Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Panichsillapakit (2016)
Title Prevalence of Transmitted HIV Drug Resistance Among Recently Infected Persons in San Diego, CA 1996-2013.
Citation JAIDS
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 496
NumPts 496
Subtype B, C, CRF20_BG, CRF01_AE, G


  Page 1 of 5    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 496 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
22k/20100805 22k None None   K103KE, K122E, S162C, K166R, D177E, I178M, V179VG, G196E, Q197K, Q207E, R211K  
22m/20100812 22m None None   V60I, I135V, T200A, Q207E E53EK, T84TI 
22n/20100830 22n None None  K103N K20R, V60I, I135V, K201R, R211K  
22y/20010316 22y None None   R211K  
238/20100812 238 None None   V35I, R83K, G196D, R211S  
23c/20091211 23c None None   A98S, K102R, D123E, I159V, K166R, D177E, T200I, E203K, R211K  
2au/20100729 2au None None   V35M, K64R, I135V, S162C, F214L  
2jm/20101018 2jm None None   V35I, D123E, D177E, T200E, Q207E, R211K, F214L  
2mb/20031205 2mb None None   K20R, D86E, D121Y, K122E, I135T, S162C  
2pb/20101022 2pb None None   E28A, K102Q, I178M, T200A, E204D, R211K  
2yb/20090203 2yb None None   V35I, S48T, K49R, I50V, I135M, S162N, T165I, E169D  
32j/20100518 32j None None   A98S, D123E, I135V, S162C, Q174H, D177E, R211K  
37a/20030929 37a None None   E6KR, V118I, K122E, T200A, Q207EK, R211RK, F214L P150PL 
37f/20101210 37f None None   V35I, V60I, D121Y, K122E, A158T, T165I, G196E  
3in/19971124 3in None None   V35I, R83K, K102R, V111VL, I135T, I142IT, V189VI  
3iv/20020305 3iv None None   V35I, R83K, K122E  
3ix/19980319 3ix None None   V35I, A98S, D123E  
3j8/19980608 3j8 None None   V35T, E36A, T39E, K122E, D123G, A158S  
3jj/20050318 3jj None None   V35VI, I135L, K154KR, S162C, T200A  
3kd/19990603 3kd None None   K22R, S48T, V60I, K122P, I135L, I178L  
3ki/19990722 3ki None None   D123E, E138A, S162C, Q207S, R211K W24WL 
3kn/19990820 3kn None None   R83K, D123E, S162SADY  
3kz/19991018 3kz None None D67N, T69D, K219Q  V60I, I135T, F214L, D218E  
3md/19991217 3md None None   R83K, D123E, S162Y, D177E, V179I  
3mt/20000317 3mt None None   K20R, V35T, V60I, S162SN, R211K  
3nd/20000801 3nd None None  K103N V60I, K64R, I135V, D192DN, T200A, Q207E  
3ni/20000814 3ni None None   D123E  
3nr/20001002 3nr None None   K20R, I135T  
3p6/20001121 3p6 None None   V8I, I135R  
3pa/20001130 3pa None None   V8I, V35M, Q207E, F214L  
3q7/20010530 3q7 None None   A98S, D123E, R211K  
3qf/20010625 3qf None None   A98S, I178M, E204Q, R211K  
3sj/20011119 3sj None None   K20R, V35VI, V60VI, R83K, K122E, D123E, Q174H, D177N, G196E, R211K  
3sk/20011107 3sk None None   D123E, D177E, V179I, Q207QE  
3ss/20011130 3ss None None   K32N, I135V, E169D, I178L  
3sw/20011214 3sw None None  K103N K11T, K20R, K122E, T200I, R211K  
3tq/20020328 3tq None None   V35I, I135T N81NS 
3ts/20020402 3ts None None   E6D, D123E  
3ui/20020510 3ui None None M41L  V60I, R83K, K122E  
3uy/20020718 3uy None None M41L, V75I, T215L, K219E Y188L V35M, T39A, E40A, E79D, R83K, K102Q, V118I, D121H, K122E, D177E, Q197QR, F214L  
3vq/20021004 3vq None None M41L, D67N, T215Y K101P, K103N K20R, T39A, V60I, I202V, R211K  
3vv/20021021 3vv None None  K103N, P225H S162C, T200I, Q207E  
3x2/20030113 3x2 None None A62AV  K49R, I50V, R83K  
3xa/20030123 3xa None None  K103N S162C  
3xf/20120110 3xf None None   V35I, R83K, I135T, S162C, I202V, R211K  
3xs/20030221 3xs None None   V35I, I135L, S162C, T200A  
3zi/20030513 3zi None None   V60I, K122P, I135T  
42v/20030812 42v None None   R83K, D123E, T200A, I202V, Q207K, R211K  
42z/20030904 42z None None   K102Q, K122E, I135T, S162C  
43w/20031110 43w None None   D123E, I135T, S162A, D177E, V189I, I195L, T200A, F214L, E224EK  
448/20031114 448 None None   K11R, R83K, K122R, D123E, E138A, S162A, D177E, I180V, I195L, T200A, F214L  
44f/20031121 44f None None   A98S, R211K  
44t/20040105 44t None None   D123E, S162C  
459/20040129 459 None None   V35T, K49KR, A98S, K122E, I135V  
45t/20040325 45t None None   S162C  
465/20040406 465 None None   P4S, A98S, K104R  
46m/20040511 46m None None   R83K, A98S, K122P, I135R  
46t/20040602 46t None None   K20R, S48SL, D86E, V118I, K122E, I135T  
46x/20040608 46x None None   K122A, A158S  
47c/20040629 47c None None   V60I, I142V  
47d/20040702 47d None None   V35I, I135L  
47v/20040806 47v None None  K103KN V35M, K102Q, K122E, D123E, I135IT, S162C  
47x/20040817 47x None None   S162SC Y127YC 
47z/20040824 47z None None   K122KE, D123E, S162C  
483/20040824 483 None None   K20R, V60VI, D123E  
48x/20041122 48x None None D67G, T69T_T  V35IMT, T39TR, K64N, K102KQ, K122KE  
49c/20050114 49c None None M41L, D67N, T69D, L74LV, M184V, L210W, T215Y A98G, K103N T39E, V60I, K101KQ, K122E, D123N, I142V, T200A, R211K  
4ag/20050328 4ag None None   V35I, I135L, S162C, Q174K, T200A  
4ap/20050418 4ap None None   V35I, I135L, S162C, Q174R, T200A  
4as/20050427 4as None None   D123E, D177E, T200A, R211S  
4cq/20051020 4cq None None M41L, L210W, T215C  T39TA, I135A, T200A, R211K  
4d5/20051123 4d5 None None   V35I, I135L, I142IV, S162C, T200E  
4dc/20051221 4dc None None   I50V, I135T, D177E, I178M, R211K  
4dx/20060317 4dx None None   V35I, I135L, S162C, T200A  
4fb/20060901 4fb None None   V35I, I142V, T200A, E204D, Q207E  
4fj/20061103 4fj None None   I142V, P176PL, I178M, R211K S156SP 
4h3/20071115 4h3 None None   K22KR, A98S, D123E, I135V, S162C, Q174H, D177E, R211K  
4h8/20080131 4h8 None None   E6DN, V35I, S48T, A98S, I135V, T200I, Q207K, R211K Y115YH 
4hs/20080721 4hs None None   R83K, K122E, I135T, Q174R, V179I, I195L, T200A, I202V, R211K  
4ie/20081016 4ie None None   D123DE, S162C, K173KE, T200I, R211K  
4j2/20090123 4j2 None None   I135T, G196GA, T200TI, I202IV  
4ka/20091130 4ka None None   V35M, R83K, D123E, S162A, D177E, I195L, T200A, R211K, F214L  
4ki/20090608 4ki None None   D121E, K122E, I135T, S162C, G196E, T200I  
4p5/20090729 4p5 None None   K66KR, R83K, D123E, I135T, S162A, T200I, R211K, F214L  
4p7/20090729 4p7 None None  A98G V179I, I202V, R211K, F214L  
4p8/20090730 4p8 None None   K102Q, D123E, S162C, D177E, I178M, I195L, R211S  
4tq/20090924 4tq None None   K20R, I50V, R83RK, I135IV, I178IL, T200TAEK, R211K  
5id/20020408 5id None None M41L, D67N, K70R, L74I, T215Y, K219Q  V35L, K43E, E44DG, K66KR, V118I, K122E, Q197E, Q207E, H208Y, L210Y, D218E, L228H  
5wg/20110218 5wg None None  K101N, G190A V35VI, K122E, I135T, S162C  
6bf/20110324 6bf None None   K122KE, I135IT, T200A, E204EK, R211REGK, F214L R72RG 
76b/20110523 76b None None   S48T, V60I, K102Q, K122P, Q174D  
8fk/20110728 8fk None None   V35I, V60I, D121Y, K122E, A158T, G196E  
bf9/20120104 bf9 None None   V35M, T39A, R83K, K101R, D121DY, K122KE, D123DE, I135T, E169ED, T200E, R211K  
c4w/20120216 c4w None None   E6EK, K20R, K122P, I135T, S162C, D177E, I178M, R211K E53EK 
crt/20120326 crt None None   V35I, S48T, K122E, Q207E, R211K, F214L  
dby/20120430 dby None None  K103S K20R, V90I, K122E, D123N, T200A  
dym/20120620 dym None None   K11R, T39A, R83K, K122E, S162C, T200S, Q207K, R211A  
f7k/20120702 f7k None None   V35I, D123E, D177E, T200E, Q207E, R211K, F214L  
fvx/20120801 fvx None None   D123E, D177E, T200I