Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Kinloch (2016)
Title Population-level immune-mediated adaptation in HIV-1 polymerase during the North American epidemic.
Citation J Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 321
NumPts 321
Subtype B


  Page 1 of 4    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 321 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
PRRT_105 PRRT_105 None None   D123E, I135T, D177E, V245Q, K277R, M357T, S379G, K385R  
PRRT_106 PRRT_106 None None   V35I, I135L, G196E, T200A, D237N, V245M, I293V, I326V, I329V, A376T, T386I  
PRRT_11 PRRT_11 None None   I135T, S162C, R211K, V245M, A272AP, Q278QE, I293V, R356RK, A360AT  
PRRT_111 PRRT_111 None None   T7P, K11R, R83K, A272S, K311KR, V317VA, Q334DN, A376V, E399D  
PRRT_114 PRRT_114 None None   E36EK, V60I, D86E, R211K, R284RK, A288S, I293V, E297EA, A327V, Q334QE, M357T, K390R  
PRRT_115 PRRT_115 None None   K122KR, D123E, S162SC, I178L, Q207E, A272P, K277R, Q334QL, A360AT  
PRRT_116 PRRT_116 None None   G196E, Q207D, R211K, V245M, K277R, T286A, Q334L, A376S  
PRRT_118 PRRT_118 None None   V60I, I135T, R211K, A272AP, V292I, I293V, R356RK, K390KR, E399ED  
PRRT_119 PRRT_119 None None   V60I, I135T, R211RK, V292I, I293V, K390R, Q394H  
PRRT_12 PRRT_12 None None   K49R, S162N, V245M, Y271YH, V276VI, I293V, Q334QP, A376V, T386TI  
PRRT_124 PRRT_124 None None   D123E, I135T, R211RS, F214L, T286A, E297K, I326IV, I329L, Q334QE, M357T, R358K, A376T, T386I, K395KR  
PRRT_129 PRRT_129 None None   V60VI, I135L, K166KR, Q197E, V245K, K277R, I293V, I329V, E370ED, T386I  
PRRT_134 PRRT_134 None None   K122E, I135T, S162C, Q207H, R211K, V245M, A272P, K277R, Q278E, E297K, I329L, A376T  
PRRT_138 PRRT_138 None None   T200A, V245M, A272V, I293V, Q334L, M357T, R358K, A376T  
PRRT_139 PRRT_139 None None   K122KE, A158AS, R211RK, I293IV, E297AV, I326V, Q367L, I375V, T386I, K390KR  
PRRT_140 PRRT_140 None None   D123E, K166KR, D177E, Q207E, R211RK, K277R, Q278H, I293V, Q334Y, K366KR, A376S, K390R  
PRRT_148 PRRT_148 None None   S162C, R172RK, V245VM, K277R, I293V, E297A, D324DE, P345PQ, K390R Q151QR 
PRRT_150 PRRT_150 None None   P1PS, K49R, I50IV, R83K, T200S, K277R, A376T  
PRRT_152 PRRT_152 None None   D121DN, D123E, I135M, I142V, I178M, V245M, K277R, I293V, I329V, T386I Q151QR 
PRRT_158 PRRT_158 None None   R83K, I293IV, D324E, R356K, A376T, K390R, A400AT  
PRRT_159 PRRT_159 None None   P14PS, K20KR, R211RK, F214L, A272AV, A288AS, I293V, I326IT, M357T, A376T  
PRRT_16 PRRT_16 None None   K122E, T200I, E297EK, I326V, F346L, R356K, M357MR, A376AITV, K388R, K390R  
PRRT_161 PRRT_161 None None   K104R, I135T, S162C, I178L, V245M, A272P, V381VI, K385R W252W* 
PRRT_165 PRRT_165 None None   Q207E, V245VEKM, I293V, T377TI  
PRRT_166 PRRT_166 None None   R83K, I135V, S162C, K166R, K277R E53K 
PRRT_17 PRRT_17 None None   D123E, I142V, R211RK, V245EQ, S251SI, K277R, T286TA, P294S, K390R  
PRRT_171 PRRT_171 None None   Q207QAEP, R211RK, V245VM, I293V, I329L, G333E, Q334H, A360AT  
PRRT_172 PRRT_172 None None   K20KR, K49KR, R83RK, K122P, D177DE, I178IL, V179VI, T286A, E297K, E312EA, A360AV, A376T, K390KR  
PRRT_176 PRRT_176 None None   K20KR, R83K, E138A, S162C, R211RK, A272P, M357MT, T377S, V381I  
PRRT_177 PRRT_177 None None   S48ST, D123E, K166R, D177DE, I178IM, G196GE, Q207QEK, R211REGK, F214FL, V245M, A272P, I293IV, I326V, Q334L, A360AT, A376T, T386I  
PRRT_183 PRRT_183 None None   E36ED, E44EK, R83K, D123E, K166KN, D177E, A272P, K277R, A376T  
PRRT_187 PRRT_187 None None   R83K, K104KR, E248D, D324NS, T369TA, A371AT  
PRRT_190 PRRT_190 None None   K49R, Q207E, V245M, I293V, S322T  
PRRT_191 PRRT_191 None None   R83K, I135V, I178IM, E297K, Q334H, G335D, G359S, V365I W239W*, G262GR 
PRRT_197 PRRT_197 None None   E6EK, T200A, K277R, A376T E29EK, G352GE 
PRRT_20 PRRT_20 None None   S68SG, N147NK, R211KQ, A288AS, Q334L, M357T, A376T, T386I, K390KR, T397M, E399D T131TS 
PRRT_203 PRRT_203 None None   K277R, P294Q, I329V, A376S  
PRRT_204 PRRT_204 None None   I142IV, Q207E, R211K, V245I, I293V, I309V, S322T, I329L, V381I  
PRRT_206 PRRT_206 None None   K122KE, S162C, E169D, I202IV, R211RK, V245T, A272P, K277R, I293V, E297A, I326IV, T386TI  
PRRT_207 PRRT_207 None None  V108I I135V, I178V, G196E, V245M, K277R, I293V, E297K  
PRRT_208 PRRT_208 None None   R83K, G196GE, Q207QH, R211REGK, I309IL, V317VA, Q334L, K390KR  
PRRT_214 PRRT_214 None None   R211K, T286A, Q334L, M357T, A376T  
PRRT_219 PRRT_219 None None   R83K, R211RK, R307RG, S322ST, A376T  
PRRT_220 PRRT_220 None None   K49KR, A158AS, E169ED, V245M, K277R, Q278QH, I293V, S322ST, I329IV, Q334QL  
PRRT_225 PRRT_225 None None   T200I, R211K, V245VM, K249KR, T286TA, I326V, M357IT, T377Q, S379SG Q151QR 
PRRT_229 PRRT_229 None None   K20KR, I135T, S162Y, Q207H, K277R, T286A, E297K, V317VA, Q334L  
PRRT_23 PRRT_23 None None   D123E, I135T, D177E, I202IV, R211RK, F214L, K277R, I329L, M357T, K385R Q151QR 
PRRT_231 PRRT_231 None None   K49R, R83K, D177N, K277R, E300Q, A376T, T377Q  
PRRT_238 PRRT_238 None None   V35VI, I135T, K277R, I293V, Q334L  
PRRT_239 PRRT_239 None None   I178M, V245M, V276VI, K277KR, T286A, I326V, A376V  
PRRT_243 PRRT_243 None None   S68G, D123E, K166R, D177X, G196E, Q207H, V245M, K277KR, E297A, I326V, I329L, K347R  
PRRT_248 PRRT_248 None None   R83K, I135T, I178M, Q207E, V276VI, K277KR, Q334Y, A376S, K390R  
PRRT_25 PRRT_25 None None   E297K, S322T, I329L, R358RK, A360AITV, A376T, E399D  
PRRT_250 PRRT_250 None None   R83K, D123N, K277R, M357T, A376T  
PRRT_258 PRRT_258 None None   R83K, K277R, Q278QE, A376T  
PRRT_263 PRRT_263 None None   V21I, V245M, A272AV, V276VI, I293V, V317A, I375V  
PRRT_27 PRRT_27 None None   A98S, I135T, S162C, G196GV, A272P, K277R, T286A, K287R  
PRRT_271 PRRT_271 None None   I135V, V189I, V245M, K277R, T286A, M357T, T369A, I375V, A376T, A400S  
PRRT_274 PRRT_274 None None   R83K, R211G, I329L, A376T  
PRRT_276 PRRT_276 None None   T7P, V60I, R83K, K122P, I135T, P176L, K277R  
PRRT_279 PRRT_279 None None   V35I, R83K, K101Q, V276I, V292I  
PRRT_280 PRRT_280 None None   R83K, K122E, A376T  
PRRT_281 PRRT_281 None None   V106VI, D123E, S134SN, D177E, K277R, A288AS, I293IV, L301M, K311KR, M357T, A376T, V381VI  
PRRT_283 PRRT_283 None None   T200TI, E204ED, A272P, K277R, K281KR, T286A, E297EK, Q334QR, F346FY, A376T, K390R  
PRRT_287 PRRT_287 None None   R83K, E169D, V245E, I329V, A376T, T377R  
PRRT_289 PRRT_289 None None   R83K, I135T, K277R, T286TA, E297A, Q334N, A376T, A400AT  
PRRT_291 PRRT_291 None None   D86DE, I135V, V245M, K277R  
PRRT_294 PRRT_294 None None   K32R, I142T, R211K, I326V, A376S, K385R, K390R  
PRRT_295 PRRT_295 None None   V35VI, I135IATV, T139TI, I329L, Q334QK, T369TA, K374KR, I375V, A376T  
PRRT_30 PRRT_30 None None   K102KR, D123E, D177E, I178M, Q207R, I293V, V317A, I329L, R358RK, I375IV T131TS 
PRRT_301 PRRT_301 None None   V35I, I135ILM, D192N, Q207E, R211K, V245K, K277R, I293V, E297A, G333E, D364E, T377R, V381I, K390R  
PRRT_303 PRRT_303 None None   D123N, V245L, A272P, K277R, A376T, K388KR, K390KR  
PRRT_309 PRRT_309 None None   R83K, K103R, D121Y, K122E, V245E, A272P, V292I, E297T, I329L  
PRRT_31 PRRT_31 None None   K11S, I135V, G196E, V245E, K277R, I326V, K390R, A400AT Q151QR 
PRRT_311 PRRT_311 None None   V245K, A288AT, I293V, Q334E, K390R  
PRRT_321 PRRT_321 None None   R83K, D123E, S162C, I202V, V245VE, T286A, V292I, I293IV, E297A, T377K, V381I  
PRRT_323 PRRT_323 None None   D123E, R211RK, I293V, A327AV, M357T, A376AT  
PRRT_36 PRRT_36 None None   R83K, V245M, V276I, A288AT, I293V, P294PT, E297K, A327V, A376V, T386I  
PRRT_38 PRRT_38 None None   D123E, I142T, R172RK, T200I, R211RGS, F214FL, A288S, I293V, G333GE, A376T, K390R  
PRRT_40 PRRT_40 None None   E6D, V35I, R83K, T200TA, Q207QK, L210F, V245K, K275R, V276I, Q278H, T286TA, E291D, K311KR, Q334D, G335C, M357T, A376T, K390R  
PRRT_42 PRRT_42 None None   I178IM, D237DE, A272P, K275KQ, K277KR, I326V, Q334L, Q367QL, T369TA, A371AV, A376AT, K385KR, K390R I380IMR 
PRRT_43 PRRT_43 None None   I135M, I178L, I293V, I329V, R356K, T386I  
PRRT_45 PRRT_45 None None   K64R, A98AS, E248N, I257IL, A272P, I293IV, M357T, I375V, K390R, E399D, A400S  
PRRT_47 PRRT_47 None None   K104R, I142V, I178IM, G196GE, Q207H, R211REGK, I293V, K311KR, V317VA, D324DE, I329V, Q334QL  
PRRT_5 PRRT_5 None None   R83RK, Q174QH, G196GE, Q207E, V276VI, V292VI, I293V, V317VA, Q334X, A376T  
PRRT_51 PRRT_51 None None   V35I, R83K, K122KE, I135T, R211K, F214L, V245VE, I293IV, E297K, I329L, A376AT T131TS 
PRRT_56 PRRT_56 None None   V35I, R83K, I135V, R211RK, E248V, A272P, V276VI, I293IV, Q334LP, A376T, K390KR  
PRRT_59 PRRT_59 None None   V35I, R83K, I135T, Q207E, I329IL  
PRRT_6 PRRT_6 None None   R83K, Q207E, R211K, V245L, I293V, D324E, I329V, G333E, T338S, R356K  
PRRT_60 PRRT_60 None None   R83RK, S162SC, I178IL, K277R, T286A, V292VI, I293IV, E297K, D324P  
PRRT_64 PRRT_64 None None   E224EK, E291D, I293V, V317A, S322AT, Q334QH, M357MT, A371AV D324HN 
PRRT_66 PRRT_66 None None   T27TS, Q174QH, D177DE, I178IM, Q207H, R211K, W212WR, I293V, V317A, I329IV, Q334QL, T338TS, M357T Q151QR 
PRRT_70 PRRT_70 None None   K122KE, I135V, S162SC, D177E, G196E, R211K, V245M, K277R, I293V, E297K, E328D, T377TI  
PRRT_71 PRRT_71 None None   V8I, V35VI, R83K, I135T, E204EK, Q207AE, R211RK, I293V, D320DE, D324DE, K390R  
PRRT_76 PRRT_76 None None   V35VI, D121X, K122KR, D123DEG, T200TA, A272S, T286A, A288S, V292VI, I293V, Q334H, R356K, M357T, R358K, E370Q, A376T, S379C, A400S L120LFPS 
PRRT_78 PRRT_78 None None   V10VI, T27S, I135V, S162C, K277KR, T286A, V317A, Q334L  
PRRT_82 PRRT_82 None None   D123E, I142T, D177EG, K277KR, T286A, I293V, E297K, Q367L, T377S  
PRRT_89 PRRT_89 None None   K122E, V245K, A272P, K277R, I293V, E300Q, I329IV, A376AT  
PRRT_91 PRRT_91 None None   E6D, T200I, Q207QE, I293IV, I326V, A360T, K390KR  
PRRT_92 PRRT_92 None None   I135T, A158AT, T200A, Q207E, R211RK, V245M, I293V, K311KR, M357T, A376AS, S379SG, I382IL, T386TI