None   E28K, K32E, V35IT, V60I, K122E, I135L, I178L, V189I  
BRPI_112 BRPI_112 None None   V35I, A98AS, K102Q, K122E, I135T, S162C, E169D, Q174K, D177E  
BRPI_113 BRPI_113 None None   K20R, K122E, Q197E, T200A, R211K  
BRPI_114 BRPI_114 None None   K11Q, D123E, D177E, I195L, T200A, I202V, Q207E, R211K  
BRPI_115 BRPI_115 None None   K122E, D123S, I135T, K173T, R211K, F214L A98Q 
BRPI_116 BRPI_116 None None   I50V, V60I, K122E, I142V  
BRPI_118 BRPI_118 None None   K20R, E44D, K122E, D123N, I135T, D177E, V179VI, R211K, F214L  
BRPI_119 BRPI_119 None None   K20R, V60I, I135T, K173R, D177E, I202V, R211K  
BRPI_12 BRPI_12 None None   V35VI, K102Q, I135T, D177EK, I178M, G196E, Q207QR, R211REGK  
BRPI_13 BRPI_13 None None   V21I, K122E, D123S, I135T, I142V, S162SN, T165I, K173T, T200I, I202IV, E204EK, R211K  
BRPI_14 BRPI_14 None None   V35I, V118I, K122E, I135T, E138A, I142M, T165I, K173KR, I178IM, V179I, R211RK, F214L  
BRPI_16 BRPI_16 None None   E6ED, V8VI, K11KR, V35T, R83K, K122E, T165I, I202IV, Q207E, R211K  
BRPI_17 BRPI_17 None None   T69S, K102E, D123N, I178M, Q207E, R211K  
BRPI_18 BRPI_18 None None   K20R, V60I, A98S, D121H, K122E, I135T, D177E, G196E, T200A, I202V, Q207L, R211K, F214L  
BRPI_20 BRPI_20 None None   K22R, V35T, E36A, T39E, S48T, I135M, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211E  
BRPI_21 BRPI_21 None None   K20R, T200I, I202V, Q207G, R211Q  
BRPI_22 BRPI_22 None None   K122E, D123S, I135T, K173T, R211K  
BRPI_23 BRPI_23 None None   K20R, D123E, I135T, K166R, T200I, R211K  
BRPI_24 BRPI_24 None None   S48T, K122E, I135T, K173Q, V179T, T200A  
BRPI_25 BRPI_25 None None   S68G, K122E, D123N, I178M, G196E, R211G  
BRPI_26 BRPI_26 None None   K102R, I135T, V179I, I202V, Q207E, R211K  
BRPI_27 BRPI_27 None None   K11R, V60I, V118I, K122E, D123T, T200I, R211K, F214L  
BRPI_28 BRPI_28 None None   V35E, V60I, K122E, I135T, I142V, K166KR, T200S, I202V  
BRPI_29 BRPI_29 None None  V179D K49R, I50V, V60I, K64R, K122E, D123S, I135T, T139K, Q197L, R211K, F214L  
BRPI_30 BRPI_30 None None   K103R, D121Y, K122E, D123E, I135T, D177E, T200TA, R211S, F214L  
BRPI_31 BRPI_31 None None  V179E V35I, V60VI, S68G, V90VI, K102KQ, D121DY, K122E, I135R, K173KR, T200A, Q207E E204NS 
BRPI_32 BRPI_32 None None   K49R, K122E, I135T, E169R, K173E, T200A, R211K  
BRPI_33 BRPI_33 None None   K49R, K122E, D123DE, I135T, E169R, K173E, R211K  
BRPI_34 BRPI_34 None None  K103KN T165I, D177E, I178L, T200A, E204K, Q207E, R211K, F214L  
BRPI_35 BRPI_35 None None   V60I, K122E, D123E, I135T, I142V, I178M, G196E  
BRPI_36 BRPI_36 None None   K20R, V60I, D86DE, A98S, D121H, K122E, I135T, N175NH, D177E, I178IMV, T200A, I202V, Q207GR, R211K, F214L  
BRPI_39 BRPI_39 None None   A98S, K122P, I135T, K173N, Q174K, D177E, G196E, R211K  
BRPI_4 BRPI_4 None None   K122E, D123N, I135IT, I142V, S162CY, Q174QK, R211Q  
BRPI_40 BRPI_40 None None   K20R, D123E, I135V, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178L, Q197K, T200E, Q207K, R211T S3N 
BRPI_41 BRPI_41 None None   V35I, R83RK, K103R, I142IT, S162C, T200TA, R211RK, F214L R78RK 
BRPI_43 BRPI_43 None None   I135T, Q174HR, D177E, T200I, I202V, Q207E, R211Q P225A 
BRPI_44 BRPI_44 None None   V35T, T39L, V60I, D121Y, K122E, D123G, I135T, S162A, Q174R, D177N, I180V, T200E  
BRPI_45 BRPI_45 None None   K49R, K122E, I135V, E169K, K173Q, D177E, T200TA  
BRPI_47 BRPI_47 None None   S48T, K49R, K122E, K173Q  
BRPI_48 BRPI_48 None None   S68G, K122E, D123N, G196E, R211G  
BRPI_49 BRPI_49 None None   K49R, I135T, S163C, E169R, K173E, R211K  
BRPI_5 BRPI_5 None None   K122E, I135T, I202V, Q207K, R211Q  
BRPI_50 BRPI_50 None None   K20R, V35T, T39TR, K122KR, D123E, I135T, I178M, T200A, Q207N, R211K  
BRPI_51 BRPI_51 None None   K122P, I142V, D177E, I178M, R211K T216H 
BRPI_52 BRPI_52 None None   K20R, K49KR, K104KR, K122KR, D123DE, R211K  
BRPI_53 BRPI_53 None None   K20R, S162C, D177N, R211K  
BRPI_54 BRPI_54 None None   K49R, V90VI, K122E, I135T, E169R, K173E, I202V, R211K, F214L  
BRPI_55 BRPI_55 None None   E6EK, K20KR, S48T, K122E, I135T, K173Q, Q174QH, T200A, R211K  
BRPI_56 BRPI_56 None None D67DN, V75I  V35I, K49R, K122E, I135T, E169D, D177E  
BRPI_57 BRPI_57 None None   K20R, I142T, D177N, T200S, I202V, L210M  
BRPI_58 BRPI_58 None None M41L, T215S  I135T, T165I, K173Q H221D 
BRPI_6 BRPI_6 None None   K20R, V35I, E40D, V60I, I135IL, T139TA, E194D, G196E, T200A, F214L  
BRPI_60 BRPI_60 None None  K103N V35I, R83K, I135T, I178L, F214L  
BRPI_64 BRPI_64 None None   V35L, S48T, D123E, D177E  
BRPI_66 BRPI_66 None None   K20R, V35IT, V60I, K122E, D123E, I135T, I142V, I178L, T200A, Q207E  
BRPI_7 BRPI_7 None None   K20KR, D123S, I135T, R211K, F214L F171FC 
BRPI_71 BRPI_71 None None   V8I, V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, I135T, D177E  
BRPI_72 BRPI_72 None None   E79D, S162C, D177N, T200A, Q207QL, R211K  
BRPI_73 BRPI_73 None None   K20R, K122E, D123E, I135T, T200S, I202V  
BRPI_74 BRPI_74 None None   D123E, I135T, D177E, I178IMV, G196E, T200E, E204K, R211EG, F214L  
BRPI_75 BRPI_75 None None   V35T, E36EA, T39D, K49KR, K122E, I135T, K173A, D177E, T200A, E204D, Q207E  
BRPI_76 BRPI_76 None None   K20R, K122KE, I135T, K166R, E169D, T200TA, I202V, R211K E53EK 
BRPI_77 BRPI_77 None None  K103S V35I, S68G, K102Q, D123E, I135T, K166R, D177E, I178M, D192N, T200A, I202V, Q207K, R211K  
BRPI_78 BRPI_78 None None   E6ED, K11KR, V35I, R83K, D177E, I178M, V189VI, Q197K, T200I, R211K  
BRPI_79 BRPI_79 None None   K20R, K49R, D123E, I135T, S162C, D177E, I178M, T200TA, Q207K, R211Q  
BRPI_8 BRPI_8 None None   V60I, A98S, D121Y, K122E, I135T, Q174K, D177E, T200A, R211G  
BRPI_81 BRPI_81 None None   K46KE, I135T, D177E, T200I, I202V, Q207E, R211Q Q174CS 
BRPI_83 BRPI_83 None None   V35T, K49KR, K122E, S162C, E169D, K173R, Q174K, T200V, Q207K L209I 
BRPI_85 BRPI_85 None None T215L V179E, Y188L K122E, I135T, E138EG, R211K, F214L  
BRPI_86 BRPI_86 None None   P14A, K20R, D121H, K122E, I135T, E138A, I142V, S162C, Q174QR, D177DE, I195T, T200A, I202V R78RK 
BRPI_88 BRPI_88 None None   V35I, S48T, V60I, F87L, V118I, D121H, K122E, I135T, D177E, Q197K, T200A, R211K, F214L  
BRPI_89 BRPI_89 None None   K49R, K122A, I142V, E169D, R211S  
BRPI_9 BRPI_9 None None   K11R, K20R, V35T, T39K, D123E, I135T, I178M, T200A, Q207N  
BRPI_90 BRPI_90 None None T215TN F227L K20R, T39AE, K49R, I50N, K102Q, K122E, I135T, S162C, E169D, Q174R, T200N, R211RK, F214L P226L 
BRPI_92 BRPI_92 None None   D123E, I135T, D177E  
BRPI_93 BRPI_93 None None   V35I, R83K, K122E, D123S, I135T, R211K  
BRPI_96 BRPI_96 None None   K20R, V35M, D123E, I178V, I180V, R211RK, F214L  
BRPI_97 BRPI_97 None None   K20KR, V35IT, I135V, S162C  
BRPI_98 BRPI_98 None None   K20KR, V60I, A98S, K102Q, K122E, D123G, I135T, E169D, N175H, D177E, G196EK, T200A, K201T, L228F  
BRPI_99 BRPI_99 None None   V118I, D121H, K122E, I135T, T165TI, D177E, T200A, R211K, F214L