<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Guo (2015)
Title Low prevalence of the transmitted HIV-1 drug resistance among newly diagnosed HIV-1 individuals in Jiangsu Province, China during 2009-2011.
Citation BMC Public Health
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 130
NumPts 130
Subtype CRF01_AE, CRF07_BC, B, CRF68_01B, CRF08_BC, CRF67_01B, B + C, C

 

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Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 130 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
CZU03-2010 CZU03-2010 None None   E6D, K11R, V35T, T39K, K43E, K102R, K122E, D123S, I135R, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, I195L, T200I, Q207A, R211S  
CZU11-2010 CZU11-2010 None None   P4S, E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K82R, K122E, D123S, I135T, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, Q207T, R211S  
CZU18-2009 CZU18-2009 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S  
CZU19-2009 CZU19-2009 None None   V106I, K122E, I135T, K166R  
CZU20-2009 CZU20-2009 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, E169D  
CZU24-2011 CZU24-2011 None None   E6D, K11T, E28EK, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S  
CZU26-2010 CZU26-2010 None None   K20R, V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, I135V, E138A, I142T, S162C, Q207E, R211RK  
CZU26-2011 CZU26-2011 None None   E6D, V35T, T39K, V118I, K122E, V189A, T200I, R211K  
CZU27-2010 CZU27-2010 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
CZU27-2011 CZU27-2011 None None   E6D, V35T, T39K, V118I, V189A, T200I, R211K  
CZU28-2010 CZU28-2010 None None A62V  E6D, V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69N, S162C, I202V, Q207E  
CZU29-2010 CZU29-2010 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
CZU30-2010 CZU30-2010 None None   V35M, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E  
CZU31-2010 CZU31-2010 None None   K20R, V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, I135V, S162C, Q207E, R211K  
HUN15-2009 HUN15-2009 None None   V106I, K122E, I135T, K166R  
HUN15-2011 HUN15-2011 None None   E28K, K32E, V35IT, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, A158S  
HUN33-2010 HUN33-2010 None None   K122E, I135V, S162C, T200A, I202V  
HUN44-2010 HUN44-2010 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T N137S 
LNG06-2010 LNG06-2010 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, E40A, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207T, R211S  
NJG01-2010 NJG01-2010 None None   V106I, D121H, K122E, I135T, K166R  
NJG04-2009 NJG04-2009 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43A, K122E, D123S, I135IR, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179T, T200I, Q207A, R211S  
NJG33-2011 NJG33-2011 None None   I135V, S162C, I180V, T200A  
NJG46-2009 NJG46-2009 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, I135V, S162C, I178L, Q207G, R211K  
NJG47-2009 NJG47-2009 None None   T7I, V106I, K122E, I135T, K166R  
NJG52-2009 NJG52-2009 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S134C, K166R, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S  
NJG53-2009 NJG53-2009 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, T69N, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, Q207A, R211S I47V 
NJG54-2009 NJG54-2009 None None   E6N, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S E169E* 
NJG54-2010 NJG54-2010 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, W88WR, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S  
NJG58-2009 NJG58-2009 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135IT, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S  
NJG58-2010 NJG58-2010 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E  
NJG60-2010 NJG60-2010 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200R, Q207T, R211S V90VD 
NJG62-2010 NJG62-2010 None None   E6D, V35T, T39K, V118I, K122E, D123N, T200I, R211K  
NJG65-2010 NJG65-2010 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, D123N, I135T, S162C, E169D, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207T, R211S  
NJG67-2010 NJG67-2010 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E  
SQN07-2011 SQN07-2011 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S  
SQN18-2011 SQN18-2011 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, V60I, D121Y, K122E, D177G, H208Y, R211K  
SZU07-2009 SZU07-2009 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, D177G  
SZU15-2010 SZU15-2010 None None   I135V, S162C, I178M, T200A, Q207E  
SZU16-2010 SZU16-2010 None None   S162C, I178IL, T200A, Q207E  
SZU18-2010 SZU18-2010 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I  
SZU31-2009 SZU31-2009 None None   E6D, V106I, K122E, I135T, K166R  
SZU32-2009 SZU32-2009 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135R, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S  
SZU34-2009 SZU34-2009 None None   E6N, K11T, V35T, T39K, K43E, K104R, K122E, D123S, I135V, S162C, E169ED, K173GR, Q174K, D177E, I178M, Q207A, L210M, R211S  
SZU35-2009 SZU35-2009 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S105A, K122E, D123S, I135T, S162C, Q174K, D177E, I178M, T200E, Q207A, R211S  
SZU36-2009 SZU36-2009 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173N, Q174K, D177E, I178M, T200E, Q207A, R211S  
SZU38-2009 SZU38-2009 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123N, T200I, I202V, R211K  
SZU38-2011 SZU38-2011 None None   E6S, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, F171FY, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
SZU39-2011 SZU39-2011 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, V179VI, T200R, Q207A, L210M, R211S  
SZU40-2009 SZU40-2009 None None   I5V, E6K, K43N, V118I, K122E, I135M, T200I  
SZU40-2011 SZU40-2011 None None   E28K, K32E, V35I, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135IM, T200A  
SZU41-2009 SZU41-2009 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, Q174N, D177E, I178M, Q207A, L210F, R211S  
SZU41-2011 SZU41-2011 None None   E6D, V35T, T39K, V118I, K122A, I135T, R172K, T200I, R211K  
SZU42-2011 SZU42-2011 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K102R, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200E, Q207T, R211S  
SZU45-2011 SZU45-2011 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, R211S Q207M 
SZU47-2011 SZU47-2011 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S  
SZU59-2009 SZU59-2009 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135M, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
SZU60-2009 SZU60-2009 None None   E6D, V35T, T39R, K43E, V60I, K104KR, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, V189I, Q207A, L210F, R211S  
TZU-38-2010 TZU-38-2010 None None   E6N, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207T, R211S N81NT 
TZU06-2009 TZU06-2009 None None   E6EDKN, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, E169EK, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207T, R211S I2IM, L168LF 
TZU22-2009 TZU22-2009 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, K173N, Q174K, D177E, V179I, T200I, E203D, Q207A, R211S  
TZU32-2010 TZU32-2010 None None   K11R, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, G196R  
TZU41-2010 TZU41-2010 None None   K32Q, V35T, T39D, S48T, V60I, K122E, I135R, I142V  
TZU42-2010 TZU42-2010 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
TZU43-2010 TZU43-2010 None None   I5IV, E6K, V118I, K122E, I135M, K166R, T200I  
WXI01-2011 WXI01-2011 None None   E6D, V35T, K122E, D123S, K166R, T200I, R211K  
WXI02-2011 WXI02-2011 None None   V8I, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K166R  
WXI03-2011 WXI03-2011 None None   E6D, K11A, V35T, T39K, K43E, K102KR, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S  
WXI04-2011 WXI04-2011 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K173R, Q197K  
WXI08-2009 WXI08-2009 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K102KR, K122E, D123NS, S162C, E169EK, K173R, Q174K, D177E, I178M, I195L, Q207A, R211NS  
WXI10-2011 WXI10-2011 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K101R, S105A, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
WXI11-2009 WXI11-2009 None None   E6D, K11AT, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174N, D177E, I178M, Q207A, R211S  
WXI13-2009 WXI13-2009 None None   E6N, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
WXI23-2009 WXI23-2009 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207T, R211S  
WXI24-2009 WXI24-2009 None None   E6N, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207T, R211S  
WXI25-2009 WXI25-2009 None None  V179D E6N, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
WXI26-2009 WXI26-2009 None None   P4PH, E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S105A, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S  
WXI27-2009 WXI27-2009 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, E169D, K173RT, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
WXI30-2011 WXI30-2011 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I195L, Q207A, R211T  
WXI31-2011 WXI31-2011 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135V, T139A, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, I195L, T200A, Q207A, R211S  
WXI32-2011 WXI32-2011 None None   I5V, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135RT, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S  
WXI45-2010 WXI45-2010 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E  
WXI46-2010 WXI46-2010 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I135V, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
YCG08-2011 YCG08-2011 None None   V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, V189I, Q207A, R211S  
YCG09-2011 YCG09-2011 None None   E6N, K11T, V35T, T39K, K43E, K102R, S105A, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, G196E, Q207A, R211S  
YCG11-2011 YCG11-2011 None None   E6EAD, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, S68G, K122E, D123N, I135T, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207T, R211S  
YCG34-2011 YCG34-2011 None None   I5V, E6D, T7I, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, F171Y, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
YCG37-2011 YCG37-2011 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E  
YCG43-2009 YCG43-2009 None None   K122E, I135V, S162C, T200A  
YZU09-2009 YZU09-2009 None None   V106I, I135T, K166R  
YZU09-2010 YZU09-2010 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, D121Y, K122E, I178V, T200I, R211Q  
YZU14-2011 YZU14-2011 None None   I5V, E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207T, R211S  
YZU35-2011 YZU35-2011 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43KE, D121DA, K122E, D123S, I135V, S162C, K173KR, Q174E, D177E, V179I, Q207A, R211S  
ZJG19-2011 ZJG19-2011 None None   E6D, V35T, T39K, V118I, K122A, T200I, R211K  
ZJG21-2009 ZJG21-2009 None None   E6D, V35T, T39K, K43S, S68G, K122E, D123S, T165I, K173I, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200I, Q207A, R211S  
ZJG21-2011 ZJG21-2011 None None  K101E V35T, E36A, T39D, V60I, A98S, K102KR, D121Y, K122E, E169ED, E204EK  
ZJG23-2011 ZJG23-2011 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135RT  
ZJG47-2010 ZJG47-2010 None None   E6N, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207T, R211S  
ZJG48-2010 ZJG48-2010 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, D121Y, K122E, I178V, T200I, R211Q D186DE, L187LV 
ZJG49-2010 ZJG49-2010 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178IM, Q207AT, R211S G93GW 
ZJG52-2010 ZJG52-2010 None None   E6N, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207T, R211S Q91QP