<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Dos Anjos Silva (2016)
Title HIV-1 genetic diversity and transmitted drug resistance in antiretroviral treatment-naive individuals from Amapa state, northern Brazil.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 97
NumPts 97
Subtype B, F, C, CRF02_AG, B + C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
AP001 AP001 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, S162A, E169K, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K  
AP002 AP002 None None   K20R, V60I, K122E, I135T, S162C, T200A, E204D, K238S  
AP004 AP004 None None   K20R, V35T, E44K, G45E, V60I, I135T, K173T, Q174K, T200A, Q207D, R211K E53K 
AP005 AP005 None None   V60I, S68G, K122E, I135T, K166KR, D177E, V179I, T200A, R211K  
AP007 AP007 None None   I135T, R211K  
AP009 AP009 None None   V35I, V60I, D121H, K122E, I135T, I142V, S162A, I178M, T200A, R211K  
AP010 AP010 None None   S68G, D123E, I135T, T165I, D177E, T200A, Q207A, R211K  
AP011 AP011 None None   V60I, E138A, I142V, S162N, D177E, G196E, E203D, Q207E, R211K  
AP012 AP012 None None M184ML  V35T, T39K, K43E, V60I, K104R, D121H, K122E, I135T, I142V, S162A, K173KR, Q197K, T200AE, R211K  
AP013 AP013 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, K104R, D121H, K122E, I135T, I142V, S162A, Q197K, T200E, R211K  
AP014 AP014 None None   P14A, V35T, T39N, S48T, V60I, V118I, K122E, I135T, I142V, R211K, F214L  
AP017 AP017 None None   V35T, T39A, E40D, K49R, T69N, S162C, E169D, K173A, Q174K, I178L, V179I, T200A, I202V, Q207E, R211K  
AP019 AP019 None None   T39A, I135T, T139I, Y146YF, D177E, T200I, F214L T128TI, P133PS 
AP020 AP020 None None   V35T, E40D, V60I, K104R, D121H, K122E, I135T, I142V, S162A, G196R, T200V, Q207R, R211KT  
AP021 AP021 None None   S68G, K122E, I135T, K173N, Q174K, T200A, R211K  
AP022 AP022 None None   V35I, E40D, K49R, D123E, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, Q207D, R211K  
AP023 AP023 None None   V35T, T39N, K49R, K104R, D123E, I135V, E169D, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207N  
AP027 AP027 None None   K122E, I135T, S162C, T200E, I202V, R211K  
AP028 AP028 None None   K49R, I135T, I178M  
AP029 AP029 None None   V35T, K173T, Q174K, T200A, Q207D, R211K  
AP030 AP030 None None   V35VA, V60I, K64KR, K122E, T200E, Q207E  
AP031 AP031 None None   K122E, I135R, D177E, I178M, V179I, Q207K, R211Q  
AP032 AP032 None None   V35T, V60I, K104R, D121H, K122E, I135T, I142V, S162A, T200V, R211K  
AP034 AP034 None None   K32Q, V118I, K122E, L210M, R211K, F214L  
AP035 AP035 None None   K32Q, S48T, V118I, K122E, I135T, L210M, R211K, F214L  
AP036 AP036 None None   V21I, V60I, I135T, S162C, K173E, R211K  
AP037 AP037 None None   M16L, K20R, S68G, K166R, D177E, I195L, G196E, R211K  
AP038 AP038 None None   V60I, K104R, D121H, K122E, I135T, I142V, S162A, I178M, T200V, R211K  
AP039 AP039 None None  V179D T39A, V60I, I135T, I142V, S162A, I178M, T200A, Q207G, R211K, F214L  
AP040 AP040 None None   D123E, I135RT, E169D, N175H, G196E, F214L  
AP041 AP041 None None   V21I, V60I, I135T, S162C, K173E, R211K  
AP042 AP042 None None  K103KN V35T, D123DE, I135V, I142LMR, E169D, K173T, Q174K, Q207K, R211T, K238S  
AP044 AP044 None None   V35K, K49R, D121Y, K122E, I135T, S162C, E169D, K173T, Q174K, P176L, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L  
AP045 AP045 None None   V35AT, K173E, V179I, I195L, G196E, Q197K, Q207QR, R211T P97PT 
AP046 AP046 None None   S48T, D123E, I135T, S162C, G196E, T200A  
AP047 AP047 None None   S48T, D123E, I135T, S162C, G196E, T200A, D237E  
AP048 AP048 None None   K20R, V35T, T39TA, K122E, K173T, Q174R, I195M, T200A, Q207D, R211K  
AP049 AP049 None None   V60I, D121H, K122E, I135T, I142V, S162A, I178M, T200A, R211RK  
AP050 AP050 None None   V35T, T39K, V60I, S68G, I135T, Q174H, V189I, G196E, Q207E, R211K  
AP051 AP051 None None   E6D, K122Q, I142IV, D177E, R211K  
AP053 AP053 None None   V35I, T39S, K122E, D123E, I135T, S162C, E169N, G196E, Q197E, Q207K, R211G  
AP055 AP055 None None   K43R, I135T, R211K  
AP056 AP056 None None   S68G, D123E, I135T, K166KR, D177E, T200A, R211K I195Q 
AP057 AP057 None None   K102Q, I135T, I178M, Q197K, T200A  
AP058 AP058 None None   K20R, V35I, T39A, R83K, V118I, K122E, D123E, F214L  
AP059 AP059 None None   I135T, R211K  
AP060 AP060 None None   K102Q, I135T, I178M, T200A  
AP061 AP061 None None   V60I, K122E, I135T, I142V, S162A, E169ED, D177E, T200E, Q207NT, R211K  
AP063 AP063 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, S162A, E169K, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K  
AP065 AP065 None None   E6K, S68G, K122E, D123E, I135T, D177E, T200A, Q207H, R211K  
AP066 AP066 None None   V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, I142V, S162A, I178M, T200I, Q207E, R211K  
AP067 AP067 None None   S68G, D123E, T139TS, I142T, D177DE, Q207A  
AP068 AP068 None None   I135V, D177E  
AP069 AP069 None None   V35T, K49R, D123E, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
AP070 AP070 None None   K20R, V35I, K49R, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, I178L, T200A, Q207D, R211K  
AP072 AP072 None None   K20R, V35T, E36D, V60I, S162A, K166R, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K  
AP073 AP073 None None   V35I, V60I, S68G, K102R, K122E, I135T, I195R, G196E, Q207E R172T 
AP074 AP074 None None   V35R, K104N, K122E, I135T, S162A, T200I, R211K  
AP075 AP075 None None   K104KR, K122E, S162C, G196E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
AP076 AP076 None None   K104R, K122E, S162C, G196E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
AP077 AP077 None None   V35I, I135V, T139A, S162C, R211K  
AP078 AP078 None None   V60VI, K64R, T200I, R211S  
AP079 AP079 None None  V179D I135V, D177E, G196E, T200I, Q207E, R211K, F214L  
AP080 AP080 None None   V60I, K104R, D121H, K122E, I135T, I142V, S162A, T200E, R211K  
AP081 AP081 None None   V21I, V60I, T69S, D86DN, K122E, I135T, F171Y, T200A, I202V, R211K W88W*, G141GR 
AP082 AP082 None None   I135T, R211K  
AP084 AP084 None None   V35T, I135T, I142V, D177E, I178M, G196E, H208Y, R211K  
AP085 AP085 None None   V8I, D123G, D177E, G196E, E203D, R211K  
AP086 AP086 None None   V35K, K49R, D121A, K122E, I135T, S162C, E169D, K173T, Q174R, D177E, I178L, I202V, Q207E, R211K, F214L  
AP087 AP087 None None M184I G190R D121DN, K122E, I135T, E204Q, R206K, Q207E, W212*, W229*, M230I, W239* M41MI, G51GR, W71W*, R72RK, R78RK, W88W*, G93GR, G152GEKR, W153W*, G155GR, G213R, G231R 
AP088 AP088 None None   V35M, E40D, K122E, G196R, R211K, F214L  
AP089 AP089 None None   V35T, I135T, I142V, P170PS, D177E, G196E, R211K  
AP090 AP090 None None   E6D, V35T, T39K, K49R, I135T, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, V179I, Q207S, R211K  
AP091 AP091 None None   S68G, D123E, I135T, K166R, Q174R, D177E, I195L, R211K  
AP092 AP092 None None   T39TA, S68G, D123E, I135T, K166KR, T200A, R211K, F214L  
AP093 AP093 None None   V35K, K49R, D121Y, K122E, I135T, S162C, E169D, K173T, Q174K, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L  
AP094 AP094 None None   K49R, S68G, V90I, K122E, I135T, I178M, T200A, Q207E  
AP095 AP095 None None   D123E, I135T, E169D, N175H, G196E, F214L  
AP096 AP096 None None   E6D, V35T, T39K, K49R, I135T, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, V179I, Q207S, R211K  
AP097 AP097 None None   V35K, K46KE, K49R, V60X, D121Y, K122E, I135T, S162C, E169D, K173T, Q174K, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L G45GR, P59AS 
AP098 AP098 None None   V60X, D177E, I178M, R211K G45GR, P59PAT 
AP099 AP099 None None   K122P, I135T, S162C, D177E, I178M, T200A, Q207H, R211K  
AP100 AP100 None None   V60I, K104R, D121H, K122E, I135T, I142V, S162A, I178M, T200V, R211Q  
AP102 AP102 None None   E169D, R211K  
AP103 AP103 None None   I5V, E6D, V35K, K49R, V106I, D121Y, K122E, I135T, S162C, E169D, K173A, Q174R, I178L, Q207E, R211K, F214L  
AP104 AP104 None None   G45E, I135T, T200S, R211K  
AP105 AP105 None None   V35T, E36D, G45GE, I135T, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, Q207E, R211K  
AP107 AP107 None None   K20R, K49R, E53D, I135T, K166R, T200E  
AP108 AP108 None None   K20R, V21I, T39I, I135T  
AP109 AP109 None None   S68G, D123E, I135T, T165I, P170T, G196E, E204Q, Q207A, R211K  
AP111 AP111 None None M184I  V35T, T39K, E40D, K49R, D86E, D123E, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, W212*, M230I G51R, G152R, G231R 
AP112 AP112 None None   V60I, S68G, D123E, I135T, Q174K, D177E, I195L, T200A, Q207E, R211K  
AP115 AP115 None None   I50V, V60I, D121H, K122E, I135T, A158S, S162A, I180V, T200V, R211K  
AP116 AP116 None None   V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, I142V, S162A, P176S, T200A, Q207H, R211K  
AP118 AP118 None None   K32E, V35L, T39A, S48E, V118I, I135R, K173S, R211K, F214L  
AP119 AP119 None None   E6D, K20R, I135T, Q207D, R211K  
AP121 AP121 None None   I142V, Q174R, R211E