<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Wang (2015)
Title Targeting HIV prevention based on molecular epidemiology among deeply sampled subnetworks of men who have sex with men.
Citation Clin Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 175
NumPts 175
Subtype CRF01_AE, B, CRF07_BC, B + C, C

 

  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 175 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
100 100 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, E169G, K173R, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V  
102 102 None None   V118I, K122E, I135IT, S162N, T200I, F214L, V245I, V261I, K275KQ, V276VI, K277KR, V292I, I293V  
105 105 None None   V106I, K122E, Q207E, R211K, V245E, I293V, E297K  
106 106 None None   E6D, K11T, V35T, E36A, T39K, K43E, S68G, K103R, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, V245E, V276I, T286A, E291D, V292I, I293V  
111 111 None None   E6K, V35I, V106I, V118I, I178IL, R211K, F214L, V245M, V261I, K277R, I293V  
113 113 None None   E28EK, K32KE, V35VA, E36EG, T39TA, V118VI, D121DY, K122E, I135IM, H208HY, R211RG, F214L, V245I, V261I, I293V V60VIM 
115 115 None None   E6N, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135R, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P, E291D, I293V  
117 117 None None   V118I, K122E, I135T, F214L, V245M, V261I, K277R  
12 12 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A P133PL 
122 122 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207G, R211S, K238R, V245K, D250E, T286A, E291D, I293V R83RS 
127 127 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, V111I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I, T286A, E291D, V292I, I293V  
128 128 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, V111I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I, T286A, E291D, V292I, I293V Y144YN 
129 129 None None   E6D, P9PS, K11T, V35T, T39K, K43E, K102KR, K122E, D123N, S162C, K173R, Q174E, D177E, I178M, E203D, E204K, Q207A, R211S, K238R, V245E, V276I, E291D, I293V S191SF 
132 132 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E, V254I, T286A, E291D, V292I, I293V Y144YD 
133 133 None None  V179D E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207T, R211N, K238R, V245E, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
135 135 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I142V, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, K275Q, T286A, E291D, I293V  
136 136 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K103R, S117SP, K122E, D123S, S162C, Q174N, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P, K275R, V276I, T286A, E291D, V292I, I293V S156SP 
142 142 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, E40EG, K43E, K102KR, K104KR, K122E, D123S, S162C, E169D, Q174KR, D177E, Q207D, K238R, V245E, K249Q, T286A, E291D, V292I, I293V F61FS 
144 144 None None   K102R, V118I, K122E, D123N, I135T, T200I, R211G, F214L, V245M, V261I, V276I, I293V, E297R  
149 149 None None  V179D E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K102E, D121Y, K122E, S162C, T200A, Q207E, R211K, F214L, D237N, V245Q, A272P, K277R, L283I, T286A, E291D, V292I, I293V  
150 150 None None   I5V, E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135T, K154X, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, I202V, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P, E291D, I293V  
151 151 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, I195L, Q207A, R211S, K238R, V245VE, K277R, T286A, I293V, E297A  
153 153 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, L283I, I293V  
154 154 None None   I5V, E36G, V118I, K122E, I135M, R211K, F214L, V245I, V261I, A272Q, I293V F87F*LY 
158 158 None None  V179D E6D, K11T, E28K, K32E, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E L209LV 
164 164 None None   I135V, S162C, E169D, Q174E, T200A, Q278E, L283I, V292I  
165 165 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D76X, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200R, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, R284X, T286A, E291D, V292I, I293V  
168 168 None None   P4PH, E6D, K11RT, V35T, T39K, K43E, K49R, S105SA, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E, V276I, T286A, E291D, I293V  
169 169 None None  Y188YS E28K, K32E, V35T, E36A, T39N, S48T, V60I, D121Y, K122E, I159V, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V R143RS 
170 170 None None   V35I, V118I, K122E, I135T, S162N, T200I, F214L, V245I, V261I, K275Q, K277R, T290TA, V292I, I293V  
171 171 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, V245Q, A272P, K277R, K287KR, E291D, V292I, I293V, P294T  
172 172 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K101KQ, K102KR, K104KR, S105SA, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
174 174 None None  V179E E6D, E28G, T39A, V118VI, D121Y, K122E, I135T, D177AE, I178ILM, I180IV, T200A, Q207E, F214L, V245M, V261I, K277R, A288S, I293V  
176 176 None None   E6N, K11T, K22KR, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, V179VI, D192DN, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245K, K249KR, A272P, K281KR, T286TA, E291D, I293V Y144YD 
184 184 None None  V179D E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D76X, R83X, K102E, D121Y, K122E, I135T, S162C, T200A, Q207E, R211X, F214L, D237N, V245QR, A272P, K277R, L283I T286L 
186 186 None None   I5V, E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, I202V, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P, E291D, I293V  
188 188 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, R211RK, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
191 191 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V Y144YH 
192 192 None None   V106I, V118I, D123E, I135T, K166R, D177N, I180V, R211K, F214L, V245M, V261I, I293V  
193 193 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K103R, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E, S251N, K275R, V276I  
197 197 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, V276I, T286A, E291D, I293V  
200 200 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135V, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245K, I257L, K277R, T286A, I293V D86DY 
204 204 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39DN, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
206 206 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173M, Q174K, D177E, T200I, I202V, Q207A, R211S, F214FL, K238R, V245E, K281KR, T286TA, E291D, V292I, I293V  
207 207 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, D121H, K122E, I178IL, E204K, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, E291ED, V292I, I293V  
214 214 None None  V179E D121Y, K122E, I135T, D177A, T200A, Q207E, F214L, V245M, V261I, I293V  
216 216 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, V292I I293AV 
220 220 None None   K49R, V60I, R83K, K122E, D123S, I195K, T200A, Q207E, R211K, E248D, K277R, A288S, T290TA, I293V, E297K  
221 221 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, T200I, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K275R, K277R, E291D, V292I, I293V R143RS 
226 226 None None   I5V, V118I, I135M, F214L, V245I, V261I, A272P, V276I, I293V E138EV, P140PS, G141GV 
230 230 None None   V35T, T39K, K43E, K103R, K104R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200V, Q207A, R211S, F214L, V245E, T286A, V292I, I293V E291DV 
232 232 None None   E6N, K11KR, V35T, T39K, E40A, K43E, K102KR, K103R, K104R, K122E, D123S, S162SR, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200V, Q207A, R211S, F214L, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V S191SF 
237 237 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, V276I, T286A, E291D, I293V  
238 238 None None   V35M, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
24 24 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
247 247 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, R211K, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
27 27 None None  V179VD E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A, E291D, I293V  
28 28 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
32 32 None None   I5V, E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211T, K238R, V245E, A272P, E291D, I293V  
33 33 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203ED, Q207A, R211S, K238R, V245K, I257IL, T286TA, I293V P59PS, L264LP 
34 34 None None  V179D E6D, K11T, E28K, K32E, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, K275KR, V276I, K277KR, K281KR, T286A, E291D, V292I, I293V  
35 35 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, V111I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V R284RS 
37 37 None None   T39TA, K103R, V118I, K122E, I135T, E169D, I180V, Q197K, I202V, R211K, F214L, I257L, K259R, V261I, V276I, Q278H, I293V F77FY 
44 44 None None   K20R, K82R, V118I, I135T, E204D, R211K, F214L, V245M, I257L, V261I, T290S, I293V  
46 46 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K49R, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, V276I, T286A, E291D, I293V  
50 50 None None   V118I, D121Y, K122E, I178IV, R211G, F214L, V245M, V261I, K275Q, K277R, V292I, I293V  
51 51 None None   I5V, E6K, K101Q, V118I, K122E, F214L, V245I, V261I, V276I, I293V  
53 53 None None   I5V, E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, T200TI, I202V, Q207AS, R211S, K238R, V245E, A272P, I293V  
55 55 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, T200K, E203ED, Q207A, R211S, K238R, V245E, V276VI, K281KR, T286A, E291D, I293V G285GR 
57 57 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286V, E291D, V292I, I293V, P294Q  
60 60 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, E203ED, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P, K281KR, T286A, E291D, I293V  
61 61 None None   V106I, I135T, T200K, Q207E, F214L, V245T, V261I, K277R, I293V, E297K  
62 62 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V179VI, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V G285GE 
63 63 None None   E6N, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135R, S162C, D177E, I178M, T200TI, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P, E291D, I293V I142ILPT 
65 65 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
66 66 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K173A, Q174N, D177E, V179I, T200I, E203D, Q207A, R211S, K223KR, K238R, V245E, K281R, T286A, E291D, I293V, P294Q  
70 70 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, V60I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200R, Q207A, R211S, K238R, V245D, E291D, V292I, I293V  
71 71 None None   K102Q, K103R, K104R, V106I, V118I, T139TA, K166R, F214L, V245M, V261I, V276I, Q278H, K281R, V292I, I293V  
73 73 None None   E6D, K11R, V35T, T39K, K43E, K104R, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V  
75 75 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, V245Q, E248I, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
76 76 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, F87X, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, V245D, V276I, T286A, E291D, V292I, I293V  
79 79 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39A, S48T, D76X, D86X, D121Y, K122E, I135IT, G141X, R143X, Q145E, N147H, P170PS, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, G285X, E291D, V292X, I293X I142~, Y144V, Y146V 
80 80 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, D177DG, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
81 81 None None   V60I, D76X, L80X, T107S, K122E, D123S, I195K, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245E, E248D, K277R, A288S, E297K  
87 87 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, D76X, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, E204K, Q207A, R211S, K238R, V245E, K277R, T286A, E291D, I293V  
90 90 None None   I5V, E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, D76X, W88WR, K122E, D123S, S162C, K173N, Q174K, D177E, Q207A, R211T, K238R, V245E, A272P, E291D, I293V F87FY 
93 93 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, K64KR, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, V276I, R284X, T286A, E291D, I293V R206RG 
97 97 None None   E6D, K11T, V35T, K103R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I, R284K, T286A, L289I, T290TS, E291D, V292I, I293V  
ya110 ya110 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162Y, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207T, R211S, K238R, V245E, K277R, Q278H, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294L  
YA13 YA13 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A, I293V  
ya130 ya130 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, V111I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I, T286A, E291D, V292I, I293V  
ya139 ya139 None None   V35T, K43E, V60I, S68G, K122E, D123S, I135T, K173R, Q174E, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245K, K277R, T286A, E291D  
ya15 ya15 None None   E6K, V106I, V118I, R211K, F214L, V245M, V261I, K277R, I293V  
ya228 ya228 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
ya233 ya233 None None   K49KR, V106I, K122E, I135T, T200A, I202V, F214L, I257L, V261I, K277R, A288S N265I 
ya36 ya36 None None  K101E E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, W88WR, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V L12S 
ya41 ya41 None None   E6N, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, K249R, T286A, E291D, I293V  
ya42 ya42 None None T215S Y188L Q197E, R211K, A272S, K277R, I293V, E297K  
ya43 ya43 None None   E6D, V35A, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K154E, S163G, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
ya6 ya6 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, K173S, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, I293V