Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Pessoa (2016)
Title Ultra-deep sequencing of HIV-1 near full-length and partial proviral genomes reveals high genetic diversity among Brazilian blood donors.
Citation PLoS One
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 196
NumPts 196
Subtype B, C, F, D, B + F, CRF12_BF, CRF05_DF


  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 196 Clinical PR Isolates

10BR_084RJ 10BR_084RJ None    K14R, R41K, H69Q, V77I, L89M  
10BR_MG006 10BR_MG006 None    I13V, K14R, E35D, N37E, R41K, L63P, I93L  
10BR_MG011 10BR_MG011 None    L10V, T12M, I13V, K14E, I15V, E35D, R57K, L63P, I93L  
10BR_MG016 10BR_MG016 None    T12Q, I15V, L19I, N37S, R41K, H69Q  
10BR_MG022 10BR_MG022 None    N37S, Q61E, I62V, L63P, C67Y, V77I, I93L  
10BR_MG023 10BR_MG023 None    I15V, L19T, E35D, M36I, R41K, L63P, H69Q, V77I  
10BR_MG024 10BR_MG024 None    N37S, L63P, V77I, L89M, I93L  
10BR_MG030 10BR_MG030 None  M46MI  T12Q, E35D, M36I, R41K, L63P W42W*, G49GE, G51GR 
10BR_MG031 10BR_MG031 None    M36I, P39LV, R41K, D60E, I62V, L63P, V77VI  
10BR_MG032 10BR_MG032 None    K20R, M36I, N37K, R41I, R57K, D60E, Q61N, L63P, H69K, L89M, I93L  
10BR_MG037 10BR_MG037 None    I15V, M36I, N37K, R41N, L63P, H69K, L89M, I93L  
10BR_MG038 10BR_MG038 None    M36I, L63H, I64V, P79A  
10BR_MG039 10BR_MG039 None    L19V, R41K, K43I, R57K, L63A, A71T, I72E, V77I, I93L  
10BR_MG041 10BR_MG041 None   L33I K14R, N37A, P39Q, L63P, A71V, V77I, I93L  
10BR_MG043 10BR_MG043 None    I15V, L19V, E35D, M36I, R41K, R57K, I62V, L63P, I64V, E65D, K70R, V77I  
10BR_MG044 10BR_MG044 None    T12K, K14R, E35D, N37S, R57K, L63S, I64V, K70Q  
10BR_MG045 10BR_MG045 None  M46L  K14R, L33V, N37S, R41K, L63Q, I64V, I93L  
10BR_MG051 10BR_MG051 None    L19T, E35D, P39S, K45R, R57K, L63P  
10BR_MG052 10BR_MG052 None    L10V, E35D, N37E, L63S  
10BR_PE014 10BR_PE014 None  D30N N88D I13V, K20R, E35D, M36I, N37D, I62V, L63A, A71V  
10BR_PE017 10BR_PE017 None    N37S, L63T, I72V, V77I  
10BR_PE019 10BR_PE019 None    K14R, R41K, K43R, I62V, L63P, I93L  
10BR_PE020 10BR_PE020 None    T12A, L19I, N37S, I62V, L63N, K70N, A71T, I72V, V77I  
10BR_PE021 10BR_PE021 None    G16E, P39S, I62K, L63LI, I64V, I72T  
10BR_PE023 10BR_PE023 None    I13V, I15V, N37K, R41N, L63V, I64M, H69K, T74S, L89M, I93L  
10BR_PE031 10BR_PE031 None    I15IV, E35D, M36MI, R41K, K43R, I62V, L63P, V77I, I93L  
10BR_PE033 10BR_PE033 None    R57K, V77I, I93L  
10BR_PE036 10BR_PE036 None    N37S, L63T, I72V, V77I  
10BR_PE038 10BR_PE038 None    I15V, Q18H, M36I, R41K, L63A, I93L  
10BR_PE040 10BR_PE040 None    I15V, M36L, N37S, I62V, L63P, I72T  
10BR_PE043 10BR_PE043 None    T12A, N37S, L63T, I72V, V77I  
10BR_PE044 10BR_PE044 None    D60E, I62V, L63P, C67S, H69Q, V77I  
10BR_PE045 10BR_PE045 None    T12N, L19T, R41K, L63S, I64V, I72V  
10BR_PE047 10BR_PE047 None    I3IV, N37NS  
10BR_PE048 10BR_PE048 None    L19T, I64V, E65D, I72T, V77I  
10BR_PE052 10BR_PE052 None    I15V, E35D, M36I, I64V  
10BR_PE054 10BR_PE054 None    K14R, E35D, N37E, R57K, Q61E, L63P, A71T, V77I, I93L  
10BR_PE058 10BR_PE058 None  D30DN, M46MI G48GEKR E34EK, M36MI, N37S, R41K, V77I, I93L G27GR, W42W*, G49GR, G51GR, G52GS 
10BR_PE061 10BR_PE061 None    L19I, N37D, R41K, I62V, L63H, I72V, V77I, Q92H  
10BR_PE063 10BR_PE063 None    K14R, V32X, L33X, E35D, M36I, R41K, L63A, L89M D60G, Q61~ 
10BR_PE065 10BR_PE065 None    I15V, E35D, N37S, R57K, L63P, V75I, I93L  
10BR_PE070 10BR_PE070 None    I13V, K14R, E35D, N37T, R41K, L63P  
10BR_PE072 10BR_PE072 None    T12S, K14R, L19I, N37S, R57RK, L63P D25N, W42W*, G51GR, G86GR 
10BR_PE076 10BR_PE076 None    T12N, L19I, M36I, R41K, L63P, H69Q, I72L  
10BR_PE082 10BR_PE082 None    I13V, M36I, R41K, I64V, K70R, I72V  
10BR_PE089 10BR_PE089 None    K14R, E35D, R41K, R57K, I62V, L63P, K70R, A71T, V77I, I93L  
10BR_PE095 10BR_PE095 None    I15V, L19V, E35D, L63V  
10BR_PE096 10BR_PE096 None    T12S, K14R, R41K, L63P, V77I, I93L  
10BR_PE106 10BR_PE106 None    K14R, I15V, E35D, R41K  
10BR_PE110 10BR_PE110 None    T12A, L19Q, N37S, L63T, I72V, V77I  
10BR_RJ004 10BR_RJ004 None    T12S, R57K, L63P, I64V  
10BR_RJ005 10BR_RJ005 None    K14R, G17D, E35Q, N37D, L63C, H69Y, I72V, V77I  
10BR_RJ014 10BR_RJ014 None    E35D, M36I, P39Q, R41K, R57K, Q61D, I62V, L63T, I64V, E65D  
10BR_RJ016 10BR_RJ016 None    N37K, R41I, I93L  
10BR_RJ017 10BR_RJ017 None   L33I L19I, R41K, K45R, L63P, A71V, V77I, I93L  
10BR_RJ019 10BR_RJ019 None    L63P, I72E, V77I, I93L  
10BR_RJ029 10BR_RJ029 None    T12TS, I15V, E35D, M36I, R41K, R57K, Q61N, H69Y, I72E, L89M  
10BR_RJ030 10BR_RJ030 None    L10M, T12E, E21K, M36I, L63T, I72T, I93L  
10BR_RJ033 10BR_RJ033 None    I13V, K14R, I15V, E35D, M36I, R41N, Q61N, G68E, I72V, V82I, L89M  
10BR_RJ039 10BR_RJ039 None    G16E, K20R, M36I, N37K, P39S, R41N, H69K, L89M, I93L  
10BR_RJ040 10BR_RJ040 None    K14R, E35D, N37D, R41K, I62V, L63P, V77I, I93L  
10BR_RJ044 10BR_RJ044 None    T12N, K14R, L19I, M36I, R57K, Q61S, L63S, I64V  
10BR_RJ052 10BR_RJ052 None    I13V, E35D, M36I, I62V, L63P  
10BR_RJ055 10BR_RJ055 None    K14R, I15V, L19I, E35D, M36I, N37E, R41K, R57K, D60E, Q61N, L63S, E65D  
10BR_RJ056 10BR_RJ056 None    T12P, Q18E, E35G, M36V, N37D, I62V, L63P, I93L  
10BR_RJ064 10BR_RJ064 None    K14R, I15V, L19V, R41K, L63R, K70T, V77I  
10BR_RJ067 10BR_RJ067 None    L10V, K14R, R41K, D60E, I62V, L63P, V77I, I93L  
10BR_RJ068 10BR_RJ068 None    G17E, L19I, R41K, D60E, L63P, A71T, I93L  
10BR_RJ078 10BR_RJ078 None   I47M I13V, G17E, E35D, R41K, R57K, D60E, L63P, A71V, I93L  
10BR_RJ083 10BR_RJ083 None    L10I, N37S, P39S, D60E, I62V, L63P, I64V, V77I, I93L  
10BR_RJ085 10BR_RJ085 None    I3V, G17E, I64V, V77I  
10BR_RJ086 10BR_RJ086 None    T12S, N37S, Q61D, V82I  
10BR_RJ088 10BR_RJ088 None    T12S, L19I, L63P, I72L, V77I  
10BR_RJ090 10BR_RJ090 None    N37D, L63A, A71T, V77I, I93L  
10BR_RJ091 10BR_RJ091 None    T12A, K14R, G17D, N37D, L63P, K70T  
10BR_RJ093 10BR_RJ093 None    L10V, E35D, M36I, R41K, Q61N, L89M  
10BR_RJ097 10BR_RJ097 None    G17D, N37S, L63C, I72V, V77I  
10BR_RJ099 10BR_RJ099 None    N37S, R41K, I62V, L63S, K70R, A71T, I72E, V77I, I93L  
10BR_RJ106 10BR_RJ106 None    L10V, K14R, L19I, N37S, L63V, V77I  
10BR_RJ110 10BR_RJ110 None    L10I, Q61D, I62V, L63A, H69Y, I72T, V77I, I85V  
10BR_RJ111 10BR_RJ111 None    T12P, K14R, G16E, E35D, L63H, I72V, V77I, I93L  
10BR_SP002 10BR_SP002 None    L10V, L33V, M36I, N37T, I64V, I93L  
10BR_SP012 10BR_SP012 None    L10I, K20R, M36I, Q61E, I62V, L63A, I64L, V77I, I93L  
10BR_SP015 10BR_SP015 None   G73GS I13V, I15V, G17E, Q18QH, L63P, I64V  
10BR_SP016 10BR_SP016 None    K14R, E35D, R41K, I64V, K70R  
10BR_SP024 10BR_SP024 None    I15V, G17E, E35D, N37E, L63P, I64V, K70R, V77I, I93L  
10BR_SP026 10BR_SP026 None    L19Q, M36I, R41K, K45R, R57K, Q61D, L63P, L89I  
10BR_SP027 10BR_SP027 None    I15V, E35D, M36I, I62V, L63S, I64V  
10BR_SP031 10BR_SP031 None    L10I, I13V, E35D, N37D, R41K, D60E, L63P, K70T  
10BR_SP033 10BR_SP033 None    T12S, I15V, L19I, E35D, M36L, N37K, R41N, L63P, H69K, V82I, L89M, I93L  
10BR_SP037 10BR_SP037 None    T12N, I15V, E35D, M36I, R41K, R57K, Q61N, L63C  
10BR_SP039 10BR_SP039 None    I15V, Q18H, E35D, M36I, N37E, I62V, L63Q  
10BR_SP044 10BR_SP044 None    K14R, L63P  
10BR_SP052 10BR_SP052 None    E35D, K43R, R57K, I62V, L63Q, A71V, I72M, I93L  
10BR_SP063 10BR_SP063 None    L10V, T12M, I13V, I15V, G16E, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, Q61N, L63H, I72T  
10BR_SP065 10BR_SP065 None    I15V, L19I, E35D, M36I, N37S, R57K, L63T, I64V, V77I  
10BR_SP067 10BR_SP067 None    N37S, L63P, I64V, C67Y, V77I  
10BR_SP068 10BR_SP068 None    L10V, T12M, I13V, I15V, E35D, M36I, N37D, R41K, R57K, Q61N, L63C  
10BR_SP073 10BR_SP073 None    E35D, M36I, N37D, L63P, H69K, A71V, I93L  
10BR_SP074 10BR_SP074 None    K14R, N37S, R41K, I62V, I64L, A71V, I72T, I93L