<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Boillot (2016)
Title Programmatic feasibility of dried blood spots for the virological follow-up of patients on antiretroviral treatment in Nord Kivu, Democratic Republic of the Congo.
Citation JAIDS
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 55
NumPts 55
Subtype A, D, B, C, G, CRF25_cpx, H, G + H + J, CRF18_cpx, G + Unknown, CRF06_cpx

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
ALO03 ALO03 D4T, 3TC NVP   P4PH, K11KAET, V35T, K122E, D123N, I135T, I142V, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245Q, E248D, D250E  
ALO07 ALO07 D4T, 3TC NVP   E28A, K122E, D123N, T139TIM, I142T, S162A, K173S, D177E, V179I, Q207A, R211S, F214FL, L228LM, V245Q  
ALO14 ALO14 D4T, 3TC NVP   V35T, V60I, K122E, D123N, I135L, S162C, K173A, Q174K, T200A, Q207A, V245L  
BEN02 BEN02 D4T, 3TC NVP   V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, D177E, Q207E, R211K, P243A, V245K  
BEN14 BEN14 D4T, 3TC EFV   P4PT, E6A, K20KR, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, A158S, S162Q, D177E, I178V, V179I, I202V, E204R, Q207E, V245K  
BEN15 BEN15 D4T, 3TC NVP M184V K103N K20R, V35T, K49R, D123N, E169D, K173E, Q174K, D177E, T200A, Q207A, I244V  
HES05 HES05 D4T, 3TC NVP   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123S, I135T, K173A, I178V, T200I, Q207G, R211K, V245Q, E248V, K249Q, D250E  
HES06 HES06 D4T, 3TC EFV  V179D E6K, V35T, E40D, K49R, V60I, K66R, V118I, R172K, D177EK, T200A, E204K, R206K, Q207E, F214L, P243A, V245K W229L 
HES08 HES08 D4T, 3TC EFV   K20R, V35T, T39N, E40D, V60I, D121H, K122E, K166R, D177E, T200A, Q207E, R211K, E248D  
HES11 HES11 D4T, 3TC EFV   K32E, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, Q207E, R211K, V245E  
HES17 HES17 D4T, 3TC NVP  K103N K32I, V35T, T39K, E40D, K122E, D123E, A158S, S162Y, K173S, T200A, Q207A, V245Q, D250E  
HES21 HES21 D4T, 3TC EFV   K11E, V35T, V60I, K64R, K82R, K104R, T107S, D121H, K122E, D123S, T200A, Q207A, R211K, I244V, V245K  
HES30 HES30 D4T, 3TC NVP   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123N, I135T, E169A, K173S, Q174K, D177E, Q207E, R211K, F214L, V245K, D250E  
MAB04 MAB04 AZT, 3TC EFV M184V K103N, V108VI V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245E, D250E  
MAB06 MAB06 D4T, 3TC EFV M184V, T215Y K103KN, G190A K11KQ, V35T, E36A, T39D, K102Q, K122E, I135T, I142V, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
MAG15 MAG15 D4T, 3TC NVP M184V Y181C E6K, K11T, I31L, K32I, V35T, T39N, T69N, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211K, H221Y, V245Q, D250E  
MAK01 MAK01 D4T, 3TC EFV  K103KN V35I, K49R, I50V, V60I, S68G, D121H, K122E, D123S, I135T, T165I, K173S, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207N, R211K  
MAK13 MAK13 D4T, 3TC EFV M184V, T215TS K103N, Y181C E6D, V35M, K49R, V60I, K122P, I135T, S162SN, D177E, T200E, K201T, E204R, Q207E, R211K, V245Q  
MAK16 MAK16 D4T, 3TC NVP M184V K103N V35T, V60I, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, Q207E, V245Q, E248D, D250E  
MAK23 MAK23 D4T, 3TC NVP M184V K101E, G190A K11T, E28K, V35T, E36D, T39K, K43E, K49R, D123N, I142V, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245Q  
MAK26 MAK26 AZT, 3TC NVP M184V, T215TNSY K103KNRS, G190A K11T, V35T, E36ED, T39K, K122E, D123N, I135T, I142V, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L, V245Q  
MAN02 MAN02 D4T, 3TC EFV  K103N V35T, T39I, V60I, K122P, I135V, I142V, S162C, K173A, Q174K, D177E, I178M, Q207E, R211K  
MAN05 MAN05 D4T, 3TC EFV  V179E K32I, V35T, V60I, V106I, V118I, K122E, D123N, I135R, S162C, E169A, K173T, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E, R211K, F214L, E224EG, V245Q, E248N  
MAT03 MAT03 D4T, 3TC NVP M184V K103N, K238T P9S, K20R, E28EGKR, K32KE, V35T, T39KR, K122E, D123N, K173A, Q174QR, D177E, T200A, Q207D, R211K, F214L, I244V, V245K, D250E  
MAT05 MAT05 D4T, 3TC NVP   V35T, T39A, K102R, I142V, D177E, T200A, Q207E, V245Q, D250E  
MAT06 MAT06 D4T, 3TC EFV V75I  K11R, V35T, T39A, K49R, V60I, D123E, I132L, S162H, E169D, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207E, R211M, I244V, V245N P133T 
MAT08 MAT08 D4T, 3TC EFV   K11T, K20R, V35T, T39R, V111I, K122KE, D123NS, K166KR, K173A, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, F214FL  
MBI03 MBI03 AZT, 3TC EFV M184V G190A V35T, E36A, T39E, V90I, K122E, D123N, E138Q, A158S, T165I, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245M, E248D, D250E  
MBI11 MBI11 D4T, 3TC EFV   K20R, K32R, V35T, V60I, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, V245Q, D250E  
MBI12 MBI12 D4T, 3TC EFV   V35T, E40D, K49R, V60I, D121H, K122E, I135T, T139I, R172K, D177E, I178M, E204EK, Q207K, R211K, V245Q  
MBI17 MBI17 D4T, 3TC EFV   P4T, V35T, E40D, K49R, V60I, D121C, K122E, E169D, D177E, I178V, G196E, T200A, E204K, Q207E, F214L, I244V, V245T, D250E  
RUB01 RUB01 AZT, 3TC EFV   K11T, V35T, T39A, E40D, K122E, D123S, K173S, D177E, V179I, Q207A, R211K, F214L, V245Q, E248N  
RUB07 RUB07 D4T, 3TC NVP   V35T, T39M, V60I, I135V, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207N  
RUB08 RUB08 AZT, 3TC EFV M184V K103N E6S, K20R, V35T, T39N, E40D, V60I, K122E, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, P243S, V245K, D250E  
RUB14 RUB14 D4T, 3TC EFV M184MV K103KN, G190GA V35T, K49R, V60I, D121CY, K122E, I142IT, K166KQ, K173KE, D177E, I178L, T200A, E204EK, Q207E, V245Q  
RUT03 RUT03 AZT, 3TC EFV   E6D, V35T, T39N, S48T, K102Q, K122E, D123N, N147NK, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245Q, E248D  
RUT04 RUT04 D4T, 3TC EFV M184V, T215TNSY A98G, G190A V35T, E40D, K49R, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200TA, Q207A, R211S, F214FL  
RUT07 RUT07 AZT, 3TC EFV M184V K103N, Y181C T27S, V35T, T39N, E40D, I50IV, V60I, K101KR, K104R, D123E, I135V, K173KAET, D177E, T200A, Q207G, R211K, F214L, H221Y, V245Q  
VIR06 VIR06 D4T, 3TC EFV M184V K103N, Y181C V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123S, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
VIR09 VIR09 D4T, 3TC NVP M184MIV A98AG, G190GA K11M, V35T, D121H, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245K  
VIR10 VIR10 D4T, 3TC EFV   V35T, D121H, K122E, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, P243A, V245K  
VIR102 VIR102 AZT, 3TC EFV   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D177E, E204D, Q207A, R211K, V245K, D250E  
VIR105 VIR105 AZT, 3TC NVP   K11Q, V35T, T39N, K49R, V60I, K102Q, K122E, D123N, I135T, I142V, K173V, Q174K, D177Q, I178V, V179I, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D  
VIR106 VIR106 AZT, 3TC EFV   K11T, V35T, E40D, K122E, D123S, I142V, K173S, D177E, Q207A, R211S, V245Q, E248D, D250E  
VIR108 VIR108 D4T, 3TC EFV   V35T, T39K, K122E, D123N, A158S, K173A, T200A, Q207A, R211S, V245Q  
VIR111 VIR111 AZT, 3TC EFV M184V K103N E6D, V35T, T39L, K122E, D123S, I135M, S162A, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200V, Q207A, R211N, V245I  
VIR17 VIR17 AZT, 3TC EFV   I5IV, V35T, T39E, E40D, S48T, K122E, D123N, K173A, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S, V245Q, D250E  
VIR21 VIR21 D4T, 3TC EFV M184V, T215Y G190A K11Q, V35T, T39N, K49R, K122E, D123N, I135T, A158S, K173S, D177E, Q207D, R211K, V245Q, E248D  
VIR26 VIR26 AZT, 3TC EFV   K11Q, V35T, K49R, A98S, K122E, D123G, I135T, I142V, T165I, K173A, Q174QK, D177E, I178IM, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245Q, E248D V60VM 
VIR29 VIR29 D4T, 3TC EFV  K103N E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, E40D, K122E, K173A, Q174N, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
VIR32 VIR32 D4T, 3TC EFV M41L, D67N, K70R, M184V, T215Y A98G, Y188L K11T, V35T, T39A, V60I, V106I, D121Y, K122E, D123G, I135T, I142V, K173S, Q174K, D177E, V179I, G196E, Q207A, R211S, F214L, E224D, D237E, V245E  
VIR61 VIR61 D4T, 3TC NVP M184V K103N K20R, V35T, T39A, E40D, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, S162F, E169EAD, K173A, Q174K, D177E, V179VI, T200A, Q207A, R211S  
VIR88 VIR88 AZT, 3TC EFV   V35T, E36A, T39E, I47L, S48T, V60I, K122E, D123E, K173A, D177E, I178M, E194A, G196E, T200A, E204K, Q207E, V245K  
VIR92 VIR92 D4T, 3TC EFV M184V K103N V35T, E40D, K122E, D123N, I135L, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245Q  
VIR93 VIR93 AZT, 3TC EFV  V106VA, G190GA V35T, K49R, V60I, K122E, D123N, I135T, K173T, Q174K, V179I, T200TA, Q207A, R211S, I244IV, V245I