<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Kouri (2015)
Title CRF19_cpx is an evolutionary fit HIV-1 variant strongly associated with rapid progression to AIDS in Cuba.
Citation EBioMedicine
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 92
NumPts 92
Subtype B, CRF20_BG, D, CRF18_cpx, CRF24_BG, C, B + G, G, CRF02_AG, F, CRF23_BG, H

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
AIDS-RP1 AIDS-RP1 None None   V35T, V60I, S68G, K122E, D123S, I135V, E138G, E169D, R172K, D177E, I178L, Q207E, P243S, V245S, D250E, A272P, T286A, I329V  
AIDS-RP10 AIDS-RP10 None None   V35I, I135V, S162A, D177DA, I178M, T200A, Q207E, R211K, K277R, T286A, I293V, I326V P176E 
AIDS-RP11 AIDS-RP11 None None   V21VI, V35T, V60I, D121H, K122E, S162C, D177E, I178L, T200E, E204EA, Q207E, R211K, V245T, D250E, A272P, K277KR, L283LI, T286TA, I293IV, E297K, P313PS, V317VA, I329V  
AIDS-RP12 AIDS-RP12 None None   V21I, V35T, V60I, K122P, I142IT, Q174E, D177E, I178V, E204K, Q207E, R211RK, V245Q, E248ED, A272P, L283I, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, L301M, I329V K201V 
AIDS-RP13 AIDS-RP13 None None   K49R, D123E, I135T, E169D, I178L, E194D, Q207E, R211K, F214L, V245M, A272AS, K277R, I293V, E297K, S322SL, I329L  
AIDS-RP14 AIDS-RP14 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, D123E, I135T, E169D, Q197K, T200TA, Q207E, V245T, D250E, A272S, K277R, T286A, P313E, I329V  
AIDS-RP15 AIDS-RP15 None None   A98S, K122KE, I135L, S162C, D177E, I178L, T200A, R211K, L228H, V245VEKM, D250E, A272P, K277R, T286A, I293V, E297T, I329V, G333GE, Q334K  
AIDS-RP16 AIDS-RP16 None None   V8VI, K11KR, T27TP, V35T, E36A, T39D, K122E, K173T, D177E, T200V, Q207G, R211Q, V245Q, A272P, K281R, E291D, V292I, I293IV, I326V  
AIDS-RP17 AIDS-RP17 None None   V10A, V35I, K49R, V90VI, K122P, S162CG, T165TI, Q174D, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248N, D250E, A272P, V276T, L283I, V292VI, I293IV, P294PT, E297AP, V317VA  
AIDS-RP18 AIDS-RP18 None None   K122E, S162C, G196GE, Q197K, Q207QH, R211KQ, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, V292VI, E297A, V317VA, I329IV  
AIDS-RP19 AIDS-RP19 None None   V35T, E36A, T39E, D121Y, K122E, D123G, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, D324E  
AIDS-RP2 AIDS-RP2 None None   E6EK, V8VI, V35IT, T39S, V60I, T107AS, V111VI, K122E, D123E, T139A, D177E, T200A, Q207E, H208HY, L210LS, V245E, D250E, T286A, P294T, I329V R72RG 
AIDS-RP20 AIDS-RP20 None None   V35T, E40D, V60I, K122P, I135V, I142V, Q174E, D177E, I178V, T200A, K201I, E204K, Q207E, R211K, F214L, V245Q, Y271F, A272P, T286A, P294PQ, I326V  
AIDS-RP21 AIDS-RP21 None None   D121H, K122E, I135T, S162C, D177E, R211K, V245Q, E248N, A272P, K277R, I293V, E297T, I329V  
AIDS-RP22 AIDS-RP22 None None M41L V179D K20KR, V35I, T39A, V60I, K122E, I135R, I202V, Q207EG, L210LF, R211S, F214FL, A288S, I293V, S322A, I326V, Q334E  
AIDS-RP23 AIDS-RP23 None None   V35T, E40D, V60I, K122P, S162C, I178L, K201I, E203D, E204EK, R211K, V245Q, A272P, K277R, L283F, T286TA, E291D, V292I, I293V, E297A, L301M, H315L, I326V  
AIDS-RP24 AIDS-RP24 None None   V21I, V60I, A98S, D123E, I178IM, T200TA, Q207E, V245Q, K249Q, D250E, E291D, V317A  
AIDS-RP25 AIDS-RP25 None None   K102Q, K103R, I135T, I142T, S162C, V189I, V245M, A272P, K277R, I293V, E297A  
AIDS-RP26 AIDS-RP26 None None   D121H, K122E, S162C, D177E, Q197K, T200E, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, E291D, V292I, E297A, I329L  
AIDS-RP27 AIDS-RP27 None None   K11R, V35I, D123A, I135T, S162C, E203D, R211K, V245Q, E248D, A272P, V292I, I293V, E297A, G333E K126N 
AIDS-RP28 AIDS-RP28 None None   V35T, T39A, V60I, K122E, D123S, I142IT, E169D, D177E, Q207K, V245K, D250E, A272P, K277R, T286A, D324E A267G 
AIDS-RP29 AIDS-RP29 None None   V35T, K49R, V60I, K122E, E169D, R172K, D177E, T200A, E204EK, Q207E, V245T, D250E, A272S, K277R, T286A, I293V, P313Q, I329L  
AIDS-RP3 AIDS-RP3 None None  V179E V35T, T39A, V60I, D121DN, K122E, D123N, I135L, S162N, K173V, D177E, R211S, V245Q, D250E, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, D324E, L325I, I329V N54NI, D76DN, D113DN, W153W* 
AIDS-RP30 AIDS-RP30 None None   P4PS, V118I, T165I, E169D, D177E, D192E, Q207E, R211K, F214L, D250T, I329L  
AIDS-RP31 AIDS-RP31 None None   K122E, D123N, F124L, S162C, D177E, E203D, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, V292I, I293V, E297A, A327V  
AIDS-RP32 AIDS-RP32 None None   V35T, K122E, S162C, D177E, I178V, T200A, E204V, R211E, A272P, K277R, V292I, I293V, E297A, Q334L  
AIDS-RP33 AIDS-RP33 None None   V35T, T39A, E40D, K122E, I135T, S162C, D177E, I178M, T200A, R211K, V245T, D250E, A272S, T286A, E297K, K311R, P313Q, V317VA, D324E P150S 
AIDS-RP34 AIDS-RP34 None None   K49R, D123E, S162C, E169D, I178L, T200A, E204K, Q207E, F214L, V245M, V276I, I293V, E297A, I329L  
AIDS-RP35 AIDS-RP35 None None  L234I K122E, S162C, Q197K, T200V, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, V292I, E297A G45GR, G93R, I270M, I274M 
AIDS-RP36 AIDS-RP36 None None F116Y, T215S, K219Q  V35T, E36A, T39D, K64R, S162N, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, H208Y, R211Q, D218E, V245Q, A272P, K281R, E291D, V292I, L303W, I326V R143M, R307M, I309M, Y319D 
AIDS-RP37 AIDS-RP37 None None   K122E, S162C, Q197K, T200V, R211K, V245Q, E248D, A272S, K277R, V292I, E297A  
AIDS-RP38 AIDS-RP38 None None   K22R, K49R, D123E, I135T, E169D, D177E, I178L, I202V, E204K, Q207E, R211K, F214L, R284K, A288S, I293V, E297A, I326T, I329L E89K 
AIDS-RP39 AIDS-RP39 None None   V35T, K49R, V60I, K122P, D123E, I135T, I142T, D177E, Q207E, R211K, V245S, D250E, A272P, K277R, T286A, I329V  
AIDS-RP4 AIDS-RP4 None None   K122Q, S162C, D177E, V245Q, E248D, A272P, K277R, I293V, E297T, P321S, S322A, Q334L  
AIDS-RP40 AIDS-RP40 None None   K122E, D123E, I135T, S162C, D177E, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, E297A, K311R  
AIDS-RP41 AIDS-RP41 None None   A98S, K122E, D123N, S162C, E169K, Q174H, D177E, I178M, T200A, R211K, L228H, P243T, V245E, D250E, A272S, T286A, E297T, I329V L149P, W266G 
AIDS-RP42 AIDS-RP42 None None   V35T, E36A, T39D, K122E, D123N, I135T, I142V, K173T, Q174K, V179I, I195V, T200A, Q207G, R211Q, V245Q, E248D, V254I, A272P, K281R, E291D, V292I, I293V, I326V G155GR 
AIDS-RP43 AIDS-RP43 None None   V35T, V60I, T107S, D177E, T200A, Q207A, R211K, P243A, I244V, V245Q, E248D, A272P, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297R, K311R L92LI 
AIDS-RP44 AIDS-RP44 None None   A98S, I135L, S162C, D177E, Q197K, T200A, R211K, L228R, V245E, D250E, A272S, T286A, A288S, E297A  
AIDS-RP45 AIDS-RP45 None None   V21I, V35T, V60I, K122P, D123E, I135IKMT, T165TI, R172K, K173A, Q174K, D177E, I178L, I195L, Q207K, R211Q, V245Q, E248D, D250E, A272P, T286A, E291D, V292I, E297A, D324E, L325I, I329V K281KT 
AIDS-RP46 AIDS-RP46 None None   V35T, V60I, D121Y, K122E, I135R, S162C, D177E, I178L, T200A, E204A, Q207EK, R211K, V245T, D250E, A272S, K277R, T286A, E297K, P313S, V317A, I329V, Q334QH  
AIDS-RP47 AIDS-RP47 None None   K102Q, I135L, I142M, S162C, D177E, T200A, Q207A, R211K, L228R, V245Q, A272P, K277R, T286A, E297A, I326V, I329L  
AIDS-RP48 AIDS-RP48 None None M184V K103S, G190A, P225H E6EK, K20R, V35T, E36D, K49R, V60I, K102R, K122E, D123G, I135V, K173T, Q174K, D177E, I178M, I195*, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
AIDS-RP49 AIDS-RP49 None None   V35T, E36D, T39M, D123E, I135V, E138EA, T139TI, I142IT, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, E203K, Q207D, R211K, P243A, V245Q, R284K, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, K311R, S322T, I326V  
AIDS-RP5 AIDS-RP5 None None   K122Q, S162C, D177E, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, I293V, E297T, S322T  
AIDS-RP50 AIDS-RP50 None None   S3I, V35T, E36D, K49R, V60I, D123E, S162G, K173RT, Q174E, D177E, V189I, T200A, Q207E, V245Q, E248D, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, S322A, L325S, I326V R72S, P95L, D113K 
AIDS-RP51 AIDS-RP51 None None   A98S, I135L, S162C, D177E, T200A, R211K, L228Q, V245VEKM, L246LM, D250E, A272S, K277R, E297A, I329V  
AIDS-RP52 AIDS-RP52 None None   E6D, K49R, D123E, I135T, T139A, Q174E, P176PT, V179I, G196E, F214L, K277R, T286A, E297R, L301I, I326V, I329V  
AIDS-RP6 AIDS-RP6 None None   K102Q, K122E, D123N, S162C, Q197K, T200V, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, V292I, E297A  
AIDS-RP7 AIDS-RP7 None None   V35T, V60I, D123E, I142T, E169D, D177E, T200A, Q207E, L210LF, V245E, D250E, K277R, T286A, P294T, I329V  
AIDS-RP8 AIDS-RP8 None None   A98S, I135L, S162W, D177E, Q197K, T200A, R211K, L228H, V245E, D250E, A272P, K277R, T286A, E297T, E312EQ, G333E  
AIDS-RP9 AIDS-RP9 None None  K103N D123E, I135T, S162AG, D177E, G196E, T200A, R211A, V245K, A272P, T286A, E297R, P313T, Q334S  
C_AIDS1 C_AIDS1 None None   S162C, I178IM, Y271F, A272P, L283I, A288S, V292I, I293IV, I326V, I329L  
C_AIDS10 C_AIDS10 None None   V90VI, A98S, K122E, I135V, S162C, D177E, I178V, T200A, R211K, L228Q, D250E, A272S, K277R, T286A, E297A, S322T, I329V, Q334QE  
C_AIDS11 C_AIDS11 None None M41L, T215D  E40D, K43R, V60I, V118I, K122E, D123NS, I135V, S162C, T200A, I202V, E204D, R211K, E248D, A272P, K277R, E297A, Q334L  
C_AIDS13 C_AIDS13 None None   K49R, A98S, D123E, E169D, N175HY, I178L, G196E, T200AE, Q207EK, R211RK, F214L, I244IV, V245M, V254VI, I293V, I329L  
C_AIDS14 C_AIDS14 None None   V21I, V35T, K49KR, V60I, D123E, K173I, Q174K, D177E, T200A, I202V, R211RK, V245Q, E248D, D250E, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, P321S, D324E, L325I, I329V F214FS, T216TA, P217PA 
C_AIDS15 C_AIDS15 None None   V35I, T39A, R83K, I178M, Q207E, V245M, K277R, T286A, I329L  
C_AIDS16 C_AIDS16 None None   V21I, V35T, V60I, K122P, Q174E, D177E, I178V, K201I, E204KN, Q207G, V245Q, A272P, L283I, E291D, V292I, I293V, E297A, L301M, D324E, E328D  
C_AIDS17 C_AIDS17 None None   V35T, E36A, T39D, K122E, S162C, E169A, K173A, T200A, Q207D, R211K, V245Q, A272P, E291D, V292I, I293V, P294T, L301F, K311R A299AE 
C_AIDS18 C_AIDS18 None None D67N, T215S, K219Q  V35T, E36A, T39D, K64R, S162N, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, H208Y, R211Q, D218E, V245Q, A272P, K281R, E291D, V292I A267G 
C_AIDS19 C_AIDS19 None None   V35T, V60I, I135V, E138A, S162C, K173T, Q174EG, T200A, Q207E, R211K, V245L, E248D, A272P, K277R, L283I, R284K, E291D, V292I, I293V, E297K  
C_AIDS2 C_AIDS2 None None   K49R, D123E, I135T, E169D, D177DE, I178L, T200TI, E204K, Q207E, R211K, F214L, V245M, I293V, I329L  
C_AIDS20 C_AIDS20 None None   D123E, D177E, E194A, G196E, Q197L, T200E, R211K, V241I, V245Q, D250E, S251N, A272S, V292I, I293V, E297A  
C_AIDS21 C_AIDS21 None None   D123E, E138A, I142T, S162C, D177E, I178V, R211K, A272P, T286A, I293V, I326V  
C_AIDS22 C_AIDS22 None None   T39TA, S68G, K122E, D123N, I135L, S162C, D177E, T200A, R211K, L228Q, I244V, V245E, D250E, A272P, K277R, T286TA, I293IV, E297T  
C_AIDS3 C_AIDS3 None None   T107TS, K122P, I135T, S162C, D177E, Q197K, R211KQ, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286P, V292I, I293V, E297A, K311KR, V317VA  
C_AIDS4 C_AIDS4 None None   V35T, V60I, K122P, D123E, I135V, Q174E, D177E, I178M, E204K, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P, V276I, L283I, T286A, E291D, I293V, E297A, I326V  
C_AIDS5 C_AIDS5 None None   M16L, D86E, D123E, I142IM, S162W, Q207EG, R211K, V245VE, A272P, K277R, I293V, E297R, K311KR, E312T, G333E, Q334QL  
C_AIDS6 C_AIDS6 None None   P4S, A98S, E169D, D177E, Q207E, R211K, F214L, V245M, D250E, I329L  
C_AIDS7 C_AIDS7 None None   V35T, E40D, V60I, K122P, T165I, Q174E, D177E, Q207EK, V245K, A272S, K277R, T286A, E297K, P313Q, V317A, I329V  
C_AIDS8 C_AIDS8 None None   K20R, I178M, A272P, K277R, Q278E, P313S, H315Q, V317A, S322A D110D_S 
C_AIDS9 C_AIDS9 None None   K49R, I50V, A98S, V106I, K122A, D123E, E169D, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245M, A272P, I329L, Q334H  
N_AIDS1 N_AIDS1 None None   V35VI, K49R, V60I, K102Q, D123E, I135IT, S162C, D177E, I178M, T200A, Q207K, R211S, A272P, K277R, T286TA, A288AG  
N_AIDS10 N_AIDS10 None None   K49R, I135T, E169D, D177E, I178L, Q207EG, R211K, F214L, V245M, A272P, A288S, I329L W71WC, K73KN, Q85QE 
N_AIDS12 N_AIDS12 None None   K49R, A98S, V106I, D123E, E169D, I178L, Q207E, R211K, F214L, V245Q, K277R, I293V, I329L  
N_AIDS13 N_AIDS13 None None   K64R, I135T, S162C, K173E, D177A, E194ED, Q197E, T200A, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277KR, V292I, E297A, I329L, Q334QH R143RT 
N_AIDS14 N_AIDS14 None None   E6EK, K20R, K49R, D123E, I135T, E169D, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245M, A272S, K277KR, I293V, I329L  
N_AIDS15 N_AIDS15 None None   E28EG, K101R, K122P, I142V, S162C, D177E, V179A, T200A, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, T286A, I293V, P294T, E297V  
N_AIDS16 N_AIDS16 None None   A98S, I135L, S162C, D177E, Q197K, T200A, R211K, L228R, V245E, A272S, K277R, T286A, E297T  
N_AIDS17 N_AIDS17 None None   K49R, D123E, I135T, E169D, I178L, Q207E, H208HY, R211K, F214L, V245M, E297K, I329L F160FY, G285GR 
N_AIDS18 N_AIDS18 None None   E6D, V35I, A98S, D123E, I135T, D177E, Q207E, F214L, A272P, V292I, I293V, E297A, E300A, I329V W266R, E302EQ 
N_AIDS19 N_AIDS19 None None   K20R, R83K, D123E, D177DG, I178L, G196E, A272P, K277R, T286A, I293V, T296S, E297K, V317VA, G333E, Q334QL S162P 
N_AIDS2 N_AIDS2 None None   A98S, I135L, S162C, D177E, I178L, T200A, R211K, L228Q, V245E, D250E, A272S, K277R, T286A, I293V, E297AT, I329V, Q334E  
N_AIDS21 N_AIDS21 None None   S162C, Q197K, T200E, R211K, V245KLMQ, E248D, D250DAE, S251SHNR, A272P, K277KR, T286A, V292I, I293IV, E297A, K311KR  
N_AIDS3 N_AIDS3 None None   A98S, K103KR, K122KE, I135L, S162C, D177E, T200AE, Q207K, R211T, L228Q, V245VEKM, D250E, A272P, K277R, T286A, E297T, I329V  
N_AIDS4 N_AIDS4 None None   V21I, V35T, E40D, V60I, K122P, D123E, I135C, S162C, Q174E, D177E, Q207K, R211T, V245Q, A272S, T286A, E291D, V292I, E297A, I326V  
N_AIDS5 N_AIDS5 None None  K103N V60I, K122AP, I135IV, S162SC, Q174QE, D177E, T200A, E204EK, Q207QE, R211K, V241VI, V245Q, E248ED, A272PS, V276VAIT, L279LI, L283LI, I293V, P294PS, E297A, I326IV, Q334HY V21VIM 
N_AIDS6 N_AIDS6 None None   V21I, V35T, T39M, V60I, K122P, D123E, I135T, Q174AE, D177DE, I178IM, Q207E, R211K, F214FL, V245Q, A272S, V276I, T286A, E291D, V292I, I293V, P294PT, E297AV, E298ED, I326IV  
N_AIDS7 N_AIDS7 None None   K49KR, K122E, S162C, Q197E, T200A, K201R, R211K, V245Q, E248D, A272P, T286A, V292I, E297T, I329V  
N_AIDS8 N_AIDS8 None None   P4PS, K20R, V21I, V35T, T39R, I47N, V60I, L100F, K122P, D123E, I135V, S162C, Q174E, D177E, Q207A, R211K, V245Q, A272S, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, E312A, I326V, E328D E29A, G45R, K66KN 
N_AIDS9 N_AIDS9 None None   K49R, D123E, I135T, E169D, D177E, I178L, T200A, Q207E, F214L, V245M, A288S, I329L